MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 plasmid pO55

Total Repeats: 149

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013942	GGCA	2	8	789	796	25 %	0 %	50 %	25 %	291285841
2	NC_013942	CTGA	2	8	1944	1951	25 %	25 %	25 %	25 %	291285845
3	NC_013942	GGGA	2	8	2179	2186	25 %	0 %	75 %	0 %	291285846
4	NC_013942	GAAA	2	8	2751	2758	75 %	0 %	25 %	0 %	291285846
5	NC_013942	ATTT	2	8	2783	2790	25 %	75 %	0 %	0 %	291285846
6	NC_013942	CTGC	2	8	4056	4063	0 %	25 %	25 %	50 %	291285848
7	NC_013942	CAGT	2	8	4716	4723	25 %	25 %	25 %	25 %	291285849
8	NC_013942	ATTT	2	8	6418	6425	25 %	75 %	0 %	0 %	291285852
9	NC_013942	CAGA	2	8	7379	7386	50 %	0 %	25 %	25 %	291285853
10	NC_013942	TATT	2	8	7842	7849	25 %	75 %	0 %	0 %	291285854
11	NC_013942	ACCA	2	8	7945	7952	50 %	0 %	0 %	50 %	291285855
12	NC_013942	CTGG	2	8	8751	8758	0 %	25 %	50 %	25 %	291285856
13	NC_013942	CCGT	2	8	9219	9226	0 %	25 %	25 %	50 %	291285857
14	NC_013942	TCGC	2	8	9460	9467	0 %	25 %	25 %	50 %	291285858
15	NC_013942	CTGG	2	8	9934	9941	0 %	25 %	50 %	25 %	291285858
16	NC_013942	GTGG	2	8	10938	10945	0 %	25 %	75 %	0 %	291285860
17	NC_013942	GCTG	2	8	11026	11033	0 %	25 %	50 %	25 %	291285860
18	NC_013942	TGCC	2	8	11758	11765	0 %	25 %	25 %	50 %	291285861
19	NC_013942	TGGA	2	8	12127	12134	25 %	25 %	50 %	0 %	291285862
20	NC_013942	GAAT	2	8	12776	12783	50 %	25 %	25 %	0 %	291285863
21	NC_013942	ACGT	2	8	12861	12868	25 %	25 %	25 %	25 %	291285863
22	NC_013942	GCCT	2	8	13714	13721	0 %	25 %	25 %	50 %	291285866
23	NC_013942	TTAT	2	8	14409	14416	25 %	75 %	0 %	0 %	291285868
24	NC_013942	TGGT	2	8	14430	14437	0 %	50 %	50 %	0 %	291285868
25	NC_013942	TGTT	2	8	14555	14562	0 %	75 %	25 %	0 %	291285869
26	NC_013942	CATG	2	8	14816	14823	25 %	25 %	25 %	25 %	291285870
27	NC_013942	ATTT	2	8	14884	14891	25 %	75 %	0 %	0 %	291285870
28	NC_013942	CCTC	2	8	15124	15131	0 %	25 %	0 %	75 %	291285870
29	NC_013942	AAAC	2	8	15237	15244	75 %	0 %	0 %	25 %	291285870
30	NC_013942	CTGC	2	8	15550	15557	0 %	25 %	25 %	50 %	291285870
31	NC_013942	GAAG	2	8	15795	15802	50 %	0 %	50 %	0 %	291285870
32	NC_013942	CTAC	2	8	15808	15815	25 %	25 %	0 %	50 %	291285870
33	NC_013942	GAAA	2	8	16761	16768	75 %	0 %	25 %	0 %	291285870
34	NC_013942	TAAA	2	8	17447	17454	75 %	25 %	0 %	0 %	291285870
35	NC_013942	ACAG	2	8	17938	17945	50 %	0 %	25 %	25 %	291285873
36	NC_013942	TTCT	2	8	18654	18661	0 %	75 %	0 %	25 %	291285874
37	NC_013942	AAAG	2	8	19062	19069	75 %	0 %	25 %	0 %	291285874
38	NC_013942	CTGA	2	8	20756	20763	25 %	25 %	25 %	25 %	291285875
39	NC_013942	TCAG	2	8	21270	21277	25 %	25 %	25 %	25 %	291285875
40	NC_013942	ACTG	2	8	21409	21416	25 %	25 %	25 %	25 %	291285875
41	NC_013942	GCTG	2	8	21517	21524	0 %	25 %	50 %	25 %	291285875
42	NC_013942	CTGA	2	8	22539	22546	25 %	25 %	25 %	25 %	291285876
43	NC_013942	TGGC	2	8	23035	23042	0 %	25 %	50 %	25 %	291285876
44	NC_013942	GGGA	2	8	24376	24383	25 %	0 %	75 %	0 %	291285879
45	NC_013942	GTAA	2	8	25059	25066	50 %	25 %	25 %	0 %	291285880
46	NC_013942	ATTA	2	8	25403	25410	50 %	50 %	0 %	0 %	291285881
47	NC_013942	GATC	2	8	25528	25535	25 %	25 %	25 %	25 %	291285881
48	NC_013942	GCCA	2	8	25607	25614	25 %	0 %	25 %	50 %	291285881
49	NC_013942	GCTG	2	8	25759	25766	0 %	25 %	50 %	25 %	291285881
50	NC_013942	CAGC	2	8	25969	25976	25 %	0 %	25 %	50 %	291285881
51	NC_013942	GAGG	2	8	26041	26048	25 %	0 %	75 %	0 %	291285881
52	NC_013942	CAGA	2	8	26243	26250	50 %	0 %	25 %	25 %	291285882
53	NC_013942	GCAG	2	8	27126	27133	25 %	0 %	50 %	25 %	291285882
54	NC_013942	ATTC	2	8	28177	28184	25 %	50 %	0 %	25 %	291285884
55	NC_013942	TCTG	2	8	28395	28402	0 %	50 %	25 %	25 %	291285884
56	NC_013942	AGCT	2	8	28467	28474	25 %	25 %	25 %	25 %	291285884
57	NC_013942	ATGG	2	8	28489	28496	25 %	25 %	50 %	0 %	291285884
58	NC_013942	TCAG	2	8	28532	28539	25 %	25 %	25 %	25 %	291285884
59	NC_013942	CAGA	2	8	30266	30273	50 %	0 %	25 %	25 %	291285888
60	NC_013942	ATTC	2	8	30397	30404	25 %	50 %	0 %	25 %	291285888
61	NC_013942	ATCA	2	8	31394	31401	50 %	25 %	0 %	25 %	291285890
62	NC_013942	GCCA	2	8	31846	31853	25 %	0 %	25 %	50 %	291285892
63	NC_013942	CAGC	2	8	31934	31941	25 %	0 %	25 %	50 %	291285892
64	NC_013942	GGAA	2	8	31983	31990	50 %	0 %	50 %	0 %	291285892
65	NC_013942	TTCT	2	8	32328	32335	0 %	75 %	0 %	25 %	291285893
66	NC_013942	TATC	2	8	32595	32602	25 %	50 %	0 %	25 %	291285893
67	NC_013942	GTTT	2	8	33047	33054	0 %	75 %	25 %	0 %	291285894
68	NC_013942	GGGA	2	8	34168	34175	25 %	0 %	75 %	0 %	291285896
69	NC_013942	CTGG	2	8	34209	34216	0 %	25 %	50 %	25 %	291285896
70	NC_013942	GGCT	2	8	34409	34416	0 %	25 %	50 %	25 %	291285897
71	NC_013942	ATAA	2	8	34615	34622	75 %	25 %	0 %	0 %	291285898
72	NC_013942	AAAG	2	8	35786	35793	75 %	0 %	25 %	0 %	291285899
73	NC_013942	GCAG	2	8	36788	36795	25 %	0 %	50 %	25 %	291285901
74	NC_013942	TGCT	2	8	36985	36992	0 %	50 %	25 %	25 %	291285901
75	NC_013942	ATCA	2	8	37671	37678	50 %	25 %	0 %	25 %	291285901
76	NC_013942	AATT	2	8	37733	37740	50 %	50 %	0 %	0 %	291285901
77	NC_013942	TGAT	2	8	38209	38216	25 %	50 %	25 %	0 %	291285901
78	NC_013942	TAAA	2	8	38256	38263	75 %	25 %	0 %	0 %	291285901
79	NC_013942	ACAG	2	8	38287	38294	50 %	0 %	25 %	25 %	291285902
80	NC_013942	AGAA	2	8	38310	38317	75 %	0 %	25 %	0 %	291285902
81	NC_013942	GCAA	2	8	38371	38378	50 %	0 %	25 %	25 %	291285902
82	NC_013942	CTTT	2	8	38628	38635	0 %	75 %	0 %	25 %	291285903
83	NC_013942	CGTC	2	8	39459	39466	0 %	25 %	25 %	50 %	291285905
84	NC_013942	CAGC	2	8	39474	39481	25 %	0 %	25 %	50 %	291285905
85	NC_013942	CAGC	2	8	39508	39515	25 %	0 %	25 %	50 %	291285905
86	NC_013942	CAGC	2	8	39642	39649	25 %	0 %	25 %	50 %	291285905
87	NC_013942	CCAG	2	8	40747	40754	25 %	0 %	25 %	50 %	291285907
88	NC_013942	TGGC	2	8	41126	41133	0 %	25 %	50 %	25 %	291285907
89	NC_013942	AGAA	2	8	41728	41735	75 %	0 %	25 %	0 %	291285907
90	NC_013942	GCTG	2	8	41844	41851	0 %	25 %	50 %	25 %	291285907
91	NC_013942	GAAA	2	8	43026	43033	75 %	0 %	25 %	0 %	291285907
92	NC_013942	CAAA	2	8	43131	43138	75 %	0 %	0 %	25 %	291285907
93	NC_013942	GAAC	2	8	43177	43184	50 %	0 %	25 %	25 %	291285907
94	NC_013942	AAAT	2	8	43436	43443	75 %	25 %	0 %	0 %	291285907
95	NC_013942	CTGG	2	8	44101	44108	0 %	25 %	50 %	25 %	291285909
96	NC_013942	AGAA	2	8	44688	44695	75 %	0 %	25 %	0 %	291285910
97	NC_013942	ATGC	2	8	45129	45136	25 %	25 %	25 %	25 %	291285910
98	NC_013942	CTGA	2	8	45182	45189	25 %	25 %	25 %	25 %	291285910
99	NC_013942	CATC	2	8	45349	45356	25 %	25 %	0 %	50 %	291285910
100	NC_013942	CGCC	2	8	45466	45473	0 %	0 %	25 %	75 %	291285910
101	NC_013942	GCTG	2	8	45642	45649	0 %	25 %	50 %	25 %	291285910
102	NC_013942	TCGC	2	8	47543	47550	0 %	25 %	25 %	50 %	291285912
103	NC_013942	CATT	2	8	47597	47604	25 %	50 %	0 %	25 %	291285912
104	NC_013942	TTAC	2	8	49041	49048	25 %	50 %	0 %	25 %	291285913
105	NC_013942	TAAA	2	8	49058	49065	75 %	25 %	0 %	0 %	291285913
106	NC_013942	ATGG	2	8	50250	50257	25 %	25 %	50 %	0 %	291285915
107	NC_013942	CATG	2	8	51079	51086	25 %	25 %	25 %	25 %	291285916
108	NC_013942	CCAC	2	8	52008	52015	25 %	0 %	0 %	75 %	291285920
109	NC_013942	GTAA	2	8	52375	52382	50 %	25 %	25 %	0 %	291285920
110	NC_013942	CCAC	2	8	52389	52396	25 %	0 %	0 %	75 %	291285920
111	NC_013942	TCTT	2	8	52631	52638	0 %	75 %	0 %	25 %	291285920
112	NC_013942	CGGA	2	8	53364	53371	25 %	0 %	50 %	25 %	291285922
113	NC_013942	ATCA	2	8	54032	54039	50 %	25 %	0 %	25 %	291285923
114	NC_013942	TTCA	2	8	54476	54483	25 %	50 %	0 %	25 %	291285924
115	NC_013942	AGTG	2	8	55592	55599	25 %	25 %	50 %	0 %	291285926
116	NC_013942	GTGC	2	8	55752	55759	0 %	25 %	50 %	25 %	291285926
117	NC_013942	CGCC	2	8	55770	55777	0 %	0 %	25 %	75 %	291285926
118	NC_013942	CTGG	2	8	56043	56050	0 %	25 %	50 %	25 %	291285926
119	NC_013942	CGGG	2	8	56138	56145	0 %	0 %	75 %	25 %	291285926
120	NC_013942	ACAG	2	8	56355	56362	50 %	0 %	25 %	25 %	291285927
121	NC_013942	CACT	2	8	56401	56408	25 %	25 %	0 %	50 %	291285927
122	NC_013942	GACT	2	8	56553	56560	25 %	25 %	25 %	25 %	291285928
123	NC_013942	GTCC	2	8	56654	56661	0 %	25 %	25 %	50 %	291285928
124	NC_013942	GAAT	2	8	57179	57186	50 %	25 %	25 %	0 %	291285928
125	NC_013942	CCCA	2	8	57191	57198	25 %	0 %	0 %	75 %	291285928
126	NC_013942	ACTG	2	8	57552	57559	25 %	25 %	25 %	25 %	291285929
127	NC_013942	TCAT	2	8	57776	57783	25 %	50 %	0 %	25 %	291285930
128	NC_013942	TTGT	2	8	58153	58160	0 %	75 %	25 %	0 %	291285931
129	NC_013942	TATT	2	8	58350	58357	25 %	75 %	0 %	0 %	291285932
130	NC_013942	TGAA	2	8	58382	58389	50 %	25 %	25 %	0 %	291285932
131	NC_013942	TAAT	2	8	58571	58578	50 %	50 %	0 %	0 %	291285933
132	NC_013942	GGAA	2	8	58665	58672	50 %	0 %	50 %	0 %	291285933
133	NC_013942	GGTT	2	8	58818	58825	0 %	50 %	50 %	0 %	291285934
134	NC_013942	TCGC	2	8	60678	60685	0 %	25 %	25 %	50 %	291285936
135	NC_013942	CGTT	2	8	60789	60796	0 %	50 %	25 %	25 %	291285936
136	NC_013942	ACAG	2	8	61039	61046	50 %	0 %	25 %	25 %	291285936
137	NC_013942	CAAC	2	8	61269	61276	50 %	0 %	0 %	50 %	291285936
138	NC_013942	AGAA	2	8	61469	61476	75 %	0 %	25 %	0 %	291285936
139	NC_013942	GTTC	2	8	61749	61756	0 %	50 %	25 %	25 %	291285937
140	NC_013942	TTGG	2	8	62493	62500	0 %	50 %	50 %	0 %	291285938
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149	NC_013942	CAGT	2	8	65227	65234	25 %	25 %	25 %	25 %	291285945

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.