MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 chromosome

Total Repeats: 7495

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013946	GATT	2	8	821	828	25 %	50 %	25 %	0 %	291294405
2	NC_013946	CTCA	2	8	996	1003	25 %	25 %	0 %	50 %	291294405
3	NC_013946	ATTA	2	8	1428	1435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013946	TTGA	2	8	2819	2826	25 %	50 %	25 %	0 %	291294406
5	NC_013946	GGGC	2	8	3210	3217	0 %	0 %	75 %	25 %	291294407
6	NC_013946	AACC	2	8	4058	4065	50 %	0 %	0 %	50 %	291294407
7	NC_013946	CAAC	2	8	5629	5636	50 %	0 %	0 %	50 %	291294408
8	NC_013946	GGAA	2	8	5835	5842	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013946	GCCA	2	8	6218	6225	25 %	0 %	25 %	50 %	291294409
10	NC_013946	CGCT	2	8	6617	6624	0 %	25 %	25 %	50 %	291294409
11	NC_013946	TTTG	2	8	6643	6650	0 %	75 %	25 %	0 %	291294409
12	NC_013946	CGGG	2	8	7406	7413	0 %	0 %	75 %	25 %	291294411
13	NC_013946	GGCT	2	8	7598	7605	0 %	25 %	50 %	25 %	291294411
14	NC_013946	ACCT	2	8	7745	7752	25 %	25 %	0 %	50 %	291294411
15	NC_013946	CTCG	2	8	8092	8099	0 %	25 %	25 %	50 %	291294412
16	NC_013946	GCCG	2	8	8676	8683	0 %	0 %	50 %	50 %	291294413
17	NC_013946	CTGG	2	8	9063	9070	0 %	25 %	50 %	25 %	291294413
18	NC_013946	CCCG	2	8	10001	10008	0 %	0 %	25 %	75 %	291294414
19	NC_013946	GGGC	2	8	10403	10410	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
20	NC_013946	GGGC	2	8	10599	10606	0 %	0 %	75 %	25 %	291294415
21	NC_013946	GCGG	2	8	10823	10830	0 %	0 %	75 %	25 %	291294415
22	NC_013946	TCCA	2	8	10946	10953	25 %	25 %	0 %	50 %	291294415
23	NC_013946	CAAA	2	8	11838	11845	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_013946	CATC	2	8	11870	11877	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_013946	CAAA	2	8	11913	11920	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_013946	CAAA	2	8	11989	11996	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_013946	CAAA	2	8	12065	12072	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_013946	CAAA	2	8	12135	12142	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_013946	TCCT	2	8	12192	12199	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_013946	CAAA	2	8	12207	12214	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_013946	CAAA	2	8	12276	12283	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_013946	AAAT	2	8	12436	12443	75 %	25 %	0 %	0 %	291294416
33	NC_013946	CCAA	2	8	12536	12543	50 %	0 %	0 %	50 %	291294416
34	NC_013946	GGGC	2	8	13036	13043	0 %	0 %	75 %	25 %	291294417
35	NC_013946	GCAG	2	8	13495	13502	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_013946	CTAG	2	8	13538	13545	25 %	25 %	25 %	25 %	291294418
37	NC_013946	CCGC	2	8	13699	13706	0 %	0 %	25 %	75 %	291294418
38	NC_013946	CGCT	2	8	13938	13945	0 %	25 %	25 %	50 %	291294418
39	NC_013946	GTAC	2	8	14278	14285	25 %	25 %	25 %	25 %	291294418
40	NC_013946	GCCA	3	12	15013	15024	25 %	0 %	25 %	50 %	291294420
41	NC_013946	GGGC	2	8	15449	15456	0 %	0 %	75 %	25 %	291294420
42	NC_013946	GAGC	2	8	15901	15908	25 %	0 %	50 %	25 %	291294421
43	NC_013946	ACCC	2	8	16631	16638	25 %	0 %	0 %	75 %	291294421
44	NC_013946	GGGC	2	8	16960	16967	0 %	0 %	75 %	25 %	291294421
45	NC_013946	TTGG	2	8	17491	17498	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013946	GGCC	2	8	17714	17721	0 %	0 %	50 %	50 %	291294422
47	NC_013946	CTGG	2	8	17818	17825	0 %	25 %	50 %	25 %	291294422
48	NC_013946	ACCT	2	8	17895	17902	25 %	25 %	0 %	50 %	291294423
49	NC_013946	CACC	2	8	18008	18015	25 %	0 %	0 %	75 %	291294423
50	NC_013946	CCGG	2	8	18173	18180	0 %	0 %	50 %	50 %	291294423
51	NC_013946	GCTG	2	8	18296	18303	0 %	25 %	50 %	25 %	291294423
52	NC_013946	GGGT	2	8	18316	18323	0 %	25 %	75 %	0 %	291294423
53	NC_013946	CGCC	2	8	18398	18405	0 %	0 %	25 %	75 %	291294423
54	NC_013946	AACC	2	8	18848	18855	50 %	0 %	0 %	50 %	291294424
55	NC_013946	TCCA	2	8	19157	19164	25 %	25 %	0 %	50 %	291294425
56	NC_013946	GCCG	2	8	19264	19271	0 %	0 %	50 %	50 %	291294425
57	NC_013946	TGGG	2	8	19575	19582	0 %	25 %	75 %	0 %	291294425
58	NC_013946	AGCC	2	8	19650	19657	25 %	0 %	25 %	50 %	291294426
59	NC_013946	CCGA	2	8	20366	20373	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_013946	GCTC	2	8	20891	20898	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_013946	CAGC	2	8	22018	22025	25 %	0 %	25 %	50 %	291294428
62	NC_013946	GGAA	2	8	22084	22091	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013946	TTTG	2	8	22499	22506	0 %	75 %	25 %	0 %	291294429
64	NC_013946	GGGC	2	8	22580	22587	0 %	0 %	75 %	25 %	291294429
65	NC_013946	AGCC	2	8	22687	22694	25 %	0 %	25 %	50 %	291294429
66	NC_013946	GACG	2	8	24223	24230	25 %	0 %	50 %	25 %	291294432
67	NC_013946	CAGC	2	8	24546	24553	25 %	0 %	25 %	50 %	291294432
68	NC_013946	GCCA	2	8	24584	24591	25 %	0 %	25 %	50 %	291294432
69	NC_013946	GCGA	2	8	25449	25456	25 %	0 %	50 %	25 %	291294432
70	NC_013946	GGTT	2	8	25627	25634	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013946	TCGG	2	8	26279	26286	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_013946	GGCC	2	8	29199	29206	0 %	0 %	50 %	50 %	291294436
73	NC_013946	CCAG	2	8	29213	29220	25 %	0 %	25 %	50 %	291294436
74	NC_013946	CTGG	2	8	29301	29308	0 %	25 %	50 %	25 %	291294436
75	NC_013946	TCCA	2	8	29533	29540	25 %	25 %	0 %	50 %	291294436
76	NC_013946	CCCG	2	8	29956	29963	0 %	0 %	25 %	75 %	291294437
77	NC_013946	TTTG	2	8	30043	30050	0 %	75 %	25 %	0 %	291294437
78	NC_013946	CGGG	2	8	30377	30384	0 %	0 %	75 %	25 %	291294437
79	NC_013946	TGGG	2	8	30448	30455	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013946	CCGC	2	8	30874	30881	0 %	0 %	25 %	75 %	291294438
81	NC_013946	TGGA	2	8	31223	31230	25 %	25 %	50 %	0 %	291294439
82	NC_013946	GTGG	2	8	31606	31613	0 %	25 %	75 %	0 %	291294440
83	NC_013946	AATG	2	8	31617	31624	50 %	25 %	25 %	0 %	291294440
84	NC_013946	GATC	2	8	32456	32463	25 %	25 %	25 %	25 %	291294441
85	NC_013946	GGCC	2	8	33289	33296	0 %	0 %	50 %	50 %	291294442
86	NC_013946	CCGC	2	8	33373	33380	0 %	0 %	25 %	75 %	291294442
87	NC_013946	GCTG	2	8	33814	33821	0 %	25 %	50 %	25 %	291294443
88	NC_013946	CGGG	2	8	34228	34235	0 %	0 %	75 %	25 %	291294443
89	NC_013946	CTGG	2	8	34349	34356	0 %	25 %	50 %	25 %	291294443
90	NC_013946	GCCG	2	8	34529	34536	0 %	0 %	50 %	50 %	291294444
91	NC_013946	GAGG	2	8	34972	34979	25 %	0 %	75 %	0 %	291294444
92	NC_013946	GCCC	2	8	35136	35143	0 %	0 %	25 %	75 %	291294444
93	NC_013946	GGCT	2	8	35982	35989	0 %	25 %	50 %	25 %	291294444
94	NC_013946	TGCG	2	8	36223	36230	0 %	25 %	50 %	25 %	291294445
95	NC_013946	CGCC	2	8	36322	36329	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
96	NC_013946	GAGG	2	8	37057	37064	25 %	0 %	75 %	0 %	291294446
97	NC_013946	GCCC	2	8	37313	37320	0 %	0 %	25 %	75 %	291294447
98	NC_013946	CGGG	2	8	38044	38051	0 %	0 %	75 %	25 %	291294447
99	NC_013946	CACC	2	8	38444	38451	25 %	0 %	0 %	75 %	291294448
100	NC_013946	CGGC	2	8	38686	38693	0 %	0 %	50 %	50 %	291294448
101	NC_013946	GCTG	2	8	38924	38931	0 %	25 %	50 %	25 %	291294448
102	NC_013946	CAGC	2	8	39189	39196	25 %	0 %	25 %	50 %	291294448
103	NC_013946	CTGG	2	8	39583	39590	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_013946	GGGC	2	8	40578	40585	0 %	0 %	75 %	25 %	291294450
105	NC_013946	GCCT	2	8	40607	40614	0 %	25 %	25 %	50 %	291294450
106	NC_013946	CGCT	2	8	40711	40718	0 %	25 %	25 %	50 %	291294450
107	NC_013946	TCCT	2	8	41092	41099	0 %	50 %	0 %	50 %	291294450
108	NC_013946	TGGG	2	8	41189	41196	0 %	25 %	75 %	0 %	291294450
109	NC_013946	CTGG	2	8	41235	41242	0 %	25 %	50 %	25 %	291294450
110	NC_013946	GCCC	2	8	41462	41469	0 %	0 %	25 %	75 %	291294451
111	NC_013946	GGCC	2	8	41621	41628	0 %	0 %	50 %	50 %	291294451
112	NC_013946	CAAA	2	8	41929	41936	75 %	0 %	0 %	25 %	291294452
113	NC_013946	GAGG	2	8	42052	42059	25 %	0 %	75 %	0 %	291294452
114	NC_013946	TCCA	2	8	43264	43271	25 %	25 %	0 %	50 %	291294454
115	NC_013946	GGGC	2	8	43313	43320	0 %	0 %	75 %	25 %	291294454
116	NC_013946	GGGC	2	8	43650	43657	0 %	0 %	75 %	25 %	291294454
117	NC_013946	AAAC	2	8	44032	44039	75 %	0 %	0 %	25 %	291294455
118	NC_013946	CGGT	2	8	44348	44355	0 %	25 %	50 %	25 %	291294455
119	NC_013946	TGGA	2	8	44624	44631	25 %	25 %	50 %	0 %	291294456
120	NC_013946	TGGG	2	8	44721	44728	0 %	25 %	75 %	0 %	291294456
121	NC_013946	ACTC	2	8	45499	45506	25 %	25 %	0 %	50 %	291294457
122	NC_013946	CCAG	2	8	45788	45795	25 %	0 %	25 %	50 %	291294458
123	NC_013946	CCCA	2	8	45886	45893	25 %	0 %	0 %	75 %	291294458
124	NC_013946	GGCA	2	8	45997	46004	25 %	0 %	50 %	25 %	291294458
125	NC_013946	CCGC	2	8	46701	46708	0 %	0 %	25 %	75 %	291294459
126	NC_013946	CGGG	2	8	46732	46739	0 %	0 %	75 %	25 %	291294459
127	NC_013946	TGGG	2	8	46986	46993	0 %	25 %	75 %	0 %	291294459
128	NC_013946	CACT	2	8	47521	47528	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_013946	AATC	2	8	47674	47681	50 %	25 %	0 %	25 %	291294460
130	NC_013946	GTCC	2	8	48664	48671	0 %	25 %	25 %	50 %	291294461
131	NC_013946	GGGC	2	8	50148	50155	0 %	0 %	75 %	25 %	291294462
132	NC_013946	GGGC	2	8	51026	51033	0 %	0 %	75 %	25 %	291294463
133	NC_013946	GCCA	2	8	51705	51712	25 %	0 %	25 %	50 %	291294463
134	NC_013946	CGAT	2	8	51822	51829	25 %	25 %	25 %	25 %	291294463
135	NC_013946	CTGG	2	8	52134	52141	0 %	25 %	50 %	25 %	291294464
136	NC_013946	GGAT	2	8	52512	52519	25 %	25 %	50 %	0 %	291294464
137	NC_013946	GCTG	2	8	52529	52536	0 %	25 %	50 %	25 %	291294464
138	NC_013946	GGGT	2	8	52679	52686	0 %	25 %	75 %	0 %	291294464
139	NC_013946	ACCG	2	8	52936	52943	25 %	0 %	25 %	50 %	291294464
140	NC_013946	TGAG	2	8	52985	52992	25 %	25 %	50 %	0 %	291294464
141	NC_013946	CGGG	2	8	53208	53215	0 %	0 %	75 %	25 %	291294464
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143	NC_013946	ACCA	2	8	54186	54193	50 %	0 %	0 %	50 %	291294465
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