MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Erwinia amylovora CFBP1430 plasmid pEA29

Total Repeats: 72

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013957	CATT	2	8	1711	1718	25 %	50 %	0 %	25 %	291615525
2	NC_013957	TCTG	2	8	1865	1872	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_013957	CTGT	2	8	2359	2366	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_013957	CAGA	2	8	2444	2451	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_013957	AATG	2	8	2537	2544	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013957	AATT	2	8	2570	2577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013957	GCAG	2	8	3747	3754	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_013957	TCAG	2	8	4777	4784	25 %	25 %	25 %	25 %	291615529
9	NC_013957	CCCG	2	8	4892	4899	0 %	0 %	25 %	75 %	291615529
10	NC_013957	GTGC	2	8	5014	5021	0 %	25 %	50 %	25 %	291615529
11	NC_013957	GGGC	2	8	5184	5191	0 %	0 %	75 %	25 %	291615529
12	NC_013957	GCTG	2	8	5420	5427	0 %	25 %	50 %	25 %	291615529
13	NC_013957	TGGA	2	8	7144	7151	25 %	25 %	50 %	0 %	291615530
14	NC_013957	CGGT	2	8	7190	7197	0 %	25 %	50 %	25 %	291615531
15	NC_013957	CCTG	2	8	7425	7432	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_013957	ACAG	2	8	7710	7717	50 %	0 %	25 %	25 %	291615532
17	NC_013957	TAAT	2	8	7746	7753	50 %	50 %	0 %	0 %	291615532
18	NC_013957	GCTG	2	8	8025	8032	0 %	25 %	50 %	25 %	291615532
19	NC_013957	GCTG	2	8	8130	8137	0 %	25 %	50 %	25 %	291615532
20	NC_013957	AAGA	2	8	8933	8940	75 %	0 %	25 %	0 %	291615532
21	NC_013957	GCCA	2	8	9546	9553	25 %	0 %	25 %	50 %	291615533
22	NC_013957	AATA	2	8	9759	9766	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013957	ATTT	2	8	10229	10236	25 %	75 %	0 %	0 %	291615534
24	NC_013957	AGGA	2	8	10578	10585	50 %	0 %	50 %	0 %	291615534
25	NC_013957	TAAA	2	8	11388	11395	75 %	25 %	0 %	0 %	291615534
26	NC_013957	ATCG	2	8	12222	12229	25 %	25 %	25 %	25 %	291615535
27	NC_013957	TCAA	2	8	12652	12659	50 %	25 %	0 %	25 %	291615536
28	NC_013957	TGCG	2	8	12668	12675	0 %	25 %	50 %	25 %	291615536
29	NC_013957	ATCG	2	8	13521	13528	25 %	25 %	25 %	25 %	291615537
30	NC_013957	CGGC	3	12	14004	14015	0 %	0 %	50 %	50 %	291615538
31	NC_013957	TCAT	2	8	15978	15985	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_013957	GATG	2	8	16362	16369	25 %	25 %	50 %	0 %	291615542
33	NC_013957	GAAG	2	8	16450	16457	50 %	0 %	50 %	0 %	291615542
34	NC_013957	ACTA	2	8	16661	16668	50 %	25 %	0 %	25 %	291615543
35	NC_013957	TCCT	2	8	17055	17062	0 %	50 %	0 %	50 %	291615543
36	NC_013957	ATAA	2	8	18110	18117	75 %	25 %	0 %	0 %	291615545
37	NC_013957	CGAT	2	8	18126	18133	25 %	25 %	25 %	25 %	291615545
38	NC_013957	GATA	2	8	18499	18506	50 %	25 %	25 %	0 %	291615546
39	NC_013957	CGGC	2	8	18703	18710	0 %	0 %	50 %	50 %	291615546
40	NC_013957	TGCC	2	8	18957	18964	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_013957	AATT	2	8	19157	19164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013957	AGCA	2	8	19203	19210	50 %	0 %	25 %	25 %	291615547
43	NC_013957	CAAA	2	8	19380	19387	75 %	0 %	0 %	25 %	291615547
44	NC_013957	AATA	2	8	19519	19526	75 %	25 %	0 %	0 %	291615547
45	NC_013957	AATG	2	8	19692	19699	50 %	25 %	25 %	0 %	291615547
46	NC_013957	TAAA	2	8	19902	19909	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013957	ACCA	2	8	20031	20038	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_013957	TGCG	2	8	20314	20321	0 %	25 %	50 %	25 %	291615548
49	NC_013957	GGTA	2	8	20323	20330	25 %	25 %	50 %	0 %	291615548
50	NC_013957	GGCA	2	8	20435	20442	25 %	0 %	50 %	25 %	291615548
51	NC_013957	AAAC	2	8	21143	21150	75 %	0 %	0 %	25 %	291615548
52	NC_013957	CGAA	2	8	21626	21633	50 %	0 %	25 %	25 %	291615548
53	NC_013957	CAGC	2	8	21970	21977	25 %	0 %	25 %	50 %	291615548
54	NC_013957	ATTG	2	8	22382	22389	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013957	CCAG	2	8	22494	22501	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_013957	CAGG	2	8	23243	23250	25 %	0 %	50 %	25 %	291615549
57	NC_013957	GGGC	2	8	23363	23370	0 %	0 %	75 %	25 %	291615549
58	NC_013957	TGGC	2	8	23790	23797	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_013957	CTGG	2	8	24234	24241	0 %	25 %	50 %	25 %	291615550
60	NC_013957	AAAC	2	8	24684	24691	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_013957	AAAC	2	8	24903	24910	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_013957	GGAT	2	8	24966	24973	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013957	CCAC	2	8	25360	25367	25 %	0 %	0 %	75 %	291615551
64	NC_013957	GAGT	2	8	25484	25491	25 %	25 %	50 %	0 %	291615551
65	NC_013957	CGCC	2	8	25679	25686	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
66	NC_013957	CTTA	2	8	25981	25988	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_013957	GCGT	2	8	26512	26519	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_013957	TCGA	2	8	26756	26763	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_013957	TACT	2	8	27541	27548	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_013957	ATGT	2	8	27969	27976	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013957	TTAA	2	8	28005	28012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013957	CCTG	2	8	28214	28221	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.