MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Nitrosococcus halophilus Nc4 plasmid pNHAL01

Total Repeats: 73

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013958	T	6	6	181	186	0 %	100 %	0 %	0 %	291615454
2	NC_013958	G	6	6	259	264	0 %	0 %	100 %	0 %	291615454
3	NC_013958	T	6	6	912	917	0 %	100 %	0 %	0 %	291615454
4	NC_013958	A	7	7	1329	1335	100 %	0 %	0 %	0 %	291615454
5	NC_013958	G	6	6	3142	3147	0 %	0 %	100 %	0 %	291615454
6	NC_013958	G	6	6	3156	3161	0 %	0 %	100 %	0 %	291615454
7	NC_013958	G	6	6	3552	3557	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013958	G	6	6	3606	3611	0 %	0 %	100 %	0 %	291615455
9	NC_013958	T	8	8	4033	4040	0 %	100 %	0 %	0 %	291615455
10	NC_013958	A	6	6	4268	4273	100 %	0 %	0 %	0 %	291615455
11	NC_013958	A	6	6	4986	4991	100 %	0 %	0 %	0 %	291615456
12	NC_013958	G	6	6	5445	5450	0 %	0 %	100 %	0 %	291615456
13	NC_013958	C	7	7	8257	8263	0 %	0 %	0 %	100 %	291615459
14	NC_013958	G	6	6	8301	8306	0 %	0 %	100 %	0 %	291615459
15	NC_013958	T	7	7	11130	11136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013958	T	7	7	11350	11356	0 %	100 %	0 %	0 %	291615465
17	NC_013958	A	6	6	12007	12012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013958	T	6	6	12184	12189	0 %	100 %	0 %	0 %	291615467
19	NC_013958	T	6	6	13029	13034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013958	T	7	7	13229	13235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013958	G	6	6	14608	14613	0 %	0 %	100 %	0 %	291615471
22	NC_013958	A	6	6	16341	16346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013958	A	6	6	17001	17006	100 %	0 %	0 %	0 %	291615475
24	NC_013958	T	6	6	18333	18338	0 %	100 %	0 %	0 %	291615477
25	NC_013958	T	8	8	19445	19452	0 %	100 %	0 %	0 %	291615479
26	NC_013958	T	7	7	19490	19496	0 %	100 %	0 %	0 %	291615479
27	NC_013958	T	6	6	20994	20999	0 %	100 %	0 %	0 %	291615480
28	NC_013958	A	7	7	21967	21973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013958	G	6	6	23872	23877	0 %	0 %	100 %	0 %	291615485
30	NC_013958	A	6	6	23889	23894	100 %	0 %	0 %	0 %	291615485
31	NC_013958	A	6	6	24110	24115	100 %	0 %	0 %	0 %	291615485
32	NC_013958	T	6	6	24610	24615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013958	A	6	6	28306	28311	100 %	0 %	0 %	0 %	291615490
34	NC_013958	A	6	6	29212	29217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013958	A	7	7	29598	29604	100 %	0 %	0 %	0 %	291615493
36	NC_013958	A	7	7	31224	31230	100 %	0 %	0 %	0 %	291615494
37	NC_013958	T	8	8	31264	31271	0 %	100 %	0 %	0 %	291615495
38	NC_013958	A	6	6	31946	31951	100 %	0 %	0 %	0 %	291615495
39	NC_013958	A	6	6	32017	32022	100 %	0 %	0 %	0 %	291615495
40	NC_013958	T	6	6	32095	32100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013958	T	7	7	32634	32640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013958	A	6	6	32663	32668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013958	A	6	6	32812	32817	100 %	0 %	0 %	0 %	291615497
44	NC_013958	C	6	6	33578	33583	0 %	0 %	0 %	100 %	291615497
45	NC_013958	T	6	6	36037	36042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013958	T	6	6	36217	36222	0 %	100 %	0 %	0 %	291615501
47	NC_013958	A	7	7	37216	37222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013958	T	6	6	37295	37300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013958	T	6	6	37357	37362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013958	A	6	6	37510	37515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013958	G	6	6	37609	37614	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013958	C	8	8	37631	37638	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
53	NC_013958	A	6	6	41680	41685	100 %	0 %	0 %	0 %	291615507
54	NC_013958	A	6	6	42501	42506	100 %	0 %	0 %	0 %	291615508
55	NC_013958	T	6	6	42851	42856	0 %	100 %	0 %	0 %	291615508
56	NC_013958	A	6	6	42891	42896	100 %	0 %	0 %	0 %	291615508
57	NC_013958	A	6	6	42991	42996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013958	A	7	7	43691	43697	100 %	0 %	0 %	0 %	291615509
59	NC_013958	G	6	6	44621	44626	0 %	0 %	100 %	0 %	291615510
60	NC_013958	T	8	8	45053	45060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013958	T	8	8	46028	46035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013958	C	6	6	47187	47192	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
63	NC_013958	T	6	6	47282	47287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013958	A	7	7	47310	47316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013958	A	7	7	50150	50156	100 %	0 %	0 %	0 %	291615513
66	NC_013958	A	7	7	53154	53160	100 %	0 %	0 %	0 %	291615516
67	NC_013958	T	6	6	54290	54295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013958	A	7	7	54333	54339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013958	T	6	6	54651	54656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013958	A	8	8	59114	59121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013958	G	6	6	59229	59234	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013958	T	7	7	59297	59303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013958	C	6	6	64920	64925	0 %	0 %	0 %	100 %	291615521

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.