MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 chromosome

Total Repeats: 193

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013941	GAAAAT	2	12	10612	10623	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013941	TAAAAA	2	12	63323	63334	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013941	AAGGGA	2	12	88892	88903	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013941	CGCCAT	2	12	152224	152235	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5	NC_013941	TCTCCC	2	12	168814	168825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_013941	GTAGTG	2	12	203672	203683	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013941	TACACG	2	12	267987	267998	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013941	GTATGA	2	12	268700	268711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013941	GATATC	2	12	269739	269750	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_013941	TGTCGC	2	12	270100	270111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013941	TGTCGC	2	12	272665	272676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_013941	TTATAT	2	12	288417	288428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013941	ATTGAG	2	12	310716	310727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013941	TATTTT	2	12	345972	345983	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013941	GATTTT	2	12	353447	353458	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013941	AGCGGC	2	12	371859	371870	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013941	ATTATC	2	12	390603	390614	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_013941	TTTTCT	2	12	401344	401355	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_013941	CTATTT	2	12	402380	402391	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_013941	AATTTC	2	12	409106	409117	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_013941	TTTATT	2	12	440417	440428	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013941	ATGAAA	2	12	483387	483398	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013941	AACAAT	2	12	506732	506743	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_013941	TATTGA	2	12	511884	511895	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013941	TTTTCA	2	12	578227	578238	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_013941	CAGGCG	2	12	596903	596914	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_013941	CCGGAC	2	12	657296	657307	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
28	NC_013941	CGCTAC	2	12	658594	658605	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
29	NC_013941	TGTCGC	2	12	660128	660139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_013941	AACCGG	2	12	660694	660705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_013941	GAGGGG	2	12	702404	702415	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013941	TTATAT	2	12	708030	708041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013941	GATTTT	2	12	711626	711637	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013941	AATAAA	2	12	715134	715145	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013941	AATATG	2	12	742048	742059	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013941	GAAGTT	2	12	745106	745117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013941	TGCAAA	2	12	783737	783748	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_013941	ATTTTT	2	12	877758	877769	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013941	TTTACC	2	12	888671	888682	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_013941	AATCAG	2	12	936203	936214	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_013941	AATTTT	2	12	944126	944137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013941	TTTTCT	2	12	968416	968427	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_013941	TTAAAT	2	12	996090	996101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013941	TCGCTG	2	12	996248	996259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_013941	TTGTAC	2	12	997126	997137	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_013941	CATTAT	2	12	998719	998730	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_013941	ATATTT	2	12	1005180	1005191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013941	AATATT	2	12	1040155	1040166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013941	TAACCG	2	12	1150973	1150984	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_013941	AAATAA	2	12	1181267	1181278	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013941	CTGGAA	2	12	1190830	1190841	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_013941	AAAGAT	2	12	1213625	1213636	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013941	TGTCCA	2	12	1234254	1234265	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_013941	TAAGGA	2	12	1256522	1256533	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013941	ATAATG	2	12	1257936	1257947	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013941	TCAAAA	2	12	1277932	1277943	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_013941	ATCAGC	2	12	1321419	1321430	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_013941	CAAAGC	2	12	1334033	1334044	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_013941	CAAAAA	2	12	1378799	1378810	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_013941	CAAATG	2	12	1419172	1419183	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_013941	TTTAGC	2	12	1466575	1466586	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_013941	TTTTGT	2	12	1471775	1471786	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013941	GACAGT	2	12	1473790	1473801	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_013941	CAGGCT	2	12	1497382	1497393	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_013941	CTTATT	2	12	1554716	1554727	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_013941	CAAAAG	2	12	1560610	1560621	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_013941	CTGATC	2	12	1571089	1571100	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_013941	GTTTTT	2	12	1586851	1586862	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013941	CTTTTT	2	12	1606208	1606219	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_013941	TGTCTC	2	12	1626547	1626558	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_013941	AAAGTT	2	12	1628353	1628364	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013941	CTATAA	2	12	1677285	1677296	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_013941	ATTTAA	2	12	1738808	1738819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013941	AAAAAT	2	12	1753584	1753595	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013941	TCCCAA	2	12	1757420	1757431	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_013941	CCGGAC	2	12	1850617	1850628	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
77	NC_013941	CGCTAC	2	12	1851914	1851925	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
78	NC_013941	TGTCGC	2	12	1853448	1853459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_013941	AACCGG	2	12	1854014	1854025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_013941	TTTTAT	2	12	1854611	1854622	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013941	AAAAAC	2	12	1881290	1881301	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_013941	TTCATA	2	12	1892881	1892892	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_013941	ACCGTT	2	12	1896167	1896178	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_013941	TGGTTA	2	12	1904997	1905008	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013941	TTTCTG	2	12	1945538	1945549	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_013941	CAAAAA	2	12	1959938	1959949	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_013941	TTAAAT	2	12	1961737	1961748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013941	AATAAA	2	12	1988810	1988821	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013941	ATACTT	2	12	2098151	2098162	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_013941	AAAATA	2	12	2111808	2111819	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013941	TGTTTT	2	12	2112441	2112452	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013941	ACGGGG	2	12	2176389	2176400	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_013941	TATTAC	2	12	2264474	2264485	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_013941	TTTCTT	2	12	2282713	2282724	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_013941	AGGATG	2	12	2322537	2322548	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013941	AACGGT	2	12	2354828	2354839	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_013941	AATTCA	2	12	2378754	2378765	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_013941	TCTTAT	2	12	2392572	2392583	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_013941	ATATTT	2	12	2428188	2428199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013941	CCGGCC	2	12	2447370	2447381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_013941	ATTTTT	2	12	2502152	2502163	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013941	CTGATA	2	12	2511241	2511252	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_013941	TTTTGT	2	12	2578871	2578882	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013941	TCCCCC	2	12	2608899	2608910	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
105	NC_013941	CCTTAC	2	12	2673819	2673830	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_013941	CCTGTT	2	12	2685312	2685323	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_013941	TCTTCC	2	12	2739521	2739532	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_013941	CGCAGG	2	12	2796948	2796959	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_013941	CCATGC	2	12	2797518	2797529	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
110	NC_013941	CAGCGT	2	12	2799460	2799471	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_013941	CCACTA	2	12	2817609	2817620	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_013941	TAAATG	2	12	2873956	2873967	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013941	TGTCAC	2	12	2887590	2887601	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_013941	AGAAAA	2	12	2897870	2897881	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013941	CAACGT	2	12	2939454	2939465	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_013941	GTTAAC	2	12	2945380	2945391	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_013941	GTTAAC	2	12	2945444	2945455	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_013941	CTGATG	2	12	2964208	2964219	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_013941	GTTATG	2	12	2982048	2982059	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013941	CAAGTG	2	12	2996769	2996780	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_013941	TCCTTC	2	12	3096494	3096505	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_013941	TGGACA	2	12	3150989	3151000	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_013941	TTTTTC	2	12	3259119	3259130	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_013941	TAAAAA	2	12	3260938	3260949	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013941	CATTGC	2	12	3320314	3320325	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_013941	GTTAGT	2	12	3341776	3341787	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013941	AATGAT	2	12	3462514	3462525	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013941	GGTTTT	2	12	3478505	3478516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013941	ACAAGA	2	12	3482836	3482847	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_013941	ATTCTC	2	12	3558904	3558915	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_013941	ATCGGT	2	12	3559841	3559852	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_013941	GATCAT	2	12	3568179	3568190	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_013941	ATATCA	2	12	3597740	3597751	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_013941	ATCGCG	2	12	3603307	3603318	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_013941	GTAAGG	2	12	3617982	3617993	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
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137	NC_013941	ATGCTG	2	12	3689675	3689686	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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139	NC_013941	ATTTAA	2	12	3764212	3764223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013941	ATAAAA	2	12	3806911	3806922	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013941	AGTTGT	2	12	3840314	3840325	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013941	CTTTTT	2	12	3844991	3845002	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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145	NC_013941	GTAACC	2	12	3895446	3895457	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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148	NC_013941	TTTTAT	2	12	3907707	3907718	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013941	ATATAA	2	12	3918476	3918487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013941	GCTCCC	2	12	4041972	4041983	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
151	NC_013941	AGCGTT	2	12	4042092	4042103	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
152	NC_013941	AATTTA	2	12	4147137	4147148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_013941	AGATGC	2	12	4276243	4276254	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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155	NC_013941	GCCAGC	2	12	4338715	4338726	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
156	NC_013941	TTTATC	2	12	4407397	4407408	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
157	NC_013941	AAAATA	2	12	4489288	4489299	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_013941	TTTATT	2	12	4501229	4501240	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_013941	CCACGA	2	12	4518102	4518113	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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161	NC_013941	TTTATT	2	12	4579360	4579371	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.