MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Erwinia amylovora CFBP1430 plasmid pEA29

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013957	CATT	2	8	1711	1718	25 %	50 %	0 %	25 %	291615525
2	NC_013957	TCAG	2	8	4777	4784	25 %	25 %	25 %	25 %	291615529
3	NC_013957	CCCG	2	8	4892	4899	0 %	0 %	25 %	75 %	291615529
4	NC_013957	GTGC	2	8	5014	5021	0 %	25 %	50 %	25 %	291615529
5	NC_013957	GGGC	2	8	5184	5191	0 %	0 %	75 %	25 %	291615529
6	NC_013957	GCTG	2	8	5420	5427	0 %	25 %	50 %	25 %	291615529
7	NC_013957	TGGA	2	8	7144	7151	25 %	25 %	50 %	0 %	291615530
8	NC_013957	CGGT	2	8	7190	7197	0 %	25 %	50 %	25 %	291615531
9	NC_013957	ACAG	2	8	7710	7717	50 %	0 %	25 %	25 %	291615532
10	NC_013957	TAAT	2	8	7746	7753	50 %	50 %	0 %	0 %	291615532
11	NC_013957	GCTG	2	8	8025	8032	0 %	25 %	50 %	25 %	291615532
12	NC_013957	GCTG	2	8	8130	8137	0 %	25 %	50 %	25 %	291615532
13	NC_013957	AAGA	2	8	8933	8940	75 %	0 %	25 %	0 %	291615532
14	NC_013957	GCCA	2	8	9546	9553	25 %	0 %	25 %	50 %	291615533
15	NC_013957	ATTT	2	8	10229	10236	25 %	75 %	0 %	0 %	291615534
16	NC_013957	AGGA	2	8	10578	10585	50 %	0 %	50 %	0 %	291615534
17	NC_013957	TAAA	2	8	11388	11395	75 %	25 %	0 %	0 %	291615534
18	NC_013957	ATCG	2	8	12222	12229	25 %	25 %	25 %	25 %	291615535
19	NC_013957	TCAA	2	8	12652	12659	50 %	25 %	0 %	25 %	291615536
20	NC_013957	TGCG	2	8	12668	12675	0 %	25 %	50 %	25 %	291615536
21	NC_013957	ATCG	2	8	13521	13528	25 %	25 %	25 %	25 %	291615537
22	NC_013957	CGGC	3	12	14004	14015	0 %	0 %	50 %	50 %	291615538
23	NC_013957	GATG	2	8	16362	16369	25 %	25 %	50 %	0 %	291615542
24	NC_013957	GAAG	2	8	16450	16457	50 %	0 %	50 %	0 %	291615542
25	NC_013957	ACTA	2	8	16661	16668	50 %	25 %	0 %	25 %	291615543
26	NC_013957	TCCT	2	8	17055	17062	0 %	50 %	0 %	50 %	291615543
27	NC_013957	ATAA	2	8	18110	18117	75 %	25 %	0 %	0 %	291615545
28	NC_013957	CGAT	2	8	18126	18133	25 %	25 %	25 %	25 %	291615545
29	NC_013957	GATA	2	8	18499	18506	50 %	25 %	25 %	0 %	291615546
30	NC_013957	CGGC	2	8	18703	18710	0 %	0 %	50 %	50 %	291615546
31	NC_013957	AGCA	2	8	19203	19210	50 %	0 %	25 %	25 %	291615547
32	NC_013957	CAAA	2	8	19380	19387	75 %	0 %	0 %	25 %	291615547
33	NC_013957	AATA	2	8	19519	19526	75 %	25 %	0 %	0 %	291615547
34	NC_013957	AATG	2	8	19692	19699	50 %	25 %	25 %	0 %	291615547
35	NC_013957	TGCG	2	8	20314	20321	0 %	25 %	50 %	25 %	291615548
36	NC_013957	GGTA	2	8	20323	20330	25 %	25 %	50 %	0 %	291615548
37	NC_013957	GGCA	2	8	20435	20442	25 %	0 %	50 %	25 %	291615548
38	NC_013957	AAAC	2	8	21143	21150	75 %	0 %	0 %	25 %	291615548
39	NC_013957	CGAA	2	8	21626	21633	50 %	0 %	25 %	25 %	291615548
40	NC_013957	CAGC	2	8	21970	21977	25 %	0 %	25 %	50 %	291615548
41	NC_013957	CAGG	2	8	23243	23250	25 %	0 %	50 %	25 %	291615549
42	NC_013957	GGGC	2	8	23363	23370	0 %	0 %	75 %	25 %	291615549
43	NC_013957	CTGG	2	8	24234	24241	0 %	25 %	50 %	25 %	291615550
44	NC_013957	CCAC	2	8	25360	25367	25 %	0 %	0 %	75 %	291615551
45	NC_013957	GAGT	2	8	25484	25491	25 %	25 %	50 %	0 %	291615551

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.