MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Erwinia amylovora CFBP1430 plasmid pEA29

Total Repeats: 363

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013957	CTG	2	6	6	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013957	AGT	2	6	33	38	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615523
3	NC_013957	CCT	2	6	51	56	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291615523
4	NC_013957	CAG	2	6	123	128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615523
5	NC_013957	CAG	2	6	333	338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615523
6	NC_013957	TGA	2	6	339	344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615523
7	NC_013957	TGC	2	6	780	785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615523
8	NC_013957	TGA	2	6	956	961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615523
9	NC_013957	GCT	2	6	1015	1020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013957	TTG	2	6	1067	1072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013957	ATA	2	6	1121	1126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013957	GAG	2	6	1138	1143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013957	ATC	2	6	1252	1257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_013957	CTG	2	6	1312	1317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_013957	TGC	2	6	1318	1323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_013957	ACC	2	6	1374	1379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291615524
17	NC_013957	TGC	2	6	1389	1394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615524
18	NC_013957	CCG	2	6	1459	1464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615524
19	NC_013957	CGG	2	6	1478	1483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615524
20	NC_013957	TGA	2	6	1528	1533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615524
21	NC_013957	GTG	2	6	1565	1570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291615524
22	NC_013957	CAC	2	6	1611	1616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291615524
23	NC_013957	CGG	2	6	1649	1654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615524
24	NC_013957	ATT	2	6	1790	1795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291615525
25	NC_013957	GCA	2	6	1897	1902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_013957	GAC	2	6	2095	2100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_013957	TCA	2	6	2301	2306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_013957	TTC	2	6	2367	2372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_013957	GAC	2	6	2704	2709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_013957	TCA	2	6	2828	2833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615526
31	NC_013957	GAG	2	6	2856	2861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291615526
32	NC_013957	CTG	2	6	2895	2900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615526
33	NC_013957	TCT	2	6	2963	2968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291615526
34	NC_013957	ACT	2	6	3020	3025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615526
35	NC_013957	GAT	2	6	3579	3584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013957	CCG	2	6	3615	3620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_013957	ACA	2	6	3700	3705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_013957	ATT	2	6	3810	3815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013957	ATT	2	6	3833	3838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013957	GCC	2	6	3880	3885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_013957	CGC	2	6	3947	3952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615527
42	NC_013957	GCT	2	6	3980	3985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615527
43	NC_013957	CTT	2	6	4015	4020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291615527
44	NC_013957	TGT	2	6	4027	4032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291615527
45	NC_013957	TAA	2	6	4071	4076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291615527
46	NC_013957	GTT	2	6	4154	4159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013957	ATT	2	6	4214	4219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013957	TCA	2	6	4407	4412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615528
49	NC_013957	GAA	2	6	4577	4582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013957	AGG	2	6	4591	4596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013957	TAT	2	6	4727	4732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013957	CGG	2	6	5090	5095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615529
53	NC_013957	GAT	2	6	5114	5119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615529
54	NC_013957	CTC	2	6	5142	5147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291615529
55	NC_013957	TGA	2	6	5290	5295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615529
56	NC_013957	CTG	2	6	5561	5566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615529
57	NC_013957	CTT	2	6	5582	5587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291615529
58	NC_013957	ATT	3	9	5657	5665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013957	ATG	2	6	5770	5775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615530
60	NC_013957	CGG	2	6	5789	5794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615530
61	NC_013957	CCA	2	6	5849	5854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291615530
62	NC_013957	CGA	2	6	5856	5861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615530
63	NC_013957	GCT	2	6	5937	5942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615530
64	NC_013957	CAG	2	6	5968	5973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615530
65	NC_013957	ATG	2	6	5992	5997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615530
66	NC_013957	GCG	2	6	6206	6211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615530
67	NC_013957	CTG	2	6	6223	6228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615530
68	NC_013957	GCA	2	6	6288	6293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615530
69	NC_013957	GGT	2	6	6333	6338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291615530
70	NC_013957	GCC	2	6	6388	6393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615530
71	NC_013957	GCG	2	6	6424	6429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615530
72	NC_013957	GCG	2	6	6448	6453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615530
73	NC_013957	TGC	2	6	6522	6527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615530
74	NC_013957	GCG	2	6	6604	6609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615530
75	NC_013957	CGA	2	6	6720	6725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615530
76	NC_013957	TGC	2	6	6770	6775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615530
77	NC_013957	GGC	2	6	6778	6783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615530
78	NC_013957	ACT	2	6	6806	6811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615530
79	NC_013957	GAT	2	6	6901	6906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615530
80	NC_013957	CGG	2	6	6951	6956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615530
81	NC_013957	TGG	2	6	7065	7070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291615530
82	NC_013957	GAA	2	6	7074	7079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291615530
83	NC_013957	CTC	2	6	7182	7187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291615531
84	NC_013957	CAC	2	6	7317	7322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291615531
85	NC_013957	CGG	2	6	7446	7451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615532
86	NC_013957	AGC	2	6	7519	7524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615532
87	NC_013957	CCA	2	6	7536	7541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291615532
88	NC_013957	AGC	2	6	7543	7548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615532
89	NC_013957	TGC	2	6	7553	7558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615532
90	NC_013957	GCA	2	6	7625	7630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615532
91	NC_013957	CCA	2	6	7704	7709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291615532
92	NC_013957	GGC	2	6	7768	7773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615532
93	NC_013957	CGG	2	6	7806	7811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615532
94	NC_013957	CAA	2	6	7812	7817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291615532
95	NC_013957	CCG	2	6	7860	7865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615532
96	NC_013957	TGA	2	6	7914	7919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615532
97	NC_013957	TGA	2	6	7947	7952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615532
98	NC_013957	GTT	2	6	8076	8081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291615532
99	NC_013957	TGG	2	6	8085	8090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291615532
100	NC_013957	TTC	2	6	8119	8124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291615532
101	NC_013957	TGC	2	6	8193	8198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615532
102	NC_013957	CAG	2	6	8251	8256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615532
103	NC_013957	TGC	2	6	8270	8275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615532
104	NC_013957	CCA	2	6	8277	8282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291615532
105	NC_013957	CCT	2	6	8303	8308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291615532
106	NC_013957	CCT	2	6	8322	8327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291615532
107	NC_013957	TGC	3	9	8329	8337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615532
108	NC_013957	GAG	2	6	8425	8430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291615532
109	NC_013957	ATG	2	6	8435	8440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615532
110	NC_013957	GAT	2	6	8645	8650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615532
111	NC_013957	GAC	2	6	8666	8671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615532
112	NC_013957	ATC	2	6	8786	8791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615532
113	NC_013957	CCG	2	6	9045	9050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_013957	CGC	2	6	9266	9271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_013957	GCG	2	6	9296	9301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_013957	TCT	2	6	9437	9442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291615533
117	NC_013957	GCT	2	6	9540	9545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615533
118	NC_013957	GTC	2	6	9623	9628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615533
119	NC_013957	TGG	2	6	9630	9635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291615533
120	NC_013957	GAA	2	6	10098	10103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013957	GGC	2	6	10622	10627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615534
122	NC_013957	TGG	2	6	10768	10773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291615534
123	NC_013957	CTT	2	6	10873	10878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291615534
124	NC_013957	AAG	2	6	10910	10915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291615534
125	NC_013957	GCA	2	6	10934	10939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615534
126	NC_013957	GAT	2	6	11078	11083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615534
127	NC_013957	TGA	2	6	11284	11289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615534
128	NC_013957	CAA	2	6	11449	11454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_013957	TGG	2	6	11505	11510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013957	ATC	2	6	11629	11634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615535
131	NC_013957	CGC	2	6	11670	11675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615535
132	NC_013957	TGC	2	6	11679	11684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615535
133	NC_013957	GCG	2	6	11715	11720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615535
134	NC_013957	CGG	2	6	11723	11728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615535
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250	NC_013957	GAA	2	6	20121	20126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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257	NC_013957	GAC	2	6	20506	20511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615548
258	NC_013957	TCA	2	6	20557	20562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615548
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260	NC_013957	GGC	2	6	20607	20612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615548
261	NC_013957	GCG	2	6	20633	20638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615548
262	NC_013957	TCT	2	6	20643	20648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291615548
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264	NC_013957	CAT	2	6	20818	20823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615548
265	NC_013957	CGG	2	6	20878	20883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615548
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273	NC_013957	CTG	2	6	21214	21219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615548
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289	NC_013957	AAG	2	6	22360	22365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
290	NC_013957	TGT	2	6	22415	22420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
291	NC_013957	CTG	2	6	22449	22454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
292	NC_013957	CAG	2	6	22504	22509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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362	NC_013957	GTT	2	6	28188	28193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
363	NC_013957	AAT	2	6	28234	28239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.