MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Erwinia amylovora CFBP1430 plasmid pEA29

Total Repeats: 110

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013957	CTG	2	6	6	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013957	GCT	2	6	1015	1020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_013957	TTG	2	6	1067	1072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013957	ATA	2	6	1121	1126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013957	GAG	2	6	1138	1143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013957	ATC	2	6	1252	1257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_013957	CTG	2	6	1312	1317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013957	TGC	2	6	1318	1323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013957	GCA	2	6	1897	1902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013957	GAC	2	6	2095	2100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013957	TCA	2	6	2301	2306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_013957	TTC	2	6	2367	2372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_013957	GAC	2	6	2704	2709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_013957	GAT	2	6	3579	3584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013957	CCG	2	6	3615	3620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_013957	ACA	2	6	3700	3705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013957	ATT	2	6	3810	3815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013957	ATT	2	6	3833	3838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013957	GCC	2	6	3880	3885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_013957	GTT	2	6	4154	4159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013957	ATT	2	6	4214	4219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013957	GAA	2	6	4577	4582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013957	AGG	2	6	4591	4596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013957	TAT	2	6	4727	4732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013957	ATT	3	9	5657	5665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013957	CCG	2	6	9045	9050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_013957	CGC	2	6	9266	9271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_013957	GCG	2	6	9296	9301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_013957	GAA	2	6	10098	10103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013957	CAA	2	6	11449	11454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_013957	TGG	2	6	11505	11510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013957	GGT	2	6	14769	14774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013957	AAT	2	6	14798	14803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013957	GCC	2	6	14815	14820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_013957	CAA	2	6	14934	14939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_013957	AGG	2	6	15674	15679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013957	GAA	2	6	15718	15723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013957	CAG	2	6	16030	16035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_013957	TCC	2	6	16105	16110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_013957	GAT	2	6	16146	16151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013957	TGG	2	6	16160	16165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013957	TAT	2	6	16240	16245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013957	GAC	2	6	16298	16303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_013957	ATA	2	6	16304	16309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013957	GCC	2	6	17459	17464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_013957	CGT	2	6	17465	17470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_013957	CGA	2	6	17474	17479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_013957	GCT	2	6	17496	17501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013957	TGA	2	6	17516	17521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013957	AGC	2	6	17597	17602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_013957	GTC	2	6	17916	17921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_013957	CTT	2	6	17924	17929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_013957	TGG	2	6	18183	18188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013957	TCA	2	6	18868	18873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_013957	CAA	2	6	18991	18996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_013957	TGT	2	6	19005	19010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013957	ATA	2	6	19029	19034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013957	AAT	2	6	19093	19098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013957	GAA	2	6	19169	19174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013957	ATG	2	6	19974	19979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013957	GAA	2	6	20121	20126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013957	CCG	2	6	22241	22246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_013957	AGT	2	6	22286	22291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013957	TCC	2	6	22332	22337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_013957	CGT	2	6	22345	22350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_013957	AAG	2	6	22360	22365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013957	TGT	2	6	22415	22420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013957	CTG	2	6	22449	22454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013957	CAG	2	6	22504	22509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_013957	TTA	2	6	23850	23855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013957	ACC	2	6	23984	23989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_013957	AGA	3	9	24429	24437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013957	GAT	2	6	24511	24516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013957	CGG	2	6	24555	24560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_013957	CCT	2	6	24615	24620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_013957	AAT	2	6	24698	24703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013957	GAT	2	6	24745	24750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013957	CAG	2	6	24770	24775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_013957	TAA	2	6	24824	24829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013957	TAT	2	6	24841	24846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013957	TCA	2	6	24982	24987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_013957	GCG	2	6	25023	25028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_013957	CAA	2	6	25090	25095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_013957	GAA	2	6	25867	25872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013957	TTA	2	6	25924	25929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013957	TGA	2	6	25969	25974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013957	CAA	2	6	25998	26003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_013957	ATT	2	6	26225	26230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013957	CAA	2	6	26307	26312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_013957	TCA	2	6	26364	26369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_013957	GCA	2	6	26433	26438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_013957	CAT	2	6	26487	26492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_013957	ATG	3	9	26536	26544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013957	TGC	2	6	26636	26641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_013957	CCG	2	6	27026	27031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_013957	TAT	2	6	27247	27252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013957	TAA	2	6	27253	27258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013957	CAT	2	6	27519	27524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_013957	CAT	2	6	27589	27594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_013957	GAA	2	6	27636	27641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013957	CAT	2	6	27653	27658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_013957	AAT	2	6	27679	27684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013957	ATG	2	6	27790	27795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013957	GGA	2	6	27834	27839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013957	AGG	2	6	27852	27857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013957	ATC	2	6	27960	27965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_013957	TTA	2	6	28027	28032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013957	GTC	2	6	28055	28060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_013957	GTT	2	6	28188	28193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013957	AAT	2	6	28234	28239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.