MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 plasmid pO55

Total Repeats: 719

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013942	CAT	2	6	47	52	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291285840
2	NC_013942	ATG	2	6	174	179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291285840
3	NC_013942	GGC	2	6	192	197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291285840
4	NC_013942	CAT	2	6	293	298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291285840
5	NC_013942	GTG	2	6	574	579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291285841
6	NC_013942	ACG	2	6	701	706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291285841
7	NC_013942	GAA	2	6	724	729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291285841
8	NC_013942	GAA	2	6	862	867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291285841
9	NC_013942	GCG	2	6	977	982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291285842
10	NC_013942	CAC	2	6	1007	1012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291285842
11	NC_013942	TTG	2	6	1021	1026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291285842
12	NC_013942	CAG	2	6	1053	1058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291285842
13	NC_013942	GGT	2	6	1071	1076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291285842
14	NC_013942	GCA	2	6	1093	1098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291285842
15	NC_013942	GCC	2	6	1129	1134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291285843
16	NC_013942	TTC	3	9	1287	1295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291285843
17	NC_013942	GCG	2	6	1704	1709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291285844
18	NC_013942	GAT	2	6	1800	1805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291285844
19	NC_013942	CGT	2	6	1870	1875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291285845
20	NC_013942	CTT	2	6	1881	1886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291285845
21	NC_013942	GAA	2	6	1895	1900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291285845
22	NC_013942	CAG	2	6	1937	1942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291285845
23	NC_013942	CTG	2	6	2120	2125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291285845
24	NC_013942	CCG	2	6	2283	2288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291285846
25	NC_013942	GAT	2	6	2305	2310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291285846
26	NC_013942	CAA	2	6	2387	2392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291285846
27	NC_013942	ATC	2	6	2398	2403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291285846
28	NC_013942	TGA	2	6	2415	2420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291285846
29	NC_013942	ATG	2	6	2561	2566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291285846
30	NC_013942	GAT	2	6	2583	2588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291285846
31	NC_013942	AAT	2	6	2635	2640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291285846
32	NC_013942	ATA	2	6	2735	2740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291285846
33	NC_013942	CGT	2	6	2866	2871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291285846
34	NC_013942	CAA	2	6	3015	3020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291285846
35	NC_013942	AGG	2	6	3212	3217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291285847
36	NC_013942	CGC	2	6	3480	3485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291285848
37	NC_013942	CGT	2	6	3486	3491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291285848
38	NC_013942	TGG	3	9	3517	3525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291285848
39	NC_013942	CTG	2	6	3609	3614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291285848
40	NC_013942	GCC	2	6	3654	3659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291285848
41	NC_013942	TGA	2	6	3776	3781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291285848
42	NC_013942	TGA	2	6	3865	3870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291285848
43	NC_013942	CGG	2	6	3915	3920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291285848
44	NC_013942	CCA	2	6	3955	3960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291285848
45	NC_013942	CTG	3	9	4011	4019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291285848
46	NC_013942	GAA	2	6	4067	4072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291285848
47	NC_013942	AGA	2	6	4088	4093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291285848
48	NC_013942	AGC	2	6	4323	4328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291285848
49	NC_013942	CTG	2	6	4329	4334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291285848
50	NC_013942	GCT	2	6	4370	4375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291285848
51	NC_013942	AGG	2	6	4381	4386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291285848
52	NC_013942	CAA	2	6	4429	4434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291285848
53	NC_013942	GCG	2	6	4458	4463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291285848
54	NC_013942	GCA	2	6	4663	4668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291285848
55	NC_013942	TTC	2	6	4843	4848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291285850
56	NC_013942	ATA	2	6	5019	5024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291285850
57	NC_013942	TGT	2	6	5055	5060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291285850
58	NC_013942	AAT	2	6	5344	5349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291285850
59	NC_013942	TGG	2	6	5381	5386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291285850
60	NC_013942	CAC	2	6	5391	5396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291285850
61	NC_013942	ATG	2	6	5757	5762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291285851
62	NC_013942	ATT	2	6	5783	5788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291285851
63	NC_013942	CTT	2	6	5852	5857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291285851
64	NC_013942	TAA	2	6	5926	5931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291285851
65	NC_013942	CTT	2	6	5936	5941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291285851
66	NC_013942	ATC	2	6	5962	5967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291285851
67	NC_013942	ATC	2	6	6067	6072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291285851
68	NC_013942	TGA	3	9	6100	6108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291285851
69	NC_013942	CAA	2	6	6320	6325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291285852
70	NC_013942	CTG	2	6	6347	6352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291285852
71	NC_013942	ATT	2	6	6641	6646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291285852
72	NC_013942	GAA	2	6	7187	7192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291285853
73	NC_013942	TAA	2	6	7211	7216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291285853
74	NC_013942	ATC	2	6	7226	7231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291285853
75	NC_013942	GAT	2	6	7309	7314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291285853
76	NC_013942	GCT	2	6	7625	7630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291285854
77	NC_013942	TGA	2	6	7635	7640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291285854
78	NC_013942	TTC	2	6	7643	7648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291285854
79	NC_013942	GCA	2	6	7671	7676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291285854
80	NC_013942	GTT	2	6	7742	7747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291285854
81	NC_013942	GTT	2	6	7754	7759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291285854
82	NC_013942	ATG	2	6	7793	7798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291285854
83	NC_013942	CAT	2	6	7831	7836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291285854
84	NC_013942	CGT	2	6	7864	7869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291285854
85	NC_013942	GCA	2	6	7993	7998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291285855
86	NC_013942	CTG	2	6	8146	8151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291285855
87	NC_013942	CAG	2	6	8437	8442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291285856
88	NC_013942	TCA	2	6	8479	8484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291285856
89	NC_013942	GAA	2	6	8566	8571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291285856
90	NC_013942	GTG	2	6	8660	8665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291285856
91	NC_013942	AAT	2	6	8800	8805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291285857
92	NC_013942	GTG	2	6	8867	8872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291285857
93	NC_013942	GGT	2	6	8885	8890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291285857
94	NC_013942	CGG	2	6	9007	9012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291285857
95	NC_013942	CAA	2	6	9031	9036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291285857
96	NC_013942	GAA	2	6	9155	9160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291285857
97	NC_013942	GCC	2	6	9374	9379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291285858
98	NC_013942	ATG	2	6	9410	9415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291285858
99	NC_013942	CGC	2	6	9448	9453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291285858
100	NC_013942	CGT	2	6	9518	9523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291285858
101	NC_013942	AGG	2	6	9531	9536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291285858
102	NC_013942	CTG	2	6	9611	9616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291285858
103	NC_013942	CCA	2	6	9753	9758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291285858
104	NC_013942	TCA	2	6	9759	9764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291285858
105	NC_013942	CTG	2	6	10057	10062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291285858
106	NC_013942	ATA	2	6	10067	10072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291285858
107	NC_013942	GTG	2	6	10117	10122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291285858
108	NC_013942	ACA	2	6	10199	10204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291285859
109	NC_013942	CCG	2	6	10281	10286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291285859
110	NC_013942	GCT	2	6	10431	10436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291285859
111	NC_013942	TGC	2	6	10445	10450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291285859
112	NC_013942	TGA	2	6	10536	10541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291285860
113	NC_013942	ATC	2	6	10640	10645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291285860
114	NC_013942	ATG	2	6	10967	10972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291285860
115	NC_013942	GCT	2	6	11017	11022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291285860
116	NC_013942	CTG	2	6	11093	11098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291285860
117	NC_013942	CCT	2	6	11124	11129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291285860
118	NC_013942	GGC	2	6	11137	11142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291285860
119	NC_013942	TGA	2	6	11157	11162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291285860
120	NC_013942	GAT	2	6	11312	11317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291285861
121	NC_013942	CAT	2	6	11416	11421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291285861
122	NC_013942	CAC	2	6	11428	11433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291285861
123	NC_013942	GGC	2	6	11497	11502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291285861
124	NC_013942	TGG	2	6	11585	11590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291285861
125	NC_013942	GTG	2	6	11660	11665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291285861
126	NC_013942	AGG	3	9	11805	11813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291285861
127	NC_013942	TGA	2	6	11887	11892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291285861
128	NC_013942	CGG	2	6	12090	12095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291285862
129	NC_013942	GCA	2	6	12179	12184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291285862
130	NC_013942	GGT	2	6	12665	12670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291285863
131	NC_013942	ATG	2	6	12679	12684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291285863
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133	NC_013942	CAA	2	6	13474	13479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291285865
134	NC_013942	TCT	2	6	13520	13525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291285865
135	NC_013942	TGG	2	6	13636	13641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291285866
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145	NC_013942	TTA	2	6	14339	14344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291285868
146	NC_013942	TTA	2	6	14346	14351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291285868
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247	NC_013942	CAT	2	6	21226	21231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291285875
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249	NC_013942	GAG	2	6	21839	21844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291285875
250	NC_013942	GTT	2	6	21893	21898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291285876
251	NC_013942	TGC	2	6	21979	21984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291285876
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253	NC_013942	ATT	2	6	22097	22102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291285876
254	NC_013942	TGG	2	6	22123	22128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291285876
255	NC_013942	TGG	2	6	22297	22302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291285876
256	NC_013942	CGG	2	6	22303	22308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291285876
257	NC_013942	GTC	2	6	22342	22347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291285876
258	NC_013942	CTG	2	6	22459	22464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291285876
259	NC_013942	GCT	3	9	22571	22579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291285876
260	NC_013942	ATG	2	6	22611	22616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291285876
261	NC_013942	TCA	2	6	22646	22651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291285876
262	NC_013942	CTG	3	9	22653	22661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291285876
263	NC_013942	TCA	2	6	22805	22810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291285876
264	NC_013942	ATG	2	6	22890	22895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291285876
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266	NC_013942	TGG	3	9	23023	23031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291285876
267	NC_013942	GTC	2	6	23043	23048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291285876
268	NC_013942	CAA	2	6	23090	23095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291285876
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270	NC_013942	TTG	2	6	23172	23177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291285877
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278	NC_013942	GAT	2	6	23602	23607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291285878
279	NC_013942	TTG	2	6	23618	23623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291285878
280	NC_013942	CAA	2	6	23684	23689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291285878
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282	NC_013942	GAT	2	6	23912	23917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291285878
283	NC_013942	TGC	2	6	23997	24002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291285878
284	NC_013942	AGG	2	6	24046	24051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291285878
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286	NC_013942	TGA	2	6	24090	24095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291285878
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362	NC_013942	GCC	2	6	31900	31905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291285892
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369	NC_013942	GTG	2	6	33104	33109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291285894
370	NC_013942	TGC	2	6	33241	33246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291285894
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372	NC_013942	CGT	2	6	33260	33265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291285894
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376	NC_013942	GGA	2	6	33461	33466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291285894
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