MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Sideroxydans lithotrophicus ES-1 chromosome

Total Repeats: 1965

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013959	GGCAA	2	10	441	450	40 %	0 %	40 %	20 %	291612473
2	NC_013959	ATTCA	2	10	720	729	40 %	40 %	0 %	20 %	291612473
3	NC_013959	TATCA	2	10	1067	1076	40 %	40 %	0 %	20 %	291612473
4	NC_013959	TACCA	2	10	2668	2677	40 %	20 %	0 %	40 %	291612474
5	NC_013959	GTTTG	2	10	3189	3198	0 %	60 %	40 %	0 %	291612475
6	NC_013959	AGCCA	2	10	8630	8639	40 %	0 %	20 %	40 %	291612477
7	NC_013959	TCCCT	2	10	9091	9100	0 %	40 %	0 %	60 %	291612478
8	NC_013959	GATTG	2	10	12155	12164	20 %	40 %	40 %	0 %	291612481
9	NC_013959	CCTGC	2	10	18377	18386	0 %	20 %	20 %	60 %	291612486
10	NC_013959	CTGAC	2	10	18408	18417	20 %	20 %	20 %	40 %	291612486
11	NC_013959	GGCAT	2	10	20065	20074	20 %	20 %	40 %	20 %	291612487
12	NC_013959	TGAAC	2	10	24176	24185	40 %	20 %	20 %	20 %	291612490
13	NC_013959	GGCAC	2	10	25227	25236	20 %	0 %	40 %	40 %	291612492
14	NC_013959	GGCCA	2	10	25464	25473	20 %	0 %	40 %	40 %	291612492
15	NC_013959	TCATC	2	10	26611	26620	20 %	40 %	0 %	40 %	291612493
16	NC_013959	GGCCA	2	10	27670	27679	20 %	0 %	40 %	40 %	291612494
17	NC_013959	CCGAT	2	10	28265	28274	20 %	20 %	20 %	40 %	291612494
18	NC_013959	ACGGC	2	10	29598	29607	20 %	0 %	40 %	40 %	291612496
19	NC_013959	CGGCA	2	10	29927	29936	20 %	0 %	40 %	40 %	291612496
20	NC_013959	TTCCA	2	10	31139	31148	20 %	40 %	0 %	40 %	291612496
21	NC_013959	CCCAT	2	10	32899	32908	20 %	20 %	0 %	60 %	291612498
22	NC_013959	CGAAT	2	10	33148	33157	40 %	20 %	20 %	20 %	291612499
23	NC_013959	TCATA	2	10	33340	33349	40 %	40 %	0 %	20 %	291612499
24	NC_013959	AGCGA	2	10	35365	35374	40 %	0 %	40 %	20 %	291612502
25	NC_013959	CCCTG	2	10	35558	35567	0 %	20 %	20 %	60 %	291612502
26	NC_013959	TTTGC	2	10	38597	38606	0 %	60 %	20 %	20 %	291612505
27	NC_013959	GCGAT	2	10	39773	39782	20 %	20 %	40 %	20 %	291612506
28	NC_013959	ATTTA	2	10	41220	41229	40 %	60 %	0 %	0 %	291612508
29	NC_013959	TGCGG	2	10	41428	41437	0 %	20 %	60 %	20 %	291612508
30	NC_013959	GCTCC	2	10	41893	41902	0 %	20 %	20 %	60 %	291612508
31	NC_013959	CCAGC	2	10	43672	43681	20 %	0 %	20 %	60 %	291612510
32	NC_013959	CCGTG	2	10	44645	44654	0 %	20 %	40 %	40 %	291612511
33	NC_013959	GCATC	2	10	44672	44681	20 %	20 %	20 %	40 %	291612511
34	NC_013959	GCCGT	2	10	47866	47875	0 %	20 %	40 %	40 %	291612515
35	NC_013959	CTGCA	2	10	48546	48555	20 %	20 %	20 %	40 %	291612515
36	NC_013959	TCCGT	2	10	49820	49829	0 %	40 %	20 %	40 %	291612516
37	NC_013959	GCCGC	2	10	52041	52050	0 %	0 %	40 %	60 %	291612517
38	NC_013959	GCGCC	2	10	54952	54961	0 %	0 %	40 %	60 %	291612520
39	NC_013959	CGCAG	2	10	55282	55291	20 %	0 %	40 %	40 %	291612520
40	NC_013959	GCTGC	2	10	55346	55355	0 %	20 %	40 %	40 %	291612520
41	NC_013959	GCACC	2	10	55447	55456	20 %	0 %	20 %	60 %	291612520
42	NC_013959	GCGAT	2	10	57039	57048	20 %	20 %	40 %	20 %	291612522
43	NC_013959	CCCAG	2	10	58516	58525	20 %	0 %	20 %	60 %	291612524
44	NC_013959	TGTCG	2	10	58673	58682	0 %	40 %	40 %	20 %	291612524
45	NC_013959	AAAAT	2	10	59801	59810	80 %	20 %	0 %	0 %	291612525
46	NC_013959	CAGCG	2	10	60765	60774	20 %	0 %	40 %	40 %	291612527
47	NC_013959	TGCTC	2	10	61696	61705	0 %	40 %	20 %	40 %	291612529
48	NC_013959	CCGCG	2	10	62243	62252	0 %	0 %	40 %	60 %	291612530
49	NC_013959	GTTTT	2	10	62870	62879	0 %	80 %	20 %	0 %	291612531
50	NC_013959	GCGTA	2	10	64349	64358	20 %	20 %	40 %	20 %	291612532
51	NC_013959	GCGTG	2	10	65566	65575	0 %	20 %	60 %	20 %	291612532
52	NC_013959	CGCCT	2	10	67793	67802	0 %	20 %	20 %	60 %	291612534
53	NC_013959	CGGCA	2	10	67958	67967	20 %	0 %	40 %	40 %	291612534
54	NC_013959	GATGA	2	10	70759	70768	40 %	20 %	40 %	0 %	291612538
55	NC_013959	GGATG	2	10	71651	71660	20 %	20 %	60 %	0 %	291612538
56	NC_013959	CGGCT	2	10	71697	71706	0 %	20 %	40 %	40 %	291612538
57	NC_013959	CAAGC	2	10	71787	71796	40 %	0 %	20 %	40 %	291612538
58	NC_013959	CTGGT	2	10	72133	72142	0 %	40 %	40 %	20 %	291612538
59	NC_013959	TCGAA	2	10	72594	72603	40 %	20 %	20 %	20 %	291612539
60	NC_013959	CCGCA	2	10	73293	73302	20 %	0 %	20 %	60 %	291612540
61	NC_013959	TGGTC	2	10	75260	75269	0 %	40 %	40 %	20 %	291612541
62	NC_013959	CCGAT	2	10	75790	75799	20 %	20 %	20 %	40 %	291612541
63	NC_013959	TTCCA	2	10	77610	77619	20 %	40 %	0 %	40 %	291612542
64	NC_013959	CGTTG	2	10	77729	77738	0 %	40 %	40 %	20 %	291612542
65	NC_013959	TGGAC	2	10	79050	79059	20 %	20 %	40 %	20 %	291612544
66	NC_013959	AAAGT	2	10	79461	79470	60 %	20 %	20 %	0 %	291612545
67	NC_013959	ACTTG	2	10	79756	79765	20 %	40 %	20 %	20 %	291612546
68	NC_013959	CAGCG	2	10	81415	81424	20 %	0 %	40 %	40 %	291612547
69	NC_013959	ACCGA	2	10	82532	82541	40 %	0 %	20 %	40 %	291612550
70	NC_013959	CACGA	2	10	82814	82823	40 %	0 %	20 %	40 %	291612550
71	NC_013959	TCCGT	2	10	84068	84077	0 %	40 %	20 %	40 %	291612552
72	NC_013959	CGGTG	2	10	86076	86085	0 %	20 %	60 %	20 %	291612552
73	NC_013959	ATCGA	2	10	87484	87493	40 %	20 %	20 %	20 %	291612552
74	NC_013959	ATCGC	2	10	88922	88931	20 %	20 %	20 %	40 %	291612553
75	NC_013959	TGCCC	2	10	89286	89295	0 %	20 %	20 %	60 %	291612553
76	NC_013959	CCGGC	2	10	89310	89319	0 %	0 %	40 %	60 %	291612553
77	NC_013959	GGCGC	2	10	89675	89684	0 %	0 %	60 %	40 %	291612554
78	NC_013959	TGATC	2	10	93056	93065	20 %	40 %	20 %	20 %	291612557
79	NC_013959	CAGCC	2	10	96587	96596	20 %	0 %	20 %	60 %	291612562
80	NC_013959	TGGCA	2	10	96632	96641	20 %	20 %	40 %	20 %	291612562
81	NC_013959	GTCGT	2	10	97211	97220	0 %	40 %	40 %	20 %	291612562
82	NC_013959	TGCGC	2	10	99757	99766	0 %	20 %	40 %	40 %	291612565
83	NC_013959	GCCAG	2	10	100036	100045	20 %	0 %	40 %	40 %	291612565
84	NC_013959	GGGCT	2	10	100750	100759	0 %	20 %	60 %	20 %	291612566
85	NC_013959	TCACC	2	10	101529	101538	20 %	20 %	0 %	60 %	291612566
86	NC_013959	AATGA	2	10	101963	101972	60 %	20 %	20 %	0 %	291612567
87	NC_013959	TCGCG	2	10	104254	104263	0 %	20 %	40 %	40 %	291612569
88	NC_013959	ATCTC	2	10	105331	105340	20 %	40 %	0 %	40 %	291612570
89	NC_013959	GTGAG	2	10	106922	106931	20 %	20 %	60 %	0 %	291612572
90	NC_013959	TCTTG	2	10	107052	107061	0 %	60 %	20 %	20 %	291612572
91	NC_013959	GCGTG	2	10	109039	109048	0 %	20 %	60 %	20 %	291612575
92	NC_013959	GACGC	2	10	109598	109607	20 %	0 %	40 %	40 %	291612577
93	NC_013959	GGTAA	2	10	111540	111549	40 %	20 %	40 %	0 %	291612578
94	NC_013959	CGAAA	2	10	112870	112879	60 %	0 %	20 %	20 %	291612579
95	NC_013959	TGCGC	2	10	115212	115221	0 %	20 %	40 %	40 %	291612580
96	NC_013959	AGCTA	2	10	118281	118290	40 %	20 %	20 %	20 %	291612584
97	NC_013959	TGGTG	2	10	119590	119599	0 %	40 %	60 %	0 %	291612585
98	NC_013959	ATCCA	2	10	119880	119889	40 %	20 %	0 %	40 %	291612585
99	NC_013959	ATGGG	2	10	120606	120615	20 %	20 %	60 %	0 %	291612585
100	NC_013959	AAAAG	2	10	122397	122406	80 %	0 %	20 %	0 %	291612587
101	NC_013959	CAAGG	2	10	122716	122725	40 %	0 %	40 %	20 %	291612587
102	NC_013959	CGATC	2	10	123750	123759	20 %	20 %	20 %	40 %	291612587
103	NC_013959	GCATC	2	10	124968	124977	20 %	20 %	20 %	40 %	291612587
104	NC_013959	CACCG	2	10	125583	125592	20 %	0 %	20 %	60 %	291612587
105	NC_013959	ACCAG	2	10	128134	128143	40 %	0 %	20 %	40 %	291612588
106	NC_013959	CTGGA	2	10	129096	129105	20 %	20 %	40 %	20 %	291612589
107	NC_013959	TCGCG	2	10	129660	129669	0 %	20 %	40 %	40 %	291612590
108	NC_013959	CGTGC	2	10	130816	130825	0 %	20 %	40 %	40 %	291612590
109	NC_013959	TGCCG	2	10	132992	133001	0 %	20 %	40 %	40 %	291612592
110	NC_013959	ACGGC	2	10	133399	133408	20 %	0 %	40 %	40 %	291612592
111	NC_013959	TCCGG	2	10	135714	135723	0 %	20 %	40 %	40 %	291612594
112	NC_013959	CGAAA	2	10	136153	136162	60 %	0 %	20 %	20 %	291612594
113	NC_013959	AATGG	2	10	140156	140165	40 %	20 %	40 %	0 %	291612598
114	NC_013959	CGTGG	2	10	142882	142891	0 %	20 %	60 %	20 %	291612602
115	NC_013959	CTTTG	2	10	143769	143778	0 %	60 %	20 %	20 %	291612603
116	NC_013959	GGGTG	2	10	144785	144794	0 %	20 %	80 %	0 %	291612604
117	NC_013959	ATCGT	2	10	144951	144960	20 %	40 %	20 %	20 %	291612604
118	NC_013959	TGCTG	2	10	145482	145491	0 %	40 %	40 %	20 %	291612605
119	NC_013959	CGTGC	2	10	148862	148871	0 %	20 %	40 %	40 %	291612608
120	NC_013959	GCGCT	2	10	150204	150213	0 %	20 %	40 %	40 %	291612609
121	NC_013959	CCGCG	2	10	150986	150995	0 %	0 %	40 %	60 %	291612610
122	NC_013959	CGCAC	2	10	151969	151978	20 %	0 %	20 %	60 %	291612611
123	NC_013959	GCGGT	2	10	158293	158302	0 %	20 %	60 %	20 %	291612617
124	NC_013959	CAGGG	2	10	159414	159423	20 %	0 %	60 %	20 %	291612619
125	NC_013959	CGCAG	2	10	160816	160825	20 %	0 %	40 %	40 %	291612621
126	NC_013959	CCATA	2	10	163771	163780	40 %	20 %	0 %	40 %	291612622
127	NC_013959	CCTCG	2	10	167535	167544	0 %	20 %	20 %	60 %	291612626
128	NC_013959	CCGAT	2	10	171263	171272	20 %	20 %	20 %	40 %	291612628
129	NC_013959	CCATG	2	10	172164	172173	20 %	20 %	20 %	40 %	291612629
130	NC_013959	GGTGT	2	10	175827	175836	0 %	40 %	60 %	0 %	291612630
131	NC_013959	GAAGG	2	10	176136	176145	40 %	0 %	60 %	0 %	291612630
132	NC_013959	GCGCT	2	10	176659	176668	0 %	20 %	40 %	40 %	291612632
133	NC_013959	CGGGT	2	10	177457	177466	0 %	20 %	60 %	20 %	291612632
134	NC_013959	GCGCA	2	10	177960	177969	20 %	0 %	40 %	40 %	291612632
135	NC_013959	AGATC	2	10	184804	184813	40 %	20 %	20 %	20 %	291612636
136	NC_013959	GTGCG	2	10	185419	185428	0 %	20 %	60 %	20 %	291612637
137	NC_013959	CAGCG	2	10	185645	185654	20 %	0 %	40 %	40 %	291612637
138	NC_013959	GCCGC	2	10	185922	185931	0 %	0 %	40 %	60 %	291612637
139	NC_013959	GTGCT	2	10	190920	190929	0 %	40 %	40 %	20 %	291612643
140	NC_013959	CCATC	2	10	190964	190973	20 %	20 %	0 %	60 %	291612643
141	NC_013959	GTCTC	2	10	190974	190983	0 %	40 %	20 %	40 %	291612643
142	NC_013959	GTCTT	2	10	195489	195498	0 %	60 %	20 %	20 %	291612648
143	NC_013959	TGAAA	2	10	199572	199581	60 %	20 %	20 %	0 %	291612653
144	NC_013959	CGGTG	2	10	200253	200262	0 %	20 %	60 %	20 %	291612653
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147	NC_013959	GCATT	2	10	205072	205081	20 %	40 %	20 %	20 %	291612657
148	NC_013959	CGGCT	2	10	205142	205151	0 %	20 %	40 %	40 %	291612657
149	NC_013959	CTGGT	2	10	205297	205306	0 %	40 %	40 %	20 %	291612657
150	NC_013959	ACCGC	2	10	205479	205488	20 %	0 %	20 %	60 %	291612657
151	NC_013959	CAAGC	2	10	207164	207173	40 %	0 %	20 %	40 %	291612659
152	NC_013959	CGCTG	2	10	211252	211261	0 %	20 %	40 %	40 %	291612663
153	NC_013959	GGCGC	2	10	215796	215805	0 %	0 %	60 %	40 %	291612671
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155	NC_013959	AAGCG	2	10	219336	219345	40 %	0 %	40 %	20 %	291612677
156	NC_013959	GAAGA	2	10	220988	220997	60 %	0 %	40 %	0 %	291612683
157	NC_013959	GCGCA	2	10	221557	221566	20 %	0 %	40 %	40 %	291612684
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159	NC_013959	GCGCC	2	10	223281	223290	0 %	0 %	40 %	60 %	291612688
160	NC_013959	GCTGG	2	10	223760	223769	0 %	20 %	60 %	20 %	291612689
161	NC_013959	CGCGC	2	10	225547	225556	0 %	0 %	40 %	60 %	291612694
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166	NC_013959	ACGCC	2	10	231867	231876	20 %	0 %	20 %	60 %	291612700
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169	NC_013959	GGGCT	2	10	234456	234465	0 %	20 %	60 %	20 %	291612705
170	NC_013959	TGCCG	2	10	235420	235429	0 %	20 %	40 %	40 %	291612707
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174	NC_013959	GGCGT	2	10	238659	238668	0 %	20 %	60 %	20 %	291612711
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177	NC_013959	GGTGC	2	10	241886	241895	0 %	20 %	60 %	20 %	291612714
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192	NC_013959	CGTCC	2	10	272967	272976	0 %	20 %	20 %	60 %	291612740
193	NC_013959	AACCG	2	10	278496	278505	40 %	0 %	20 %	40 %	291612746
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211	NC_013959	CGTCT	2	10	314225	314234	0 %	40 %	20 %	40 %	291612783
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238	NC_013959	GCGCT	2	10	368377	368386	0 %	20 %	40 %	40 %	291612828
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244	NC_013959	GCCGC	2	10	377168	377177	0 %	0 %	40 %	60 %	291612836
245	NC_013959	TCGAA	2	10	379424	379433	40 %	20 %	20 %	20 %	291612839
246	NC_013959	GCAAC	2	10	380771	380780	40 %	0 %	20 %	40 %	291612840
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248	NC_013959	TCGGC	2	10	384056	384065	0 %	20 %	40 %	40 %	291612844
249	NC_013959	ATGCG	2	10	391279	391288	20 %	20 %	40 %	20 %	291612853
250	NC_013959	GCGCC	2	10	392162	392171	0 %	0 %	40 %	60 %	291612854
251	NC_013959	GGATG	2	10	393625	393634	20 %	20 %	60 %	0 %	291612858
252	NC_013959	CTCTC	2	10	393939	393948	0 %	40 %	0 %	60 %	291612859
253	NC_013959	GGCAG	2	10	394703	394712	20 %	0 %	60 %	20 %	291612859
254	NC_013959	GATGC	2	10	394964	394973	20 %	20 %	40 %	20 %	291612859
255	NC_013959	CGGCG	2	10	395068	395077	0 %	0 %	60 %	40 %	291612859
256	NC_013959	GCTCC	2	10	397734	397743	0 %	20 %	20 %	60 %	291612863
257	NC_013959	TGCGG	2	10	398681	398690	0 %	20 %	60 %	20 %	291612864
258	NC_013959	TGCGA	2	10	398732	398741	20 %	20 %	40 %	20 %	291612864
259	NC_013959	GCACC	2	10	402091	402100	20 %	0 %	20 %	60 %	291612867
260	NC_013959	CGGCA	2	10	402283	402292	20 %	0 %	40 %	40 %	291612867
261	NC_013959	TTATC	2	10	402744	402753	20 %	60 %	0 %	20 %	291612867
262	NC_013959	CGTGA	2	10	407032	407041	20 %	20 %	40 %	20 %	291612871
263	NC_013959	CGTCA	2	10	410487	410496	20 %	20 %	20 %	40 %	291612875
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390	NC_013959	CTGGA	2	10	618532	618541	20 %	20 %	40 %	20 %	291613077
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499	NC_013959	CAGTG	2	10	771224	771233	20 %	20 %	40 %	20 %	291613236
500	NC_013959	GTACG	2	10	771242	771251	20 %	20 %	40 %	20 %	291613236

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