MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 chromosome

Total Repeats: 2638

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013946	GTTAG	2	10	1352	1361	20 %	40 %	40 %	0 %	291294405
2	NC_013946	ACTCG	2	10	3149	3158	20 %	20 %	20 %	40 %	291294407
3	NC_013946	GGGCT	2	10	3483	3492	0 %	20 %	60 %	20 %	291294407
4	NC_013946	TGCCC	2	10	6499	6508	0 %	20 %	20 %	60 %	291294409
5	NC_013946	CCCTG	2	10	7834	7843	0 %	20 %	20 %	60 %	291294411
6	NC_013946	TGGGG	2	10	8362	8371	0 %	20 %	80 %	0 %	291294412
7	NC_013946	TGTCC	2	10	8994	9003	0 %	40 %	20 %	40 %	291294413
8	NC_013946	TGCGG	2	10	9380	9389	0 %	20 %	60 %	20 %	291294414
9	NC_013946	GGGCG	2	10	9863	9872	0 %	0 %	80 %	20 %	291294414
10	NC_013946	CGGCC	2	10	10019	10028	0 %	0 %	40 %	60 %	291294414
11	NC_013946	CTGGA	2	10	10386	10395	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_013946	AACCC	2	10	11529	11538	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
13	NC_013946	CAGCA	2	10	11549	11558	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_013946	CTGCG	2	10	12909	12918	0 %	20 %	40 %	40 %	291294417
15	NC_013946	GCACC	2	10	13738	13747	20 %	0 %	20 %	60 %	291294418
16	NC_013946	GGCTG	2	10	17857	17866	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_013946	CAGGG	2	10	20487	20496	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_013946	CTGCC	2	10	21125	21134	0 %	20 %	20 %	60 %	291294428
19	NC_013946	CCAGC	2	10	21569	21578	20 %	0 %	20 %	60 %	291294428
20	NC_013946	CCAGA	2	10	22003	22012	40 %	0 %	20 %	40 %	291294428
21	NC_013946	CCAAC	2	10	22180	22189	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
22	NC_013946	AGCGC	2	10	22707	22716	20 %	0 %	40 %	40 %	291294430
23	NC_013946	GGCGG	2	10	23022	23031	0 %	0 %	80 %	20 %	291294430
24	NC_013946	CCAGG	2	10	24445	24454	20 %	0 %	40 %	40 %	291294432
25	NC_013946	GGCGG	2	10	24873	24882	0 %	0 %	80 %	20 %	291294432
26	NC_013946	CGGCC	2	10	26595	26604	0 %	0 %	40 %	60 %	291294434
27	NC_013946	CCCGG	2	10	29914	29923	0 %	0 %	40 %	60 %	291294437
28	NC_013946	CTGGG	2	10	32900	32909	0 %	20 %	60 %	20 %	291294441
29	NC_013946	CGGCC	2	10	33010	33019	0 %	0 %	40 %	60 %	291294441
30	NC_013946	ACCCC	2	10	34428	34437	20 %	0 %	0 %	80 %	291294444
31	NC_013946	GGCCA	2	10	34561	34570	20 %	0 %	40 %	40 %	291294444
32	NC_013946	CCAGG	2	10	35011	35020	20 %	0 %	40 %	40 %	291294444
33	NC_013946	TCCAG	2	10	36269	36278	20 %	20 %	20 %	40 %	291294445
34	NC_013946	TGACC	2	10	39386	39395	20 %	20 %	20 %	40 %	291294448
35	NC_013946	GCCAC	2	10	41719	41728	20 %	0 %	20 %	60 %	291294451
36	NC_013946	TCAGC	2	10	45485	45494	20 %	20 %	20 %	40 %	291294457
37	NC_013946	TCGAA	2	10	48593	48602	40 %	20 %	20 %	20 %	291294460
38	NC_013946	CAGGG	2	10	50103	50112	20 %	0 %	60 %	20 %	291294462
39	NC_013946	CTGGG	2	10	52099	52108	0 %	20 %	60 %	20 %	291294464
40	NC_013946	AGCCC	2	10	52760	52769	20 %	0 %	20 %	60 %	291294464
41	NC_013946	TGGCC	2	10	53226	53235	0 %	20 %	40 %	40 %	291294464
42	NC_013946	GCGGG	2	10	53567	53576	0 %	0 %	80 %	20 %	291294465
43	NC_013946	CGGTG	2	10	53986	53995	0 %	20 %	60 %	20 %	291294465
44	NC_013946	ACCTG	2	10	54746	54755	20 %	20 %	20 %	40 %	291294466
45	NC_013946	CACTG	2	10	55769	55778	20 %	20 %	20 %	40 %	291294468
46	NC_013946	CCGTT	2	10	56100	56109	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_013946	CACCC	2	10	57064	57073	20 %	0 %	0 %	80 %	291294470
48	NC_013946	GGGAG	2	10	60265	60274	20 %	0 %	80 %	0 %	291294475
49	NC_013946	AGCCC	2	10	62783	62792	20 %	0 %	20 %	60 %	291294478
50	NC_013946	GCCGC	2	10	65462	65471	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
51	NC_013946	GCCGG	2	10	65906	65915	0 %	0 %	60 %	40 %	291294481
52	NC_013946	ACCAG	2	10	66308	66317	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_013946	AAAGG	2	10	66524	66533	60 %	0 %	40 %	0 %	291294483
54	NC_013946	GGCCT	2	10	68462	68471	0 %	20 %	40 %	40 %	291294487
55	NC_013946	TACGC	2	10	69071	69080	20 %	20 %	20 %	40 %	291294488
56	NC_013946	GGCCA	2	10	69273	69282	20 %	0 %	40 %	40 %	291294489
57	NC_013946	CACCC	2	10	69518	69527	20 %	0 %	0 %	80 %	291294489
58	NC_013946	TTTGG	2	10	72315	72324	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013946	GCCCT	2	10	72452	72461	0 %	20 %	20 %	60 %	291294493
60	NC_013946	GCACC	2	10	73646	73655	20 %	0 %	20 %	60 %	291294496
61	NC_013946	TCTAG	2	10	75229	75238	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_013946	TTTGG	2	10	75422	75431	0 %	60 %	40 %	0 %	291294500
63	NC_013946	GGCCA	2	10	76033	76042	20 %	0 %	40 %	40 %	291294501
64	NC_013946	ACGGG	2	10	76541	76550	20 %	0 %	60 %	20 %	291294501
65	NC_013946	GCCCG	2	10	77325	77334	0 %	0 %	40 %	60 %	291294501
66	NC_013946	GTGCG	2	10	78230	78239	0 %	20 %	60 %	20 %	291294501
67	NC_013946	GGTGA	2	10	78469	78478	20 %	20 %	60 %	0 %	291294502
68	NC_013946	CTGGC	2	10	80073	80082	0 %	20 %	40 %	40 %	291294504
69	NC_013946	CAGCC	2	10	81141	81150	20 %	0 %	20 %	60 %	291294506
70	NC_013946	CGCCA	2	10	81425	81434	20 %	0 %	20 %	60 %	291294506
71	NC_013946	GGTGG	2	10	82658	82667	0 %	20 %	80 %	0 %	291294508
72	NC_013946	GGGGT	2	10	83342	83351	0 %	20 %	80 %	0 %	291294508
73	NC_013946	GGCCC	2	10	84560	84569	0 %	0 %	40 %	60 %	291294511
74	NC_013946	TGCTT	2	10	88923	88932	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_013946	CGGTG	2	10	91314	91323	0 %	20 %	60 %	20 %	291294517
76	NC_013946	CTAAA	2	10	95376	95385	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_013946	GGTGG	2	10	96061	96070	0 %	20 %	80 %	0 %	291294522
78	NC_013946	CAGGC	2	10	96842	96851	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
79	NC_013946	TCGCC	2	10	101006	101015	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
80	NC_013946	TCTCC	2	10	103167	103176	0 %	40 %	0 %	60 %	291294526
81	NC_013946	TACGC	2	10	103338	103347	20 %	20 %	20 %	40 %	291294526
82	NC_013946	CCGAA	2	10	104081	104090	40 %	0 %	20 %	40 %	291294527
83	NC_013946	CAGGC	2	10	106156	106165	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
84	NC_013946	GCCCC	2	10	106658	106667	0 %	0 %	20 %	80 %	291294530
85	NC_013946	GGCCA	2	10	107137	107146	20 %	0 %	40 %	40 %	291294531
86	NC_013946	GCCGA	2	10	108240	108249	20 %	0 %	40 %	40 %	291294532
87	NC_013946	ATCGG	2	10	109207	109216	20 %	20 %	40 %	20 %	291294533
88	NC_013946	TGGGC	2	10	111044	111053	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
89	NC_013946	GGGCT	2	10	114517	114526	0 %	20 %	60 %	20 %	291294539
90	NC_013946	TGGAC	2	10	114996	115005	20 %	20 %	40 %	20 %	291294539
91	NC_013946	GCCGG	2	10	117054	117063	0 %	0 %	60 %	40 %	291294541
92	NC_013946	GCCGG	2	10	117343	117352	0 %	0 %	60 %	40 %	291294541
93	NC_013946	CTTCA	2	10	117557	117566	20 %	40 %	0 %	40 %	291294541
94	NC_013946	CAGCT	2	10	118528	118537	20 %	20 %	20 %	40 %	291294543
95	NC_013946	GACCA	2	10	120051	120060	40 %	0 %	20 %	40 %	291294546
96	NC_013946	TGGGG	2	10	124360	124369	0 %	20 %	80 %	0 %	291294548
97	NC_013946	TGGCG	2	10	125741	125750	0 %	20 %	60 %	20 %	291294549
98	NC_013946	CCTGG	2	10	126253	126262	0 %	20 %	40 %	40 %	291294550
99	NC_013946	TGGTT	2	10	127091	127100	0 %	60 %	40 %	0 %	291294550
100	NC_013946	GCTGG	2	10	128947	128956	0 %	20 %	60 %	20 %	291294552
101	NC_013946	GCCCG	2	10	129131	129140	0 %	0 %	40 %	60 %	291294552
102	NC_013946	GCCAC	2	10	129851	129860	20 %	0 %	20 %	60 %	291294553
103	NC_013946	GCGCA	2	10	133119	133128	20 %	0 %	40 %	40 %	291294556
104	NC_013946	ACAGC	2	10	133814	133823	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NC_013946	CACTG	2	10	134698	134707	20 %	20 %	20 %	40 %	291294557
106	NC_013946	GGGCA	2	10	135533	135542	20 %	0 %	60 %	20 %	291294557
107	NC_013946	ACAGA	2	10	135900	135909	60 %	0 %	20 %	20 %	291294558
108	NC_013946	CCTCA	2	10	136143	136152	20 %	20 %	0 %	60 %	291294558
109	NC_013946	TTCCA	2	10	137002	137011	20 %	40 %	0 %	40 %	291294559
110	NC_013946	CGGGC	2	10	139373	139382	0 %	0 %	60 %	40 %	291294562
111	NC_013946	CGCAG	2	10	139615	139624	20 %	0 %	40 %	40 %	291294562
112	NC_013946	GAAAA	2	10	142996	143005	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013946	CGCTG	2	10	143119	143128	0 %	20 %	40 %	40 %	291294565
114	NC_013946	CGGCA	2	10	143653	143662	20 %	0 %	40 %	40 %	291294565
115	NC_013946	CGGAG	2	10	145155	145164	20 %	0 %	60 %	20 %	291294567
116	NC_013946	AGGGG	2	10	146863	146872	20 %	0 %	80 %	0 %	291294569
117	NC_013946	CTGGG	2	10	147404	147413	0 %	20 %	60 %	20 %	291294569
118	NC_013946	CCCGG	2	10	151714	151723	0 %	0 %	40 %	60 %	291294574
119	NC_013946	GGGGT	2	10	152981	152990	0 %	20 %	80 %	0 %	291294575
120	NC_013946	CGGCC	2	10	153926	153935	0 %	0 %	40 %	60 %	291294575
121	NC_013946	CCCGG	2	10	154399	154408	0 %	0 %	40 %	60 %	291294576
122	NC_013946	GGGCT	2	10	154960	154969	0 %	20 %	60 %	20 %	291294576
123	NC_013946	GGCGG	2	10	158880	158889	0 %	0 %	80 %	20 %	291294580
124	NC_013946	GGGCG	2	10	158900	158909	0 %	0 %	80 %	20 %	291294580
125	NC_013946	CGGCG	2	10	159673	159682	0 %	0 %	60 %	40 %	291294581
126	NC_013946	CGGCG	2	10	160886	160895	0 %	0 %	60 %	40 %	291294583
127	NC_013946	CTGGG	2	10	161807	161816	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
128	NC_013946	TATTT	2	10	161889	161898	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013946	CAAGC	2	10	167496	167505	40 %	0 %	20 %	40 %	291294595
130	NC_013946	CTGGC	2	10	169879	169888	0 %	20 %	40 %	40 %	291294597
131	NC_013946	GATCA	2	10	170388	170397	40 %	20 %	20 %	20 %	291294598
132	NC_013946	GCCCA	2	10	170615	170624	20 %	0 %	20 %	60 %	291294598
133	NC_013946	CCAGC	2	10	172642	172651	20 %	0 %	20 %	60 %	291294600
134	NC_013946	GGGTG	2	10	175103	175112	0 %	20 %	80 %	0 %	291294603
135	NC_013946	GTGCG	2	10	176641	176650	0 %	20 %	60 %	20 %	291294605
136	NC_013946	GCCCT	2	10	179769	179778	0 %	20 %	20 %	60 %	291294610
137	NC_013946	GGCCT	2	10	179865	179874	0 %	20 %	40 %	40 %	291294610
138	NC_013946	CTGGC	2	10	180360	180369	0 %	20 %	40 %	40 %	291294610
139	NC_013946	CGGCC	2	10	183578	183587	0 %	0 %	40 %	60 %	291294612
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242	NC_013946	TGCGG	2	10	306606	306615	0 %	20 %	60 %	20 %	291294736
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267	NC_013946	CCAGC	2	10	332039	332048	20 %	0 %	20 %	60 %	291294754
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401	NC_013946	GCGAT	2	10	466536	466545	20 %	20 %	40 %	20 %	291294878
402	NC_013946	GGGCG	2	10	469807	469816	0 %	0 %	80 %	20 %	291294880
403	NC_013946	ACCTG	2	10	470659	470668	20 %	20 %	20 %	40 %	291294881
404	NC_013946	GGCGG	2	10	472234	472243	0 %	0 %	80 %	20 %	291294882
405	NC_013946	GGGCC	2	10	473750	473759	0 %	0 %	60 %	40 %	291294885
406	NC_013946	AGGCC	2	10	475154	475163	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
407	NC_013946	GGCCC	2	10	475436	475445	0 %	0 %	40 %	60 %	291294887
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410	NC_013946	GGCCG	2	10	478079	478088	0 %	0 %	60 %	40 %	291294889
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421	NC_013946	CATCT	2	10	483787	483796	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
422	NC_013946	CCCAC	2	10	484477	484486	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
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427	NC_013946	ATGCT	2	10	489844	489853	20 %	40 %	20 %	20 %	291294899
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431	NC_013946	CTGGG	2	10	494155	494164	0 %	20 %	60 %	20 %	291294907
432	NC_013946	GGAAG	2	10	494508	494517	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
433	NC_013946	GGGGC	2	10	497286	497295	0 %	0 %	80 %	20 %	291294912
434	NC_013946	ATATT	2	10	497965	497974	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
435	NC_013946	TGCGC	2	10	498171	498180	0 %	20 %	40 %	40 %	291294913
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452	NC_013946	CAGCC	2	10	519986	519995	20 %	0 %	20 %	60 %	291294937
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454	NC_013946	ACAAT	2	10	522152	522161	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
455	NC_013946	TGGAT	2	10	527054	527063	20 %	40 %	40 %	0 %	291294947
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463	NC_013946	CTGAG	2	10	532859	532868	20 %	20 %	40 %	20 %	291294953
464	NC_013946	AGCCG	2	10	532929	532938	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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