MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Nitrosococcus halophilus Nc4 plasmid pNHAL01

Total Repeats: 78

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013958	TC	3	6	3697	3702	0 %	50 %	0 %	50 %	291615455
2	NC_013958	AG	3	6	4511	4516	50 %	0 %	50 %	0 %	291615455
3	NC_013958	GA	3	6	4945	4950	50 %	0 %	50 %	0 %	291615456
4	NC_013958	AT	3	6	6644	6649	50 %	50 %	0 %	0 %	291615457
5	NC_013958	AG	3	6	8661	8666	50 %	0 %	50 %	0 %	291615460
6	NC_013958	TC	3	6	8695	8700	0 %	50 %	0 %	50 %	291615460
7	NC_013958	GC	3	6	9136	9141	0 %	0 %	50 %	50 %	291615461
8	NC_013958	AT	3	6	11394	11399	50 %	50 %	0 %	0 %	291615465
9	NC_013958	GC	3	6	11671	11676	0 %	0 %	50 %	50 %	291615466
10	NC_013958	GC	3	6	12480	12485	0 %	0 %	50 %	50 %	291615467
11	NC_013958	CA	3	6	12508	12513	50 %	0 %	0 %	50 %	291615467
12	NC_013958	CT	3	6	12632	12637	0 %	50 %	0 %	50 %	291615467
13	NC_013958	AC	3	6	13332	13337	50 %	0 %	0 %	50 %	291615468
14	NC_013958	AG	3	6	14775	14780	50 %	0 %	50 %	0 %	291615471
15	NC_013958	CG	3	6	15718	15723	0 %	0 %	50 %	50 %	291615472
16	NC_013958	AG	3	6	15913	15918	50 %	0 %	50 %	0 %	291615473
17	NC_013958	GC	3	6	18667	18672	0 %	0 %	50 %	50 %	291615478
18	NC_013958	TC	3	6	18884	18889	0 %	50 %	0 %	50 %	291615478
19	NC_013958	CG	3	6	19960	19965	0 %	0 %	50 %	50 %	291615479
20	NC_013958	CT	3	6	19984	19989	0 %	50 %	0 %	50 %	291615479
21	NC_013958	GC	3	6	21392	21397	0 %	0 %	50 %	50 %	291615481
22	NC_013958	CT	3	6	22363	22368	0 %	50 %	0 %	50 %	291615483
23	NC_013958	CG	3	6	22968	22973	0 %	0 %	50 %	50 %	291615484
24	NC_013958	AC	3	6	23597	23602	50 %	0 %	0 %	50 %	291615485
25	NC_013958	AC	3	6	23633	23638	50 %	0 %	0 %	50 %	291615485
26	NC_013958	GC	3	6	23677	23682	0 %	0 %	50 %	50 %	291615485
27	NC_013958	GC	3	6	23852	23857	0 %	0 %	50 %	50 %	291615485
28	NC_013958	TC	3	6	26157	26162	0 %	50 %	0 %	50 %	291615488
29	NC_013958	CA	3	6	26734	26739	50 %	0 %	0 %	50 %	291615489
30	NC_013958	CG	3	6	27242	27247	0 %	0 %	50 %	50 %	291615489
31	NC_013958	CA	3	6	28129	28134	50 %	0 %	0 %	50 %	291615490
32	NC_013958	AT	3	6	29377	29382	50 %	50 %	0 %	0 %	291615492
33	NC_013958	CG	3	6	29785	29790	0 %	0 %	50 %	50 %	291615493
34	NC_013958	GC	3	6	30143	30148	0 %	0 %	50 %	50 %	291615493
35	NC_013958	CT	3	6	30534	30539	0 %	50 %	0 %	50 %	291615494
36	NC_013958	CA	3	6	30638	30643	50 %	0 %	0 %	50 %	291615494
37	NC_013958	TC	3	6	30913	30918	0 %	50 %	0 %	50 %	291615494
38	NC_013958	GT	3	6	30996	31001	0 %	50 %	50 %	0 %	291615494
39	NC_013958	AG	3	6	31875	31880	50 %	0 %	50 %	0 %	291615495
40	NC_013958	AT	3	6	36018	36023	50 %	50 %	0 %	0 %	291615500
41	NC_013958	GC	3	6	38501	38506	0 %	0 %	50 %	50 %	291615504
42	NC_013958	GC	3	6	38999	39004	0 %	0 %	50 %	50 %	291615504
43	NC_013958	TC	3	6	39151	39156	0 %	50 %	0 %	50 %	291615504
44	NC_013958	TA	3	6	43136	43141	50 %	50 %	0 %	0 %	291615509
45	NC_013958	AT	3	6	43478	43483	50 %	50 %	0 %	0 %	291615509
46	NC_013958	GA	3	6	43842	43847	50 %	0 %	50 %	0 %	291615510
47	NC_013958	AG	3	6	44102	44107	50 %	0 %	50 %	0 %	291615510
48	NC_013958	GA	3	6	44680	44685	50 %	0 %	50 %	0 %	291615510
49	NC_013958	CG	3	6	45295	45300	0 %	0 %	50 %	50 %	291615511
50	NC_013958	TC	3	6	45402	45407	0 %	50 %	0 %	50 %	291615511
51	NC_013958	CG	3	6	46549	46554	0 %	0 %	50 %	50 %	291615512
52	NC_013958	TC	3	6	46816	46821	0 %	50 %	0 %	50 %	291615512
53	NC_013958	AG	3	6	47460	47465	50 %	0 %	50 %	0 %	291615513
54	NC_013958	GC	3	6	48781	48786	0 %	0 %	50 %	50 %	291615513
55	NC_013958	AC	3	6	49536	49541	50 %	0 %	0 %	50 %	291615513
56	NC_013958	AG	3	6	49940	49945	50 %	0 %	50 %	0 %	291615513
57	NC_013958	CG	3	6	50977	50982	0 %	0 %	50 %	50 %	291615514
58	NC_013958	GC	3	6	52606	52611	0 %	0 %	50 %	50 %	291615516
59	NC_013958	GC	3	6	52928	52933	0 %	0 %	50 %	50 %	291615516
60	NC_013958	CA	3	6	53280	53285	50 %	0 %	0 %	50 %	291615516
61	NC_013958	GC	3	6	54177	54182	0 %	0 %	50 %	50 %	291615518
62	NC_013958	GC	3	6	55061	55066	0 %	0 %	50 %	50 %	291615519
63	NC_013958	GC	3	6	55316	55321	0 %	0 %	50 %	50 %	291615519
64	NC_013958	GA	3	6	55431	55436	50 %	0 %	50 %	0 %	291615519
65	NC_013958	GC	3	6	56126	56131	0 %	0 %	50 %	50 %	291615519
66	NC_013958	CG	4	8	57287	57294	0 %	0 %	50 %	50 %	291615519
67	NC_013958	CA	3	6	57631	57636	50 %	0 %	0 %	50 %	291615519
68	NC_013958	TG	3	6	57720	57725	0 %	50 %	50 %	0 %	291615519
69	NC_013958	CG	3	6	57863	57868	0 %	0 %	50 %	50 %	291615519
70	NC_013958	AG	3	6	58136	58141	50 %	0 %	50 %	0 %	291615519
71	NC_013958	GA	3	6	59664	59669	50 %	0 %	50 %	0 %	291615521
72	NC_013958	CA	3	6	59771	59776	50 %	0 %	0 %	50 %	291615521
73	NC_013958	GC	3	6	60223	60228	0 %	0 %	50 %	50 %	291615521
74	NC_013958	GC	3	6	60306	60311	0 %	0 %	50 %	50 %	291615521
75	NC_013958	CA	3	6	60590	60595	50 %	0 %	0 %	50 %	291615521
76	NC_013958	AT	3	6	61284	61289	50 %	50 %	0 %	0 %	291615521
77	NC_013958	GC	3	6	61602	61607	0 %	0 %	50 %	50 %	291615521
78	NC_013958	CA	3	6	63299	63304	50 %	0 %	0 %	50 %	291615521

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.