MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter mustelae 12198 chromosome

Total Repeats: 16964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013949	GAA	2	6	49	54	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291276244
2	NC_013949	CGT	2	6	222	227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291276244
3	NC_013949	CCT	2	6	299	304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291276244
4	NC_013949	TAA	2	6	336	341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291276244
5	NC_013949	ATT	2	6	518	523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291276244
6	NC_013949	ATT	2	6	581	586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291276244
7	NC_013949	TGA	2	6	594	599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291276244
8	NC_013949	AGA	2	6	726	731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291276244
9	NC_013949	ATC	2	6	805	810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291276244
10	NC_013949	CAT	2	6	822	827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291276244
11	NC_013949	TCA	2	6	828	833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291276244
12	NC_013949	CAT	2	6	852	857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291276244
13	NC_013949	CAT	2	6	906	911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291276244
14	NC_013949	CAT	2	6	1026	1031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291276244
15	NC_013949	CAA	2	6	1224	1229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291276244
16	NC_013949	AGA	2	6	1239	1244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291276244
17	NC_013949	TAA	2	6	1462	1467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291276245
18	NC_013949	ATT	2	6	1481	1486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291276245
19	NC_013949	CTC	2	6	1522	1527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291276245
20	NC_013949	AGA	2	6	1561	1566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291276245
21	NC_013949	TTG	2	6	1800	1805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291276245
22	NC_013949	TTG	2	6	1916	1921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291276245
23	NC_013949	ATT	2	6	1932	1937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291276245
24	NC_013949	TAT	2	6	2014	2019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291276245
25	NC_013949	TCA	2	6	2097	2102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291276245
26	NC_013949	ATT	2	6	2115	2120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291276245
27	NC_013949	AGA	2	6	2359	2364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291276245
28	NC_013949	CAT	2	6	2630	2635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291276246
29	NC_013949	GTG	2	6	2648	2653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291276246
30	NC_013949	TGA	2	6	2665	2670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291276246
31	NC_013949	GAT	2	6	2738	2743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291276246
32	NC_013949	GGA	2	6	2858	2863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291276246
33	NC_013949	ATC	2	6	2987	2992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291276246
34	NC_013949	TCA	2	6	3078	3083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291276246
35	NC_013949	AGA	2	6	3136	3141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291276246
36	NC_013949	AGA	2	6	3196	3201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291276246
37	NC_013949	TAT	2	6	3229	3234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291276246
38	NC_013949	ATG	2	6	3297	3302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291276246
39	NC_013949	AAT	2	6	3323	3328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291276246
40	NC_013949	TGG	2	6	3343	3348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291276246
41	NC_013949	ATT	2	6	3476	3481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291276246
42	NC_013949	GAA	2	6	3596	3601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291276246
43	NC_013949	GCA	2	6	3662	3667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291276246
44	NC_013949	GGT	2	6	3797	3802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291276246
45	NC_013949	TGA	2	6	3904	3909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291276246
46	NC_013949	GGA	2	6	3949	3954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291276246
47	NC_013949	ATC	2	6	3986	3991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291276246
48	NC_013949	CAA	2	6	4430	4435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291276246
49	NC_013949	TGA	2	6	4483	4488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291276246
50	NC_013949	CAA	2	6	4534	4539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291276246
51	NC_013949	CTT	2	6	4589	4594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291276246
52	NC_013949	GAA	2	6	4595	4600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291276246
53	NC_013949	GAA	2	6	4604	4609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291276246
54	NC_013949	AGC	2	6	4668	4673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291276246
55	NC_013949	AGA	2	6	4726	4731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291276246
56	NC_013949	ATT	2	6	4759	4764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291276246
57	NC_013949	CGC	2	6	4787	4792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291276246
58	NC_013949	ATC	2	6	5045	5050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291276247
59	NC_013949	ATT	2	6	5093	5098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291276248
60	NC_013949	CTT	2	6	5112	5117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291276248
61	NC_013949	TTC	2	6	5125	5130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291276248
62	NC_013949	GAA	2	6	5181	5186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291276248
63	NC_013949	CAT	2	6	5523	5528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291276248
64	NC_013949	TAG	2	6	5552	5557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291276248
65	NC_013949	GCA	2	6	5579	5584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291276248
66	NC_013949	TGA	2	6	5610	5615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291276248
67	NC_013949	AGA	2	6	5661	5666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291276248
68	NC_013949	TTG	2	6	5672	5677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291276248
69	NC_013949	ATT	2	6	6640	6645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291276249
70	NC_013949	GTA	2	6	6694	6699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291276249
71	NC_013949	TTA	2	6	6833	6838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291276249
72	NC_013949	ATG	2	6	6898	6903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291276249
73	NC_013949	CCT	2	6	7193	7198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291276249
74	NC_013949	ATA	2	6	7237	7242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291276249
75	NC_013949	CCA	2	6	7468	7473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291276250
76	NC_013949	AGC	2	6	7576	7581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291276250
77	NC_013949	TCA	2	6	8121	8126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291276251
78	NC_013949	ATT	2	6	8165	8170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291276251
79	NC_013949	TGA	2	6	8470	8475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291276251
80	NC_013949	CAG	3	9	8692	8700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291276251
81	NC_013949	AGA	2	6	8702	8707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291276251
82	NC_013949	TAC	2	6	8734	8739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291276251
83	NC_013949	AGT	2	6	8756	8761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291276251
84	NC_013949	GTT	2	6	8771	8776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291276251
85	NC_013949	GTA	2	6	8780	8785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291276251
86	NC_013949	TGG	2	6	8800	8805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291276251
87	NC_013949	TTC	2	6	8807	8812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291276251
88	NC_013949	GCA	3	9	8823	8831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291276251
89	NC_013949	GGA	2	6	8858	8863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291276251
90	NC_013949	ATG	2	6	8882	8887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291276251
91	NC_013949	TCA	2	6	8976	8981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291276251
92	NC_013949	AAT	2	6	9021	9026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291276251
93	NC_013949	ACC	2	6	9050	9055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291276251
94	NC_013949	GAA	2	6	9173	9178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291276252
95	NC_013949	GGA	2	6	9257	9262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291276252
96	NC_013949	GTG	2	6	9326	9331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291276252
97	NC_013949	GCT	2	6	9492	9497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291276252
98	NC_013949	GCG	2	6	9574	9579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291276252
99	NC_013949	CGT	2	6	9599	9604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291276252
100	NC_013949	TCT	2	6	9640	9645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291276253
101	NC_013949	TGA	2	6	9659	9664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291276253
102	NC_013949	TCC	2	6	9718	9723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291276253
103	NC_013949	ATG	2	6	9751	9756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291276253
104	NC_013949	TGA	2	6	9926	9931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291276253
105	NC_013949	ATT	2	6	10035	10040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291276253
106	NC_013949	ATC	2	6	10065	10070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291276253
107	NC_013949	TCA	2	6	10223	10228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291276253
108	NC_013949	CAT	2	6	10433	10438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291276254
109	NC_013949	TCT	2	6	10573	10578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291276254
110	NC_013949	GAT	2	6	10694	10699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291276254
111	NC_013949	CAT	2	6	10764	10769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291276254
112	NC_013949	CTT	2	6	10880	10885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291276254
113	NC_013949	AAG	2	6	10997	11002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291276254
114	NC_013949	GTT	2	6	11226	11231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291276255
115	NC_013949	GAT	2	6	11291	11296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291276255
116	NC_013949	ATA	2	6	11590	11595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291276255
117	NC_013949	TCA	2	6	11607	11612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291276255
118	NC_013949	CCA	2	6	11629	11634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291276255
119	NC_013949	TGG	2	6	11646	11651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291276255
120	NC_013949	CTT	2	6	11713	11718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291276255
121	NC_013949	GAT	2	6	11774	11779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291276255
122	NC_013949	AGG	2	6	11818	11823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291276255
123	NC_013949	TAA	2	6	12027	12032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291276256
124	NC_013949	ACC	2	6	12038	12043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291276256
125	NC_013949	GAT	2	6	12110	12115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291276256
126	NC_013949	TGA	2	6	12346	12351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291276256
127	NC_013949	GAA	2	6	12441	12446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291276256
128	NC_013949	AGA	2	6	12688	12693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291276256
129	NC_013949	TGA	2	6	12764	12769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291276257
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131	NC_013949	CAT	2	6	13098	13103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291276257
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500	NC_013949	GAT	2	6	49622	49627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291276286

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