MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Nitrosococcus halophilus Nc4 chromosome

Total Repeats: 6470

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013960	AGA	2	6	42	47	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013960	TCC	2	6	61	66	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_013960	AAT	2	6	114	119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013960	GTT	2	6	1641	1646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013960	CCA	2	6	1682	1687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_013960	ATA	2	6	1720	1725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013960	ATA	2	6	1809	1814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013960	AAC	2	6	4149	4154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013960	ATT	2	6	6604	6609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013960	GAT	2	6	8082	8087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013960	TAA	2	6	10835	10840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013960	ATT	2	6	10842	10847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013960	CTT	2	6	12123	12128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_013960	TTG	2	6	12258	12263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013960	GGT	2	6	12284	12289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013960	TCT	2	6	14389	14394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013960	ATC	2	6	15420	15425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013960	TAT	2	6	15718	15723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013960	CAT	2	6	16615	16620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_013960	CTG	2	6	16671	16676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_013960	TCC	2	6	19259	19264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_013960	TCT	2	6	23392	23397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_013960	AGA	2	6	23427	23432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013960	TCT	2	6	25767	25772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_013960	CCT	2	6	26365	26370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_013960	TCA	2	6	27974	27979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_013960	ATA	2	6	27986	27991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013960	CTG	2	6	28040	28045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_013960	AAT	2	6	28217	28222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013960	GTT	2	6	29873	29878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013960	ATG	2	6	29933	29938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013960	GAG	2	6	30156	30161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013960	TGC	2	6	30183	30188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_013960	GTT	2	6	30195	30200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013960	GGC	2	6	30413	30418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_013960	TGA	2	6	30433	30438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013960	AGG	2	6	31667	31672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013960	CAA	2	6	36390	36395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_013960	GTA	2	6	36396	36401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013960	AGG	2	6	38098	38103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013960	GGT	2	6	40965	40970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013960	TTA	2	6	42862	42867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013960	CTG	2	6	42931	42936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_013960	CCA	2	6	42940	42945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_013960	GTG	2	6	43045	43050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013960	TCC	2	6	43145	43150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_013960	GAA	2	6	43162	43167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013960	TAA	2	6	43309	43314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013960	TAA	2	6	43323	43328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013960	AAT	2	6	43346	43351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013960	ATT	2	6	43414	43419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013960	TTG	2	6	43544	43549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013960	TTG	2	6	44057	44062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013960	TCC	2	6	44117	44122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_013960	TTA	2	6	44378	44383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013960	TTA	2	6	44482	44487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013960	GGC	2	6	44547	44552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_013960	ATT	2	6	44655	44660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013960	GAT	2	6	44696	44701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013960	GAA	2	6	44768	44773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013960	GAG	2	6	44870	44875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013960	AGA	2	6	44971	44976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013960	GAG	2	6	45111	45116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013960	TGT	2	6	46093	46098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013960	CTT	2	6	46187	46192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_013960	ACC	2	6	46218	46223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_013960	ACC	2	6	48127	48132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_013960	TAA	2	6	48178	48183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013960	GCC	2	6	48343	48348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_013960	TAA	2	6	48430	48435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013960	TAA	2	6	49904	49909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013960	ATT	2	6	51547	51552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013960	GCT	2	6	51601	51606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_013960	AAT	2	6	51703	51708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013960	TAG	2	6	51781	51786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013960	ATG	2	6	51845	51850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013960	AAT	3	9	51870	51878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013960	ATT	2	6	51962	51967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013960	TGG	2	6	52587	52592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013960	TAA	2	6	52628	52633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013960	ATA	2	6	54049	54054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013960	AAT	2	6	54361	54366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013960	CTG	2	6	58418	58423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_013960	AAT	2	6	58730	58735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013960	CTG	2	6	58895	58900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_013960	TCT	2	6	59735	59740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_013960	CTG	2	6	60493	60498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_013960	CAG	2	6	60514	60519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_013960	ACC	2	6	60654	60659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_013960	AAT	2	6	60891	60896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013960	GTT	2	6	61008	61013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013960	AGG	2	6	61968	61973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013960	ATG	2	6	62029	62034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013960	GTT	2	6	63661	63666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013960	TTA	2	6	64425	64430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013960	GGA	2	6	64447	64452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013960	TGC	2	6	65332	65337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_013960	TTA	2	6	65365	65370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013960	TAA	2	6	65395	65400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013960	TAG	2	6	65696	65701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013960	CTC	2	6	69252	69257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_013960	ATA	2	6	69281	69286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013960	ATT	2	6	70979	70984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013960	TGC	2	6	75597	75602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_013960	GAA	2	6	75631	75636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013960	CTG	2	6	76119	76124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_013960	TTG	2	6	76126	76131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013960	TCA	2	6	76186	76191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_013960	TCC	2	6	76813	76818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_013960	TGC	2	6	76921	76926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_013960	TCT	2	6	76929	76934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_013960	CTT	2	6	76938	76943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_013960	GTT	2	6	77011	77016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013960	CAT	2	6	77017	77022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_013960	AAC	2	6	77110	77115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_013960	ACC	2	6	77174	77179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_013960	CAG	2	6	77221	77226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_013960	GCA	2	6	77284	77289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_013960	CCA	2	6	77318	77323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_013960	ATC	2	6	77372	77377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_013960	CGG	2	6	77379	77384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_013960	CAG	2	6	77413	77418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_013960	GCC	3	9	77609	77617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_013960	GGT	2	6	77731	77736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013960	TTG	2	6	77762	77767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013960	CCA	2	6	77796	77801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_013960	GCT	2	6	77861	77866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_013960	GTT	2	6	77989	77994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013960	GCT	2	6	78078	78083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_013960	GTG	2	6	78145	78150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013960	CCG	2	6	78205	78210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_013960	ATG	2	6	78310	78315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013960	GCG	2	6	78374	78379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_013960	ATT	2	6	78383	78388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013960	ATT	2	6	78395	78400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013960	ATT	2	6	78412	78417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013960	GCG	2	6	78515	78520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_013960	TAG	2	6	78540	78545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013960	TAA	2	6	78578	78583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013960	GAA	2	6	78633	78638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013960	CGA	2	6	83148	83153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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