MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Denitrovibrio acetiphilus DSM 12809 chromosome

Total Repeats: 266

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013943	ATTAA	2	10	1425	1434	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013943	AGAGA	2	10	5434	5443	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013943	AAGGA	2	10	27386	27395	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013943	ATTAA	2	10	32234	32243	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013943	TGCCG	2	10	72650	72659	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_013943	GGGCT	2	10	72664	72673	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
7	NC_013943	TTGCT	2	10	79005	79014	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_013943	TAGCA	2	10	102103	102112	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_013943	AATTG	2	10	106104	106113	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013943	GGTAT	2	10	112016	112025	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013943	ATGAC	2	10	115705	115714	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_013943	ATATA	2	10	128854	128863	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013943	AAGTT	2	10	137540	137549	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013943	ATCTG	2	10	164856	164865	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_013943	CTGAT	2	10	188363	188372	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_013943	CAAGA	2	10	198982	198991	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_013943	GTCCT	2	10	204809	204818	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_013943	GTCCT	2	10	210546	210555	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_013943	GTTTA	2	10	223358	223367	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013943	AACTA	2	10	225765	225774	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_013943	AATCT	2	10	233416	233425	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_013943	AATAT	2	10	248029	248038	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013943	ATGCA	2	10	256100	256109	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_013943	TGAAT	2	10	262504	262513	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013943	TAAAA	2	10	275782	275791	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013943	CAATT	2	10	290424	290433	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_013943	AGCGT	2	10	293899	293908	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_013943	GAAAT	2	10	299107	299116	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013943	TGATA	2	10	299265	299274	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013943	GGTAT	2	10	326220	326229	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013943	TATAT	2	10	348431	348440	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013943	TATAG	2	10	371857	371866	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013943	CTTTT	2	10	386936	386945	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_013943	TCTTT	2	10	407467	407476	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_013943	TGATA	2	10	432263	432272	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013943	TTGTA	2	10	502685	502694	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013943	TATGT	2	10	516028	516037	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013943	TATAT	2	10	516271	516280	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013943	TATAA	2	10	522076	522085	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013943	GTGTT	2	10	525239	525248	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013943	CTTCT	2	10	529983	529992	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_013943	TGAAA	2	10	556653	556662	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013943	TAAGA	2	10	598220	598229	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013943	AAAAG	2	10	598631	598640	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013943	ACTCA	2	10	600674	600683	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_013943	ATATT	2	10	600843	600852	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013943	TAGGG	2	10	615127	615136	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013943	ATTTT	2	10	624659	624668	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013943	ATCTA	2	10	626820	626829	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_013943	AAAAT	2	10	630630	630639	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013943	AATGA	2	10	637547	637556	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013943	CGAAC	2	10	637995	638004	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_013943	CAATT	2	10	679199	679208	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_013943	TAAAA	2	10	681784	681793	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013943	GGTTT	2	10	682074	682083	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013943	TAGGG	2	10	704841	704850	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013943	AATAA	2	10	714029	714038	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013943	AAAAT	2	10	717474	717483	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013943	CAATT	2	10	719572	719581	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_013943	AGCGT	2	10	723163	723172	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_013943	GAACC	2	10	723583	723592	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
62	NC_013943	CAAAG	2	10	724117	724126	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_013943	GAACT	2	10	724202	724211	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_013943	TGAAT	2	10	724385	724394	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013943	TCATG	2	10	727250	727259	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_013943	ATTTA	2	10	752169	752178	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013943	TATTT	2	10	752206	752215	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013943	ATTCA	2	10	783772	783781	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_013943	TCCCG	2	10	785704	785713	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
70	NC_013943	TAATA	2	10	792520	792529	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013943	TTTTG	2	10	800464	800473	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013943	TCATT	2	10	819192	819201	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_013943	GTTTT	2	10	822613	822622	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013943	TATAA	2	10	836898	836907	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013943	TAATT	2	10	838059	838068	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013943	TATAA	2	10	858528	858537	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013943	CACTT	2	10	858538	858547	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
78	NC_013943	TATTT	2	10	864450	864459	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013943	ATAAA	2	10	876577	876586	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013943	ATTTT	2	10	884305	884314	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013943	TAAAC	2	10	905256	905265	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_013943	TATAG	2	10	925303	925312	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013943	TTATT	2	10	937218	937227	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013943	TTATT	2	10	937349	937358	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013943	TTATT	2	10	937469	937478	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013943	AAAGG	2	10	949057	949066	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013943	TACTG	2	10	953107	953116	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_013943	ACAGA	2	10	956021	956030	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_013943	ACTTA	2	10	973147	973156	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_013943	TATCT	2	10	975152	975161	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_013943	CTCAT	2	10	976878	976887	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
92	NC_013943	TTTTA	2	10	976955	976964	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013943	GTATA	2	10	983591	983600	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013943	ATCTG	2	10	983934	983943	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_013943	AATTT	2	10	995451	995460	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013943	ATATC	2	10	996676	996685	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_013943	ATAAA	2	10	1003013	1003022	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013943	TAAAT	2	10	1006709	1006718	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013943	ATTGT	2	10	1090963	1090972	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013943	TCTGT	2	10	1090997	1091006	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_013943	TAAGC	2	10	1091635	1091644	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_013943	ATTAA	2	10	1107454	1107463	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013943	TAGAA	2	10	1121185	1121194	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013943	TTTGC	2	10	1128352	1128361	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_013943	CTGTT	2	10	1128518	1128527	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_013943	ACGCT	2	10	1131126	1131135	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
107	NC_013943	CAATT	2	10	1134823	1134832	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_013943	TACGG	2	10	1137640	1137649	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_013943	TGAAT	2	10	1138631	1138640	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013943	TGGTG	2	10	1161358	1161367	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013943	ATGAT	2	10	1168647	1168656	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013943	TTTTG	2	10	1174003	1174012	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013943	TATAG	2	10	1214234	1214243	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013943	GCGTT	2	10	1248141	1248150	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_013943	GAAAA	2	10	1262385	1262394	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013943	TGACG	2	10	1272270	1272279	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_013943	GTAAA	2	10	1283306	1283315	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013943	TTTAA	2	10	1288013	1288022	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013943	TCAGA	2	10	1288108	1288117	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_013943	TAATT	2	10	1302462	1302471	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013943	AATTA	2	10	1322437	1322446	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013943	TGGCT	2	10	1325387	1325396	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
123	NC_013943	TATGT	2	10	1336105	1336114	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013943	CTATT	2	10	1336809	1336818	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_013943	TCAAA	2	10	1338531	1338540	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_013943	CTTTC	2	10	1396346	1396355	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
127	NC_013943	ATCTT	2	10	1396475	1396484	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_013943	TGGGT	2	10	1416474	1416483	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013943	TGTAT	2	10	1419056	1419065	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013943	GAAAA	2	10	1421416	1421425	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013943	AATGC	2	10	1425056	1425065	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_013943	TCAAG	2	10	1472093	1472102	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_013943	AATTG	2	10	1529092	1529101	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013943	AATGT	2	10	1552765	1552774	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013943	TAATT	2	10	1566336	1566345	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013943	TAATT	2	10	1566459	1566468	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013943	CAAGA	2	10	1622502	1622511	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_013943	TTATA	2	10	1632510	1632519	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013943	TTTTA	2	10	1632711	1632720	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013943	CAATG	2	10	1641388	1641397	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_013943	TTCAT	2	10	1641490	1641499	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_013943	ACCAA	2	10	1659890	1659899	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
143	NC_013943	TCTAT	2	10	1686965	1686974	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_013943	GCAAA	2	10	1687081	1687090	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_013943	AATTG	2	10	1691054	1691063	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013943	TTGGT	2	10	1693254	1693263	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013943	CAATT	2	10	1716886	1716895	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_013943	TAAAG	2	10	1732036	1732045	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013943	CTCAT	2	10	1740392	1740401	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
150	NC_013943	TGAAC	2	10	1755341	1755350	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
151	NC_013943	AAACG	2	10	1764817	1764826	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
152	NC_013943	ACTTA	2	10	1771752	1771761	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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154	NC_013943	TATTT	2	10	1783960	1783969	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_013943	ACTTA	2	10	1811702	1811711	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
156	NC_013943	GAAAT	2	10	1819653	1819662	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_013943	AAAAT	2	10	1878156	1878165	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_013943	TGCCT	2	10	1878342	1878351	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
160	NC_013943	CCTGC	2	10	1878471	1878480	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
161	NC_013943	TTATT	2	10	1894488	1894497	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_013943	TAAAA	2	10	1898696	1898705	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_013943	TATCA	2	10	1926243	1926252	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
164	NC_013943	TTCTC	2	10	1927997	1928006	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
165	NC_013943	TACGG	2	10	1928024	1928033	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
166	NC_013943	TAAAA	2	10	1930203	1930212	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_013943	CTAAT	2	10	1931844	1931853	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
168	NC_013943	TAATA	2	10	1960011	1960020	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_013943	TAGTT	2	10	1972436	1972445	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_013943	ATTTA	2	10	2098276	2098285	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_013943	TGATT	2	10	2114040	2114049	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_013943	ATTTT	2	10	2163050	2163059	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_013943	ATTTA	2	10	2221164	2221173	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_013943	TGATA	2	10	2222304	2222313	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
189	NC_013943	ATATA	2	10	2230392	2230401	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
190	NC_013943	ATTTA	2	10	2254778	2254787	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NC_013943	ATAAA	2	10	2285135	2285144	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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193	NC_013943	AAGTA	2	10	2314593	2314602	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_013943	ACTTC	2	10	2325156	2325165	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
196	NC_013943	TGCCA	2	10	2351170	2351179	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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253	NC_013943	CAATT	2	10	3004065	3004074	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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256	NC_013943	TATAA	2	10	3055823	3055832	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
257	NC_013943	AAATG	2	10	3068862	3068871	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
258	NC_013943	TAATA	2	10	3092979	3092988	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_013943	AATCA	2	10	3110486	3110495	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
260	NC_013943	AACAA	2	10	3139212	3139221	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
261	NC_013943	TGCAA	2	10	3139227	3139236	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
262	NC_013943	TTAAC	2	10	3139385	3139394	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
263	NC_013943	TTATT	2	10	3149325	3149334	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
264	NC_013943	TCGAT	2	10	3161594	3161603	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
265	NC_013943	TATAA	2	10	3197070	3197079	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
266	NC_013943	GCTAT	2	10	3207719	3207728	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.