MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Erwinia amylovora CFBP1430 chromosome

Total Repeats: 50585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013961	CGG	2	6	67	72	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292486493
2	NC_013961	CAG	2	6	146	151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486493
3	NC_013961	GCT	2	6	241	246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486493
4	NC_013961	TGT	2	6	277	282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292486493
5	NC_013961	GTG	3	9	369	377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292486493
6	NC_013961	GCT	2	6	397	402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486493
7	NC_013961	GAT	2	6	409	414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292486493
8	NC_013961	TAA	2	6	839	844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292486494
9	NC_013961	GGT	2	6	861	866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292486494
10	NC_013961	CCA	2	6	878	883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292486494
11	NC_013961	CTT	2	6	884	889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292486494
12	NC_013961	GCT	2	6	893	898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486494
13	NC_013961	GCA	2	6	913	918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486494
14	NC_013961	GAT	2	6	942	947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292486494
15	NC_013961	AGC	2	6	956	961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486494
16	NC_013961	CGT	2	6	965	970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486494
17	NC_013961	TGA	2	6	1010	1015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292486494
18	NC_013961	CGG	2	6	1394	1399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292486495
19	NC_013961	CAG	2	6	1401	1406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486495
20	NC_013961	GCC	2	6	1455	1460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292486495
21	NC_013961	GAA	2	6	1507	1512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292486495
22	NC_013961	CGC	2	6	1523	1528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292486495
23	NC_013961	AGT	2	6	1808	1813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292486495
24	NC_013961	ACC	2	6	1822	1827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292486495
25	NC_013961	TGC	2	6	2041	2046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486495
26	NC_013961	GAA	2	6	2076	2081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292486495
27	NC_013961	GCC	2	6	2142	2147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292486495
28	NC_013961	GTC	2	6	2190	2195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486495
29	NC_013961	GTG	2	6	2239	2244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292486495
30	NC_013961	CCG	2	6	2408	2413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292486495
31	NC_013961	TCC	2	6	2437	2442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292486495
32	NC_013961	GCC	2	6	2464	2469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292486495
33	NC_013961	CTT	2	6	2513	2518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292486495
34	NC_013961	CAG	2	6	2523	2528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486495
35	NC_013961	GCT	2	6	2549	2554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486495
36	NC_013961	TGA	2	6	2556	2561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292486495
37	NC_013961	TCA	2	6	2617	2622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292486495
38	NC_013961	CCA	2	6	2625	2630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292486495
39	NC_013961	CGG	2	6	2651	2656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292486495
40	NC_013961	ATC	2	6	2760	2765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292486495
41	NC_013961	TGT	2	6	2810	2815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292486495
42	NC_013961	CTG	2	6	3003	3008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486495
43	NC_013961	TCG	2	6	3131	3136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486495
44	NC_013961	TCA	2	6	3148	3153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292486495
45	NC_013961	GCC	2	6	3171	3176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292486495
46	NC_013961	TGA	2	6	3191	3196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292486495
47	NC_013961	ATA	2	6	3216	3221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292486495
48	NC_013961	TCG	2	6	3271	3276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486495
49	NC_013961	TGT	2	6	3349	3354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292486495
50	NC_013961	TGG	2	6	3406	3411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292486495
51	NC_013961	TGT	2	6	3412	3417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292486495
52	NC_013961	ATG	2	6	3426	3431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292486495
53	NC_013961	GCG	2	6	3522	3527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292486496
54	NC_013961	GCT	2	6	3629	3634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486496
55	NC_013961	ACC	2	6	3709	3714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292486496
56	NC_013961	TGA	2	6	3865	3870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292486496
57	NC_013961	AGC	2	6	3887	3892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486496
58	NC_013961	CAG	2	6	3918	3923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486496
59	NC_013961	TGG	2	6	4027	4032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292486496
60	NC_013961	CAG	2	6	4089	4094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486496
61	NC_013961	CCA	2	6	4103	4108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292486496
62	NC_013961	GCC	2	6	4109	4114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292486496
63	NC_013961	CGG	2	6	4161	4166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292486496
64	NC_013961	CAG	2	6	4167	4172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486496
65	NC_013961	ATC	2	6	4182	4187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292486496
66	NC_013961	ATC	2	6	4266	4271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292486496
67	NC_013961	CAG	2	6	4323	4328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486496
68	NC_013961	CGC	2	6	4422	4427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292486496
69	NC_013961	CAG	2	6	4497	4502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486496
70	NC_013961	GCT	2	6	4511	4516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486496
71	NC_013961	AGC	2	6	4522	4527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486496
72	NC_013961	TGC	2	6	4591	4596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486496
73	NC_013961	GTT	2	6	4664	4669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292486496
74	NC_013961	CAG	2	6	4683	4688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486496
75	NC_013961	CTG	2	6	4734	4739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486496
76	NC_013961	GCG	2	6	4766	4771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292486496
77	NC_013961	TTG	2	6	4791	4796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292486496
78	NC_013961	CAG	2	6	4890	4895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486496
79	NC_013961	TAA	2	6	4898	4903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292486496
80	NC_013961	CCA	2	6	4913	4918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292486496
81	NC_013961	CTG	2	6	5000	5005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486497
82	NC_013961	TTC	2	6	5012	5017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292486497
83	NC_013961	TCG	2	6	5127	5132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486497
84	NC_013961	CTG	2	6	5141	5146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486497
85	NC_013961	GTC	2	6	5213	5218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486497
86	NC_013961	CGG	2	6	5383	5388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292486497
87	NC_013961	GCC	2	6	5432	5437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292486497
88	NC_013961	TGC	4	12	5472	5483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486497
89	NC_013961	GGC	2	6	5491	5496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292486497
90	NC_013961	TTG	2	6	5507	5512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292486497
91	NC_013961	GCT	2	6	5530	5535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486497
92	NC_013961	AGC	2	6	5580	5585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486497
93	NC_013961	CAG	2	6	5621	5626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486497
94	NC_013961	GCA	2	6	5755	5760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486497
95	NC_013961	CTG	2	6	5819	5824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486497
96	NC_013961	CTC	2	6	5828	5833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292486497
97	NC_013961	CTG	2	6	5879	5884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486497
98	NC_013961	CAG	2	6	6011	6016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486497
99	NC_013961	CGC	2	6	6057	6062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292486497
100	NC_013961	AGC	2	6	6078	6083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486497
101	NC_013961	TCA	2	6	6117	6122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292486497
102	NC_013961	TCA	2	6	6241	6246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292486497
103	NC_013961	CGG	2	6	6317	6322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292486497
104	NC_013961	CAG	2	6	6359	6364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486497
105	NC_013961	ATG	2	6	6380	6385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292486497
106	NC_013961	GCT	2	6	6891	6896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486498
107	NC_013961	GGC	2	6	7042	7047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292486498
108	NC_013961	TCT	2	6	7052	7057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292486498
109	NC_013961	GGT	2	6	7065	7070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292486498
110	NC_013961	CGG	2	6	7079	7084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292486498
111	NC_013961	CTG	2	6	7174	7179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486498
112	NC_013961	TGC	2	6	7235	7240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486498
113	NC_013961	GGC	2	6	7257	7262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292486498
114	NC_013961	TGT	2	6	7461	7466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292486498
115	NC_013961	GCT	3	9	7509	7517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486498
116	NC_013961	TCT	2	6	7640	7645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292486498
117	NC_013961	GCC	2	6	7680	7685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292486498
118	NC_013961	GCT	2	6	7749	7754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486498
119	NC_013961	GGT	2	6	7764	7769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292486498
120	NC_013961	GGC	2	6	7806	7811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292486498
121	NC_013961	GCA	2	6	7862	7867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486498
122	NC_013961	TGT	2	6	7949	7954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292486498
123	NC_013961	GTG	2	6	7963	7968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292486498
124	NC_013961	CGG	2	6	7980	7985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292486498
125	NC_013961	ACC	2	6	8029	8034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292486498
126	NC_013961	CTG	2	6	8056	8061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486498
127	NC_013961	GAT	2	6	8097	8102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292486498
128	NC_013961	CGC	2	6	8120	8125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292486498
129	NC_013961	CCG	2	6	8144	8149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292486498
130	NC_013961	GTG	2	6	8230	8235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292486498
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134	NC_013961	GAA	2	6	8362	8367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292486498
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252	NC_013961	TCT	2	6	19071	19076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292486501
253	NC_013961	GAT	2	6	19139	19144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292486501
254	NC_013961	TTA	2	6	19206	19211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292486501
255	NC_013961	ATT	2	6	19424	19429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292486501
256	NC_013961	ATC	2	6	19550	19555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292486501
257	NC_013961	TCC	2	6	19583	19588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292486501
258	NC_013961	ACC	2	6	19624	19629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292486501
259	NC_013961	TGA	2	6	19651	19656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292486501
260	NC_013961	TAA	2	6	19678	19683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292486501
261	NC_013961	AAC	2	6	19739	19744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292486501
262	NC_013961	CTG	2	6	19878	19883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486501
263	NC_013961	TCC	2	6	19892	19897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292486501
264	NC_013961	TCA	2	6	19962	19967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292486501
265	NC_013961	TGT	2	6	20026	20031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292486501
266	NC_013961	AAT	2	6	20161	20166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292486501
267	NC_013961	CGT	2	6	20243	20248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486501
268	NC_013961	TGT	2	6	20341	20346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292486501
269	NC_013961	CAC	2	6	20365	20370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292486501
270	NC_013961	CCG	2	6	20490	20495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292486501
271	NC_013961	TTC	2	6	20652	20657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292486501
272	NC_013961	TAT	2	6	20708	20713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292486501
273	NC_013961	TGG	2	6	20749	20754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292486501
274	NC_013961	AAG	2	6	20786	20791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292486501
275	NC_013961	CTC	2	6	20858	20863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292486501
276	NC_013961	GCT	2	6	20882	20887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486501
277	NC_013961	GCC	2	6	21028	21033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292486501
278	NC_013961	GCC	2	6	21169	21174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292486501
279	NC_013961	TGC	2	6	21279	21284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486501
280	NC_013961	TAC	2	6	21292	21297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292486501
281	NC_013961	CAC	2	6	21350	21355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292486501
282	NC_013961	TTA	2	6	21480	21485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292486501
283	NC_013961	GTG	2	6	21501	21506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292486501
284	NC_013961	TGC	2	6	21554	21559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486501
285	NC_013961	GTG	2	6	21565	21570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292486501
286	NC_013961	TAA	2	6	21884	21889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292486502
287	NC_013961	AAT	2	6	22062	22067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292486502
288	NC_013961	ATG	2	6	22228	22233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292486502
289	NC_013961	ATA	2	6	22240	22245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292486502
290	NC_013961	TCA	2	6	22331	22336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292486502
291	NC_013961	AAT	2	6	22413	22418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292486502
292	NC_013961	GTC	2	6	22501	22506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486502
293	NC_013961	GTA	2	6	22591	22596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292486502
294	NC_013961	AAT	2	6	22770	22775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292486502
295	NC_013961	CTT	2	6	22872	22877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292486502
296	NC_013961	CAT	2	6	22944	22949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292486502
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298	NC_013961	AAT	2	6	23121	23126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292486502
299	NC_013961	AAT	2	6	23478	23483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292486502
300	NC_013961	ATC	2	6	23506	23511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292486502
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302	NC_013961	TGA	2	6	23564	23569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292486502
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305	NC_013961	TCT	2	6	23825	23830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292486502
306	NC_013961	AAT	2	6	23835	23840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292486502
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324	NC_013961	TAT	2	6	25345	25350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292486502
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328	NC_013961	AGC	2	6	25979	25984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486502
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332	NC_013961	ATT	2	6	26059	26064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292486502
333	NC_013961	ATA	2	6	26099	26104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292486502
334	NC_013961	ACC	2	6	26147	26152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292486502
335	NC_013961	TAA	2	6	26170	26175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292486502
336	NC_013961	GCT	2	6	26242	26247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486502
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341	NC_013961	GAG	2	6	26675	26680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292486502
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345	NC_013961	TCA	2	6	26835	26840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292486502
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347	NC_013961	CAA	2	6	26850	26855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292486502
348	NC_013961	ATG	2	6	26870	26875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292486502
349	NC_013961	TAT	2	6	26925	26930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292486502
350	NC_013961	CTC	2	6	26950	26955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292486502
351	NC_013961	TGA	2	6	27116	27121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292486502
352	NC_013961	TGA	2	6	27214	27219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292486502
353	NC_013961	TCG	2	6	27280	27285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486502
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362	NC_013961	GCG	2	6	28058	28063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292486503
363	NC_013961	TTG	2	6	28067	28072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292486503
364	NC_013961	CAG	2	6	28085	28090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486503
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366	NC_013961	GGC	2	6	28381	28386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292486503
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369	NC_013961	GCC	2	6	28452	28457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292486504
370	NC_013961	GAT	2	6	28589	28594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292486504
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372	NC_013961	GTC	2	6	28705	28710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486504
373	NC_013961	CAG	2	6	28758	28763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486504
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