MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 chromosome

Total Repeats: 2924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013941	CGCTG	2	10	692	701	0 %	20 %	40 %	40 %	291280825
2	NC_013941	ATTGC	2	10	3395	3404	20 %	40 %	20 %	20 %	291280826
3	NC_013941	CGCAG	2	10	8359	8368	20 %	0 %	40 %	40 %	291280831
4	NC_013941	CGTAC	2	10	9787	9796	20 %	20 %	20 %	40 %	291280832
5	NC_013941	CCGAT	2	10	16491	16500	20 %	20 %	20 %	40 %	291280839
6	NC_013941	AGCGA	2	10	16879	16888	40 %	0 %	40 %	20 %	291280839
7	NC_013941	GTTTT	2	10	19296	19305	0 %	80 %	20 %	0 %	291280842
8	NC_013941	TTTAT	2	10	20352	20361	20 %	80 %	0 %	0 %	291280842
9	NC_013941	AATGT	2	10	21828	21837	40 %	40 %	20 %	0 %	291280843
10	NC_013941	TGCAA	2	10	22041	22050	40 %	20 %	20 %	20 %	291280843
11	NC_013941	ATAAA	2	10	22112	22121	80 %	20 %	0 %	0 %	291280843
12	NC_013941	TAAAA	2	10	22385	22394	80 %	20 %	0 %	0 %	291280843
13	NC_013941	ATTGC	2	10	24127	24136	20 %	40 %	20 %	20 %	291280845
14	NC_013941	GCGAA	2	10	36824	36833	40 %	0 %	40 %	20 %	291280856
15	NC_013941	CCGTT	2	10	37718	37727	0 %	40 %	20 %	40 %	291280856
16	NC_013941	CACGG	2	10	38095	38104	20 %	0 %	40 %	40 %	291280856
17	NC_013941	CGAAT	2	10	40837	40846	40 %	20 %	20 %	20 %	291280861
18	NC_013941	CCATG	2	10	42375	42384	20 %	20 %	20 %	40 %	291280862
19	NC_013941	CCGTA	2	10	44021	44030	20 %	20 %	20 %	40 %	291280863
20	NC_013941	GTACA	2	10	44511	44520	40 %	20 %	20 %	20 %	291280863
21	NC_013941	TTAAA	2	10	44759	44768	60 %	40 %	0 %	0 %	291280863
22	NC_013941	ACCCA	2	10	45502	45511	40 %	0 %	0 %	60 %	291280864
23	NC_013941	TTTGA	2	10	47129	47138	20 %	60 %	20 %	0 %	291280865
24	NC_013941	CGGCG	2	10	47380	47389	0 %	0 %	60 %	40 %	291280865
25	NC_013941	AATCA	2	10	47662	47671	60 %	20 %	0 %	20 %	291280866
26	NC_013941	CGGTT	2	10	48617	48626	0 %	40 %	40 %	20 %	291280867
27	NC_013941	TGGCG	2	10	50308	50317	0 %	20 %	60 %	20 %	291280869
28	NC_013941	TGCAC	2	10	52070	52079	20 %	20 %	20 %	40 %	291280870
29	NC_013941	AGGGC	2	10	53155	53164	20 %	0 %	60 %	20 %	291280871
30	NC_013941	GGCGC	2	10	53189	53198	0 %	0 %	60 %	40 %	291280871
31	NC_013941	GAAAC	2	10	54002	54011	60 %	0 %	20 %	20 %	291280871
32	NC_013941	AACGT	2	10	56475	56484	40 %	20 %	20 %	20 %	291280876
33	NC_013941	GCGTC	2	10	59459	59468	0 %	20 %	40 %	40 %	291280879
34	NC_013941	ATGTT	2	10	60273	60282	20 %	60 %	20 %	0 %	291280880
35	NC_013941	CTTCG	2	10	60706	60715	0 %	40 %	20 %	40 %	291280880
36	NC_013941	TGCGT	2	10	60992	61001	0 %	40 %	40 %	20 %	291280880
37	NC_013941	AAAGT	2	10	68053	68062	60 %	20 %	20 %	0 %	291280884
38	NC_013941	GTGCT	2	10	69316	69325	0 %	40 %	40 %	20 %	291280885
39	NC_013941	GGTGA	2	10	70300	70309	20 %	20 %	60 %	0 %	291280885
40	NC_013941	CAGCG	2	10	71668	71677	20 %	0 %	40 %	40 %	291280887
41	NC_013941	GGATC	2	10	74163	74172	20 %	20 %	40 %	20 %	291280888
42	NC_013941	GGCAA	2	10	80815	80824	40 %	0 %	40 %	20 %	291280894
43	NC_013941	TTGCT	2	10	81550	81559	0 %	60 %	20 %	20 %	291280895
44	NC_013941	GATGG	2	10	82286	82295	20 %	20 %	60 %	0 %	291280895
45	NC_013941	GCTTC	2	10	83431	83440	0 %	40 %	20 %	40 %	291280896
46	NC_013941	CCTGG	2	10	84539	84548	0 %	20 %	40 %	40 %	291280897
47	NC_013941	GACCG	2	10	86806	86815	20 %	0 %	40 %	40 %	291280899
48	NC_013941	ATGTT	2	10	89353	89362	20 %	60 %	20 %	0 %	291280901
49	NC_013941	TGCAT	2	10	90295	90304	20 %	40 %	20 %	20 %	291280902
50	NC_013941	ATTCC	2	10	90465	90474	20 %	40 %	0 %	40 %	291280902
51	NC_013941	TTACG	2	10	91357	91366	20 %	40 %	20 %	20 %	291280902
52	NC_013941	AGTTC	2	10	95558	95567	20 %	40 %	20 %	20 %	291280907
53	NC_013941	CGTGG	2	10	96931	96940	0 %	20 %	60 %	20 %	291280909
54	NC_013941	GGGCT	2	10	101310	101319	0 %	20 %	60 %	20 %	291280912
55	NC_013941	GCCTG	2	10	101770	101779	0 %	20 %	40 %	40 %	291280913
56	NC_013941	ACCGT	2	10	103683	103692	20 %	20 %	20 %	40 %	291280914
57	NC_013941	ATCAG	2	10	105456	105465	40 %	20 %	20 %	20 %	291280916
58	NC_013941	TGACG	2	10	106928	106937	20 %	20 %	40 %	20 %	291280917
59	NC_013941	AGCCG	2	10	107224	107233	20 %	0 %	40 %	40 %	291280917
60	NC_013941	GCGCA	2	10	109552	109561	20 %	0 %	40 %	40 %	291280919
61	NC_013941	TGGCG	2	10	110546	110555	0 %	20 %	60 %	20 %	291280920
62	NC_013941	CCGGC	2	10	113515	113524	0 %	0 %	40 %	60 %	291280923
63	NC_013941	CGCGG	2	10	116724	116733	0 %	0 %	60 %	40 %	291280927
64	NC_013941	ATCCC	2	10	118968	118977	20 %	20 %	0 %	60 %	291280931
65	NC_013941	CATCG	2	10	118981	118990	20 %	20 %	20 %	40 %	291280931
66	NC_013941	TAACG	2	10	119675	119684	40 %	20 %	20 %	20 %	291280931
67	NC_013941	ATGCC	2	10	120134	120143	20 %	20 %	20 %	40 %	291280931
68	NC_013941	TCTGT	2	10	122363	122372	0 %	60 %	20 %	20 %	291280933
69	NC_013941	GCATG	2	10	123456	123465	20 %	20 %	40 %	20 %	291280934
70	NC_013941	AGCAG	2	10	124794	124803	40 %	0 %	40 %	20 %	291280936
71	NC_013941	CGAAG	2	10	126709	126718	40 %	0 %	40 %	20 %	291280937
72	NC_013941	ACACG	2	10	126842	126851	40 %	0 %	20 %	40 %	291280937
73	NC_013941	TCGCG	2	10	127103	127112	0 %	20 %	40 %	40 %	291280937
74	NC_013941	GCATC	2	10	127193	127202	20 %	20 %	20 %	40 %	291280937
75	NC_013941	GACTG	2	10	128511	128520	20 %	20 %	40 %	20 %	291280938
76	NC_013941	AGAGC	2	10	128921	128930	40 %	0 %	40 %	20 %	291280938
77	NC_013941	AGGCG	2	10	134077	134086	20 %	0 %	60 %	20 %	291280941
78	NC_013941	GGTTG	2	10	134830	134839	0 %	40 %	60 %	0 %	291280941
79	NC_013941	TCTGG	2	10	137476	137485	0 %	40 %	40 %	20 %	291280942
80	NC_013941	GGGCA	2	10	138888	138897	20 %	0 %	60 %	20 %	291280943
81	NC_013941	CAGCG	2	10	139167	139176	20 %	0 %	40 %	40 %	291280944
82	NC_013941	ACGAC	2	10	140447	140456	40 %	0 %	20 %	40 %	291280945
83	NC_013941	CCGTC	2	10	146152	146161	0 %	20 %	20 %	60 %	291280949
84	NC_013941	GTGAA	2	10	146162	146171	40 %	20 %	40 %	0 %	291280949
85	NC_013941	GTTCA	2	10	146549	146558	20 %	40 %	20 %	20 %	291280950
86	NC_013941	ATCCA	2	10	146875	146884	40 %	20 %	0 %	40 %	291280950
87	NC_013941	CTTTA	2	10	148138	148147	20 %	60 %	0 %	20 %	291280952
88	NC_013941	TGGCG	2	10	148365	148374	0 %	20 %	60 %	20 %	291280952
89	NC_013941	TTTCA	2	10	150678	150687	20 %	60 %	0 %	20 %	291280955
90	NC_013941	CCTTT	2	10	155372	155381	0 %	60 %	0 %	40 %	291280959
91	NC_013941	TTTAA	2	10	156932	156941	40 %	60 %	0 %	0 %	291280962
92	NC_013941	TGGTT	2	10	157294	157303	0 %	60 %	40 %	0 %	291280963
93	NC_013941	GCGAG	2	10	162693	162702	20 %	0 %	60 %	20 %	291280967
94	NC_013941	GGCGT	2	10	163131	163140	0 %	20 %	60 %	20 %	291280967
95	NC_013941	ACCAC	2	10	166034	166043	40 %	0 %	0 %	60 %	291280971
96	NC_013941	GGCGT	2	10	167737	167746	0 %	20 %	60 %	20 %	291280972
97	NC_013941	CGACG	2	10	168776	168785	20 %	0 %	40 %	40 %	291280972
98	NC_013941	CTGCG	2	10	170912	170921	0 %	20 %	40 %	40 %	291280973
99	NC_013941	AAAAC	2	10	172763	172772	80 %	0 %	0 %	20 %	291280974
100	NC_013941	TGGTT	2	10	173020	173029	0 %	60 %	40 %	0 %	291280974
101	NC_013941	AACCT	2	10	175101	175110	40 %	20 %	0 %	40 %	291280976
102	NC_013941	TGGTC	2	10	175143	175152	0 %	40 %	40 %	20 %	291280976
103	NC_013941	TGGCG	2	10	176388	176397	0 %	20 %	60 %	20 %	291280977
104	NC_013941	GGTCC	2	10	181952	181961	0 %	20 %	40 %	40 %	291280982
105	NC_013941	ACGGG	2	10	183869	183878	20 %	0 %	60 %	20 %	291280984
106	NC_013941	GTGAT	2	10	186028	186037	20 %	40 %	40 %	0 %	291280985
107	NC_013941	GTGAT	2	10	186319	186328	20 %	40 %	40 %	0 %	291280985
108	NC_013941	GCCAG	2	10	190038	190047	20 %	0 %	40 %	40 %	291280989
109	NC_013941	GTTCT	2	10	191479	191488	0 %	60 %	20 %	20 %	291280989
110	NC_013941	CTGAA	2	10	193471	193480	40 %	20 %	20 %	20 %	291280991
111	NC_013941	AAGCG	2	10	193535	193544	40 %	0 %	40 %	20 %	291280991
112	NC_013941	TGGTG	2	10	195441	195450	0 %	40 %	60 %	0 %	291280993
113	NC_013941	TGCAC	2	10	195567	195576	20 %	20 %	20 %	40 %	291280993
114	NC_013941	TGCGC	2	10	195960	195969	0 %	20 %	40 %	40 %	291280993
115	NC_013941	CATGG	2	10	197661	197670	20 %	20 %	40 %	20 %	291280995
116	NC_013941	CAGAT	2	10	198700	198709	40 %	20 %	20 %	20 %	291280996
117	NC_013941	ACTTT	2	10	198833	198842	20 %	60 %	0 %	20 %	291280996
118	NC_013941	GACGT	2	10	202753	202762	20 %	20 %	40 %	20 %	291280999
119	NC_013941	CGACG	2	10	204580	204589	20 %	0 %	40 %	40 %	291281001
120	NC_013941	CCACG	2	10	206421	206430	20 %	0 %	20 %	60 %	291281003
121	NC_013941	ATGCC	2	10	207148	207157	20 %	20 %	20 %	40 %	291281004
122	NC_013941	TGGCC	2	10	208474	208483	0 %	20 %	40 %	40 %	291281006
123	NC_013941	ACCGC	2	10	208487	208496	20 %	0 %	20 %	60 %	291281006
124	NC_013941	GTAAC	2	10	209217	209226	40 %	20 %	20 %	20 %	291281006
125	NC_013941	AGCCG	2	10	209845	209854	20 %	0 %	40 %	40 %	291281006
126	NC_013941	GGTGG	2	10	209954	209963	0 %	20 %	80 %	0 %	291281006
127	NC_013941	TTAGT	2	10	216915	216924	20 %	60 %	20 %	0 %	291281010
128	NC_013941	ACGGT	2	10	221010	221019	20 %	20 %	40 %	20 %	291281017
129	NC_013941	TGATT	2	10	223851	223860	20 %	60 %	20 %	0 %	291281020
130	NC_013941	CGCAA	2	10	225301	225310	40 %	0 %	20 %	40 %	291281022
131	NC_013941	GTGAA	2	10	235680	235689	40 %	20 %	40 %	0 %	291281027
132	NC_013941	TAATT	2	10	235864	235873	40 %	60 %	0 %	0 %	291281027
133	NC_013941	ACTGG	2	10	238802	238811	20 %	20 %	40 %	20 %	291281030
134	NC_013941	CGCGG	2	10	239847	239856	0 %	0 %	60 %	40 %	291281032
135	NC_013941	GCGCG	2	10	245558	245567	0 %	0 %	60 %	40 %	291281039
136	NC_013941	CCAGA	2	10	245627	245636	40 %	0 %	20 %	40 %	291281039
137	NC_013941	ATCGC	2	10	247995	248004	20 %	20 %	20 %	40 %	291281039
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139	NC_013941	GGGCA	2	10	255093	255102	20 %	0 %	60 %	20 %	291281044
140	NC_013941	ATTTC	2	10	255603	255612	20 %	60 %	0 %	20 %	291281044
141	NC_013941	CCAGC	2	10	257834	257843	20 %	0 %	20 %	60 %	291281047
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145	NC_013941	ACTGT	2	10	264741	264750	20 %	40 %	20 %	20 %	291281054
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147	NC_013941	CCTCA	2	10	274972	274981	20 %	20 %	0 %	60 %	291281059
148	NC_013941	AGCGC	2	10	277036	277045	20 %	0 %	40 %	40 %	291281061
149	NC_013941	GGTGT	2	10	277094	277103	0 %	40 %	60 %	0 %	291281061
150	NC_013941	AGCAA	2	10	277987	277996	60 %	0 %	20 %	20 %	291281061
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159	NC_013941	CGATG	2	10	290957	290966	20 %	20 %	40 %	20 %	291281074
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177	NC_013941	GATCA	2	10	328867	328876	40 %	20 %	20 %	20 %	291281130
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244	NC_013941	AATTC	2	10	459626	459635	40 %	40 %	0 %	20 %	291281250
245	NC_013941	CGCAG	2	10	459644	459653	20 %	0 %	40 %	40 %	291281250
246	NC_013941	CAATT	2	10	460416	460425	40 %	40 %	0 %	20 %	291281250
247	NC_013941	AGACC	2	10	460640	460649	40 %	0 %	20 %	40 %	291281250
248	NC_013941	TGACC	2	10	461363	461372	20 %	20 %	20 %	40 %	291281250
249	NC_013941	TTTTC	2	10	462689	462698	0 %	80 %	0 %	20 %	291281251
250	NC_013941	CCGGT	2	10	466661	466670	0 %	20 %	40 %	40 %	291281255
251	NC_013941	TACGT	2	10	467697	467706	20 %	40 %	20 %	20 %	291281255
252	NC_013941	GCGAA	2	10	467816	467825	40 %	0 %	40 %	20 %	291281255
253	NC_013941	GCGAA	2	10	471175	471184	40 %	0 %	40 %	20 %	291281259
254	NC_013941	GCGCA	2	10	471736	471745	20 %	0 %	40 %	40 %	291281259
255	NC_013941	TGGCG	2	10	472462	472471	0 %	20 %	60 %	20 %	291281260
256	NC_013941	GTTTG	2	10	473609	473618	0 %	60 %	40 %	0 %	291281261
257	NC_013941	GGCGC	2	10	473793	473802	0 %	0 %	60 %	40 %	291281261
258	NC_013941	CTTAC	2	10	474665	474674	20 %	40 %	0 %	40 %	291281262
259	NC_013941	TGTGT	2	10	476813	476822	0 %	60 %	40 %	0 %	291281264
260	NC_013941	TTTTC	2	10	481839	481848	0 %	80 %	0 %	20 %	291281268
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