MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Denitrovibrio acetiphilus DSM 12809 chromosome

Total Repeats: 86

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013943	AAAGTT	2	12	6133	6144	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013943	CTGAAA	2	12	256190	256201	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_013943	GTTCAG	2	12	458129	458140	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_013943	GTAAGG	2	12	474012	474023	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013943	TATTTA	2	12	521783	521794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013943	CAGAAG	2	12	600224	600235	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_013943	TATGAA	2	12	601501	601512	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013943	TATAAA	2	12	627297	627308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013943	GCTAAA	2	12	679029	679040	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_013943	TTTTCA	2	12	698904	698915	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_013943	GTATAA	2	12	707136	707147	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013943	TTATAA	2	12	717652	717663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013943	TTAAAA	2	12	751748	751759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013943	ACAAAA	2	12	752248	752259	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_013943	AATGAT	2	12	778420	778431	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013943	ACAAAT	2	12	783798	783809	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_013943	ATATTA	2	12	786886	786897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013943	ATTATC	2	12	852439	852450	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_013943	ATAGTT	2	12	943951	943962	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013943	TCTTTT	2	12	953550	953561	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_013943	ATGATA	2	12	953658	953669	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013943	TTATGT	2	12	977014	977025	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013943	TTCATA	2	12	984839	984850	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_013943	TAATGA	2	12	1040873	1040884	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013943	TACCTG	2	12	1041597	1041608	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_013943	GAAAAA	2	12	1074180	1074191	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013943	AAATAT	2	12	1085634	1085645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013943	AGGCGG	2	12	1104194	1104205	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_013943	ATTTAT	2	12	1107470	1107481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013943	ATCAAT	2	12	1107533	1107544	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_013943	AAATCT	2	12	1117464	1117475	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_013943	GAATGT	2	12	1121141	1121152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013943	ATGAAG	2	12	1131927	1131938	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013943	ATTTGT	2	12	1138603	1138614	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013943	TGCCCG	2	12	1256454	1256465	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
36	NC_013943	CTTTTT	2	12	1263636	1263647	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_013943	GGTAAA	2	12	1307628	1307639	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013943	TAAAAC	2	12	1322420	1322431	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_013943	ATATTG	2	12	1335417	1335428	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013943	TTTTAA	2	12	1425075	1425086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013943	TATTTA	2	12	1530025	1530036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013943	TGCATA	2	12	1550989	1551000	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_013943	AACACA	2	12	1593352	1593363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_013943	TTGAAA	2	12	1609309	1609320	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013943	TTATAA	2	12	1612852	1612863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013943	GAAGGA	2	12	1659424	1659435	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013943	AAACAT	2	12	1701017	1701028	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_013943	ATGGTC	2	12	1718344	1718355	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_013943	CTGAGT	2	12	1719371	1719382	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_013943	TAAAAA	2	12	1726606	1726617	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013943	ATAAGC	2	12	1738351	1738362	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_013943	AAACCA	2	12	1740139	1740150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_013943	TTGTAA	2	12	1755568	1755579	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013943	ACGTAT	2	12	1829927	1829938	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_013943	GCTTTC	2	12	1932040	1932051	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_013943	TCGGGA	2	12	2027904	2027915	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_013943	TAATTT	2	12	2092922	2092933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013943	TATCAG	2	12	2101302	2101313	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_013943	ATTTAA	2	12	2152813	2152824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013943	TTATAT	2	12	2161026	2161037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013943	CAAAAA	2	12	2171068	2171079	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_013943	TATTGA	2	12	2201478	2201489	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013943	TCAATA	2	12	2230577	2230588	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_013943	ATCTTA	2	12	2254859	2254870	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_013943	ATTTAT	2	12	2285996	2286007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013943	TATACA	2	12	2314654	2314665	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_013943	ACAGAC	2	12	2375104	2375115	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_013943	TCAAAC	2	12	2383189	2383200	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013943	GTCAGC	2	12	2411024	2411035	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_013943	AAAAAC	2	12	2479407	2479418	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_013943	TAAACC	2	12	2485456	2485467	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_013943	TACCAA	2	12	2624838	2624849	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_013943	AAAATA	2	12	2680971	2680982	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013943	ACAAAT	2	12	2691012	2691023	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_013943	TAACAA	2	12	2753456	2753467	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_013943	ATTAAA	2	12	2804060	2804071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013943	ATAAAT	2	12	2822635	2822646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013943	TTTCTA	2	12	2828956	2828967	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_013943	GACTGA	2	12	2844667	2844678	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_013943	GAAAGA	2	12	2866178	2866189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013943	TTAAAG	2	12	2921147	2921158	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013943	ACTTTA	2	12	2969725	2969736	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_013943	ATGTTT	2	12	3064961	3064972	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013943	CATCCT	2	12	3130946	3130957	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_013943	TTTATA	2	12	3136263	3136274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013943	TATCAA	2	12	3165971	3165982	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.