MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 plasmid pO55

Total Repeats: 179

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013942	ACGG	2	8	456	463	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_013942	GGCA	2	8	789	796	25 %	0 %	50 %	25 %	291285841
3	NC_013942	CTGA	2	8	1944	1951	25 %	25 %	25 %	25 %	291285845
4	NC_013942	GGGA	2	8	2179	2186	25 %	0 %	75 %	0 %	291285846
5	NC_013942	GAAA	2	8	2751	2758	75 %	0 %	25 %	0 %	291285846
6	NC_013942	ATTT	2	8	2783	2790	25 %	75 %	0 %	0 %	291285846
7	NC_013942	GTAA	2	8	3071	3078	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013942	CTGC	2	8	4056	4063	0 %	25 %	25 %	50 %	291285848
9	NC_013942	CAGT	2	8	4716	4723	25 %	25 %	25 %	25 %	291285849
10	NC_013942	ATTA	2	8	6187	6194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013942	ATTT	2	8	6418	6425	25 %	75 %	0 %	0 %	291285852
12	NC_013942	TTTA	2	8	7018	7025	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013942	CAGA	2	8	7379	7386	50 %	0 %	25 %	25 %	291285853
14	NC_013942	TATT	2	8	7842	7849	25 %	75 %	0 %	0 %	291285854
15	NC_013942	ACCA	2	8	7945	7952	50 %	0 %	0 %	50 %	291285855
16	NC_013942	CTGG	2	8	8751	8758	0 %	25 %	50 %	25 %	291285856
17	NC_013942	CCGT	2	8	9219	9226	0 %	25 %	25 %	50 %	291285857
18	NC_013942	TCGC	2	8	9460	9467	0 %	25 %	25 %	50 %	291285858
19	NC_013942	CTGG	2	8	9934	9941	0 %	25 %	50 %	25 %	291285858
20	NC_013942	GTGG	2	8	10938	10945	0 %	25 %	75 %	0 %	291285860
21	NC_013942	GCTG	2	8	11026	11033	0 %	25 %	50 %	25 %	291285860
22	NC_013942	TGCC	2	8	11758	11765	0 %	25 %	25 %	50 %	291285861
23	NC_013942	TGGA	2	8	12127	12134	25 %	25 %	50 %	0 %	291285862
24	NC_013942	GAAT	2	8	12776	12783	50 %	25 %	25 %	0 %	291285863
25	NC_013942	ACGT	2	8	12861	12868	25 %	25 %	25 %	25 %	291285863
26	NC_013942	ATTA	2	8	13201	13208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013942	GCCT	2	8	13714	13721	0 %	25 %	25 %	50 %	291285866
28	NC_013942	TTAT	2	8	14409	14416	25 %	75 %	0 %	0 %	291285868
29	NC_013942	TGGT	2	8	14430	14437	0 %	50 %	50 %	0 %	291285868
30	NC_013942	TGTT	2	8	14555	14562	0 %	75 %	25 %	0 %	291285869
31	NC_013942	CATG	2	8	14816	14823	25 %	25 %	25 %	25 %	291285870
32	NC_013942	ATTT	2	8	14884	14891	25 %	75 %	0 %	0 %	291285870
33	NC_013942	CCTC	2	8	15124	15131	0 %	25 %	0 %	75 %	291285870
34	NC_013942	AAAC	2	8	15237	15244	75 %	0 %	0 %	25 %	291285870
35	NC_013942	CTGC	2	8	15550	15557	0 %	25 %	25 %	50 %	291285870
36	NC_013942	GAAG	2	8	15795	15802	50 %	0 %	50 %	0 %	291285870
37	NC_013942	CTAC	2	8	15808	15815	25 %	25 %	0 %	50 %	291285870
38	NC_013942	GAAA	2	8	16761	16768	75 %	0 %	25 %	0 %	291285870
39	NC_013942	TAAA	2	8	17447	17454	75 %	25 %	0 %	0 %	291285870
40	NC_013942	ACAG	2	8	17938	17945	50 %	0 %	25 %	25 %	291285873
41	NC_013942	TTCT	2	8	18654	18661	0 %	75 %	0 %	25 %	291285874
42	NC_013942	AAAG	2	8	19062	19069	75 %	0 %	25 %	0 %	291285874
43	NC_013942	CTGA	2	8	20756	20763	25 %	25 %	25 %	25 %	291285875
44	NC_013942	TCAG	2	8	21270	21277	25 %	25 %	25 %	25 %	291285875
45	NC_013942	ACTG	2	8	21409	21416	25 %	25 %	25 %	25 %	291285875
46	NC_013942	GCTG	2	8	21517	21524	0 %	25 %	50 %	25 %	291285875
47	NC_013942	CTGA	2	8	22539	22546	25 %	25 %	25 %	25 %	291285876
48	NC_013942	TGGC	2	8	23035	23042	0 %	25 %	50 %	25 %	291285876
49	NC_013942	GGGA	2	8	24376	24383	25 %	0 %	75 %	0 %	291285879
50	NC_013942	GTAA	2	8	25059	25066	50 %	25 %	25 %	0 %	291285880
51	NC_013942	ATTA	2	8	25403	25410	50 %	50 %	0 %	0 %	291285881
52	NC_013942	GATC	2	8	25528	25535	25 %	25 %	25 %	25 %	291285881
53	NC_013942	GCCA	2	8	25607	25614	25 %	0 %	25 %	50 %	291285881
54	NC_013942	GCTG	2	8	25759	25766	0 %	25 %	50 %	25 %	291285881
55	NC_013942	CAGC	2	8	25969	25976	25 %	0 %	25 %	50 %	291285881
56	NC_013942	GAGG	2	8	26041	26048	25 %	0 %	75 %	0 %	291285881
57	NC_013942	AACA	2	8	26065	26072	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_013942	AGGC	2	8	26078	26085	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_013942	GGTT	2	8	26135	26142	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013942	CAGA	2	8	26243	26250	50 %	0 %	25 %	25 %	291285882
61	NC_013942	GCAG	2	8	27126	27133	25 %	0 %	50 %	25 %	291285882
62	NC_013942	ATTC	2	8	28177	28184	25 %	50 %	0 %	25 %	291285884
63	NC_013942	TCTG	2	8	28395	28402	0 %	50 %	25 %	25 %	291285884
64	NC_013942	AGCT	2	8	28467	28474	25 %	25 %	25 %	25 %	291285884
65	NC_013942	ATGG	2	8	28489	28496	25 %	25 %	50 %	0 %	291285884
66	NC_013942	TCAG	2	8	28532	28539	25 %	25 %	25 %	25 %	291285884
67	NC_013942	CAGA	2	8	30266	30273	50 %	0 %	25 %	25 %	291285888
68	NC_013942	ATTC	2	8	30397	30404	25 %	50 %	0 %	25 %	291285888
69	NC_013942	CATT	2	8	30949	30956	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_013942	GACA	2	8	30990	30997	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_013942	CTGG	2	8	31218	31225	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_013942	ATCA	2	8	31394	31401	50 %	25 %	0 %	25 %	291285890
73	NC_013942	GCCA	2	8	31846	31853	25 %	0 %	25 %	50 %	291285892
74	NC_013942	CAGC	2	8	31934	31941	25 %	0 %	25 %	50 %	291285892
75	NC_013942	GGAA	2	8	31983	31990	50 %	0 %	50 %	0 %	291285892
76	NC_013942	GCGG	2	8	32231	32238	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
77	NC_013942	TTCT	2	8	32328	32335	0 %	75 %	0 %	25 %	291285893
78	NC_013942	TATC	2	8	32595	32602	25 %	50 %	0 %	25 %	291285893
79	NC_013942	GTTT	2	8	33047	33054	0 %	75 %	25 %	0 %	291285894
80	NC_013942	TTGA	2	8	33559	33566	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013942	AGGA	2	8	33602	33609	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013942	GGGA	2	8	34168	34175	25 %	0 %	75 %	0 %	291285896
83	NC_013942	CTGG	2	8	34209	34216	0 %	25 %	50 %	25 %	291285896
84	NC_013942	GGCT	2	8	34409	34416	0 %	25 %	50 %	25 %	291285897
85	NC_013942	ATAA	2	8	34615	34622	75 %	25 %	0 %	0 %	291285898
86	NC_013942	TACT	2	8	34713	34720	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_013942	AAAG	2	8	35786	35793	75 %	0 %	25 %	0 %	291285899
88	NC_013942	GCAG	2	8	36788	36795	25 %	0 %	50 %	25 %	291285901
89	NC_013942	TGCT	2	8	36985	36992	0 %	50 %	25 %	25 %	291285901
90	NC_013942	ATCA	2	8	37671	37678	50 %	25 %	0 %	25 %	291285901
91	NC_013942	AATT	2	8	37733	37740	50 %	50 %	0 %	0 %	291285901
92	NC_013942	TGAT	2	8	38209	38216	25 %	50 %	25 %	0 %	291285901
93	NC_013942	TAAA	2	8	38256	38263	75 %	25 %	0 %	0 %	291285901
94	NC_013942	ACAG	2	8	38287	38294	50 %	0 %	25 %	25 %	291285902
95	NC_013942	AGAA	2	8	38310	38317	75 %	0 %	25 %	0 %	291285902
96	NC_013942	GCAA	2	8	38371	38378	50 %	0 %	25 %	25 %	291285902
97	NC_013942	CTTT	2	8	38628	38635	0 %	75 %	0 %	25 %	291285903
98	NC_013942	CGTC	2	8	39459	39466	0 %	25 %	25 %	50 %	291285905
99	NC_013942	CAGC	2	8	39474	39481	25 %	0 %	25 %	50 %	291285905
100	NC_013942	CAGC	2	8	39508	39515	25 %	0 %	25 %	50 %	291285905
101	NC_013942	CAGC	2	8	39642	39649	25 %	0 %	25 %	50 %	291285905
102	NC_013942	CCAG	2	8	40747	40754	25 %	0 %	25 %	50 %	291285907
103	NC_013942	TGGC	2	8	41126	41133	0 %	25 %	50 %	25 %	291285907
104	NC_013942	AGAA	2	8	41728	41735	75 %	0 %	25 %	0 %	291285907
105	NC_013942	GCTG	2	8	41844	41851	0 %	25 %	50 %	25 %	291285907
106	NC_013942	GAAA	2	8	43026	43033	75 %	0 %	25 %	0 %	291285907
107	NC_013942	CAAA	2	8	43131	43138	75 %	0 %	0 %	25 %	291285907
108	NC_013942	GAAC	2	8	43177	43184	50 %	0 %	25 %	25 %	291285907
109	NC_013942	AAAT	2	8	43436	43443	75 %	25 %	0 %	0 %	291285907
110	NC_013942	CTCG	2	8	43776	43783	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_013942	CTGG	2	8	44101	44108	0 %	25 %	50 %	25 %	291285909
112	NC_013942	AGAA	2	8	44688	44695	75 %	0 %	25 %	0 %	291285910
113	NC_013942	ATGC	2	8	45129	45136	25 %	25 %	25 %	25 %	291285910
114	NC_013942	CTGA	2	8	45182	45189	25 %	25 %	25 %	25 %	291285910
115	NC_013942	CATC	2	8	45349	45356	25 %	25 %	0 %	50 %	291285910
116	NC_013942	CGCC	2	8	45466	45473	0 %	0 %	25 %	75 %	291285910
117	NC_013942	GCTG	2	8	45642	45649	0 %	25 %	50 %	25 %	291285910
118	NC_013942	ACAA	2	8	46042	46049	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_013942	TCGC	2	8	47543	47550	0 %	25 %	25 %	50 %	291285912
120	NC_013942	CATT	2	8	47597	47604	25 %	50 %	0 %	25 %	291285912
121	NC_013942	CGGG	2	8	48813	48820	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
122	NC_013942	GAAC	2	8	48908	48915	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_013942	TTAC	2	8	49041	49048	25 %	50 %	0 %	25 %	291285913
124	NC_013942	TAAA	2	8	49058	49065	75 %	25 %	0 %	0 %	291285913
125	NC_013942	ATAA	2	8	49354	49361	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013942	ATTT	2	8	49406	49413	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013942	ATGG	2	8	50250	50257	25 %	25 %	50 %	0 %	291285915
128	NC_013942	TTAT	2	8	50926	50933	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013942	TCTT	2	8	50988	50995	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_013942	CATG	2	8	51079	51086	25 %	25 %	25 %	25 %	291285916
131	NC_013942	GGAT	2	8	51660	51667	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013942	CCAC	2	8	52008	52015	25 %	0 %	0 %	75 %	291285920
133	NC_013942	GTAA	2	8	52375	52382	50 %	25 %	25 %	0 %	291285920
134	NC_013942	CCAC	2	8	52389	52396	25 %	0 %	0 %	75 %	291285920
135	NC_013942	TCTT	2	8	52631	52638	0 %	75 %	0 %	25 %	291285920
136	NC_013942	CGGA	2	8	53364	53371	25 %	0 %	50 %	25 %	291285922
137	NC_013942	ATCA	2	8	54032	54039	50 %	25 %	0 %	25 %	291285923
138	NC_013942	TTCA	2	8	54476	54483	25 %	50 %	0 %	25 %	291285924
139	NC_013942	CAAA	2	8	55337	55344	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_013942	AGTG	2	8	55592	55599	25 %	25 %	50 %	0 %	291285926
141	NC_013942	GTGC	2	8	55752	55759	0 %	25 %	50 %	25 %	291285926
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.