MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma agalactiae chromosome

Total Repeats: 190

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013948	TATTT	2	10	2886	2895	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013948	TAGTT	2	10	12745	12754	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013948	ATTTT	2	10	21547	21556	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013948	TCTTT	2	10	24941	24950	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_013948	TAATT	2	10	34542	34551	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013948	AACAA	2	10	52742	52751	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_013948	TATAA	2	10	53037	53046	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013948	ACTAA	2	10	54307	54316	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_013948	ATTTT	2	10	67228	67237	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013948	TAATA	2	10	76574	76583	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013948	CATAA	2	10	103205	103214	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_013948	AATTA	2	10	113967	113976	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013948	TCTTT	2	10	115461	115470	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_013948	TATAA	2	10	125918	125927	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013948	TAATA	2	10	132801	132810	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013948	CTTTT	2	10	137650	137659	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_013948	TAGTT	2	10	155534	155543	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013948	ATTGC	2	10	173502	173511	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_013948	AATTA	2	10	174579	174588	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013948	AAATT	2	10	174633	174642	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013948	TTTAT	2	10	177165	177174	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013948	AATTG	2	10	181499	181508	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013948	TAATT	2	10	184449	184458	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013948	ATTTA	2	10	184495	184504	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013948	TTTTG	2	10	191547	191556	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013948	AAAAT	2	10	191996	192005	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013948	TAATC	2	10	205075	205084	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_013948	ATTAA	2	10	220966	220975	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013948	CAAAG	2	10	229896	229905	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_013948	ATTTT	2	10	236350	236359	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013948	TAGTT	2	10	244265	244274	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013948	TAATA	2	10	244307	244316	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013948	TCTTT	2	10	249978	249987	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_013948	AGTTA	2	10	252171	252180	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013948	ATTTA	2	10	273341	273350	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013948	TTTTA	2	10	273721	273730	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013948	TTTAA	2	10	281118	281127	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013948	TAATA	2	10	287818	287827	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013948	ATTTA	2	10	289067	289076	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013948	ATAAA	2	10	291407	291416	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013948	ATTTT	2	10	306770	306779	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013948	AAATA	2	10	307737	307746	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013948	TTAAA	2	10	311164	311173	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013948	AATTA	2	10	325297	325306	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013948	ATTTA	2	10	327962	327971	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013948	TCTTA	2	10	329309	329318	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_013948	AATAA	2	10	331377	331386	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013948	TTATA	2	10	334985	334994	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013948	ATTTT	2	10	336416	336425	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013948	ATTAA	2	10	344406	344415	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013948	ATTAA	2	10	344850	344859	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013948	TTTAA	2	10	345553	345562	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013948	GTAAT	2	10	347745	347754	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013948	TTTTG	2	10	369187	369196	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013948	AAATA	2	10	370899	370908	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013948	GAATT	2	10	370932	370941	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013948	AGTTA	2	10	373382	373391	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013948	GCTTT	2	10	388039	388048	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_013948	ATTAA	2	10	398377	398386	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013948	AAAAT	2	10	416667	416676	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013948	GAATT	2	10	424633	424642	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013948	TTTCT	2	10	424946	424955	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_013948	TCTTT	2	10	427658	427667	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_013948	ATTAT	2	10	430994	431003	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013948	ATGTA	2	10	431037	431046	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013948	GTAAA	2	10	431360	431369	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013948	TGAAA	2	10	431854	431863	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013948	GAAAA	2	10	432246	432255	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013948	TGAAA	2	10	432315	432324	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013948	AAAGA	2	10	432440	432449	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013948	TAATG	2	10	434461	434470	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013948	AAACA	2	10	438623	438632	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_013948	ACTTC	2	10	440227	440236	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_013948	ATTTA	2	10	441657	441666	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013948	CTTAA	2	10	443502	443511	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_013948	TAAAA	2	10	443526	443535	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013948	TGCAA	2	10	443569	443578	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_013948	TCTTT	2	10	454658	454667	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_013948	TAATT	2	10	461801	461810	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013948	AAAGA	2	10	461962	461971	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013948	ACTTT	2	10	464338	464347	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_013948	TAAAA	2	10	466902	466911	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013948	ATATT	2	10	475380	475389	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013948	TGTTT	2	10	483905	483914	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013948	TAAAT	2	10	484647	484656	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013948	AAAAT	2	10	496320	496329	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013948	GTTTT	2	10	498972	498981	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013948	ATTTT	2	10	498990	498999	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013948	AACTA	2	10	517021	517030	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_013948	TTTGT	2	10	522431	522440	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013948	ATAAA	2	10	526588	526597	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013948	ATTAT	2	10	537753	537762	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013948	TGTTT	2	10	538649	538658	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013948	ATTTA	2	10	542369	542378	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013948	TCTTT	2	10	557324	557333	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_013948	ATTTT	2	10	557606	557615	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013948	ATTAA	2	10	561455	561464	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013948	ATTAA	2	10	561899	561908	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013948	TTTAA	2	10	562602	562611	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013948	GTAAT	2	10	564794	564803	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013948	TAAAA	2	10	571805	571814	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013948	AATCA	2	10	572152	572161	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_013948	TTTGC	2	10	586047	586056	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_013948	TGGAA	2	10	586110	586119	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013948	TTTTG	2	10	586237	586246	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013948	AAATA	2	10	587948	587957	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013948	GAATT	2	10	587981	587990	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013948	TTATA	2	10	609085	609094	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013948	AAAAC	2	10	609221	609230	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_013948	TTTAT	2	10	609245	609254	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013948	ACTAT	2	10	610760	610769	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_013948	ATTTT	2	10	610791	610800	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013948	TTTTA	2	10	612642	612651	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013948	AATAA	2	10	614982	614991	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013948	AAAGA	2	10	617123	617132	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013948	AAATT	2	10	622198	622207	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013948	TAATT	2	10	623378	623387	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013948	AAAAG	2	10	623951	623960	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013948	TAATT	2	10	633070	633079	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013948	TAAAA	2	10	652188	652197	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013948	TAAAT	2	10	654468	654477	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013948	AATTA	2	10	654514	654523	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013948	AAAAT	2	10	658384	658393	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013948	TACTT	2	10	661790	661799	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_013948	TTTTC	2	10	666956	666965	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_013948	CGTAG	2	10	667656	667665	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
127	NC_013948	CACGA	2	10	667946	667955	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_013948	TTTTC	2	10	671957	671966	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_013948	CGTAG	2	10	672657	672666	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_013948	CACGA	2	10	672947	672956	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
131	NC_013948	TCTTT	2	10	675640	675649	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_013948	AAAAT	2	10	677746	677755	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013948	GAAAA	2	10	680418	680427	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013948	TCTTT	2	10	685989	685998	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_013948	CTAAT	2	10	697599	697608	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_013948	ATTTT	2	10	698441	698450	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013948	TTTTA	2	10	704130	704139	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013948	CTTTC	2	10	713192	713201	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
139	NC_013948	ATTTA	2	10	730322	730331	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013948	CTTTT	2	10	730350	730359	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_013948	GAAAA	2	10	730525	730534	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013948	TTTGC	2	10	743093	743102	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_013948	AAAAT	2	10	744336	744345	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013948	AATTA	2	10	745929	745938	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013948	CTTTC	2	10	756241	756250	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
146	NC_013948	TAAAA	2	10	757785	757794	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013948	TAAAA	2	10	762363	762372	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013948	CTTTA	2	10	769012	769021	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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189	NC_013948	TATAT	2	10	981956	981965	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.