MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Mycoplasma agalactiae chromosome

Total Repeats: 530

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013948	TAAAAC	2	12	363	374	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	291319938
2	NC_013948	ACATTA	2	12	1859	1870	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	291319939
3	NC_013948	AACTTC	2	12	6855	6866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291319943
4	NC_013948	AACTTC	2	12	7962	7973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291319944
5	NC_013948	CCAATT	2	12	8909	8920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291319945
6	NC_013948	TTTATC	2	12	11749	11760	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	291319949
7	NC_013948	AGCTAA	2	12	13748	13759	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	291319951
8	NC_013948	CAAAAT	2	12	15738	15749	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	291319952
9	NC_013948	TACAAA	2	12	17562	17573	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	291319953
10	NC_013948	ATTATG	2	12	17685	17696	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	291319953
11	NC_013948	TTGCAA	2	12	19530	19541	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	291319955
12	NC_013948	AATATA	2	12	27648	27659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291319962
13	NC_013948	CATTTT	2	12	32844	32855	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	291319967
14	NC_013948	AACATT	2	12	33422	33433	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	291319967
15	NC_013948	TTTTAA	2	12	33835	33846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291319967
16	NC_013948	TAAATT	2	12	34024	34035	50 %	50 %	0 %	0 %	291319967
17	NC_013948	GAAAAA	2	12	34233	34244	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	291319968
18	NC_013948	CTTTTC	2	12	34775	34786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291319969
19	NC_013948	ATTTAA	2	12	35762	35773	50 %	50 %	0 %	0 %	291319969
20	NC_013948	CTAAAC	2	12	40035	40046	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	291319973
21	NC_013948	GTGCTT	2	12	44944	44955	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	291319974
22	NC_013948	ATTAGC	2	12	46602	46613	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	291319974
23	NC_013948	ATCTTT	2	12	51618	51629	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	291319974
24	NC_013948	TTTGTT	2	12	52050	52061	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	291319974
25	NC_013948	ATGAAA	2	12	53688	53699	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	291319975
26	NC_013948	ACTTTA	2	12	54063	54074	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	291319975
27	NC_013948	GTTGAA	2	12	56585	56596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291319980
28	NC_013948	AGTGTT	2	12	57101	57112	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	291319981
29	NC_013948	ACTAAA	2	12	63509	63520	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	291319988
30	NC_013948	GAAAAT	2	12	65502	65513	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	291319990
31	NC_013948	TAAGAA	2	12	65608	65619	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	291319990
32	NC_013948	CAATAT	2	12	66936	66947	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	291319991
33	NC_013948	TCAAAA	2	12	68181	68192	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	291319992
34	NC_013948	GTCATC	2	12	69368	69379	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	291319993
35	NC_013948	ATGCAA	2	12	72953	72964	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	291319997
36	NC_013948	AATTTC	2	12	80158	80169	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	291320001
37	NC_013948	GAAAAG	2	12	80337	80348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291320001
38	NC_013948	TTGATA	2	12	80712	80723	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	291320001
39	NC_013948	CAAAAA	2	12	84110	84121	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	291320004
40	NC_013948	ATGTTG	2	12	86597	86608	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	291320006
41	NC_013948	AATGGC	2	12	89956	89967	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	291320009
42	NC_013948	AATGGC	2	12	90896	90907	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	291320010
43	NC_013948	AGATAT	2	12	93900	93911	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	291320013
44	NC_013948	TGTTCG	2	12	96458	96469	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	291320017
45	NC_013948	CCAGTT	2	12	96588	96599	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	291320017
46	NC_013948	CTTTGA	2	12	97237	97248	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	291320018
47	NC_013948	AACTCC	2	12	97348	97359	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	291320018
48	NC_013948	TTGAAA	2	12	101487	101498	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	291320023
49	NC_013948	TGTTTT	2	12	105718	105729	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	291320029
50	NC_013948	GAGACA	2	12	106947	106958	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	291320030
51	NC_013948	GAAAAA	2	12	108044	108055	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	291320031
52	NC_013948	ATTAAA	2	12	110253	110264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291320034
53	NC_013948	CACCCA	2	12	111938	111949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291320035
54	NC_013948	CAACTA	2	12	113132	113143	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	291320038
55	NC_013948	TTAGAA	2	12	116154	116165	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	291320040
56	NC_013948	AGCACC	2	12	116231	116242	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	291320040
57	NC_013948	TGTCTT	2	12	119344	119355	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	291320041
58	NC_013948	AAGAAA	2	12	119947	119958	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	291320041
59	NC_013948	TAAGTT	2	12	121217	121228	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	291320042
60	NC_013948	GAAGTA	2	12	124109	124120	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	291320044
61	NC_013948	CTAATG	2	12	124638	124649	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	291320044
62	NC_013948	TAAAAG	2	12	126538	126549	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	291320047
63	NC_013948	AAATAT	2	12	132147	132158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291320050
64	NC_013948	AAAGAA	2	12	135994	136005	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	291320056
65	NC_013948	GGAAAA	2	12	137501	137512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291320057
66	NC_013948	ATGTTG	2	12	138442	138453	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	291320058
67	NC_013948	TTAGAA	2	12	139149	139160	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	291320058
68	NC_013948	ATGTTA	2	12	139710	139721	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	291320059
69	NC_013948	TGCAAA	2	12	140332	140343	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	291320059
70	NC_013948	AGTTCC	2	12	141476	141487	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	291320060
71	NC_013948	TTCATA	2	12	143421	143432	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	291320061
72	NC_013948	GACATT	2	12	146220	146231	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	291320062
73	NC_013948	AGCTAG	2	12	148099	148110	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	291320064
74	NC_013948	GATAAA	2	12	149739	149750	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	291320065
75	NC_013948	TAATAT	2	12	152620	152631	50 %	50 %	0 %	0 %	291320068
76	NC_013948	AAAATC	2	12	154994	155005	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	291320070
77	NC_013948	TTGAAA	2	12	156445	156456	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	291320071
78	NC_013948	TAAAAG	2	12	156496	156507	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	291320071
79	NC_013948	GCTAAT	2	12	156813	156824	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	291320071
80	NC_013948	GATATT	2	12	159386	159397	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	291320072
81	NC_013948	CATTTT	2	12	159894	159905	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	291320072
82	NC_013948	TGAAAG	2	12	160617	160628	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	291320072
83	NC_013948	TGGCTA	2	12	164796	164807	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	291320077
84	NC_013948	TAAATT	2	12	169261	169272	50 %	50 %	0 %	0 %	291320080
85	NC_013948	AGCTTT	2	12	170089	170100	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	291320081
86	NC_013948	CAAAGA	2	12	171019	171030	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	291320081
87	NC_013948	TTATTG	2	12	176004	176015	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	291320086
88	NC_013948	CATATG	2	12	177941	177952	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	291320087
89	NC_013948	TATCTT	2	12	179877	179888	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	291320088
90	NC_013948	GAAAAT	2	12	183812	183823	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	291320090
91	NC_013948	GATAAA	2	12	189270	189281	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	291320093
92	NC_013948	TTATGG	2	12	189467	189478	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	291320093
93	NC_013948	AAAATA	2	12	189725	189736	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	291320093
94	NC_013948	AAATCA	2	12	191274	191285	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	291320094
95	NC_013948	ATCTTT	2	12	194259	194270	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	291320097
96	NC_013948	GCACTT	2	12	196215	196226	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	291320098
97	NC_013948	AATATC	2	12	196621	196632	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	291320098
98	NC_013948	TCATTT	2	12	204822	204833	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	291320102
99	NC_013948	AATGTT	2	12	207687	207698	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	291320104
100	NC_013948	AATGTT	2	12	208851	208862	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	291320106
101	NC_013948	TACATT	2	12	208923	208934	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	291320106
102	NC_013948	ACTTTT	2	12	210303	210314	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	291320107
103	NC_013948	TGAGCC	2	12	211537	211548	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	291320108
104	NC_013948	AATATA	2	12	216588	216599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291320112
105	NC_013948	AAATTT	2	12	226870	226881	50 %	50 %	0 %	0 %	291320120
106	NC_013948	ATTAGC	2	12	232416	232427	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	291320125
107	NC_013948	TCAAAA	2	12	234050	234061	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	291320126
108	NC_013948	CAAAGA	2	12	234851	234862	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	291320126
109	NC_013948	AGAAGT	2	12	234974	234985	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	291320126
110	NC_013948	CAAAGA	2	12	237225	237236	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	291320130
111	NC_013948	ACCTAG	2	12	237855	237866	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	291320132
112	NC_013948	AGCTTT	2	12	238158	238169	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	291320132
113	NC_013948	CTGCTC	2	12	238271	238282	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	291320132
114	NC_013948	AACTAA	2	12	240900	240911	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	291320135
115	NC_013948	CATAAA	2	12	241148	241159	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	291320135
116	NC_013948	TTACTT	2	12	244045	244056	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	291320137
117	NC_013948	CAATGC	2	12	246386	246397	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	291320140
118	NC_013948	AAAACA	2	12	247850	247861	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	291320142
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120	NC_013948	AAAACA	2	12	252693	252704	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	291320144
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122	NC_013948	TTTCAA	2	12	259024	259035	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	291320147
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233	NC_013948	TTTATT	2	12	443047	443058	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	291320291
234	NC_013948	AGTAAA	2	12	443220	443231	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	291320291
235	NC_013948	TTGGTC	2	12	445017	445028	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	291320294
236	NC_013948	CAATTG	2	12	446844	446855	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	291320297
237	NC_013948	AACTTG	2	12	447462	447473	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	291320297
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343	NC_013948	TTGTCT	2	12	683264	683275	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	291320483
344	NC_013948	TTTCTG	2	12	683301	683312	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	291320483
345	NC_013948	ATGAAA	2	12	684490	684501	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	291320484
346	NC_013948	TTTGAA	2	12	686264	686275	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	291320486
347	NC_013948	AATATA	2	12	686423	686434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291320486
348	NC_013948	TCAAAG	2	12	686689	686700	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	291320486
349	NC_013948	CATTTT	2	12	687976	687987	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	291320487
350	NC_013948	TACCTT	2	12	689062	689073	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	291320489
351	NC_013948	TGAGAA	2	12	689276	689287	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	291320489
352	NC_013948	CTTTTT	2	12	695542	695553	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	291320504
353	NC_013948	ACAGAT	2	12	695939	695950	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	291320505
354	NC_013948	CCTTTA	2	12	697246	697257	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	291320506
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375	NC_013948	GTTCTT	2	12	755118	755129	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	291320552
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450	NC_013948	TTTCAA	2	12	884665	884676	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	291320640
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454	NC_013948	TATTGA	2	12	891271	891282	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	291320644
455	NC_013948	TGATGT	2	12	891962	891973	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	291320645
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457	NC_013948	CTCATC	2	12	893511	893522	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	291320647
458	NC_013948	TGCATA	2	12	893730	893741	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	291320647
459	NC_013948	CTTTTG	2	12	894020	894031	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	291320647
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461	NC_013948	AATGTG	2	12	895816	895827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291320649
462	NC_013948	ATAAAT	2	12	897942	897953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291320651
463	NC_013948	AAAACA	2	12	899115	899126	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	291320652
464	NC_013948	TAAATA	2	12	903147	903158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291320656
465	NC_013948	TCAGAT	2	12	903514	903525	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	291320657
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