MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 plasmid pO55

Total Repeats: 118

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013942	T	7	7	1242	1248	0 %	100 %	0 %	0 %	291285843
2	NC_013942	A	8	8	1899	1906	100 %	0 %	0 %	0 %	291285845
3	NC_013942	A	6	6	1956	1961	100 %	0 %	0 %	0 %	291285845
4	NC_013942	T	6	6	2205	2210	0 %	100 %	0 %	0 %	291285846
5	NC_013942	A	6	6	4452	4457	100 %	0 %	0 %	0 %	291285848
6	NC_013942	T	6	6	4998	5003	0 %	100 %	0 %	0 %	291285850
7	NC_013942	T	6	6	5307	5312	0 %	100 %	0 %	0 %	291285850
8	NC_013942	A	6	6	5498	5503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013942	A	6	6	5571	5576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013942	A	6	6	5712	5717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013942	A	6	6	5769	5774	100 %	0 %	0 %	0 %	291285851
12	NC_013942	T	6	6	6086	6091	0 %	100 %	0 %	0 %	291285851
13	NC_013942	A	6	6	6094	6099	100 %	0 %	0 %	0 %	291285851
14	NC_013942	T	6	6	6423	6428	0 %	100 %	0 %	0 %	291285852
15	NC_013942	A	6	6	6699	6704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013942	T	7	7	7568	7574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013942	A	6	6	8077	8082	100 %	0 %	0 %	0 %	291285855
18	NC_013942	A	6	6	8086	8091	100 %	0 %	0 %	0 %	291285855
19	NC_013942	A	6	6	8785	8790	100 %	0 %	0 %	0 %	291285856
20	NC_013942	T	7	7	8819	8825	0 %	100 %	0 %	0 %	291285857
21	NC_013942	G	6	6	9733	9738	0 %	0 %	100 %	0 %	291285858
22	NC_013942	G	6	6	10184	10189	0 %	0 %	100 %	0 %	291285859
23	NC_013942	T	6	6	10830	10835	0 %	100 %	0 %	0 %	291285860
24	NC_013942	T	6	6	11227	11232	0 %	100 %	0 %	0 %	291285860
25	NC_013942	A	7	7	11503	11509	100 %	0 %	0 %	0 %	291285861
26	NC_013942	C	6	6	11613	11618	0 %	0 %	0 %	100 %	291285861
27	NC_013942	A	6	6	11690	11695	100 %	0 %	0 %	0 %	291285861
28	NC_013942	A	6	6	12242	12247	100 %	0 %	0 %	0 %	291285862
29	NC_013942	T	7	7	12302	12308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013942	T	6	6	12356	12361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013942	G	6	6	12440	12445	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013942	A	8	8	14457	14464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013942	T	7	7	14517	14523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013942	T	6	6	14591	14596	0 %	100 %	0 %	0 %	291285869
35	NC_013942	T	6	6	14647	14652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013942	A	6	6	14727	14732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013942	G	6	6	14922	14927	0 %	0 %	100 %	0 %	291285870
38	NC_013942	T	6	6	15413	15418	0 %	100 %	0 %	0 %	291285870
39	NC_013942	A	6	6	16204	16209	100 %	0 %	0 %	0 %	291285870
40	NC_013942	T	6	6	16390	16395	0 %	100 %	0 %	0 %	291285870
41	NC_013942	A	6	6	17383	17388	100 %	0 %	0 %	0 %	291285870
42	NC_013942	G	7	7	17862	17868	0 %	0 %	100 %	0 %	291285873
43	NC_013942	A	6	6	18035	18040	100 %	0 %	0 %	0 %	291285873
44	NC_013942	A	6	6	18143	18148	100 %	0 %	0 %	0 %	291285873
45	NC_013942	G	6	6	18493	18498	0 %	0 %	100 %	0 %	291285874
46	NC_013942	C	7	7	21490	21496	0 %	0 %	0 %	100 %	291285875
47	NC_013942	G	6	6	21773	21778	0 %	0 %	100 %	0 %	291285875
48	NC_013942	G	9	9	23446	23454	0 %	0 %	100 %	0 %	291285877
49	NC_013942	G	8	8	23836	23843	0 %	0 %	100 %	0 %	291285878
50	NC_013942	G	7	7	24643	24649	0 %	0 %	100 %	0 %	291285880
51	NC_013942	T	7	7	24944	24950	0 %	100 %	0 %	0 %	291285880
52	NC_013942	G	8	8	25555	25562	0 %	0 %	100 %	0 %	291285881
53	NC_013942	C	6	6	25592	25597	0 %	0 %	0 %	100 %	291285881
54	NC_013942	T	6	6	25927	25932	0 %	100 %	0 %	0 %	291285881
55	NC_013942	T	7	7	26090	26096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013942	A	6	6	27266	27271	100 %	0 %	0 %	0 %	291285882
57	NC_013942	G	6	6	27878	27883	0 %	0 %	100 %	0 %	291285884
58	NC_013942	G	7	7	28342	28348	0 %	0 %	100 %	0 %	291285884
59	NC_013942	T	6	6	28639	28644	0 %	100 %	0 %	0 %	291285884
60	NC_013942	A	6	6	28766	28771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013942	T	6	6	29565	29570	0 %	100 %	0 %	0 %	291285886
62	NC_013942	A	6	6	30002	30007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013942	A	6	6	30204	30209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013942	A	6	6	30707	30712	100 %	0 %	0 %	0 %	291285889
65	NC_013942	A	6	6	30727	30732	100 %	0 %	0 %	0 %	291285889
66	NC_013942	A	6	6	32496	32501	100 %	0 %	0 %	0 %	291285893
67	NC_013942	A	6	6	32945	32950	100 %	0 %	0 %	0 %	291285894
68	NC_013942	A	7	7	32993	32999	100 %	0 %	0 %	0 %	291285894
69	NC_013942	A	6	6	33144	33149	100 %	0 %	0 %	0 %	291285894
70	NC_013942	A	6	6	33173	33178	100 %	0 %	0 %	0 %	291285894
71	NC_013942	G	6	6	33582	33587	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013942	T	7	7	33630	33636	0 %	100 %	0 %	0 %	291285895
73	NC_013942	T	6	6	33687	33692	0 %	100 %	0 %	0 %	291285895
74	NC_013942	T	6	6	34129	34134	0 %	100 %	0 %	0 %	291285896
75	NC_013942	T	6	6	34312	34317	0 %	100 %	0 %	0 %	291285896
76	NC_013942	T	6	6	34349	34354	0 %	100 %	0 %	0 %	291285896
77	NC_013942	T	6	6	34389	34394	0 %	100 %	0 %	0 %	291285897
78	NC_013942	G	8	8	34693	34700	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013942	A	6	6	36589	36594	100 %	0 %	0 %	0 %	291285901
80	NC_013942	A	7	7	37042	37048	100 %	0 %	0 %	0 %	291285901
81	NC_013942	A	7	7	37893	37899	100 %	0 %	0 %	0 %	291285901
82	NC_013942	A	7	7	38403	38409	100 %	0 %	0 %	0 %	291285902
83	NC_013942	C	6	6	38563	38568	0 %	0 %	0 %	100 %	291285902
84	NC_013942	A	6	6	38759	38764	100 %	0 %	0 %	0 %	291285904
85	NC_013942	G	7	7	39004	39010	0 %	0 %	100 %	0 %	291285904
86	NC_013942	T	7	7	39912	39918	0 %	100 %	0 %	0 %	291285906
87	NC_013942	T	6	6	40460	40465	0 %	100 %	0 %	0 %	291285906
88	NC_013942	C	6	6	40822	40827	0 %	0 %	0 %	100 %	291285907
89	NC_013942	A	7	7	41539	41545	100 %	0 %	0 %	0 %	291285907
90	NC_013942	A	6	6	42402	42407	100 %	0 %	0 %	0 %	291285907
91	NC_013942	A	6	6	42949	42954	100 %	0 %	0 %	0 %	291285907
92	NC_013942	A	6	6	43579	43584	100 %	0 %	0 %	0 %	291285907
93	NC_013942	A	7	7	43695	43701	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013942	C	6	6	43930	43935	0 %	0 %	0 %	100 %	291285908
95	NC_013942	A	7	7	48111	48117	100 %	0 %	0 %	0 %	291285912
96	NC_013942	T	6	6	49164	49169	0 %	100 %	0 %	0 %	291285914
97	NC_013942	T	6	6	49183	49188	0 %	100 %	0 %	0 %	291285914
98	NC_013942	A	6	6	49338	49343	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013942	A	6	6	49859	49864	100 %	0 %	0 %	0 %	291285915
100	NC_013942	T	6	6	50002	50007	0 %	100 %	0 %	0 %	291285915
101	NC_013942	A	6	6	50068	50073	100 %	0 %	0 %	0 %	291285915
102	NC_013942	T	6	6	52791	52796	0 %	100 %	0 %	0 %	291285921
103	NC_013942	T	8	8	57320	57327	0 %	100 %	0 %	0 %	291285928
104	NC_013942	T	6	6	57460	57465	0 %	100 %	0 %	0 %	291285929
105	NC_013942	T	6	6	58693	58698	0 %	100 %	0 %	0 %	291285933
106	NC_013942	T	6	6	59110	59115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013942	A	6	6	60549	60554	100 %	0 %	0 %	0 %	291285935
108	NC_013942	T	6	6	60881	60886	0 %	100 %	0 %	0 %	291285936
109	NC_013942	A	7	7	61277	61283	100 %	0 %	0 %	0 %	291285936
110	NC_013942	A	6	6	61558	61563	100 %	0 %	0 %	0 %	291285936
111	NC_013942	T	7	7	61627	61633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013942	T	6	6	61650	61655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013942	T	8	8	61683	61690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013942	T	7	7	61723	61729	0 %	100 %	0 %	0 %	291285937
115	NC_013942	A	7	7	62123	62129	100 %	0 %	0 %	0 %	291285937
116	NC_013942	G	6	6	62269	62274	0 %	0 %	100 %	0 %	291285938
117	NC_013942	G	6	6	63087	63092	0 %	0 %	100 %	0 %	291285939
118	NC_013942	A	6	6	63759	63764	100 %	0 %	0 %	0 %	291285942

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.