MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 plasmid pO55

Total Repeats: 94

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013942	T	7	7	1242	1248	0 %	100 %	0 %	0 %	291285843
2	NC_013942	A	8	8	1899	1906	100 %	0 %	0 %	0 %	291285845
3	NC_013942	A	6	6	1956	1961	100 %	0 %	0 %	0 %	291285845
4	NC_013942	T	6	6	2205	2210	0 %	100 %	0 %	0 %	291285846
5	NC_013942	A	6	6	4452	4457	100 %	0 %	0 %	0 %	291285848
6	NC_013942	T	6	6	4998	5003	0 %	100 %	0 %	0 %	291285850
7	NC_013942	T	6	6	5307	5312	0 %	100 %	0 %	0 %	291285850
8	NC_013942	A	6	6	5769	5774	100 %	0 %	0 %	0 %	291285851
9	NC_013942	T	6	6	6086	6091	0 %	100 %	0 %	0 %	291285851
10	NC_013942	A	6	6	6094	6099	100 %	0 %	0 %	0 %	291285851
11	NC_013942	T	6	6	6423	6428	0 %	100 %	0 %	0 %	291285852
12	NC_013942	A	6	6	8077	8082	100 %	0 %	0 %	0 %	291285855
13	NC_013942	A	6	6	8086	8091	100 %	0 %	0 %	0 %	291285855
14	NC_013942	A	6	6	8785	8790	100 %	0 %	0 %	0 %	291285856
15	NC_013942	T	7	7	8819	8825	0 %	100 %	0 %	0 %	291285857
16	NC_013942	G	6	6	9733	9738	0 %	0 %	100 %	0 %	291285858
17	NC_013942	G	6	6	10184	10189	0 %	0 %	100 %	0 %	291285859
18	NC_013942	T	6	6	10830	10835	0 %	100 %	0 %	0 %	291285860
19	NC_013942	T	6	6	11227	11232	0 %	100 %	0 %	0 %	291285860
20	NC_013942	A	7	7	11503	11509	100 %	0 %	0 %	0 %	291285861
21	NC_013942	C	6	6	11613	11618	0 %	0 %	0 %	100 %	291285861
22	NC_013942	A	6	6	11690	11695	100 %	0 %	0 %	0 %	291285861
23	NC_013942	A	6	6	12242	12247	100 %	0 %	0 %	0 %	291285862
24	NC_013942	T	6	6	14591	14596	0 %	100 %	0 %	0 %	291285869
25	NC_013942	G	6	6	14922	14927	0 %	0 %	100 %	0 %	291285870
26	NC_013942	T	6	6	15413	15418	0 %	100 %	0 %	0 %	291285870
27	NC_013942	A	6	6	16204	16209	100 %	0 %	0 %	0 %	291285870
28	NC_013942	T	6	6	16390	16395	0 %	100 %	0 %	0 %	291285870
29	NC_013942	A	6	6	17383	17388	100 %	0 %	0 %	0 %	291285870
30	NC_013942	G	7	7	17862	17868	0 %	0 %	100 %	0 %	291285873
31	NC_013942	A	6	6	18035	18040	100 %	0 %	0 %	0 %	291285873
32	NC_013942	A	6	6	18143	18148	100 %	0 %	0 %	0 %	291285873
33	NC_013942	G	6	6	18493	18498	0 %	0 %	100 %	0 %	291285874
34	NC_013942	C	7	7	21490	21496	0 %	0 %	0 %	100 %	291285875
35	NC_013942	G	6	6	21773	21778	0 %	0 %	100 %	0 %	291285875
36	NC_013942	G	9	9	23446	23454	0 %	0 %	100 %	0 %	291285877
37	NC_013942	G	8	8	23836	23843	0 %	0 %	100 %	0 %	291285878
38	NC_013942	G	7	7	24643	24649	0 %	0 %	100 %	0 %	291285880
39	NC_013942	T	7	7	24944	24950	0 %	100 %	0 %	0 %	291285880
40	NC_013942	G	8	8	25555	25562	0 %	0 %	100 %	0 %	291285881
41	NC_013942	C	6	6	25592	25597	0 %	0 %	0 %	100 %	291285881
42	NC_013942	T	6	6	25927	25932	0 %	100 %	0 %	0 %	291285881
43	NC_013942	A	6	6	27266	27271	100 %	0 %	0 %	0 %	291285882
44	NC_013942	G	6	6	27878	27883	0 %	0 %	100 %	0 %	291285884
45	NC_013942	G	7	7	28342	28348	0 %	0 %	100 %	0 %	291285884
46	NC_013942	T	6	6	28639	28644	0 %	100 %	0 %	0 %	291285884
47	NC_013942	T	6	6	29565	29570	0 %	100 %	0 %	0 %	291285886
48	NC_013942	A	6	6	30707	30712	100 %	0 %	0 %	0 %	291285889
49	NC_013942	A	6	6	30727	30732	100 %	0 %	0 %	0 %	291285889
50	NC_013942	A	6	6	32496	32501	100 %	0 %	0 %	0 %	291285893
51	NC_013942	A	6	6	32945	32950	100 %	0 %	0 %	0 %	291285894
52	NC_013942	A	7	7	32993	32999	100 %	0 %	0 %	0 %	291285894
53	NC_013942	A	6	6	33144	33149	100 %	0 %	0 %	0 %	291285894
54	NC_013942	A	6	6	33173	33178	100 %	0 %	0 %	0 %	291285894
55	NC_013942	T	7	7	33630	33636	0 %	100 %	0 %	0 %	291285895
56	NC_013942	T	6	6	33687	33692	0 %	100 %	0 %	0 %	291285895
57	NC_013942	T	6	6	34129	34134	0 %	100 %	0 %	0 %	291285896
58	NC_013942	T	6	6	34312	34317	0 %	100 %	0 %	0 %	291285896
59	NC_013942	T	6	6	34349	34354	0 %	100 %	0 %	0 %	291285896
60	NC_013942	T	6	6	34389	34394	0 %	100 %	0 %	0 %	291285897
61	NC_013942	A	6	6	36589	36594	100 %	0 %	0 %	0 %	291285901
62	NC_013942	A	7	7	37042	37048	100 %	0 %	0 %	0 %	291285901
63	NC_013942	A	7	7	37893	37899	100 %	0 %	0 %	0 %	291285901
64	NC_013942	A	7	7	38403	38409	100 %	0 %	0 %	0 %	291285902
65	NC_013942	C	6	6	38563	38568	0 %	0 %	0 %	100 %	291285902
66	NC_013942	A	6	6	38759	38764	100 %	0 %	0 %	0 %	291285904
67	NC_013942	G	7	7	39004	39010	0 %	0 %	100 %	0 %	291285904
68	NC_013942	T	7	7	39912	39918	0 %	100 %	0 %	0 %	291285906
69	NC_013942	T	6	6	40460	40465	0 %	100 %	0 %	0 %	291285906
70	NC_013942	C	6	6	40822	40827	0 %	0 %	0 %	100 %	291285907
71	NC_013942	A	7	7	41539	41545	100 %	0 %	0 %	0 %	291285907
72	NC_013942	A	6	6	42402	42407	100 %	0 %	0 %	0 %	291285907
73	NC_013942	A	6	6	42949	42954	100 %	0 %	0 %	0 %	291285907
74	NC_013942	A	6	6	43579	43584	100 %	0 %	0 %	0 %	291285907
75	NC_013942	C	6	6	43930	43935	0 %	0 %	0 %	100 %	291285908
76	NC_013942	A	7	7	48111	48117	100 %	0 %	0 %	0 %	291285912
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79	NC_013942	A	6	6	49859	49864	100 %	0 %	0 %	0 %	291285915
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81	NC_013942	A	6	6	50068	50073	100 %	0 %	0 %	0 %	291285915
82	NC_013942	T	6	6	52791	52796	0 %	100 %	0 %	0 %	291285921
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84	NC_013942	T	6	6	57460	57465	0 %	100 %	0 %	0 %	291285929
85	NC_013942	T	6	6	58693	58698	0 %	100 %	0 %	0 %	291285933
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90	NC_013942	T	7	7	61723	61729	0 %	100 %	0 %	0 %	291285937
91	NC_013942	A	7	7	62123	62129	100 %	0 %	0 %	0 %	291285937
92	NC_013942	G	6	6	62269	62274	0 %	0 %	100 %	0 %	291285938
93	NC_013942	G	6	6	63087	63092	0 %	0 %	100 %	0 %	291285939
94	NC_013942	A	6	6	63759	63764	100 %	0 %	0 %	0 %	291285942

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.