MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Erwinia amylovora CFBP1430 chromosome

Total Repeats: 2031

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013961	CTTCG	2	10	4284	4293	0 %	40 %	20 %	40 %	292486496
2	NC_013961	CGCGC	2	10	4392	4401	0 %	0 %	40 %	60 %	292486496
3	NC_013961	CATGC	2	10	9545	9554	20 %	20 %	20 %	40 %	292486499
4	NC_013961	CTTGC	2	10	10428	10437	0 %	40 %	20 %	40 %	292486499
5	NC_013961	ATTGC	2	10	11999	12008	20 %	40 %	20 %	20 %	292486499
6	NC_013961	GGGGT	2	10	12421	12430	0 %	20 %	80 %	0 %	292486499
7	NC_013961	TACTG	2	10	14367	14376	20 %	40 %	20 %	20 %	292486499
8	NC_013961	CGTTT	2	10	14853	14862	0 %	60 %	20 %	20 %	292486499
9	NC_013961	CTTGC	2	10	17405	17414	0 %	40 %	20 %	40 %	292486501
10	NC_013961	CTTCT	2	10	18418	18427	0 %	60 %	0 %	40 %	292486501
11	NC_013961	CCTGC	2	10	20059	20068	0 %	20 %	20 %	60 %	292486501
12	NC_013961	TTCTG	2	10	27381	27390	0 %	60 %	20 %	20 %	292486502
13	NC_013961	GCCTT	2	10	27425	27434	0 %	40 %	20 %	40 %	292486502
14	NC_013961	CCGGG	2	10	30424	30433	0 %	0 %	60 %	40 %	292486506
15	NC_013961	GCGCC	2	10	30751	30760	0 %	0 %	40 %	60 %	292486506
16	NC_013961	GAGGG	2	10	32994	33003	20 %	0 %	80 %	0 %	292486508
17	NC_013961	GCGCT	2	10	33644	33653	0 %	20 %	40 %	40 %	292486511
18	NC_013961	TTCCG	2	10	38027	38036	0 %	40 %	20 %	40 %	292486514
19	NC_013961	CCGAT	2	10	39006	39015	20 %	20 %	20 %	40 %	292486515
20	NC_013961	CGCCA	2	10	39253	39262	20 %	0 %	20 %	60 %	292486516
21	NC_013961	CAAAC	2	10	39859	39868	60 %	0 %	0 %	40 %	292486516
22	NC_013961	ACAGC	2	10	50688	50697	40 %	0 %	20 %	40 %	292486521
23	NC_013961	GGTGA	2	10	53536	53545	20 %	20 %	60 %	0 %	292486522
24	NC_013961	TGCTG	2	10	54760	54769	0 %	40 %	40 %	20 %	292486524
25	NC_013961	GCTTT	2	10	55560	55569	0 %	60 %	20 %	20 %	292486525
26	NC_013961	AGCTG	2	10	58337	58346	20 %	20 %	40 %	20 %	292486527
27	NC_013961	CATCG	2	10	59220	59229	20 %	20 %	20 %	40 %	292486528
28	NC_013961	TTTGG	2	10	65897	65906	0 %	60 %	40 %	0 %	292486534
29	NC_013961	ACGCC	2	10	69681	69690	20 %	0 %	20 %	60 %	292486537
30	NC_013961	TGCGG	2	10	69890	69899	0 %	20 %	60 %	20 %	292486537
31	NC_013961	CGCGA	2	10	72346	72355	20 %	0 %	40 %	40 %	292486540
32	NC_013961	AGGCA	2	10	77247	77256	40 %	0 %	40 %	20 %	292486544
33	NC_013961	ACAGA	2	10	79690	79699	60 %	0 %	20 %	20 %	292486546
34	NC_013961	AAAGC	2	10	81011	81020	60 %	0 %	20 %	20 %	292486547
35	NC_013961	AAAAT	2	10	85894	85903	80 %	20 %	0 %	0 %	292486552
36	NC_013961	AAAAT	2	10	86479	86488	80 %	20 %	0 %	0 %	292486552
37	NC_013961	CCAAA	2	10	90896	90905	60 %	0 %	0 %	40 %	292486555
38	NC_013961	TTAGC	2	10	91386	91395	20 %	40 %	20 %	20 %	292486555
39	NC_013961	GAGGG	2	10	91890	91899	20 %	0 %	80 %	0 %	292486556
40	NC_013961	GCTGC	2	10	96538	96547	0 %	20 %	40 %	40 %	292486558
41	NC_013961	ATCTC	2	10	96825	96834	20 %	40 %	0 %	40 %	292486559
42	NC_013961	GCAGC	2	10	101627	101636	20 %	0 %	40 %	40 %	292486565
43	NC_013961	TGGCA	2	10	102866	102875	20 %	20 %	40 %	20 %	292486566
44	NC_013961	TAAGG	2	10	103853	103862	40 %	20 %	40 %	0 %	292486567
45	NC_013961	CAGCG	2	10	105363	105372	20 %	0 %	40 %	40 %	292486570
46	NC_013961	TTCAG	2	10	110654	110663	20 %	40 %	20 %	20 %	292486575
47	NC_013961	TAAAA	2	10	113569	113578	80 %	20 %	0 %	0 %	292486579
48	NC_013961	ACAAG	2	10	117002	117011	60 %	0 %	20 %	20 %	292486582
49	NC_013961	GGGCA	2	10	117348	117357	20 %	0 %	60 %	20 %	292486582
50	NC_013961	AGCGT	2	10	117430	117439	20 %	20 %	40 %	20 %	292486582
51	NC_013961	AGCGT	2	10	117607	117616	20 %	20 %	40 %	20 %	292486582
52	NC_013961	GCGCT	2	10	118464	118473	0 %	20 %	40 %	40 %	292486583
53	NC_013961	TCGCA	2	10	118690	118699	20 %	20 %	20 %	40 %	292486583
54	NC_013961	GGCCG	2	10	119233	119242	0 %	0 %	60 %	40 %	292486584
55	NC_013961	GGAAC	2	10	120428	120437	40 %	0 %	40 %	20 %	292486585
56	NC_013961	CGCTG	2	10	122949	122958	0 %	20 %	40 %	40 %	292486587
57	NC_013961	CTCTT	2	10	122978	122987	0 %	60 %	0 %	40 %	292486587
58	NC_013961	GCACA	2	10	124182	124191	40 %	0 %	20 %	40 %	292486589
59	NC_013961	AACAA	2	10	124346	124355	80 %	0 %	0 %	20 %	292486590
60	NC_013961	GTGCA	2	10	124775	124784	20 %	20 %	40 %	20 %	292486590
61	NC_013961	GTTTG	2	10	125110	125119	0 %	60 %	40 %	0 %	292486591
62	NC_013961	CCGCA	2	10	125441	125450	20 %	0 %	20 %	60 %	292486591
63	NC_013961	GCGCT	2	10	125488	125497	0 %	20 %	40 %	40 %	292486591
64	NC_013961	CCACG	2	10	125971	125980	20 %	0 %	20 %	60 %	292486592
65	NC_013961	GCCCG	2	10	127128	127137	0 %	0 %	40 %	60 %	292486593
66	NC_013961	TCTGC	2	10	127706	127715	0 %	40 %	20 %	40 %	292486594
67	NC_013961	TGCCC	2	10	130814	130823	0 %	20 %	20 %	60 %	292486597
68	NC_013961	GCCTG	2	10	130860	130869	0 %	20 %	40 %	40 %	292486597
69	NC_013961	AAATC	2	10	133673	133682	60 %	20 %	0 %	20 %	292486600
70	NC_013961	GGCAG	2	10	137205	137214	20 %	0 %	60 %	20 %	292486604
71	NC_013961	CGCCA	2	10	139974	139983	20 %	0 %	20 %	60 %	292486606
72	NC_013961	CCGGG	2	10	140447	140456	0 %	0 %	60 %	40 %	292486607
73	NC_013961	CGTGC	2	10	140496	140505	0 %	20 %	40 %	40 %	292486607
74	NC_013961	TCAGT	2	10	143464	143473	20 %	40 %	20 %	20 %	292486611
75	NC_013961	ACATC	2	10	143997	144006	40 %	20 %	0 %	40 %	292486612
76	NC_013961	TGGCC	2	10	144318	144327	0 %	20 %	40 %	40 %	292486612
77	NC_013961	GGGCA	2	10	145628	145637	20 %	0 %	60 %	20 %	292486614
78	NC_013961	ACTTC	2	10	146727	146736	20 %	40 %	0 %	40 %	292486615
79	NC_013961	ACGCG	2	10	146818	146827	20 %	0 %	40 %	40 %	292486615
80	NC_013961	CGTAT	2	10	149492	149501	20 %	40 %	20 %	20 %	292486618
81	NC_013961	GCTCG	2	10	149974	149983	0 %	20 %	40 %	40 %	292486619
82	NC_013961	GTTGG	2	10	152130	152139	0 %	40 %	60 %	0 %	292486621
83	NC_013961	AGCGG	2	10	154441	154450	20 %	0 %	60 %	20 %	292486623
84	NC_013961	CTGTT	2	10	154675	154684	0 %	60 %	20 %	20 %	292486623
85	NC_013961	GGCAT	2	10	155852	155861	20 %	20 %	40 %	20 %	292486623
86	NC_013961	AAGGG	2	10	155923	155932	40 %	0 %	60 %	0 %	292486623
87	NC_013961	ACGGT	2	10	161623	161632	20 %	20 %	40 %	20 %	292486627
88	NC_013961	AACCG	2	10	161675	161684	40 %	0 %	20 %	40 %	292486627
89	NC_013961	GGGGC	2	10	162063	162072	0 %	0 %	80 %	20 %	292486627
90	NC_013961	GGCAT	2	10	164734	164743	20 %	20 %	40 %	20 %	292486630
91	NC_013961	CGGCC	2	10	166746	166755	0 %	0 %	40 %	60 %	292486631
92	NC_013961	ATCAC	2	10	173552	173561	40 %	20 %	0 %	40 %	292486637
93	NC_013961	CAGAG	2	10	175583	175592	40 %	0 %	40 %	20 %	292486640
94	NC_013961	TCACG	2	10	184975	184984	20 %	20 %	20 %	40 %	292486644
95	NC_013961	CAGCG	2	10	186422	186431	20 %	0 %	40 %	40 %	292486645
96	NC_013961	CCGGC	2	10	191425	191434	0 %	0 %	40 %	60 %	292486649
97	NC_013961	CTTTG	2	10	192056	192065	0 %	60 %	20 %	20 %	292486649
98	NC_013961	TGCGG	2	10	192499	192508	0 %	20 %	60 %	20 %	292486650
99	NC_013961	TGCTG	2	10	192730	192739	0 %	40 %	40 %	20 %	292486650
100	NC_013961	GGGCA	2	10	194039	194048	20 %	0 %	60 %	20 %	292486651
101	NC_013961	GAAGT	2	10	195367	195376	40 %	20 %	40 %	0 %	292486652
102	NC_013961	ATGAA	2	10	195950	195959	60 %	20 %	20 %	0 %	292486652
103	NC_013961	CTTCT	2	10	196502	196511	0 %	60 %	0 %	40 %	292486653
104	NC_013961	AGCGG	2	10	197606	197615	20 %	0 %	60 %	20 %	292486654
105	NC_013961	CAGGC	2	10	200391	200400	20 %	0 %	40 %	40 %	292486656
106	NC_013961	TTCTG	2	10	201444	201453	0 %	60 %	20 %	20 %	292486656
107	NC_013961	CGCCC	2	10	202830	202839	0 %	0 %	20 %	80 %	292486658
108	NC_013961	TCACG	2	10	203008	203017	20 %	20 %	20 %	40 %	292486658
109	NC_013961	CGATG	2	10	203478	203487	20 %	20 %	40 %	20 %	292486658
110	NC_013961	CGAAC	2	10	206459	206468	40 %	0 %	20 %	40 %	292486661
111	NC_013961	GGGCT	2	10	207215	207224	0 %	20 %	60 %	20 %	292486662
112	NC_013961	CCGCG	2	10	208632	208641	0 %	0 %	40 %	60 %	292486663
113	NC_013961	CTGCG	2	10	211033	211042	0 %	20 %	40 %	40 %	292486665
114	NC_013961	AGGTC	2	10	211742	211751	20 %	20 %	40 %	20 %	292486666
115	NC_013961	GGCGC	2	10	212802	212811	0 %	0 %	60 %	40 %	292486667
116	NC_013961	GGCGT	2	10	215000	215009	0 %	20 %	60 %	20 %	292486669
117	NC_013961	CGCCA	2	10	216420	216429	20 %	0 %	20 %	60 %	292486670
118	NC_013961	CGGCG	2	10	216635	216644	0 %	0 %	60 %	40 %	292486670
119	NC_013961	CGCGG	2	10	219264	219273	0 %	0 %	60 %	40 %	292486672
120	NC_013961	CAACA	2	10	224110	224119	60 %	0 %	0 %	40 %	292486676
121	NC_013961	TTGGC	2	10	227642	227651	0 %	40 %	40 %	20 %	292486679
122	NC_013961	GCCGG	2	10	229373	229382	0 %	0 %	60 %	40 %	292486681
123	NC_013961	GCCGC	2	10	229736	229745	0 %	0 %	40 %	60 %	292486682
124	NC_013961	CCGTA	2	10	230798	230807	20 %	20 %	20 %	40 %	292486682
125	NC_013961	AGGCC	2	10	231313	231322	20 %	0 %	40 %	40 %	292486682
126	NC_013961	GGAAG	2	10	232641	232650	40 %	0 %	60 %	0 %	292486683
127	NC_013961	GCTGG	2	10	234506	234515	0 %	20 %	60 %	20 %	292486685
128	NC_013961	TCATC	2	10	237476	237485	20 %	40 %	0 %	40 %	292486688
129	NC_013961	GGGCG	2	10	237753	237762	0 %	0 %	80 %	20 %	292486688
130	NC_013961	CGGGC	2	10	238069	238078	0 %	0 %	60 %	40 %	292486688
131	NC_013961	CGATA	2	10	240220	240229	40 %	20 %	20 %	20 %	292486691
132	NC_013961	GGCAG	2	10	241880	241889	20 %	0 %	60 %	20 %	292486695
133	NC_013961	CAAAC	2	10	243445	243454	60 %	0 %	0 %	40 %	292486696
134	NC_013961	CGACT	2	10	244075	244084	20 %	20 %	20 %	40 %	292486696
135	NC_013961	CCGGT	2	10	244403	244412	0 %	20 %	40 %	40 %	292486696
136	NC_013961	CTTGC	2	10	247205	247214	0 %	40 %	20 %	40 %	292486699
137	NC_013961	TGAAG	2	10	252097	252106	40 %	20 %	40 %	0 %	292486703
138	NC_013961	ACTGC	2	10	253971	253980	20 %	20 %	20 %	40 %	292486706
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140	NC_013961	CGGTG	2	10	255754	255763	0 %	20 %	60 %	20 %	292486708
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149	NC_013961	GCCAA	2	10	282363	282372	40 %	0 %	20 %	40 %	292486727
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152	NC_013961	TGACC	2	10	288147	288156	20 %	20 %	20 %	40 %	292486728
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155	NC_013961	GTTCG	2	10	292065	292074	0 %	40 %	40 %	20 %	292486731
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166	NC_013961	TGACG	2	10	325875	325884	20 %	20 %	40 %	20 %	292486760
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172	NC_013961	GCGCC	2	10	332603	332612	0 %	0 %	40 %	60 %	292486768
173	NC_013961	TGCGC	2	10	333159	333168	0 %	20 %	40 %	40 %	292486769
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247	NC_013961	GTCCA	2	10	512031	512040	20 %	20 %	20 %	40 %	292486933
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249	NC_013961	TCGGG	2	10	513264	513273	0 %	20 %	60 %	20 %	292486933
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251	NC_013961	GCAAG	2	10	514715	514724	40 %	0 %	40 %	20 %	292486934
252	NC_013961	GTATG	2	10	516113	516122	20 %	40 %	40 %	0 %	292486934
253	NC_013961	CCATT	2	10	516240	516249	20 %	40 %	0 %	40 %	292486934
254	NC_013961	ATGCA	2	10	516447	516456	40 %	20 %	20 %	20 %	292486934
255	NC_013961	GGGTT	2	10	520201	520210	0 %	40 %	60 %	0 %	292486935
256	NC_013961	TCAGC	2	10	522451	522460	20 %	20 %	20 %	40 %	292486936
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258	NC_013961	AATGA	2	10	524811	524820	60 %	20 %	20 %	0 %	292486936
259	NC_013961	GCCTG	2	10	524992	525001	0 %	20 %	40 %	40 %	292486936
260	NC_013961	TCAAC	2	10	527134	527143	40 %	20 %	0 %	40 %	292486937
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