MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Nitrosococcus halophilus Nc4 chromosome

Total Repeats: 3590

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013960	CT	3	6	692	697	0 %	50 %	0 %	50 %	292490171
2	NC_013960	TC	4	8	3645	3652	0 %	50 %	0 %	50 %	292490173
3	NC_013960	AG	3	6	3660	3665	50 %	0 %	50 %	0 %	292490173
4	NC_013960	AT	3	6	5055	5060	50 %	50 %	0 %	0 %	292490174
5	NC_013960	TC	3	6	5136	5141	0 %	50 %	0 %	50 %	292490174
6	NC_013960	AG	3	6	5335	5340	50 %	0 %	50 %	0 %	292490174
7	NC_013960	AG	3	6	5783	5788	50 %	0 %	50 %	0 %	292490174
8	NC_013960	GA	3	6	6398	6403	50 %	0 %	50 %	0 %	292490174
9	NC_013960	TA	3	6	6962	6967	50 %	50 %	0 %	0 %	292490175
10	NC_013960	GA	3	6	8152	8157	50 %	0 %	50 %	0 %	292490176
11	NC_013960	CT	3	6	8372	8377	0 %	50 %	0 %	50 %	292490176
12	NC_013960	GT	3	6	8480	8485	0 %	50 %	50 %	0 %	292490176
13	NC_013960	CT	3	6	8742	8747	0 %	50 %	0 %	50 %	292490176
14	NC_013960	GT	3	6	9713	9718	0 %	50 %	50 %	0 %	292490177
15	NC_013960	GC	3	6	10789	10794	0 %	0 %	50 %	50 %	292490178
16	NC_013960	TG	3	6	12759	12764	0 %	50 %	50 %	0 %	292490180
17	NC_013960	CT	3	6	14196	14201	0 %	50 %	0 %	50 %	292490180
18	NC_013960	AG	3	6	16508	16513	50 %	0 %	50 %	0 %	292490182
19	NC_013960	GA	3	6	16760	16765	50 %	0 %	50 %	0 %	292490183
20	NC_013960	GC	3	6	16807	16812	0 %	0 %	50 %	50 %	292490183
21	NC_013960	GC	3	6	18097	18102	0 %	0 %	50 %	50 %	292490184
22	NC_013960	AG	3	6	20054	20059	50 %	0 %	50 %	0 %	292490185
23	NC_013960	TC	3	6	21772	21777	0 %	50 %	0 %	50 %	292490188
24	NC_013960	CA	3	6	22823	22828	50 %	0 %	0 %	50 %	292490188
25	NC_013960	CG	3	6	23204	23209	0 %	0 %	50 %	50 %	292490188
26	NC_013960	AG	3	6	23384	23389	50 %	0 %	50 %	0 %	292490188
27	NC_013960	GA	3	6	24472	24477	50 %	0 %	50 %	0 %	292490189
28	NC_013960	GA	3	6	25531	25536	50 %	0 %	50 %	0 %	292490189
29	NC_013960	TG	3	6	28642	28647	0 %	50 %	50 %	0 %	292490192
30	NC_013960	AG	3	6	29318	29323	50 %	0 %	50 %	0 %	292490192
31	NC_013960	AG	3	6	31321	31326	50 %	0 %	50 %	0 %	292490193
32	NC_013960	AT	3	6	31792	31797	50 %	50 %	0 %	0 %	292490195
33	NC_013960	AG	3	6	32953	32958	50 %	0 %	50 %	0 %	292490196
34	NC_013960	GC	3	6	33503	33508	0 %	0 %	50 %	50 %	292490197
35	NC_013960	TC	3	6	33571	33576	0 %	50 %	0 %	50 %	292490197
36	NC_013960	GA	3	6	35162	35167	50 %	0 %	50 %	0 %	292490198
37	NC_013960	AG	3	6	35180	35185	50 %	0 %	50 %	0 %	292490198
38	NC_013960	CG	3	6	36146	36151	0 %	0 %	50 %	50 %	292490200
39	NC_013960	TC	4	8	36906	36913	0 %	50 %	0 %	50 %	292490201
40	NC_013960	GA	3	6	37102	37107	50 %	0 %	50 %	0 %	292490202
41	NC_013960	GA	3	6	37734	37739	50 %	0 %	50 %	0 %	292490202
42	NC_013960	GC	3	6	38540	38545	0 %	0 %	50 %	50 %	292490203
43	NC_013960	GA	3	6	38546	38551	50 %	0 %	50 %	0 %	292490203
44	NC_013960	GC	3	6	38642	38647	0 %	0 %	50 %	50 %	292490204
45	NC_013960	GA	3	6	43609	43614	50 %	0 %	50 %	0 %	292490207
46	NC_013960	AG	4	8	44158	44165	50 %	0 %	50 %	0 %	292490208
47	NC_013960	AG	3	6	45138	45143	50 %	0 %	50 %	0 %	292490209
48	NC_013960	AG	3	6	45159	45164	50 %	0 %	50 %	0 %	292490209
49	NC_013960	AT	3	6	45470	45475	50 %	50 %	0 %	0 %	292490209
50	NC_013960	AG	3	6	45499	45504	50 %	0 %	50 %	0 %	292490209
51	NC_013960	TA	3	6	45755	45760	50 %	50 %	0 %	0 %	292490210
52	NC_013960	AT	3	6	45762	45767	50 %	50 %	0 %	0 %	292490210
53	NC_013960	CT	3	6	46001	46006	0 %	50 %	0 %	50 %	292490210
54	NC_013960	CT	3	6	46415	46420	0 %	50 %	0 %	50 %	292490211
55	NC_013960	TC	3	6	47210	47215	0 %	50 %	0 %	50 %	292490211
56	NC_013960	TC	3	6	47499	47504	0 %	50 %	0 %	50 %	292490211
57	NC_013960	CG	3	6	48809	48814	0 %	0 %	50 %	50 %	292490212
58	NC_013960	AG	4	8	51049	51056	50 %	0 %	50 %	0 %	292490213
59	NC_013960	AG	3	6	53484	53489	50 %	0 %	50 %	0 %	292490216
60	NC_013960	CT	3	6	55152	55157	0 %	50 %	0 %	50 %	292490221
61	NC_013960	AG	3	6	56325	56330	50 %	0 %	50 %	0 %	292490223
62	NC_013960	CG	3	6	56609	56614	0 %	0 %	50 %	50 %	292490223
63	NC_013960	GC	3	6	62112	62117	0 %	0 %	50 %	50 %	292490231
64	NC_013960	GA	3	6	63825	63830	50 %	0 %	50 %	0 %	292490232
65	NC_013960	CT	3	6	64045	64050	0 %	50 %	0 %	50 %	292490232
66	NC_013960	AT	3	6	64586	64591	50 %	50 %	0 %	0 %	292490233
67	NC_013960	GC	3	6	65596	65601	0 %	0 %	50 %	50 %	292490234
68	NC_013960	AG	3	6	66017	66022	50 %	0 %	50 %	0 %	292490235
69	NC_013960	CT	3	6	67025	67030	0 %	50 %	0 %	50 %	292490236
70	NC_013960	GT	3	6	67156	67161	0 %	50 %	50 %	0 %	292490236
71	NC_013960	AG	3	6	67591	67596	50 %	0 %	50 %	0 %	292490237
72	NC_013960	GC	3	6	68725	68730	0 %	0 %	50 %	50 %	292490238
73	NC_013960	AG	3	6	69640	69645	50 %	0 %	50 %	0 %	292490239
74	NC_013960	GT	3	6	72109	72114	0 %	50 %	50 %	0 %	292490241
75	NC_013960	TG	3	6	73825	73830	0 %	50 %	50 %	0 %	292490243
76	NC_013960	GC	3	6	75762	75767	0 %	0 %	50 %	50 %	292490246
77	NC_013960	TG	3	6	75889	75894	0 %	50 %	50 %	0 %	292490246
78	NC_013960	TG	3	6	75908	75913	0 %	50 %	50 %	0 %	292490246
79	NC_013960	CG	3	6	75987	75992	0 %	0 %	50 %	50 %	292490246
80	NC_013960	CG	3	6	80001	80006	0 %	0 %	50 %	50 %	292490248
81	NC_013960	CA	3	6	80590	80595	50 %	0 %	0 %	50 %	292490249
82	NC_013960	AT	3	6	81454	81459	50 %	50 %	0 %	0 %	292490249
83	NC_013960	GA	3	6	82050	82055	50 %	0 %	50 %	0 %	292490249
84	NC_013960	GC	3	6	82434	82439	0 %	0 %	50 %	50 %	292490250
85	NC_013960	CT	3	6	82674	82679	0 %	50 %	0 %	50 %	292490250
86	NC_013960	AG	3	6	82857	82862	50 %	0 %	50 %	0 %	292490250
87	NC_013960	AG	3	6	83040	83045	50 %	0 %	50 %	0 %	292490250
88	NC_013960	TA	3	6	83811	83816	50 %	50 %	0 %	0 %	292490251
89	NC_013960	CT	3	6	84627	84632	0 %	50 %	0 %	50 %	292490251
90	NC_013960	GT	4	8	85641	85648	0 %	50 %	50 %	0 %	292490252
91	NC_013960	CG	3	6	86641	86646	0 %	0 %	50 %	50 %	292490253
92	NC_013960	CG	3	6	86853	86858	0 %	0 %	50 %	50 %	292490253
93	NC_013960	TC	3	6	86956	86961	0 %	50 %	0 %	50 %	292490253
94	NC_013960	AG	3	6	87214	87219	50 %	0 %	50 %	0 %	292490253
95	NC_013960	GA	3	6	88949	88954	50 %	0 %	50 %	0 %	292490253
96	NC_013960	TC	3	6	89918	89923	0 %	50 %	0 %	50 %	292490254
97	NC_013960	GC	3	6	90713	90718	0 %	0 %	50 %	50 %	292490254
98	NC_013960	CG	3	6	91052	91057	0 %	0 %	50 %	50 %	292490255
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101	NC_013960	TA	3	6	92241	92246	50 %	50 %	0 %	0 %	292490256
102	NC_013960	CG	3	6	92786	92791	0 %	0 %	50 %	50 %	292490256
103	NC_013960	GA	3	6	93918	93923	50 %	0 %	50 %	0 %	292490256
104	NC_013960	CG	4	8	95145	95152	0 %	0 %	50 %	50 %	292490257
105	NC_013960	GC	3	6	97741	97746	0 %	0 %	50 %	50 %	292490259
106	NC_013960	CT	3	6	101138	101143	0 %	50 %	0 %	50 %	292490260
107	NC_013960	TC	3	6	102237	102242	0 %	50 %	0 %	50 %	292490261
108	NC_013960	CT	3	6	102710	102715	0 %	50 %	0 %	50 %	292490261
109	NC_013960	GC	3	6	102798	102803	0 %	0 %	50 %	50 %	292490261
110	NC_013960	GC	3	6	103686	103691	0 %	0 %	50 %	50 %	292490262
111	NC_013960	GC	3	6	104589	104594	0 %	0 %	50 %	50 %	292490262
112	NC_013960	GT	3	6	105677	105682	0 %	50 %	50 %	0 %	292490263
113	NC_013960	AT	3	6	106740	106745	50 %	50 %	0 %	0 %	292490264
114	NC_013960	GC	3	6	108294	108299	0 %	0 %	50 %	50 %	292490265
115	NC_013960	AT	3	6	109716	109721	50 %	50 %	0 %	0 %	292490267
116	NC_013960	GC	3	6	110218	110223	0 %	0 %	50 %	50 %	292490267
117	NC_013960	TC	3	6	111184	111189	0 %	50 %	0 %	50 %	292490267
118	NC_013960	TG	3	6	111347	111352	0 %	50 %	50 %	0 %	292490267
119	NC_013960	TG	3	6	111460	111465	0 %	50 %	50 %	0 %	292490267
120	NC_013960	CT	3	6	114964	114969	0 %	50 %	0 %	50 %	292490270
121	NC_013960	GA	3	6	116636	116641	50 %	0 %	50 %	0 %	292490271
122	NC_013960	AC	3	6	117069	117074	50 %	0 %	0 %	50 %	292490272
123	NC_013960	CG	3	6	118229	118234	0 %	0 %	50 %	50 %	292490272
124	NC_013960	AG	3	6	121320	121325	50 %	0 %	50 %	0 %	292490275
125	NC_013960	GA	3	6	121704	121709	50 %	0 %	50 %	0 %	292490276
126	NC_013960	AT	3	6	123285	123290	50 %	50 %	0 %	0 %	292490277
127	NC_013960	AC	3	6	123330	123335	50 %	0 %	0 %	50 %	292490277
128	NC_013960	GA	3	6	125785	125790	50 %	0 %	50 %	0 %	292490280
129	NC_013960	AG	3	6	128008	128013	50 %	0 %	50 %	0 %	292490282
130	NC_013960	TC	3	6	128133	128138	0 %	50 %	0 %	50 %	292490282
131	NC_013960	TA	3	6	132612	132617	50 %	50 %	0 %	0 %	292490289
132	NC_013960	CA	3	6	133367	133372	50 %	0 %	0 %	50 %	292490290
133	NC_013960	AG	3	6	133419	133424	50 %	0 %	50 %	0 %	292490290
134	NC_013960	CT	3	6	133969	133974	0 %	50 %	0 %	50 %	292490292
135	NC_013960	AC	3	6	134372	134377	50 %	0 %	0 %	50 %	292490293
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139	NC_013960	GA	3	6	145388	145393	50 %	0 %	50 %	0 %	292490298
140	NC_013960	GA	3	6	146028	146033	50 %	0 %	50 %	0 %	292490299
141	NC_013960	GC	3	6	146085	146090	0 %	0 %	50 %	50 %	292490299
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