MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Nitrosococcus halophilus Nc4 plasmid pNHAL01

Total Repeats: 103

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013958	GA	3	6	93	98	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013958	TC	3	6	3697	3702	0 %	50 %	0 %	50 %	291615455
3	NC_013958	AG	3	6	4511	4516	50 %	0 %	50 %	0 %	291615455
4	NC_013958	GA	3	6	4945	4950	50 %	0 %	50 %	0 %	291615456
5	NC_013958	AT	3	6	6644	6649	50 %	50 %	0 %	0 %	291615457
6	NC_013958	TC	3	6	7351	7356	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_013958	AG	3	6	8661	8666	50 %	0 %	50 %	0 %	291615460
8	NC_013958	TC	3	6	8695	8700	0 %	50 %	0 %	50 %	291615460
9	NC_013958	GC	3	6	9136	9141	0 %	0 %	50 %	50 %	291615461
10	NC_013958	AT	3	6	11394	11399	50 %	50 %	0 %	0 %	291615465
11	NC_013958	GC	3	6	11671	11676	0 %	0 %	50 %	50 %	291615466
12	NC_013958	GA	3	6	11991	11996	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013958	GC	3	6	12480	12485	0 %	0 %	50 %	50 %	291615467
14	NC_013958	CA	3	6	12508	12513	50 %	0 %	0 %	50 %	291615467
15	NC_013958	CT	3	6	12632	12637	0 %	50 %	0 %	50 %	291615467
16	NC_013958	GT	3	6	13053	13058	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013958	AC	3	6	13332	13337	50 %	0 %	0 %	50 %	291615468
18	NC_013958	AT	3	6	13576	13581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013958	AG	3	6	14775	14780	50 %	0 %	50 %	0 %	291615471
20	NC_013958	CG	3	6	15718	15723	0 %	0 %	50 %	50 %	291615472
21	NC_013958	AG	3	6	15913	15918	50 %	0 %	50 %	0 %	291615473
22	NC_013958	AC	3	6	16155	16160	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_013958	AC	3	6	18584	18589	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_013958	GC	3	6	18667	18672	0 %	0 %	50 %	50 %	291615478
25	NC_013958	TC	3	6	18884	18889	0 %	50 %	0 %	50 %	291615478
26	NC_013958	CG	3	6	19960	19965	0 %	0 %	50 %	50 %	291615479
27	NC_013958	CT	3	6	19984	19989	0 %	50 %	0 %	50 %	291615479
28	NC_013958	GC	3	6	21392	21397	0 %	0 %	50 %	50 %	291615481
29	NC_013958	AT	3	6	21947	21952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013958	AT	3	6	22055	22060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013958	AT	3	6	22101	22106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013958	CT	3	6	22363	22368	0 %	50 %	0 %	50 %	291615483
33	NC_013958	CG	3	6	22968	22973	0 %	0 %	50 %	50 %	291615484
34	NC_013958	AC	3	6	23597	23602	50 %	0 %	0 %	50 %	291615485
35	NC_013958	AC	3	6	23633	23638	50 %	0 %	0 %	50 %	291615485
36	NC_013958	GC	3	6	23677	23682	0 %	0 %	50 %	50 %	291615485
37	NC_013958	GC	3	6	23852	23857	0 %	0 %	50 %	50 %	291615485
38	NC_013958	TC	3	6	26157	26162	0 %	50 %	0 %	50 %	291615488
39	NC_013958	CA	3	6	26734	26739	50 %	0 %	0 %	50 %	291615489
40	NC_013958	CG	3	6	27242	27247	0 %	0 %	50 %	50 %	291615489
41	NC_013958	CA	3	6	28129	28134	50 %	0 %	0 %	50 %	291615490
42	NC_013958	AT	3	6	28358	28363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013958	AT	3	6	29377	29382	50 %	50 %	0 %	0 %	291615492
44	NC_013958	CG	3	6	29785	29790	0 %	0 %	50 %	50 %	291615493
45	NC_013958	GC	3	6	30143	30148	0 %	0 %	50 %	50 %	291615493
46	NC_013958	GA	3	6	30299	30304	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013958	CT	3	6	30388	30393	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_013958	CT	3	6	30534	30539	0 %	50 %	0 %	50 %	291615494
49	NC_013958	CA	3	6	30638	30643	50 %	0 %	0 %	50 %	291615494
50	NC_013958	TC	3	6	30913	30918	0 %	50 %	0 %	50 %	291615494
51	NC_013958	GT	3	6	30996	31001	0 %	50 %	50 %	0 %	291615494
52	NC_013958	AG	3	6	31875	31880	50 %	0 %	50 %	0 %	291615495
53	NC_013958	AT	3	6	32623	32628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013958	TA	4	8	32679	32686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013958	AT	3	6	36018	36023	50 %	50 %	0 %	0 %	291615500
56	NC_013958	TC	3	6	36684	36689	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_013958	GA	3	6	38391	38396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013958	GC	3	6	38501	38506	0 %	0 %	50 %	50 %	291615504
59	NC_013958	GC	3	6	38999	39004	0 %	0 %	50 %	50 %	291615504
60	NC_013958	TC	3	6	39151	39156	0 %	50 %	0 %	50 %	291615504
61	NC_013958	GC	4	8	39843	39850	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_013958	TA	3	6	41244	41249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013958	TA	3	6	43136	43141	50 %	50 %	0 %	0 %	291615509
64	NC_013958	AT	3	6	43478	43483	50 %	50 %	0 %	0 %	291615509
65	NC_013958	GA	3	6	43842	43847	50 %	0 %	50 %	0 %	291615510
66	NC_013958	AG	3	6	44102	44107	50 %	0 %	50 %	0 %	291615510
67	NC_013958	GA	3	6	44680	44685	50 %	0 %	50 %	0 %	291615510
68	NC_013958	AC	3	6	44898	44903	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_013958	CG	3	6	45295	45300	0 %	0 %	50 %	50 %	291615511
70	NC_013958	TC	3	6	45402	45407	0 %	50 %	0 %	50 %	291615511
71	NC_013958	CG	3	6	46549	46554	0 %	0 %	50 %	50 %	291615512
72	NC_013958	TC	3	6	46816	46821	0 %	50 %	0 %	50 %	291615512
73	NC_013958	AG	3	6	47460	47465	50 %	0 %	50 %	0 %	291615513
74	NC_013958	GC	3	6	48781	48786	0 %	0 %	50 %	50 %	291615513
75	NC_013958	AC	3	6	49536	49541	50 %	0 %	0 %	50 %	291615513
76	NC_013958	AG	3	6	49940	49945	50 %	0 %	50 %	0 %	291615513
77	NC_013958	CG	3	6	50977	50982	0 %	0 %	50 %	50 %	291615514
78	NC_013958	GC	3	6	52606	52611	0 %	0 %	50 %	50 %	291615516
79	NC_013958	GC	3	6	52928	52933	0 %	0 %	50 %	50 %	291615516
80	NC_013958	CA	3	6	53280	53285	50 %	0 %	0 %	50 %	291615516
81	NC_013958	AG	3	6	53461	53466	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013958	GC	3	6	54177	54182	0 %	0 %	50 %	50 %	291615518
83	NC_013958	AT	4	8	54257	54264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013958	TG	3	6	54658	54663	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013958	GC	3	6	55061	55066	0 %	0 %	50 %	50 %	291615519
86	NC_013958	GC	3	6	55316	55321	0 %	0 %	50 %	50 %	291615519
87	NC_013958	GA	3	6	55431	55436	50 %	0 %	50 %	0 %	291615519
88	NC_013958	GC	3	6	56126	56131	0 %	0 %	50 %	50 %	291615519
89	NC_013958	CG	4	8	57287	57294	0 %	0 %	50 %	50 %	291615519
90	NC_013958	CA	3	6	57631	57636	50 %	0 %	0 %	50 %	291615519
91	NC_013958	TG	3	6	57720	57725	0 %	50 %	50 %	0 %	291615519
92	NC_013958	CG	3	6	57863	57868	0 %	0 %	50 %	50 %	291615519
93	NC_013958	AG	3	6	58136	58141	50 %	0 %	50 %	0 %	291615519
94	NC_013958	GA	3	6	59664	59669	50 %	0 %	50 %	0 %	291615521
95	NC_013958	CA	3	6	59771	59776	50 %	0 %	0 %	50 %	291615521
96	NC_013958	GC	3	6	60223	60228	0 %	0 %	50 %	50 %	291615521
97	NC_013958	GC	3	6	60306	60311	0 %	0 %	50 %	50 %	291615521
98	NC_013958	CA	3	6	60590	60595	50 %	0 %	0 %	50 %	291615521
99	NC_013958	AT	3	6	61284	61289	50 %	50 %	0 %	0 %	291615521
100	NC_013958	GC	3	6	61602	61607	0 %	0 %	50 %	50 %	291615521
101	NC_013958	CA	3	6	63299	63304	50 %	0 %	0 %	50 %	291615521
102	NC_013958	TA	3	6	65683	65688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013958	CT	3	6	65738	65743	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.