MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter mustelae 12198 chromosome

Total Repeats: 633

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013949	TTCAAC	2	12	2190	2201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291276245
2	NC_013949	TCACAC	2	12	2703	2714	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	291276246
3	NC_013949	TGCCAG	2	12	3412	3423	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	291276246
4	NC_013949	ATTTTC	2	12	4197	4208	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	291276246
5	NC_013949	GAGATT	2	12	16165	16176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291276259
6	NC_013949	TGAGAT	2	12	16428	16439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291276259
7	NC_013949	TTTTTG	2	12	16895	16906	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	291276259
8	NC_013949	TTGCAT	2	12	22713	22724	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	291276261
9	NC_013949	TCTCCA	2	12	23654	23665	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	291276262
10	NC_013949	TGTGTT	2	12	24047	24058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291276262
11	NC_013949	CTCGAT	2	12	24120	24131	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	291276262
12	NC_013949	CCTCAT	2	12	26897	26908	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	291276265
13	NC_013949	TCTTTG	2	12	27505	27516	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	291276265
14	NC_013949	TCCAAA	2	12	30627	30638	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	291276266
15	NC_013949	TTTCAT	2	12	35887	35898	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	291276273
16	NC_013949	CAAAAA	2	12	36108	36119	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	291276274
17	NC_013949	CTTTGA	2	12	38820	38831	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	291276276
18	NC_013949	AGGGTG	2	12	38939	38950	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	291276276
19	NC_013949	CCCTTG	2	12	40029	40040	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	291276277
20	NC_013949	AATGGG	2	12	40705	40716	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	291276277
21	NC_013949	CATGCG	2	12	40869	40880	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	291276277
22	NC_013949	CCATCA	2	12	41016	41027	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	291276277
23	NC_013949	GTTGAG	2	12	41086	41097	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	291276277
24	NC_013949	TTTTTG	2	12	41249	41260	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	291276277
25	NC_013949	TATGGG	2	12	44922	44933	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	291276281
26	NC_013949	GCAAAA	2	12	46075	46086	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	291276282
27	NC_013949	TGTGGC	2	12	60323	60334	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	291276295
28	NC_013949	TAGAGC	2	12	63042	63053	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	291276296
29	NC_013949	GCCATA	2	12	65464	65475	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	291276298
30	NC_013949	TCCATG	2	12	69327	69338	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	291276300
31	NC_013949	TGGAGC	2	12	70348	70359	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	291276300
32	NC_013949	AGCTCC	2	12	73667	73678	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	291276301
33	NC_013949	ACATGG	2	12	74688	74699	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	291276301
34	NC_013949	GATAAA	2	12	76633	76644	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	291276301
35	NC_013949	TATGAA	2	12	78957	78968	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	291276302
36	NC_013949	CACAGG	2	12	80007	80018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291276302
37	NC_013949	TGGAGC	2	12	81465	81476	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	291276302
38	NC_013949	ATTTTG	2	12	82472	82483	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	291276302
39	NC_013949	AAGAGA	2	12	83285	83296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291276303
40	NC_013949	TATTGA	2	12	88209	88220	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	291276305
41	NC_013949	TGCCCC	2	12	92881	92892	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	291276309
42	NC_013949	TCTTAT	2	12	95412	95423	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	291276311
43	NC_013949	TCTTAT	2	12	98232	98243	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	291276312
44	NC_013949	TTTTTC	2	12	98558	98569	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	291276312
45	NC_013949	GCATTG	2	12	104432	104443	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	291276317
46	NC_013949	TGTGGA	2	12	105977	105988	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	291276320
47	NC_013949	TTGGTG	2	12	106110	106121	0 %	50 %	50 %	0 %	291276320
48	NC_013949	TGGGGG	2	12	107111	107122	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	291276322
49	NC_013949	TTATTT	2	12	110180	110191	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	291276324
50	NC_013949	ATTCAC	2	12	110935	110946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291276324
51	NC_013949	AGGCAT	2	12	112462	112473	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	291276326
52	NC_013949	GGGATT	2	12	138353	138364	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	291276345
53	NC_013949	CACTAT	2	12	146187	146198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291276354
54	NC_013949	CATTGG	2	12	146496	146507	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	291276354
55	NC_013949	TGGGAT	2	12	148079	148090	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	291276354
56	NC_013949	GCGATG	2	12	149807	149818	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	291276354
57	NC_013949	AAGTTG	2	12	150443	150454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291276354
58	NC_013949	AAATTG	2	12	152090	152101	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	291276354
59	NC_013949	CCACTA	2	12	157040	157051	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	291276355
60	NC_013949	TGGAAG	2	12	157650	157661	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	291276355
61	NC_013949	CCAATG	2	12	159251	159262	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	291276355
62	NC_013949	GATAGA	2	12	162746	162757	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	291276358
63	NC_013949	GGGGGA	2	12	170637	170648	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	291276364
64	NC_013949	GCTCAA	2	12	171591	171602	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	291276364
65	NC_013949	TGATGT	2	12	172587	172598	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	291276365
66	NC_013949	TTCGAT	2	12	175547	175558	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	291276369
67	NC_013949	GGATTT	2	12	186098	186109	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	291276381
68	NC_013949	GTGGAT	2	12	186168	186179	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	291276381
69	NC_013949	TTGGTT	2	12	188419	188430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291276384
70	NC_013949	ATCAGC	2	12	188677	188688	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	291276384
71	NC_013949	CATCTG	2	12	189781	189792	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	291276386
72	NC_013949	GTGGAT	2	12	191584	191595	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	291276386
73	NC_013949	TCAAAA	2	12	196720	196731	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	291276390
74	NC_013949	GCTCTT	2	12	198226	198237	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	291276391
75	NC_013949	CAAAAG	2	12	210066	210077	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	291276405
76	NC_013949	TTGGCT	3	18	211242	211259	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	291276406
77	NC_013949	GGTGAG	2	12	215071	215082	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	291276411
78	NC_013949	GCCCCT	3	18	216461	216478	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	291276413
79	NC_013949	GCATTA	2	12	219155	219166	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	291276415
80	NC_013949	GCTTTG	2	12	219985	219996	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	291276416
81	NC_013949	CATTGG	2	12	220083	220094	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	291276416
82	NC_013949	GGTGAT	2	12	223885	223896	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	291276420
83	NC_013949	AGCCTT	2	12	228579	228590	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	291276425
84	NC_013949	GTGAGT	2	12	228777	228788	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	291276425
85	NC_013949	ATTTTT	2	12	229543	229554	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	291276426
86	NC_013949	AGAAAA	2	12	235045	235056	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	291276430
87	NC_013949	TTTGCT	2	12	238110	238121	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	291276432
88	NC_013949	GTTTTT	2	12	243209	243220	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	291276436
89	NC_013949	TTCTTT	2	12	244395	244406	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	291276437
90	NC_013949	GCATTG	2	12	244495	244506	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	291276437
91	NC_013949	CCTCTG	2	12	247461	247472	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	291276438
92	NC_013949	CAAAGG	2	12	247887	247898	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	291276438
93	NC_013949	TCTTTG	2	12	249584	249595	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	291276439
94	NC_013949	CTTTCC	2	12	251444	251455	0 %	50 %	0 %	50 %	291276441
95	NC_013949	TGTTTG	2	12	251888	251899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291276442
96	NC_013949	GCGGGA	2	12	268292	268303	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	291276454
97	NC_013949	ATTTTT	2	12	270714	270725	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	291276456
98	NC_013949	ATGTCA	2	12	272328	272339	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	291276458
99	NC_013949	TTTTGC	2	12	273061	273072	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	291276458
100	NC_013949	GAAATG	2	12	274666	274677	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	291276460
101	NC_013949	AGTCCC	2	12	279713	279724	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	291276464
102	NC_013949	CTGCAG	2	12	279895	279906	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	291276464
103	NC_013949	GGGTTT	2	12	281381	281392	0 %	50 %	50 %	0 %	291276465
104	NC_013949	TTTTTG	2	12	283573	283584	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	291276467
105	NC_013949	TCCAAA	2	12	289203	289214	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	291276474
106	NC_013949	GCACAG	2	12	301579	301590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291276487
107	NC_013949	TTTGGC	2	12	303962	303973	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	291276490
108	NC_013949	TGTATT	2	12	304701	304712	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	291276491
109	NC_013949	TTGGTT	2	12	305349	305360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291276491
110	NC_013949	AATTTT	2	12	309287	309298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291276496
111	NC_013949	TTGAAT	2	12	309933	309944	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	291276496
112	NC_013949	GCTGAG	2	12	320595	320606	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	291276504
113	NC_013949	TTTCTA	2	12	320774	320785	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	291276504
114	NC_013949	CATCTT	2	12	322431	322442	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	291276505
115	NC_013949	AAGACA	2	12	325925	325936	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	291276508
116	NC_013949	CAAAAT	2	12	328170	328181	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	291276509
117	NC_013949	TCTTTG	2	12	329874	329885	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	291276510
118	NC_013949	TGCCTA	2	12	334903	334914	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	291276517
119	NC_013949	GAAAAA	2	12	335759	335770	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	291276517
120	NC_013949	TTCTCT	2	12	336391	336402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291276518
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229	NC_013949	GCTCCA	2	12	678750	678761	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	291276816
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231	NC_013949	GGAGAT	2	12	685435	685446	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	291276822
232	NC_013949	AATCAA	2	12	686545	686556	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	291276822
233	NC_013949	TAGGGA	2	12	688468	688479	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	291276824
234	NC_013949	TGAAGA	2	12	694633	694644	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	291276828
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333	NC_013949	AGCAAA	2	12	912892	912903	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	291277002
334	NC_013949	ATGCCT	2	12	915472	915483	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	291277004
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341	NC_013949	GCTGTG	2	12	932390	932401	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	291277016
342	NC_013949	ATGCCA	2	12	933507	933518	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	291277016
343	NC_013949	AGCTCT	2	12	936694	936705	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	291277019
344	NC_013949	TTCACT	2	12	937054	937065	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	291277019
345	NC_013949	AGGTGA	2	12	937863	937874	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	291277020
346	NC_013949	TCTCTT	2	12	938279	938290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291277021
347	NC_013949	TTTTTG	2	12	939712	939723	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	291277024
348	NC_013949	TGAGGG	2	12	942625	942636	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	291277025
349	NC_013949	CTATGA	2	12	945678	945689	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	291277026
350	NC_013949	CCTATG	2	12	945722	945733	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	291277026
351	NC_013949	CCTAGG	2	12	945816	945827	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	291277026
352	NC_013949	TTCCCC	2	12	949424	949435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291277030
353	NC_013949	TGGAAG	2	12	949887	949898	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	291277030
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364	NC_013949	AAGGTA	2	12	967003	967014	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	291277041
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366	NC_013949	GGGGCT	2	12	970673	970684	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	291277041
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368	NC_013949	GGCATT	2	12	971706	971717	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	291277041
369	NC_013949	GACCTT	2	12	972491	972502	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	291277041
370	NC_013949	TGTTGG	2	12	973058	973069	0 %	50 %	50 %	0 %	291277041
371	NC_013949	CCATTG	2	12	973882	973893	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	291277041
372	NC_013949	TATTGC	2	12	974063	974074	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	291277041
373	NC_013949	ATTGAG	2	12	974133	974144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291277041
374	NC_013949	ATTGAG	2	12	975036	975047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291277041
375	NC_013949	TGCCAG	2	12	977369	977380	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	291277042
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380	NC_013949	TTAGCA	2	12	994863	994874	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	291277055
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392	NC_013949	GCATTA	2	12	1013951	1013962	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	291277077
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400	NC_013949	TAATGC	2	12	1019487	1019498	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	291277090
401	NC_013949	TAATGC	2	12	1020563	1020574	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	291277092
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405	NC_013949	ATTGCC	2	12	1049802	1049813	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	291277122
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409	NC_013949	ATATTA	2	12	1058175	1058186	50 %	50 %	0 %	0 %	291277130
410	NC_013949	GCCATC	2	12	1060544	1060555	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	291277133
411	NC_013949	CAAAAA	2	12	1060935	1060946	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	291277134
412	NC_013949	TGCCAA	2	12	1065487	1065498	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	291277138
413	NC_013949	CGAGCT	2	12	1065775	1065786	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	291277138
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415	NC_013949	CCCTGC	2	12	1070959	1070970	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	291277142
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429	NC_013949	TGCATC	2	12	1095978	1095989	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	291277173
430	NC_013949	CATGAT	2	12	1098346	1098357	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	291277178
431	NC_013949	TTTGCT	2	12	1099135	1099146	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	291277179
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441	NC_013949	GCGCAG	2	12	1127278	1127289	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	291277207
442	NC_013949	ATAATT	2	12	1127369	1127380	50 %	50 %	0 %	0 %	291277207
443	NC_013949	TCCTTG	2	12	1131112	1131123	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	291277211
444	NC_013949	GAGATT	2	12	1132614	1132625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291277211
445	NC_013949	AAGCAC	2	12	1134973	1134984	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	291277213
446	NC_013949	AGTGGG	2	12	1138107	1138118	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	291277216
447	NC_013949	TCCTGC	2	12	1138201	1138212	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	291277216
448	NC_013949	AGAAAA	2	12	1140820	1140831	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	291277218
449	NC_013949	AATCCC	2	12	1142272	1142283	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	291277220
450	NC_013949	TCAATC	2	12	1146879	1146890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291277223
451	NC_013949	ATCCGT	2	12	1147091	1147102	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	291277224
452	NC_013949	TTTAAA	2	12	1147304	1147315	50 %	50 %	0 %	0 %	291277224
453	NC_013949	CCATGT	2	12	1147479	1147490	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	291277224
454	NC_013949	CAATGG	2	12	1149736	1149747	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	291277227
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456	NC_013949	GGGGAT	2	12	1158704	1158715	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	291277234
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