MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma agalactiae chromosome

Total Repeats: 64

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013948	AAACTA	2	12	21585	21596	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_013948	TAAACA	2	12	31313	31324	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_013948	ATTAAA	2	12	69822	69833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013948	AAAATT	2	12	144862	144873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013948	AAGCAA	2	12	155700	155711	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_013948	GTTTGC	2	12	155713	155724	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_013948	TTGCAA	2	12	155727	155738	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_013948	AATAAA	2	12	166738	166749	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013948	TAAAAT	2	12	166770	166781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013948	ATATAA	2	12	166784	166795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013948	AAAATT	2	12	169541	169552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013948	TTAATA	2	12	186289	186300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013948	CAGAAA	2	12	201052	201063	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_013948	ATTATA	2	12	204965	204976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013948	CTATTG	2	12	224743	224754	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_013948	ATTTTT	2	12	250211	250222	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013948	TCATTT	2	12	250278	250289	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_013948	AATTTG	2	12	250367	250378	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013948	TATTTT	2	12	252134	252145	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013948	ATTTTT	2	12	286584	286595	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013948	TTTTTA	2	12	296828	296839	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013948	ATTTAA	2	12	327943	327954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013948	TAAAAT	2	12	331208	331219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013948	ATTTTT	2	12	338552	338563	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013948	AATATT	2	12	345055	345066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013948	TAATTA	2	12	369108	369119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013948	CAAAAT	2	12	398579	398590	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_013948	TTTTAG	2	12	403048	403059	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013948	TTTTTA	2	12	422259	422270	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013948	TTTTCT	2	12	427892	427903	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_013948	AATGAC	2	12	432501	432512	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_013948	TATAAA	2	12	440239	440250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013948	TAAAAT	2	12	450787	450798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013948	ATTATA	2	12	488107	488118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013948	AGTTTA	2	12	498026	498037	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013948	TATTTT	2	12	522327	522338	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013948	CACTTA	2	12	523827	523838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_013948	ATTAAA	2	12	537764	537775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013948	TAAATT	2	12	537831	537842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013948	TAGTTT	2	12	546646	546657	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013948	ATTTTT	2	12	555867	555878	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013948	AATATT	2	12	562104	562115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013948	TAATTA	2	12	586158	586169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013948	TAAAAA	2	12	654222	654233	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013948	CTCCAG	2	12	664652	664663	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
46	NC_013948	CTCCAG	2	12	669653	669664	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
47	NC_013948	ATTTTA	2	12	688316	688327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013948	TTAATA	2	12	743045	743056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013948	CTTTTG	2	12	775688	775699	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_013948	ACCCCA	2	12	782055	782066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_013948	TTTTGT	2	12	794476	794487	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013948	AAAAAT	2	12	810988	810999	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013948	TATGCA	2	12	811844	811855	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_013948	GTTTTT	2	12	811858	811869	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013948	TAATTA	2	12	814958	814969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013948	AATATT	2	12	839012	839023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013948	ATTTTA	2	12	842446	842457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013948	TTTTTA	2	12	854092	854103	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013948	ATGAAT	2	12	878717	878728	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013948	CATTTT	2	12	879569	879580	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_013948	TAATTA	2	12	880266	880277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013948	TTATTT	2	12	948539	948550	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013948	AAAAAT	2	12	964406	964417	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013948	ATAAAC	2	12	973500	973511	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.