MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Candidatus Riesia pediculicola USDA plasmid pPAN

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013962	T	11	11	66	76	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013962	A	9	9	78	86	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013962	T	6	6	398	403	0 %	100 %	0 %	0 %	292493921
4	NC_013962	T	6	6	1119	1124	0 %	100 %	0 %	0 %	292493922
5	NC_013962	T	8	8	1244	1251	0 %	100 %	0 %	0 %	292493922
6	NC_013962	T	6	6	1701	1706	0 %	100 %	0 %	0 %	292493922
7	NC_013962	T	7	7	1760	1766	0 %	100 %	0 %	0 %	292493922
8	NC_013962	T	6	6	1841	1846	0 %	100 %	0 %	0 %	292493923
9	NC_013962	T	6	6	1848	1853	0 %	100 %	0 %	0 %	292493923
10	NC_013962	A	6	6	1939	1944	100 %	0 %	0 %	0 %	292493923
11	NC_013962	C	6	6	2471	2476	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12	NC_013962	T	8	8	2927	2934	0 %	100 %	0 %	0 %	292493925
13	NC_013962	T	6	6	3099	3104	0 %	100 %	0 %	0 %	292493925
14	NC_013962	C	6	6	3649	3654	0 %	0 %	0 %	100 %	292493926
15	NC_013962	T	8	8	4105	4112	0 %	100 %	0 %	0 %	292493927
16	NC_013962	T	6	6	4277	4282	0 %	100 %	0 %	0 %	292493927
17	NC_013962	C	6	6	4827	4832	0 %	0 %	0 %	100 %	292493928
18	NC_013962	T	7	7	5172	5178	0 %	100 %	0 %	0 %	292493929
19	NC_013962	T	6	6	5212	5217	0 %	100 %	0 %	0 %	292493929
20	NC_013962	T	6	6	5412	5417	0 %	100 %	0 %	0 %	292493929
21	NC_013962	T	7	7	5496	5502	0 %	100 %	0 %	0 %	292493929
22	NC_013962	T	6	6	5846	5851	0 %	100 %	0 %	0 %	292493929
23	NC_013962	T	7	7	5969	5975	0 %	100 %	0 %	0 %	292493929
24	NC_013962	T	6	6	6014	6019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013962	T	7	7	6069	6075	0 %	100 %	0 %	0 %	292493930
26	NC_013962	A	6	6	6083	6088	100 %	0 %	0 %	0 %	292493930
27	NC_013962	T	7	7	6135	6141	0 %	100 %	0 %	0 %	292493930
28	NC_013962	T	8	8	6173	6180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013962	T	8	8	6192	6199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013962	A	7	7	6201	6207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013962	T	8	8	6213	6220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013962	A	7	7	6238	6244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013962	A	9	9	6250	6258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013962	T	7	7	6282	6288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013962	T	6	6	6294	6299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013962	A	6	6	6305	6310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013962	T	9	9	6316	6324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013962	A	7	7	6350	6356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013962	T	8	8	6384	6391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013962	A	7	7	6410	6416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013962	T	6	6	6417	6422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013962	T	15	15	6425	6439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013962	T	6	6	6536	6541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013962	A	12	12	6570	6581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013962	A	6	6	6594	6599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013962	A	6	6	6671	6676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013962	T	6	6	6689	6694	0 %	100 %	0 %	0 %	292493931
48	NC_013962	T	7	7	6710	6716	0 %	100 %	0 %	0 %	292493931
49	NC_013962	A	7	7	6719	6725	100 %	0 %	0 %	0 %	292493931
50	NC_013962	T	7	7	6726	6732	0 %	100 %	0 %	0 %	292493931
51	NC_013962	T	6	6	6738	6743	0 %	100 %	0 %	0 %	292493931
52	NC_013962	A	8	8	6745	6752	100 %	0 %	0 %	0 %	292493931
53	NC_013962	T	6	6	6762	6767	0 %	100 %	0 %	0 %	292493931
54	NC_013962	A	6	6	6780	6785	100 %	0 %	0 %	0 %	292493931
55	NC_013962	T	6	6	6801	6806	0 %	100 %	0 %	0 %	292493931
56	NC_013962	A	7	7	6808	6814	100 %	0 %	0 %	0 %	292493931
57	NC_013962	A	6	6	6891	6896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013962	T	7	7	7332	7338	0 %	100 %	0 %	0 %	292493932
59	NC_013962	T	7	7	7383	7389	0 %	100 %	0 %	0 %	292493932
60	NC_013962	T	6	6	7391	7396	0 %	100 %	0 %	0 %	292493932
61	NC_013962	A	8	8	7428	7435	100 %	0 %	0 %	0 %	292493932
62	NC_013962	A	8	8	7450	7457	100 %	0 %	0 %	0 %	292493932
63	NC_013962	A	7	7	7509	7515	100 %	0 %	0 %	0 %	292493932
64	NC_013962	T	6	6	7590	7595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013962	A	7	7	7597	7603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013962	T	11	11	7694	7704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013962	A	9	9	7706	7714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.