MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Erwinia amylovora CFBP1430 plasmid pEA29

Total Repeats: 27

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013957	TCTG	2	8	1865	1872	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_013957	CTGT	2	8	2359	2366	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_013957	CAGA	2	8	2444	2451	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_013957	AATG	2	8	2537	2544	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013957	AATT	2	8	2570	2577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013957	GCAG	2	8	3747	3754	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_013957	CCTG	2	8	7425	7432	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_013957	AATA	2	8	9759	9766	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013957	TCAT	2	8	15978	15985	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_013957	TGCC	2	8	18957	18964	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_013957	AATT	2	8	19157	19164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013957	TAAA	2	8	19902	19909	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013957	ACCA	2	8	20031	20038	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_013957	ATTG	2	8	22382	22389	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013957	CCAG	2	8	22494	22501	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_013957	TGGC	2	8	23790	23797	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_013957	AAAC	2	8	24684	24691	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_013957	AAAC	2	8	24903	24910	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_013957	GGAT	2	8	24966	24973	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013957	CGCC	2	8	25679	25686	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
21	NC_013957	CTTA	2	8	25981	25988	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_013957	GCGT	2	8	26512	26519	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_013957	TCGA	2	8	26756	26763	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_013957	TACT	2	8	27541	27548	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_013957	ATGT	2	8	27969	27976	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013957	TTAA	2	8	28005	28012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013957	CCTG	2	8	28214	28221	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.