MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Sideroxydans lithotrophicus ES-1 chromosome

Total Repeats: 70

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013959	GACAAT	2	12	5302	5313	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_013959	AGAGGG	2	12	48871	48882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013959	CCCTCC	2	12	299140	299151	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
4	NC_013959	AGGGGG	2	12	299152	299163	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013959	GGTGTT	2	12	374600	374611	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013959	GATCAT	2	12	390115	390126	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_013959	AATTGG	2	12	396898	396909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013959	AAAACC	2	12	433627	433638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013959	AGAGGG	2	12	435083	435094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013959	CAAAAA	2	12	504750	504761	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_013959	TTGGAT	2	12	598126	598137	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013959	TCATTT	2	12	675107	675118	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_013959	TCAGCC	2	12	792564	792575	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
14	NC_013959	TGTCCT	2	12	828920	828931	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_013959	CTGCGG	2	12	829141	829152	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_013959	TGCCGA	2	12	829844	829855	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013959	CCAGCA	2	12	830234	830245	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
18	NC_013959	CGCCAG	2	12	830328	830339	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
19	NC_013959	GGGCGT	2	12	941866	941877	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_013959	GAATAA	2	12	1002304	1002315	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013959	CAACTA	2	12	1088302	1088313	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_013959	CACTTA	2	12	1093555	1093566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_013959	CAGATA	2	12	1111554	1111565	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_013959	ATAGCG	2	12	1121247	1121258	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_013959	GTCTGC	2	12	1121265	1121276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_013959	GAAAGT	2	12	1121605	1121616	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013959	ATAAAA	2	12	1208496	1208507	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013959	TGTTAT	2	12	1222577	1222588	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013959	AAATGA	2	12	1240965	1240976	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013959	TTTTTG	2	12	1244253	1244264	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013959	CAGCCA	2	12	1254907	1254918	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
32	NC_013959	TCGCTG	2	12	1287043	1287054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_013959	GAATCT	2	12	1329566	1329577	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_013959	CTGGCG	2	12	1384903	1384914	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_013959	TGTTTA	2	12	1435125	1435136	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013959	CTATTG	2	12	1498593	1498604	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_013959	TCGGAA	2	12	1507621	1507632	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_013959	CCGGAA	2	12	1532777	1532788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_013959	TTTCAT	2	12	1562959	1562970	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_013959	CCATAC	2	12	1575875	1575886	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_013959	CAATTG	2	12	1575892	1575903	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_013959	ATGGGT	2	12	1576691	1576702	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013959	GCTATG	2	12	1649493	1649504	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_013959	CTACAC	2	12	1871272	1871283	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_013959	ATGCAA	2	12	1895126	1895137	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_013959	TTCTCT	2	12	1940848	1940859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_013959	GAAAAA	2	12	1944128	1944139	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013959	CGACAA	2	12	2001764	2001775	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013959	CCTTGC	2	12	2025788	2025799	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
50	NC_013959	CTCCAT	2	12	2025943	2025954	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_013959	CGCACA	2	12	2034344	2034355	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
52	NC_013959	ATGCAA	2	12	2036794	2036805	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_013959	CATTGC	2	12	2183362	2183373	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_013959	TTCGGA	2	12	2209636	2209647	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_013959	GCAAAA	2	12	2211688	2211699	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_013959	CCCTCT	2	12	2215157	2215168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_013959	CCGAAT	2	12	2307393	2307404	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_013959	CTCTGT	2	12	2318856	2318867	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_013959	AACTAC	2	12	2330891	2330902	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_013959	ATAACT	2	12	2375491	2375502	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_013959	AAGCTA	2	12	2384683	2384694	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_013959	CCAGCC	2	12	2430628	2430639	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_013959	ACCCTA	2	12	2469201	2469212	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_013959	CTAAAA	2	12	2483816	2483827	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_013959	CAAAAA	2	12	2503540	2503551	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_013959	TTGCAA	2	12	2566013	2566024	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_013959	CCAAAT	2	12	2621066	2621077	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_013959	ATTTCC	2	12	2669828	2669839	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013959	CGAACC	2	12	2744443	2744454	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
70	NC_013959	TTTGGA	2	12	2875375	2875386	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.