MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Erwinia amylovora CFBP1430 plasmid pEA29

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013957	CAAAC	2	10	3891	3900	60 %	0 %	0 %	40 %	291615527
2	NC_013957	CCGGT	2	10	4294	4303	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_013957	GGATG	2	10	8283	8292	20 %	20 %	60 %	0 %	291615532
4	NC_013957	GTTTT	2	10	8740	8749	0 %	80 %	20 %	0 %	291615532
5	NC_013957	AAACG	2	10	11896	11905	60 %	0 %	20 %	20 %	291615535
6	NC_013957	GTTGA	2	10	13536	13545	20 %	40 %	40 %	0 %	291615537
7	NC_013957	GGCGG	2	10	14580	14589	0 %	0 %	80 %	20 %	291615538
8	NC_013957	CCCCG	2	10	15634	15643	0 %	0 %	20 %	80 %	291615540
9	NC_013957	AGAAA	2	10	17250	17259	80 %	0 %	20 %	0 %	291615543
10	NC_013957	GGAAA	2	10	18027	18036	60 %	0 %	40 %	0 %	291615545
11	NC_013957	ATTTC	2	10	18208	18217	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_013957	CGGTT	2	10	18391	18400	0 %	40 %	40 %	20 %	291615546
13	NC_013957	TGCCT	2	10	19853	19862	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_013957	AGTGG	2	10	19879	19888	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013957	AAAGC	2	10	21228	21237	60 %	0 %	20 %	20 %	291615548
16	NC_013957	TGACG	2	10	23062	23071	20 %	20 %	40 %	20 %	291615549
17	NC_013957	GCCGG	2	10	23912	23921	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
18	NC_013957	GAAAG	2	10	26153	26162	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013957	TGCAG	2	10	26794	26803	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_013957	AGTTA	2	10	27602	27611	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.