MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Nitrosococcus halophilus Nc4 plasmid pNHAL01

Total Repeats: 817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013958	TAT	2	6	147	152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013958	GAT	2	6	313	318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615454
3	NC_013958	GGC	2	6	388	393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615454
4	NC_013958	GCG	2	6	415	420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615454
5	NC_013958	TGC	2	6	471	476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615454
6	NC_013958	ACA	2	6	495	500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291615454
7	NC_013958	TGA	2	6	726	731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615454
8	NC_013958	TCA	2	6	791	796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615454
9	NC_013958	CCG	2	6	834	839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615454
10	NC_013958	TCT	2	6	854	859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291615454
11	NC_013958	GCG	2	6	958	963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615454
12	NC_013958	TGC	2	6	1043	1048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615454
13	NC_013958	CTT	2	6	1275	1280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291615454
14	NC_013958	GAA	2	6	1429	1434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291615454
15	NC_013958	CGC	2	6	1677	1682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615454
16	NC_013958	GCG	2	6	1763	1768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615454
17	NC_013958	AAG	2	6	1808	1813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291615454
18	NC_013958	TCT	2	6	1835	1840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291615454
19	NC_013958	GGC	2	6	1904	1909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615454
20	NC_013958	TCA	2	6	1919	1924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615454
21	NC_013958	GAT	2	6	2101	2106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615454
22	NC_013958	TTG	2	6	2149	2154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291615454
23	NC_013958	TCA	2	6	2172	2177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615454
24	NC_013958	GCA	2	6	2264	2269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615454
25	NC_013958	CAA	2	6	2404	2409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291615454
26	NC_013958	CGG	2	6	2450	2455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615454
27	NC_013958	CTT	2	6	2460	2465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291615454
28	NC_013958	TAG	2	6	2471	2476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615454
29	NC_013958	CGA	2	6	2531	2536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615454
30	NC_013958	TGG	2	6	2562	2567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291615454
31	NC_013958	CAT	2	6	2707	2712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615454
32	NC_013958	GCA	3	9	2871	2879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615454
33	NC_013958	TTC	2	6	2914	2919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291615454
34	NC_013958	TCT	2	6	2993	2998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291615454
35	NC_013958	GCT	2	6	3015	3020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615454
36	NC_013958	CCT	2	6	3096	3101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291615454
37	NC_013958	CCT	2	6	3105	3110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291615454
38	NC_013958	CAG	2	6	3199	3204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615454
39	NC_013958	CCA	2	6	3321	3326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291615454
40	NC_013958	CGG	3	9	3570	3578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615455
41	NC_013958	CTT	2	6	3579	3584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291615455
42	NC_013958	CGG	2	6	3597	3602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615455
43	NC_013958	CGC	2	6	3618	3623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615455
44	NC_013958	GGA	2	6	3643	3648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291615455
45	NC_013958	TGA	2	6	3687	3692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615455
46	NC_013958	CGG	2	6	3745	3750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615455
47	NC_013958	CTT	2	6	3818	3823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291615455
48	NC_013958	TCG	2	6	3855	3860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615455
49	NC_013958	TAC	2	6	3969	3974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615455
50	NC_013958	TTC	2	6	4024	4029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291615455
51	NC_013958	TCT	2	6	4169	4174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291615455
52	NC_013958	TCA	2	6	4193	4198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615455
53	NC_013958	GCG	2	6	4306	4311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615455
54	NC_013958	GGC	2	6	4336	4341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615455
55	NC_013958	GGC	2	6	4344	4349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615455
56	NC_013958	GTT	2	6	4350	4355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291615455
57	NC_013958	TTG	2	6	4400	4405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291615455
58	NC_013958	GTC	2	6	4418	4423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615455
59	NC_013958	TTG	2	6	4522	4527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291615455
60	NC_013958	CAG	2	6	4580	4585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615455
61	NC_013958	AGC	2	6	4607	4612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615455
62	NC_013958	ATC	2	6	4666	4671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615455
63	NC_013958	CCA	2	6	4817	4822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291615456
64	NC_013958	CTG	2	6	4845	4850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615456
65	NC_013958	CTT	2	6	5016	5021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291615456
66	NC_013958	CTT	2	6	5031	5036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291615456
67	NC_013958	AAC	2	6	5353	5358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291615456
68	NC_013958	GCA	2	6	5570	5575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615456
69	NC_013958	GCG	2	6	5632	5637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615456
70	NC_013958	CCA	2	6	5684	5689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291615456
71	NC_013958	CCA	2	6	5744	5749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291615456
72	NC_013958	CCA	2	6	5753	5758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291615456
73	NC_013958	TGA	2	6	5765	5770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615456
74	NC_013958	CCG	2	6	5804	5809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615456
75	NC_013958	CAC	2	6	5889	5894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291615456
76	NC_013958	TGA	2	6	5984	5989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615456
77	NC_013958	GCT	2	6	6065	6070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615456
78	NC_013958	GCC	2	6	6210	6215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615456
79	NC_013958	GGT	2	6	6277	6282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013958	ATC	2	6	6377	6382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_013958	GCA	2	6	6475	6480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_013958	TTG	2	6	6591	6596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013958	AGG	2	6	6835	6840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291615457
84	NC_013958	GGC	3	9	6864	6872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615457
85	NC_013958	CAG	2	6	6885	6890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615457
86	NC_013958	CAA	2	6	6930	6935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291615457
87	NC_013958	CAG	2	6	6939	6944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615457
88	NC_013958	TGC	2	6	7090	7095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615458
89	NC_013958	CGG	2	6	7135	7140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615458
90	NC_013958	CGG	2	6	7519	7524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615459
91	NC_013958	GCA	2	6	7623	7628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615459
92	NC_013958	GAT	2	6	7650	7655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615459
93	NC_013958	TGC	2	6	7724	7729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615459
94	NC_013958	ACC	2	6	7790	7795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291615459
95	NC_013958	ATG	2	6	7843	7848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615459
96	NC_013958	TGC	2	6	8048	8053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615459
97	NC_013958	GGC	2	6	8101	8106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615459
98	NC_013958	CAA	2	6	8107	8112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291615459
99	NC_013958	TCA	2	6	8118	8123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615459
100	NC_013958	TGC	2	6	8139	8144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615459
101	NC_013958	CAC	2	6	8179	8184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291615459
102	NC_013958	AGG	2	6	8297	8302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291615459
103	NC_013958	CGC	2	6	8455	8460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615459
104	NC_013958	TTG	2	6	8561	8566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013958	CGG	2	6	8668	8673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615460
106	NC_013958	TCT	2	6	8979	8984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291615461
107	NC_013958	ACT	2	6	8993	8998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615461
108	NC_013958	AAT	2	6	9120	9125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291615461
109	NC_013958	CGG	2	6	9238	9243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615462
110	NC_013958	CCA	2	6	9322	9327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291615462
111	NC_013958	TCA	2	6	9328	9333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615462
112	NC_013958	CCA	2	6	9397	9402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291615462
113	NC_013958	TCA	2	6	9432	9437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615462
114	NC_013958	CCG	2	6	9453	9458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615462
115	NC_013958	CAC	2	6	9467	9472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291615462
116	NC_013958	CCG	2	6	9541	9546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615462
117	NC_013958	CCA	2	6	9590	9595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291615462
118	NC_013958	TGA	2	6	9634	9639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615462
119	NC_013958	CTG	2	6	9674	9679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615462
120	NC_013958	CGG	2	6	9824	9829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615462
121	NC_013958	TCA	2	6	9834	9839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615462
122	NC_013958	TGG	2	6	9927	9932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291615462
123	NC_013958	CAC	2	6	9944	9949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291615462
124	NC_013958	GCG	2	6	9959	9964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_013958	GCC	2	6	9996	10001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615463
126	NC_013958	GGC	2	6	10043	10048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615463
127	NC_013958	CCG	2	6	10057	10062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615463
128	NC_013958	AGG	2	6	10152	10157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291615463
129	NC_013958	TCC	2	6	10185	10190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291615463
130	NC_013958	GCC	2	6	10240	10245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615463
131	NC_013958	TGA	2	6	10265	10270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615463
132	NC_013958	TCA	2	6	10342	10347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615463
133	NC_013958	GCT	2	6	10364	10369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615463
134	NC_013958	TGG	2	6	10622	10627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291615463
135	NC_013958	AGC	2	6	10657	10662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615463
136	NC_013958	CTC	2	6	10758	10763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291615463
137	NC_013958	AGT	2	6	10792	10797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615463
138	NC_013958	CAC	3	9	10801	10809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291615463
139	NC_013958	CTT	2	6	10821	10826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291615464
140	NC_013958	ATG	2	6	10865	10870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615464
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142	NC_013958	GGT	2	6	10954	10959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291615464
143	NC_013958	AAT	2	6	11037	11042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291615464
144	NC_013958	ATA	2	6	11090	11095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013958	TCT	2	6	11116	11121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_013958	CTG	2	6	11256	11261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_013958	GAT	2	6	11267	11272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013958	GTG	2	6	11798	11803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291615466
149	NC_013958	ATT	2	6	11824	11829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013958	CTT	2	6	11854	11859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_013958	GAA	3	9	12088	12096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_013958	TGT	2	6	12225	12230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291615467
153	NC_013958	TCT	2	6	12231	12236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291615467
154	NC_013958	CCG	2	6	12244	12249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615467
155	NC_013958	CTT	2	6	12283	12288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291615467
156	NC_013958	TGA	2	6	12448	12453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615467
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159	NC_013958	GCT	2	6	12649	12654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615467
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162	NC_013958	ACC	2	6	12784	12789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291615467
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165	NC_013958	CTT	2	6	13106	13111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_013958	TTA	2	6	13178	13183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_013958	GGA	2	6	13689	13694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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258	NC_013958	TTC	2	6	21179	21184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291615481
259	NC_013958	CCT	2	6	21238	21243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291615481
260	NC_013958	CCG	2	6	21427	21432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615481
261	NC_013958	TCC	2	6	21462	21467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291615481
262	NC_013958	GCC	2	6	21492	21497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615481
263	NC_013958	CTC	3	9	21530	21538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291615481
264	NC_013958	TTC	2	6	21593	21598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291615481
265	NC_013958	CTC	2	6	21770	21775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291615482
266	NC_013958	TCA	2	6	21780	21785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615482
267	NC_013958	TCC	2	6	21920	21925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
268	NC_013958	ATT	2	6	22026	22031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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272	NC_013958	GGC	2	6	22588	22593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
273	NC_013958	TCA	2	6	22697	22702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
274	NC_013958	ATT	2	6	22720	22725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_013958	AGT	2	6	22739	22744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
276	NC_013958	TAC	2	6	22781	22786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615484
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292	NC_013958	CGG	2	6	23452	23457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
293	NC_013958	ACC	2	6	23462	23467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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342	NC_013958	GCA	2	6	27948	27953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615490
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344	NC_013958	CAA	2	6	28045	28050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291615490
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373	NC_013958	GAT	2	6	30246	30251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
374	NC_013958	CAC	2	6	30308	30313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
375	NC_013958	GCT	2	6	30334	30339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
376	NC_013958	TTG	2	6	30394	30399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
377	NC_013958	AGG	2	6	30490	30495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291615494
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379	NC_013958	GGC	2	6	30963	30968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615494
380	NC_013958	TCG	2	6	30990	30995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615494
381	NC_013958	GCA	2	6	31104	31109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615494
382	NC_013958	TCT	2	6	31201	31206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291615494
383	NC_013958	CAT	2	6	31295	31300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615495
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385	NC_013958	AAC	2	6	31393	31398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291615495
386	NC_013958	ATG	2	6	31540	31545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615495
387	NC_013958	GAA	2	6	31593	31598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291615495
388	NC_013958	GCT	2	6	31919	31924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615495
389	NC_013958	CTG	2	6	31927	31932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615495
390	NC_013958	GAA	2	6	31933	31938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291615495
391	NC_013958	TGC	2	6	31964	31969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615495
392	NC_013958	GCT	2	6	32000	32005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615495
393	NC_013958	TCC	2	6	32262	32267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291615496
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399	NC_013958	GAA	2	6	32938	32943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291615497
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414	NC_013958	TAA	2	6	34104	34109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291615498
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462	NC_013958	GGC	2	6	36938	36943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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500	NC_013958	GAG	2	6	40414	40419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291615505

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