MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 chromosome

Total Repeats: 13188

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013941	CAGA	2	8	156	163	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_013941	CAGG	2	8	419	426	25 %	0 %	50 %	25 %	291280825
3	NC_013941	ACCA	2	8	465	472	50 %	0 %	0 %	50 %	291280825
4	NC_013941	GCTG	2	8	974	981	0 %	25 %	50 %	25 %	291280825
5	NC_013941	GGAC	2	8	1012	1019	25 %	0 %	50 %	25 %	291280825
6	NC_013941	CCAG	2	8	2002	2009	25 %	0 %	25 %	50 %	291280825
7	NC_013941	GCAA	2	8	3029	3036	50 %	0 %	25 %	25 %	291280826
8	NC_013941	ATGA	2	8	3127	3134	50 %	25 %	25 %	0 %	291280826
9	NC_013941	CAGC	2	8	3282	3289	25 %	0 %	25 %	50 %	291280826
10	NC_013941	TTCA	2	8	3427	3434	25 %	50 %	0 %	25 %	291280826
11	NC_013941	AGCG	2	8	3564	3571	25 %	0 %	50 %	25 %	291280826
12	NC_013941	CTGA	2	8	3850	3857	25 %	25 %	25 %	25 %	291280827
13	NC_013941	CAGT	2	8	5765	5772	25 %	25 %	25 %	25 %	291280829
14	NC_013941	GCGG	2	8	6098	6105	0 %	0 %	75 %	25 %	291280829
15	NC_013941	AGCG	2	8	6269	6276	25 %	0 %	50 %	25 %	291280829
16	NC_013941	GCCA	2	8	7226	7233	25 %	0 %	25 %	50 %	291280830
17	NC_013941	GCAT	2	8	7955	7962	25 %	25 %	25 %	25 %	291280830
18	NC_013941	GGCG	2	8	8086	8093	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19	NC_013941	CAAC	2	8	8334	8341	50 %	0 %	0 %	50 %	291280831
20	NC_013941	TTGA	2	8	8387	8394	25 %	50 %	25 %	0 %	291280831
21	NC_013941	AAGA	2	8	8810	8817	75 %	0 %	25 %	0 %	291280831
22	NC_013941	GCTG	2	8	8989	8996	0 %	25 %	50 %	25 %	291280831
23	NC_013941	CTGT	2	8	9239	9246	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_013941	GGTG	2	8	9661	9668	0 %	25 %	75 %	0 %	291280832
25	NC_013941	AGAT	2	8	9994	10001	50 %	25 %	25 %	0 %	291280833
26	NC_013941	AGAA	2	8	10268	10275	75 %	0 %	25 %	0 %	291280833
27	NC_013941	GAAT	2	8	10515	10522	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013941	GCAG	2	8	10671	10678	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_013941	CATT	2	8	11349	11356	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_013941	CAGT	2	8	11496	11503	25 %	25 %	25 %	25 %	291280835
31	NC_013941	ATTC	2	8	11911	11918	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_013941	AGTG	2	8	12053	12060	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013941	ATGG	2	8	12216	12223	25 %	25 %	50 %	0 %	291280836
34	NC_013941	TGGT	2	8	12307	12314	0 %	50 %	50 %	0 %	291280836
35	NC_013941	ACCG	2	8	12674	12681	25 %	0 %	25 %	50 %	291280836
36	NC_013941	CAAC	2	8	12820	12827	50 %	0 %	0 %	50 %	291280836
37	NC_013941	AAGA	2	8	12894	12901	75 %	0 %	25 %	0 %	291280836
38	NC_013941	CCAT	2	8	13471	13478	25 %	25 %	0 %	50 %	291280836
39	NC_013941	GACA	2	8	15683	15690	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_013941	AACA	2	8	15873	15880	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_013941	AATT	2	8	15897	15904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013941	TAAT	2	8	15916	15923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013941	GGTT	2	8	16285	16292	0 %	50 %	50 %	0 %	291280839
44	NC_013941	GTGG	2	8	16909	16916	0 %	25 %	75 %	0 %	291280839
45	NC_013941	CGTT	2	8	17281	17288	0 %	50 %	25 %	25 %	291280839
46	NC_013941	TTTA	2	8	17453	17460	25 %	75 %	0 %	0 %	291280840
47	NC_013941	CCAC	2	8	17756	17763	25 %	0 %	0 %	75 %	291280840
48	NC_013941	AATA	2	8	18386	18393	75 %	25 %	0 %	0 %	291280841
49	NC_013941	CTTC	2	8	18408	18415	0 %	50 %	0 %	50 %	291280841
50	NC_013941	TGTT	2	8	19681	19688	0 %	75 %	25 %	0 %	291280842
51	NC_013941	TGGC	2	8	20142	20149	0 %	25 %	50 %	25 %	291280842
52	NC_013941	GAAC	2	8	20775	20782	50 %	0 %	25 %	25 %	291280842
53	NC_013941	TGAG	2	8	21031	21038	25 %	25 %	50 %	0 %	291280842
54	NC_013941	TAAA	2	8	21175	21182	75 %	25 %	0 %	0 %	291280842
55	NC_013941	CTTT	2	8	22122	22129	0 %	75 %	0 %	25 %	291280843
56	NC_013941	ATAA	2	8	22340	22347	75 %	25 %	0 %	0 %	291280843
57	NC_013941	TTAA	2	8	23019	23026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013941	TTAA	2	8	23253	23260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013941	TATT	2	8	24660	24667	25 %	75 %	0 %	0 %	291280845
60	NC_013941	CAGT	2	8	25660	25667	25 %	25 %	25 %	25 %	291280847
61	NC_013941	CATA	2	8	25817	25824	50 %	25 %	0 %	25 %	291280848
62	NC_013941	GCGT	2	8	26281	26288	0 %	25 %	50 %	25 %	291280848
63	NC_013941	CCGC	2	8	26704	26711	0 %	0 %	25 %	75 %	291280848
64	NC_013941	CTGG	2	8	27061	27068	0 %	25 %	50 %	25 %	291280849
65	NC_013941	CTGC	2	8	27522	27529	0 %	25 %	25 %	50 %	291280849
66	NC_013941	ACTC	2	8	28401	28408	25 %	25 %	0 %	50 %	291280849
67	NC_013941	GTGG	2	8	29277	29284	0 %	25 %	75 %	0 %	291280849
68	NC_013941	GCTG	2	8	29631	29638	0 %	25 %	50 %	25 %	291280850
69	NC_013941	ATGG	2	8	30491	30498	25 %	25 %	50 %	0 %	291280851
70	NC_013941	TTGA	2	8	31362	31369	25 %	50 %	25 %	0 %	291280852
71	NC_013941	TGGC	2	8	31905	31912	0 %	25 %	50 %	25 %	291280853
72	NC_013941	CTGG	2	8	32365	32372	0 %	25 %	50 %	25 %	291280853
73	NC_013941	GTGG	2	8	32530	32537	0 %	25 %	75 %	0 %	291280853
74	NC_013941	TCAT	2	8	32589	32596	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_013941	TCCC	2	8	32619	32626	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
76	NC_013941	TGGC	2	8	32660	32667	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_013941	GCTG	2	8	32882	32889	0 %	25 %	50 %	25 %	291280854
78	NC_013941	CGTG	2	8	33359	33366	0 %	25 %	50 %	25 %	291280854
79	NC_013941	CATG	2	8	33829	33836	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_013941	AGTG	2	8	33979	33986	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013941	TCCT	2	8	34141	34148	0 %	50 %	0 %	50 %	291280855
82	NC_013941	CTTA	2	8	34169	34176	25 %	50 %	0 %	25 %	291280855
83	NC_013941	AGCC	2	8	35071	35078	25 %	0 %	25 %	50 %	291280855
84	NC_013941	GGGC	2	8	35213	35220	0 %	0 %	75 %	25 %	291280856
85	NC_013941	GACC	2	8	35337	35344	25 %	0 %	25 %	50 %	291280856
86	NC_013941	TGAT	2	8	35786	35793	25 %	50 %	25 %	0 %	291280856
87	NC_013941	CGCA	2	8	36337	36344	25 %	0 %	25 %	50 %	291280856
88	NC_013941	CTGT	2	8	36511	36518	0 %	50 %	25 %	25 %	291280856
89	NC_013941	GGCG	2	8	36687	36694	0 %	0 %	75 %	25 %	291280856
90	NC_013941	ACCG	2	8	36841	36848	25 %	0 %	25 %	50 %	291280856
91	NC_013941	CGTC	2	8	37315	37322	0 %	25 %	25 %	50 %	291280856
92	NC_013941	GGCG	2	8	37524	37531	0 %	0 %	75 %	25 %	291280856
93	NC_013941	TGGC	2	8	37778	37785	0 %	25 %	50 %	25 %	291280856
94	NC_013941	GCTG	2	8	37791	37798	0 %	25 %	50 %	25 %	291280856
95	NC_013941	GCAC	2	8	38376	38383	25 %	0 %	25 %	50 %	291280856
96	NC_013941	GGTG	2	8	38722	38729	0 %	25 %	75 %	0 %	291280858
97	NC_013941	AAGA	2	8	38957	38964	75 %	0 %	25 %	0 %	291280858
98	NC_013941	CCAT	2	8	39443	39450	25 %	25 %	0 %	50 %	291280859
99	NC_013941	ATTT	2	8	40657	40664	25 %	75 %	0 %	0 %	291280860
100	NC_013941	TTCT	2	8	40669	40676	0 %	75 %	0 %	25 %	291280861
101	NC_013941	TTCA	2	8	40800	40807	25 %	50 %	0 %	25 %	291280861
102	NC_013941	CAGC	2	8	41013	41020	25 %	0 %	25 %	50 %	291280861
103	NC_013941	CCCG	2	8	41176	41183	0 %	0 %	25 %	75 %	291280861
104	NC_013941	TCGG	2	8	41648	41655	0 %	25 %	50 %	25 %	291280861
105	NC_013941	GGCG	2	8	41927	41934	0 %	0 %	75 %	25 %	291280861
106	NC_013941	GGGC	2	8	42246	42253	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
107	NC_013941	CCAT	2	8	42461	42468	25 %	25 %	0 %	50 %	291280862
108	NC_013941	TGAT	2	8	42483	42490	25 %	50 %	25 %	0 %	291280862
109	NC_013941	AGGC	2	8	43014	43021	25 %	0 %	50 %	25 %	291280862
110	NC_013941	CCGA	2	8	44100	44107	25 %	0 %	25 %	50 %	291280863
111	NC_013941	CCCG	2	8	44496	44503	0 %	0 %	25 %	75 %	291280863
112	NC_013941	TCCA	2	8	44548	44555	25 %	25 %	0 %	50 %	291280863
113	NC_013941	TTAA	2	8	44801	44808	50 %	50 %	0 %	0 %	291280864
114	NC_013941	TATC	2	8	45194	45201	25 %	50 %	0 %	25 %	291280864
115	NC_013941	CACC	2	8	45345	45352	25 %	0 %	0 %	75 %	291280864
116	NC_013941	AGCC	2	8	45912	45919	25 %	0 %	25 %	50 %	291280864
117	NC_013941	CCAG	2	8	46112	46119	25 %	0 %	25 %	50 %	291280864
118	NC_013941	AACC	2	8	46120	46127	50 %	0 %	0 %	50 %	291280864
119	NC_013941	GAAA	2	8	46271	46278	75 %	0 %	25 %	0 %	291280864
120	NC_013941	ATTT	2	8	46346	46353	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013941	GTTT	2	8	46363	46370	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013941	GTGC	2	8	46816	46823	0 %	25 %	50 %	25 %	291280865
123	NC_013941	TGAT	2	8	47052	47059	25 %	50 %	25 %	0 %	291280865
124	NC_013941	CTGC	2	8	47312	47319	0 %	25 %	25 %	50 %	291280865
125	NC_013941	GTCG	2	8	48178	48185	0 %	25 %	50 %	25 %	291280866
126	NC_013941	ATGG	2	8	48285	48292	25 %	25 %	50 %	0 %	291280866
127	NC_013941	GTTA	2	8	48662	48669	25 %	50 %	25 %	0 %	291280867
128	NC_013941	CACC	2	8	49213	49220	25 %	0 %	0 %	75 %	291280867
129	NC_013941	ATTG	2	8	49460	49467	25 %	50 %	25 %	0 %	291280867
130	NC_013941	CCTT	2	8	49672	49679	0 %	50 %	0 %	50 %	291280867
131	NC_013941	TGTT	2	8	50499	50506	0 %	75 %	25 %	0 %	291280869
132	NC_013941	TGTT	2	8	50744	50751	0 %	75 %	25 %	0 %	291280869
133	NC_013941	TGTT	2	8	50934	50941	0 %	75 %	25 %	0 %	291280869
134	NC_013941	CTGG	2	8	51199	51206	0 %	25 %	50 %	25 %	291280869
135	NC_013941	TGCG	2	8	52404	52411	0 %	25 %	50 %	25 %	291280871
136	NC_013941	ATGA	2	8	52559	52566	50 %	25 %	25 %	0 %	291280871
137	NC_013941	GGCG	2	8	52723	52730	0 %	0 %	75 %	25 %	291280871
138	NC_013941	GGCG	2	8	52900	52907	0 %	0 %	75 %	25 %	291280871
139	NC_013941	GGAT	2	8	53514	53521	25 %	25 %	50 %	0 %	291280871
140	NC_013941	AACC	2	8	53584	53591	50 %	0 %	0 %	50 %	291280871
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