MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Erwinia amylovora CFBP1430 plasmid pEA29

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013957	CG	3	6	630	635	0 %	0 %	50 %	50 %	291615523
2	NC_013957	TG	3	6	2613	2618	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013957	TA	3	6	3397	3402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013957	TC	3	6	3721	3726	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_013957	GC	3	6	5298	5303	0 %	0 %	50 %	50 %	291615529
6	NC_013957	CG	3	6	5869	5874	0 %	0 %	50 %	50 %	291615530
7	NC_013957	TC	3	6	6162	6167	0 %	50 %	0 %	50 %	291615530
8	NC_013957	TG	3	6	6463	6468	0 %	50 %	50 %	0 %	291615530
9	NC_013957	AG	3	6	6649	6654	50 %	0 %	50 %	0 %	291615530
10	NC_013957	AT	3	6	7646	7651	50 %	50 %	0 %	0 %	291615532
11	NC_013957	TA	3	6	9213	9218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013957	GC	3	6	9451	9456	0 %	0 %	50 %	50 %	291615533
13	NC_013957	AG	3	6	9885	9890	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013957	TC	3	6	9929	9934	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_013957	CT	3	6	10363	10368	0 %	50 %	0 %	50 %	291615534
16	NC_013957	GA	3	6	10584	10589	50 %	0 %	50 %	0 %	291615534
17	NC_013957	GC	3	6	10640	10645	0 %	0 %	50 %	50 %	291615534
18	NC_013957	GA	3	6	10801	10806	50 %	0 %	50 %	0 %	291615534
19	NC_013957	CA	3	6	11123	11128	50 %	0 %	0 %	50 %	291615534
20	NC_013957	AC	3	6	11194	11199	50 %	0 %	0 %	50 %	291615534
21	NC_013957	GC	3	6	11578	11583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_013957	GC	4	8	12323	12330	0 %	0 %	50 %	50 %	291615535
23	NC_013957	CG	3	6	12684	12689	0 %	0 %	50 %	50 %	291615536
24	NC_013957	GC	3	6	12905	12910	0 %	0 %	50 %	50 %	291615536
25	NC_013957	CG	3	6	13106	13111	0 %	0 %	50 %	50 %	291615536
26	NC_013957	GC	3	6	13196	13201	0 %	0 %	50 %	50 %	291615536
27	NC_013957	CG	3	6	14215	14220	0 %	0 %	50 %	50 %	291615538
28	NC_013957	GC	3	6	14317	14322	0 %	0 %	50 %	50 %	291615538
29	NC_013957	TG	3	6	14485	14490	0 %	50 %	50 %	0 %	291615538
30	NC_013957	TC	3	6	14723	14728	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_013957	GT	3	6	16270	16275	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013957	GT	3	6	16402	16407	0 %	50 %	50 %	0 %	291615542
33	NC_013957	TA	3	6	16598	16603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013957	AC	3	6	16723	16728	50 %	0 %	0 %	50 %	291615543
35	NC_013957	AT	3	6	16754	16759	50 %	50 %	0 %	0 %	291615543
36	NC_013957	AG	3	6	17010	17015	50 %	0 %	50 %	0 %	291615543
37	NC_013957	GC	4	8	17184	17191	0 %	0 %	50 %	50 %	291615543
38	NC_013957	TA	3	6	17289	17294	50 %	50 %	0 %	0 %	291615543
39	NC_013957	TA	3	6	17313	17318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013957	AC	3	6	17354	17359	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_013957	TG	3	6	17403	17408	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013957	AT	3	6	19149	19154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013957	AC	3	6	20510	20515	50 %	0 %	0 %	50 %	291615548
44	NC_013957	GC	3	6	21034	21039	0 %	0 %	50 %	50 %	291615548
45	NC_013957	CG	3	6	21124	21129	0 %	0 %	50 %	50 %	291615548
46	NC_013957	GC	3	6	22213	22218	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_013957	CG	3	6	22660	22665	0 %	0 %	50 %	50 %	291615549
48	NC_013957	AG	3	6	22753	22758	50 %	0 %	50 %	0 %	291615549
49	NC_013957	TC	3	6	23735	23740	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_013957	TC	3	6	23904	23909	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_013957	AG	3	6	24545	24550	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013957	GT	3	6	25266	25271	0 %	50 %	50 %	0 %	291615551
53	NC_013957	CA	3	6	25406	25411	50 %	0 %	0 %	50 %	291615551
54	NC_013957	AT	3	6	26004	26009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013957	GA	3	6	27284	27289	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013957	GA	3	6	27328	27333	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013957	CT	3	6	27418	27423	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_013957	GA	3	6	27783	27788	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013957	TG	3	6	28227	28232	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.