MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Sideroxydans lithotrophicus ES-1 chromosome

Total Repeats: 739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013959	ATTA	2	8	46	53	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013959	GGAA	2	8	1463	1470	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013959	ACAA	2	8	1481	1488	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_013959	AAAG	2	8	1605	1612	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013959	GCCG	2	8	17142	17149	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_013959	GCTG	2	8	20399	20406	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_013959	TTTG	2	8	24245	24252	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013959	GGCA	2	8	24259	24266	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_013959	GATC	2	8	24294	24301	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_013959	TGAC	2	8	25814	25821	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_013959	TTAT	2	8	26929	26936	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013959	CGAA	2	8	28475	28482	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_013959	CTTT	2	8	37688	37695	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_013959	AAAG	2	8	37706	37713	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013959	GAAA	2	8	37866	37873	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013959	GGAG	2	8	37952	37959	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013959	TAAG	2	8	38214	38221	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013959	GGAG	2	8	38381	38388	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013959	CTTG	2	8	43388	43395	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_013959	TGCG	2	8	53708	53715	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_013959	CGAT	2	8	77143	77150	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_013959	GCCG	2	8	77180	77187	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_013959	ACCA	2	8	78855	78862	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_013959	AGAC	2	8	80514	80521	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_013959	GTTC	2	8	80595	80602	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_013959	CTTT	2	8	81561	81568	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_013959	CACG	2	8	82034	82041	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_013959	GCAA	2	8	82073	82080	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_013959	GAGG	2	8	91330	91337	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013959	GGTT	2	8	93185	93192	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013959	CGGG	2	8	95317	95324	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32	NC_013959	GACT	2	8	95406	95413	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_013959	ACCA	2	8	100195	100202	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_013959	TACC	2	8	104674	104681	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_013959	CATG	2	8	106120	106127	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_013959	GCCG	2	8	111226	111233	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_013959	GTTG	2	8	132638	132645	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013959	GATT	2	8	135306	135313	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013959	GAAT	2	8	137562	137569	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013959	CAGC	2	8	138720	138727	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_013959	TGAC	2	8	145100	145107	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_013959	GGCG	2	8	145151	145158	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
43	NC_013959	ACCA	2	8	155680	155687	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_013959	CTTT	2	8	155715	155722	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_013959	AAAG	2	8	155734	155741	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013959	CTCA	2	8	155982	155989	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_013959	GCAA	2	8	161481	161488	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_013959	CTTC	2	8	161632	161639	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_013959	TCGT	2	8	164455	164462	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_013959	CATG	2	8	164514	164521	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_013959	AGAA	2	8	164800	164807	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013959	ATGC	2	8	165961	165968	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_013959	GGCG	2	8	173651	173658	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
54	NC_013959	GGGC	2	8	181635	181642	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
55	NC_013959	TTGC	2	8	181784	181791	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_013959	CCGG	2	8	182766	182773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_013959	TGCG	2	8	191843	191850	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_013959	AATG	2	8	196039	196046	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013959	AAAC	2	8	206202	206209	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_013959	CCAA	2	8	207908	207915	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_013959	CGCT	2	8	208073	208080	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_013959	AACG	2	8	208460	208467	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_013959	TGCG	2	8	223012	223019	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_013959	CGGG	2	8	230521	230528	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
65	NC_013959	ACCT	2	8	232151	232158	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_013959	GCTG	2	8	254775	254782	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_013959	AAAC	2	8	265063	265070	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_013959	CTGC	2	8	265333	265340	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_013959	TTTG	2	8	265466	265473	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013959	CTTT	2	8	267207	267214	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_013959	CTGA	2	8	267260	267267	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_013959	TCAA	2	8	268717	268724	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_013959	TCAA	2	8	278798	278805	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_013959	CAGC	2	8	278831	278838	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_013959	CTGC	2	8	285511	285518	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_013959	AACC	2	8	293574	293581	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_013959	AAAG	2	8	297490	297497	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013959	TCGT	2	8	302763	302770	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_013959	GCAC	2	8	306083	306090	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_013959	GGTT	2	8	311222	311229	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013959	CCAT	2	8	325351	325358	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_013959	CTTT	2	8	349481	349488	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_013959	AAAG	2	8	349500	349507	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013959	TGAG	2	8	357332	357339	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013959	GTGA	2	8	357780	357787	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013959	GAAA	2	8	357822	357829	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013959	TACC	2	8	358359	358366	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_013959	GACG	2	8	359012	359019	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_013959	AAAG	2	8	359313	359320	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013959	CTGA	2	8	359641	359648	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_013959	AAAT	2	8	359706	359713	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013959	GCGA	2	8	359737	359744	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_013959	AAAC	2	8	360276	360283	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_013959	GACA	2	8	360429	360436	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_013959	AAAG	2	8	360571	360578	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013959	TTGA	2	8	361356	361363	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013959	ACAA	2	8	362618	362625	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_013959	GAAG	2	8	363105	363112	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013959	AGCA	2	8	373895	373902	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_013959	AGCG	2	8	375512	375519	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_013959	ACAA	2	8	389294	389301	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_013959	CTCC	2	8	389936	389943	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
103	NC_013959	ATAC	2	8	390863	390870	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_013959	ACGC	2	8	395308	395315	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_013959	GATG	2	8	396107	396114	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013959	ATGG	2	8	396837	396844	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013959	GGCC	2	8	397232	397239	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_013959	GTCT	2	8	398152	398159	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_013959	CGAC	2	8	404104	404111	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_013959	GACG	2	8	410315	410322	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_013959	TTTG	2	8	413313	413320	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013959	GTGG	2	8	415438	415445	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013959	GTAA	2	8	415725	415732	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013959	TGCC	2	8	429954	429961	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_013959	CTTT	2	8	433665	433672	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_013959	AAAG	2	8	433684	433691	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013959	GGAA	2	8	433871	433878	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013959	CTTT	2	8	434959	434966	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_013959	GGTT	2	8	436394	436401	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013959	TGCT	2	8	437764	437771	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_013959	TGGT	2	8	447643	447650	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013959	GTCG	2	8	447698	447705	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_013959	GCTT	2	8	457076	457083	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_013959	ATGA	2	8	465176	465183	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013959	CTTG	2	8	478520	478527	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_013959	AGGA	2	8	479296	479303	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013959	GCCG	2	8	481280	481287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_013959	CTCG	2	8	481325	481332	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_013959	CGTG	2	8	482727	482734	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_013959	GGGC	2	8	483145	483152	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
131	NC_013959	TGTT	2	8	483219	483226	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013959	GCAT	2	8	483285	483292	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_013959	GTGA	2	8	483358	483365	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013959	GGCA	2	8	484526	484533	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_013959	CAAC	2	8	493631	493638	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_013959	CGTG	2	8	494382	494389	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_013959	TGGT	2	8	494646	494653	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013959	CTTG	2	8	495238	495245	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_013959	GTTC	2	8	502871	502878	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_013959	CGGG	2	8	503380	503387	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
141	NC_013959	GTGG	2	8	512226	512233	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013959	GCCG	2	8	513780	513787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_013959	CGTT	2	8	516947	516954	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_013959	TCTG	2	8	517193	517200	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_013959	TGCC	2	8	523447	523454	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_013959	GTTC	2	8	528570	528577	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_013959	GCAC	2	8	538002	538009	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_013959	AAAC	2	8	546283	546290	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_013959	AATC	2	8	548683	548690	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_013959	TGTT	2	8	548841	548848	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_013959	CATG	2	8	549959	549966	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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