MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 plasmid pO55

Total Repeats: 114

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013942	TC	3	6	98	103	0 %	50 %	0 %	50 %	291285840
2	NC_013942	AC	3	6	363	368	50 %	0 %	0 %	50 %	291285840
3	NC_013942	CG	3	6	1143	1148	0 %	0 %	50 %	50 %	291285843
4	NC_013942	AG	4	8	1820	1827	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013942	TA	4	8	3234	3241	50 %	50 %	0 %	0 %	291285847
6	NC_013942	TG	4	8	4746	4753	0 %	50 %	50 %	0 %	291285849
7	NC_013942	CT	3	6	5481	5486	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_013942	GT	3	6	5612	5617	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013942	TC	3	6	5993	5998	0 %	50 %	0 %	50 %	291285851
10	NC_013942	AG	3	6	6495	6500	50 %	0 %	50 %	0 %	291285852
11	NC_013942	TA	3	6	6792	6797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013942	CT	3	6	8308	8313	0 %	50 %	0 %	50 %	291285856
13	NC_013942	AT	3	6	8520	8525	50 %	50 %	0 %	0 %	291285856
14	NC_013942	AT	3	6	9719	9724	50 %	50 %	0 %	0 %	291285858
15	NC_013942	AG	3	6	9808	9813	50 %	0 %	50 %	0 %	291285858
16	NC_013942	GA	3	6	10049	10054	50 %	0 %	50 %	0 %	291285858
17	NC_013942	TG	3	6	11739	11744	0 %	50 %	50 %	0 %	291285861
18	NC_013942	TG	3	6	12422	12427	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013942	AT	3	6	12493	12498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013942	TC	3	6	13300	13305	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_013942	AT	3	6	14284	14289	50 %	50 %	0 %	0 %	291285868
22	NC_013942	AT	3	6	14617	14622	50 %	50 %	0 %	0 %	291285869
23	NC_013942	GT	3	6	14682	14687	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013942	CT	3	6	14832	14837	0 %	50 %	0 %	50 %	291285870
25	NC_013942	TC	3	6	15899	15904	0 %	50 %	0 %	50 %	291285870
26	NC_013942	AC	3	6	16479	16484	50 %	0 %	0 %	50 %	291285870
27	NC_013942	GA	3	6	17564	17569	50 %	0 %	50 %	0 %	291285871
28	NC_013942	CA	3	6	17754	17759	50 %	0 %	0 %	50 %	291285872
29	NC_013942	GA	3	6	18406	18411	50 %	0 %	50 %	0 %	291285873
30	NC_013942	AT	3	6	21731	21736	50 %	50 %	0 %	0 %	291285875
31	NC_013942	GC	3	6	22214	22219	0 %	0 %	50 %	50 %	291285876
32	NC_013942	GC	3	6	23299	23304	0 %	0 %	50 %	50 %	291285877
33	NC_013942	TA	3	6	23418	23423	50 %	50 %	0 %	0 %	291285877
34	NC_013942	AG	3	6	24433	24438	50 %	0 %	50 %	0 %	291285879
35	NC_013942	CG	3	6	24591	24596	0 %	0 %	50 %	50 %	291285880
36	NC_013942	GC	3	6	24969	24974	0 %	0 %	50 %	50 %	291285880
37	NC_013942	GA	3	6	25993	25998	50 %	0 %	50 %	0 %	291285881
38	NC_013942	TG	3	6	26833	26838	0 %	50 %	50 %	0 %	291285882
39	NC_013942	AT	3	6	27180	27185	50 %	50 %	0 %	0 %	291285882
40	NC_013942	TG	3	6	30435	30440	0 %	50 %	50 %	0 %	291285888
41	NC_013942	CA	3	6	31054	31059	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_013942	TA	3	6	31514	31519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013942	TA	3	6	31525	31530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013942	AT	3	6	32159	32164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013942	TA	5	10	32476	32485	50 %	50 %	0 %	0 %	291285893
46	NC_013942	TG	3	6	32506	32511	0 %	50 %	50 %	0 %	291285893
47	NC_013942	AT	3	6	32678	32683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013942	CT	3	6	32835	32840	0 %	50 %	0 %	50 %	291285894
49	NC_013942	TA	3	6	32893	32898	50 %	50 %	0 %	0 %	291285894
50	NC_013942	TA	3	6	33129	33134	50 %	50 %	0 %	0 %	291285894
51	NC_013942	AG	3	6	33345	33350	50 %	0 %	50 %	0 %	291285894
52	NC_013942	AT	3	6	34584	34589	50 %	50 %	0 %	0 %	291285898
53	NC_013942	TC	3	6	34590	34595	0 %	50 %	0 %	50 %	291285898
54	NC_013942	GC	3	6	36631	36636	0 %	0 %	50 %	50 %	291285901
55	NC_013942	CT	3	6	36681	36686	0 %	50 %	0 %	50 %	291285901
56	NC_013942	AC	3	6	36718	36723	50 %	0 %	0 %	50 %	291285901
57	NC_013942	GA	3	6	36800	36805	50 %	0 %	50 %	0 %	291285901
58	NC_013942	AG	3	6	36857	36862	50 %	0 %	50 %	0 %	291285901
59	NC_013942	AG	3	6	37803	37808	50 %	0 %	50 %	0 %	291285901
60	NC_013942	AT	3	6	37957	37962	50 %	50 %	0 %	0 %	291285901
61	NC_013942	TA	3	6	38318	38323	50 %	50 %	0 %	0 %	291285902
62	NC_013942	AG	3	6	38495	38500	50 %	0 %	50 %	0 %	291285902
63	NC_013942	AT	3	6	38557	38562	50 %	50 %	0 %	0 %	291285902
64	NC_013942	GC	3	6	39494	39499	0 %	0 %	50 %	50 %	291285905
65	NC_013942	AT	3	6	40494	40499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013942	GT	4	8	41449	41456	0 %	50 %	50 %	0 %	291285907
67	NC_013942	AT	3	6	42150	42155	50 %	50 %	0 %	0 %	291285907
68	NC_013942	AT	3	6	42740	42745	50 %	50 %	0 %	0 %	291285907
69	NC_013942	GA	4	8	43158	43165	50 %	0 %	50 %	0 %	291285907
70	NC_013942	GA	3	6	43633	43638	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013942	GA	3	6	46702	46707	50 %	0 %	50 %	0 %	291285911
72	NC_013942	TC	4	8	47608	47615	0 %	50 %	0 %	50 %	291285912
73	NC_013942	CG	3	6	47837	47842	0 %	0 %	50 %	50 %	291285912
74	NC_013942	TC	3	6	47951	47956	0 %	50 %	0 %	50 %	291285912
75	NC_013942	AG	3	6	48403	48408	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013942	CT	3	6	49805	49810	0 %	50 %	0 %	50 %	291285915
77	NC_013942	AT	3	6	50982	50987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013942	TC	3	6	51183	51188	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_013942	AT	3	6	51631	51636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013942	TG	3	6	52172	52177	0 %	50 %	50 %	0 %	291285920
81	NC_013942	CT	3	6	53211	53216	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_013942	AT	3	6	53708	53713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013942	AT	3	6	53812	53817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013942	TC	3	6	53835	53840	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_013942	TA	3	6	53904	53909	50 %	50 %	0 %	0 %	291285923
86	NC_013942	CT	3	6	53954	53959	0 %	50 %	0 %	50 %	291285923
87	NC_013942	GA	3	6	54124	54129	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013942	TA	3	6	54155	54160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013942	AT	3	6	54295	54300	50 %	50 %	0 %	0 %	291285924
90	NC_013942	AT	3	6	54781	54786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013942	CG	3	6	55351	55356	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_013942	CA	3	6	55972	55977	50 %	0 %	0 %	50 %	291285926
93	NC_013942	TA	3	6	56204	56209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013942	TA	3	6	56252	56257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013942	CT	3	6	56813	56818	0 %	50 %	0 %	50 %	291285928
96	NC_013942	CA	3	6	57111	57116	50 %	0 %	0 %	50 %	291285928
97	NC_013942	GT	3	6	57533	57538	0 %	50 %	50 %	0 %	291285929
98	NC_013942	CA	3	6	57843	57848	50 %	0 %	0 %	50 %	291285930
99	NC_013942	TA	4	8	58000	58007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013942	CT	3	6	58026	58031	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_013942	AT	3	6	59336	59341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013942	AT	3	6	59389	59394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013942	GA	3	6	60702	60707	50 %	0 %	50 %	0 %	291285936
104	NC_013942	AG	3	6	61049	61054	50 %	0 %	50 %	0 %	291285936
105	NC_013942	TC	3	6	61140	61145	0 %	50 %	0 %	50 %	291285936
106	NC_013942	CT	3	6	62233	62238	0 %	50 %	0 %	50 %	291285938
107	NC_013942	TC	3	6	62326	62331	0 %	50 %	0 %	50 %	291285938
108	NC_013942	CG	3	6	62638	62643	0 %	0 %	50 %	50 %	291285938
109	NC_013942	AG	3	6	62910	62915	50 %	0 %	50 %	0 %	291285939
110	NC_013942	CA	3	6	64052	64057	50 %	0 %	0 %	50 %	291285942
111	NC_013942	GC	3	6	64283	64288	0 %	0 %	50 %	50 %	291285943
112	NC_013942	GA	3	6	64482	64487	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013942	CA	3	6	64906	64911	50 %	0 %	0 %	50 %	291285944
114	NC_013942	TG	3	6	65883	65888	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.