MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Sideroxydans lithotrophicus ES-1 chromosome

Total Repeats: 7523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013959	ATTA	2	8	46	53	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013959	CAAC	2	8	619	626	50 %	0 %	0 %	50 %	291612473
3	NC_013959	TGAT	2	8	709	716	25 %	50 %	25 %	0 %	291612473
4	NC_013959	TGAT	2	8	781	788	25 %	50 %	25 %	0 %	291612473
5	NC_013959	ACAA	3	12	789	800	75 %	0 %	0 %	25 %	291612473
6	NC_013959	GACT	2	8	877	884	25 %	25 %	25 %	25 %	291612473
7	NC_013959	GGAA	2	8	1463	1470	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013959	ACAA	2	8	1481	1488	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_013959	AAAG	2	8	1605	1612	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013959	CAAA	2	8	1627	1634	75 %	0 %	0 %	25 %	291612474
11	NC_013959	GCAA	2	8	1689	1696	50 %	0 %	25 %	25 %	291612474
12	NC_013959	CAAA	2	8	1923	1930	75 %	0 %	0 %	25 %	291612474
13	NC_013959	ATTG	2	8	1987	1994	25 %	50 %	25 %	0 %	291612474
14	NC_013959	CATT	2	8	2157	2164	25 %	50 %	0 %	25 %	291612474
15	NC_013959	GAAA	2	8	2176	2183	75 %	0 %	25 %	0 %	291612474
16	NC_013959	TTCT	2	8	2205	2212	0 %	75 %	0 %	25 %	291612474
17	NC_013959	CTTT	2	8	2633	2640	0 %	75 %	0 %	25 %	291612474
18	NC_013959	GTAT	2	8	2828	2835	25 %	50 %	25 %	0 %	291612475
19	NC_013959	CTGG	2	8	2911	2918	0 %	25 %	50 %	25 %	291612475
20	NC_013959	GCGG	2	8	3067	3074	0 %	0 %	75 %	25 %	291612475
21	NC_013959	TCCT	2	8	3385	3392	0 %	50 %	0 %	50 %	291612475
22	NC_013959	CAAG	2	8	4098	4105	50 %	0 %	25 %	25 %	291612475
23	NC_013959	CAAG	2	8	4413	4420	50 %	0 %	25 %	25 %	291612475
24	NC_013959	AGCC	2	8	4614	4621	25 %	0 %	25 %	50 %	291612475
25	NC_013959	GCCC	2	8	4638	4645	0 %	0 %	25 %	75 %	291612475
26	NC_013959	CAAG	2	8	4929	4936	50 %	0 %	25 %	25 %	291612475
27	NC_013959	TCCA	2	8	4975	4982	25 %	25 %	0 %	50 %	291612475
28	NC_013959	GGAT	2	8	6127	6134	25 %	25 %	50 %	0 %	291612476
29	NC_013959	TGGT	2	8	6384	6391	0 %	50 %	50 %	0 %	291612476
30	NC_013959	CGAC	2	8	6750	6757	25 %	0 %	25 %	50 %	291612476
31	NC_013959	GGCT	2	8	6877	6884	0 %	25 %	50 %	25 %	291612476
32	NC_013959	AGCG	2	8	7114	7121	25 %	0 %	50 %	25 %	291612476
33	NC_013959	GCGT	2	8	7141	7148	0 %	25 %	50 %	25 %	291612476
34	NC_013959	TGCT	2	8	7877	7884	0 %	50 %	25 %	25 %	291612476
35	NC_013959	GGAT	2	8	7900	7907	25 %	25 %	50 %	0 %	291612476
36	NC_013959	CTTG	2	8	9023	9030	0 %	50 %	25 %	25 %	291612478
37	NC_013959	AAGG	2	8	10497	10504	50 %	0 %	50 %	0 %	291612479
38	NC_013959	AAAC	2	8	11466	11473	75 %	0 %	0 %	25 %	291612480
39	NC_013959	ACTC	2	8	11613	11620	25 %	25 %	0 %	50 %	291612481
40	NC_013959	CTAC	2	8	12119	12126	25 %	25 %	0 %	50 %	291612481
41	NC_013959	GAGC	2	8	12187	12194	25 %	0 %	50 %	25 %	291612481
42	NC_013959	AAAG	2	8	12555	12562	75 %	0 %	25 %	0 %	291612482
43	NC_013959	GCAG	2	8	12832	12839	25 %	0 %	50 %	25 %	291612482
44	NC_013959	GAGG	2	8	12848	12855	25 %	0 %	75 %	0 %	291612482
45	NC_013959	GAAG	2	8	12866	12873	50 %	0 %	50 %	0 %	291612482
46	NC_013959	GCAG	2	8	12932	12939	25 %	0 %	50 %	25 %	291612482
47	NC_013959	TGCG	2	8	13205	13212	0 %	25 %	50 %	25 %	291612482
48	NC_013959	GCAG	2	8	13468	13475	25 %	0 %	50 %	25 %	291612482
49	NC_013959	GGAA	2	8	13797	13804	50 %	0 %	50 %	0 %	291612483
50	NC_013959	TGGA	2	8	13963	13970	25 %	25 %	50 %	0 %	291612483
51	NC_013959	CTTG	2	8	14130	14137	0 %	50 %	25 %	25 %	291612483
52	NC_013959	CCAG	2	8	14307	14314	25 %	0 %	25 %	50 %	291612483
53	NC_013959	GTTG	2	8	14486	14493	0 %	50 %	50 %	0 %	291612484
54	NC_013959	ACCA	2	8	14909	14916	50 %	0 %	0 %	50 %	291612484
55	NC_013959	GCAT	2	8	15584	15591	25 %	25 %	25 %	25 %	291612484
56	NC_013959	ACAT	2	8	16033	16040	50 %	25 %	0 %	25 %	291612484
57	NC_013959	TGAA	2	8	16048	16055	50 %	25 %	25 %	0 %	291612484
58	NC_013959	AGCC	2	8	16407	16414	25 %	0 %	25 %	50 %	291612484
59	NC_013959	GCCG	2	8	17142	17149	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_013959	TGGC	2	8	17775	17782	0 %	25 %	50 %	25 %	291612486
61	NC_013959	TGTC	2	8	19556	19563	0 %	50 %	25 %	25 %	291612487
62	NC_013959	GCTG	2	8	20399	20406	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_013959	GGCA	2	8	20937	20944	25 %	0 %	50 %	25 %	291612488
64	NC_013959	AGGC	2	8	21365	21372	25 %	0 %	50 %	25 %	291612488
65	NC_013959	CTGG	2	8	21475	21482	0 %	25 %	50 %	25 %	291612488
66	NC_013959	GACA	2	8	22155	22162	50 %	0 %	25 %	25 %	291612489
67	NC_013959	CGAG	2	8	22305	22312	25 %	0 %	50 %	25 %	291612489
68	NC_013959	CGAA	2	8	23659	23666	50 %	0 %	25 %	25 %	291612490
69	NC_013959	TTTG	2	8	24245	24252	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013959	GGCA	2	8	24259	24266	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_013959	GATC	2	8	24294	24301	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_013959	GTTG	2	8	24819	24826	0 %	50 %	50 %	0 %	291612491
73	NC_013959	AAGT	2	8	24847	24854	50 %	25 %	25 %	0 %	291612491
74	NC_013959	GCCA	2	8	24986	24993	25 %	0 %	25 %	50 %	291612492
75	NC_013959	CAGG	2	8	25083	25090	25 %	0 %	50 %	25 %	291612492
76	NC_013959	TGCT	2	8	25715	25722	0 %	50 %	25 %	25 %	291612492
77	NC_013959	TGAC	2	8	25814	25821	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_013959	TGCC	2	8	26167	26174	0 %	25 %	25 %	50 %	291612493
79	NC_013959	GCAG	2	8	26220	26227	25 %	0 %	50 %	25 %	291612493
80	NC_013959	TGAA	2	8	26526	26533	50 %	25 %	25 %	0 %	291612493
81	NC_013959	GCCT	2	8	26684	26691	0 %	25 %	25 %	50 %	291612493
82	NC_013959	TTAT	2	8	26929	26936	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013959	TTTC	2	8	27308	27315	0 %	75 %	0 %	25 %	291612494
84	NC_013959	CTGG	2	8	27552	27559	0 %	25 %	50 %	25 %	291612494
85	NC_013959	CGAA	2	8	28475	28482	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_013959	GCTG	2	8	28748	28755	0 %	25 %	50 %	25 %	291612495
87	NC_013959	ATCC	2	8	28843	28850	25 %	25 %	0 %	50 %	291612495
88	NC_013959	CGAC	2	8	29313	29320	25 %	0 %	25 %	50 %	291612496
89	NC_013959	GCAG	2	8	29401	29408	25 %	0 %	50 %	25 %	291612496
90	NC_013959	GGCC	2	8	29809	29816	0 %	0 %	50 %	50 %	291612496
91	NC_013959	AACG	2	8	29951	29958	50 %	0 %	25 %	25 %	291612496
92	NC_013959	ATCG	2	8	30776	30783	25 %	25 %	25 %	25 %	291612496
93	NC_013959	CGCT	2	8	30911	30918	0 %	25 %	25 %	50 %	291612496
94	NC_013959	CGGC	2	8	31038	31045	0 %	0 %	50 %	50 %	291612496
95	NC_013959	CAAG	2	8	32088	32095	50 %	0 %	25 %	25 %	291612497
96	NC_013959	TCAT	2	8	32482	32489	25 %	50 %	0 %	25 %	291612497
97	NC_013959	GCGG	2	8	32833	32840	0 %	0 %	75 %	25 %	291612498
98	NC_013959	GGCG	2	8	32853	32860	0 %	0 %	75 %	25 %	291612498
99	NC_013959	GGCC	2	8	33837	33844	0 %	0 %	50 %	50 %	291612499
100	NC_013959	CGTG	2	8	33892	33899	0 %	25 %	50 %	25 %	291612499
101	NC_013959	CTGG	2	8	33901	33908	0 %	25 %	50 %	25 %	291612499
102	NC_013959	AACA	2	8	33923	33930	75 %	0 %	0 %	25 %	291612499
103	NC_013959	GATC	2	8	34959	34966	25 %	25 %	25 %	25 %	291612501
104	NC_013959	CCAC	2	8	35184	35191	25 %	0 %	0 %	75 %	291612501
105	NC_013959	CAAG	2	8	35351	35358	50 %	0 %	25 %	25 %	291612502
106	NC_013959	GCCG	2	8	35526	35533	0 %	0 %	50 %	50 %	291612502
107	NC_013959	GATG	2	8	35664	35671	25 %	25 %	50 %	0 %	291612502
108	NC_013959	CAGG	2	8	36053	36060	25 %	0 %	50 %	25 %	291612503
109	NC_013959	GGCT	2	8	36443	36450	0 %	25 %	50 %	25 %	291612503
110	NC_013959	CCAT	2	8	37056	37063	25 %	25 %	0 %	50 %	291612504
111	NC_013959	CATG	2	8	37180	37187	25 %	25 %	25 %	25 %	291612504
112	NC_013959	TGGA	2	8	37244	37251	25 %	25 %	50 %	0 %	291612504
113	NC_013959	CTTT	2	8	37688	37695	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_013959	AAAG	2	8	37706	37713	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013959	GAAA	2	8	37866	37873	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013959	GGAG	2	8	37952	37959	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013959	TAAG	2	8	38214	38221	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013959	GGAG	2	8	38381	38388	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013959	GGGT	2	8	39176	39183	0 %	25 %	75 %	0 %	291612506
120	NC_013959	CCGA	2	8	39299	39306	25 %	0 %	25 %	50 %	291612506
121	NC_013959	GCCA	2	8	39308	39315	25 %	0 %	25 %	50 %	291612506
122	NC_013959	AAGG	2	8	39877	39884	50 %	0 %	50 %	0 %	291612506
123	NC_013959	GCCG	2	8	40320	40327	0 %	0 %	50 %	50 %	291612507
124	NC_013959	AGGA	2	8	40906	40913	50 %	0 %	50 %	0 %	291612508
125	NC_013959	GTCG	2	8	41016	41023	0 %	25 %	50 %	25 %	291612508
126	NC_013959	AAGT	2	8	42205	42212	50 %	25 %	25 %	0 %	291612509
127	NC_013959	CAGC	2	8	42279	42286	25 %	0 %	25 %	50 %	291612509
128	NC_013959	TCCA	2	8	42642	42649	25 %	25 %	0 %	50 %	291612509
129	NC_013959	CGGA	2	8	42656	42663	25 %	0 %	50 %	25 %	291612509
130	NC_013959	ATCC	2	8	42761	42768	25 %	25 %	0 %	50 %	291612509
131	NC_013959	CGGA	2	8	43073	43080	25 %	0 %	50 %	25 %	291612509
132	NC_013959	CTTG	2	8	43388	43395	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_013959	AACC	2	8	43478	43485	50 %	0 %	0 %	50 %	291612510
134	NC_013959	TGCG	2	8	43880	43887	0 %	25 %	50 %	25 %	291612510
135	NC_013959	TCGC	2	8	44221	44228	0 %	25 %	25 %	50 %	291612511
136	NC_013959	GGCA	2	8	44523	44530	25 %	0 %	50 %	25 %	291612511
137	NC_013959	CATA	2	8	45208	45215	50 %	25 %	0 %	25 %	291612511
138	NC_013959	TGGG	2	8	46897	46904	0 %	25 %	75 %	0 %	291612513
139	NC_013959	GGAG	2	8	47320	47327	25 %	0 %	75 %	0 %	291612514
140	NC_013959	GGCA	2	8	48027	48034	25 %	0 %	50 %	25 %	291612515
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142	NC_013959	CATT	2	8	49122	49129	25 %	50 %	0 %	25 %	291612516
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