MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 chromosome

Total Repeats: 1996

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013941	CAGA	2	8	156	163	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_013941	GGCG	2	8	8086	8093	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3	NC_013941	CTGT	2	8	9239	9246	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_013941	GAAT	2	8	10515	10522	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013941	GCAG	2	8	10671	10678	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_013941	CATT	2	8	11349	11356	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_013941	ATTC	2	8	11911	11918	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_013941	AGTG	2	8	12053	12060	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013941	GACA	2	8	15683	15690	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_013941	AACA	2	8	15873	15880	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_013941	AATT	2	8	15897	15904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013941	TAAT	2	8	15916	15923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013941	TTAA	2	8	23019	23026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013941	TTAA	2	8	23253	23260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013941	TCAT	2	8	32589	32596	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_013941	TCCC	2	8	32619	32626	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
17	NC_013941	TGGC	2	8	32660	32667	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_013941	CATG	2	8	33829	33836	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_013941	AGTG	2	8	33979	33986	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013941	GGGC	2	8	42246	42253	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21	NC_013941	ATTT	2	8	46346	46353	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013941	GTTT	2	8	46363	46370	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013941	TGTT	2	8	54057	54064	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013941	TATT	2	8	63367	63374	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013941	TCCA	2	8	74859	74866	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_013941	ATAA	2	8	88635	88642	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013941	ATTA	2	8	89972	89979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013941	AGGC	2	8	90182	90189	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_013941	TTAA	2	8	93723	93730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013941	GCGT	2	8	120270	120277	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_013941	ACGC	2	8	120706	120713	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_013941	GGAT	2	8	120744	120751	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013941	TGGT	2	8	122012	122019	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013941	GAAT	2	8	126236	126243	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013941	TCAA	2	8	126427	126434	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_013941	GATA	2	8	127442	127449	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013941	CGGC	2	8	132050	132057	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_013941	AATT	2	8	145592	145599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013941	GAAT	2	8	145657	145664	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013941	ACTT	2	8	152338	152345	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_013941	CTGT	2	8	160570	160577	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_013941	AATT	2	8	161430	161437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013941	TTAC	2	8	165040	165047	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_013941	GGTT	2	8	168805	168812	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013941	CCCA	2	8	171586	171593	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
46	NC_013941	CTTT	2	8	171605	171612	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_013941	GGAT	2	8	188400	188407	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013941	ATTG	2	8	192079	192086	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013941	GAGC	2	8	194127	194134	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_013941	GAAA	2	8	195280	195287	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013941	ATAA	2	8	196027	196034	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013941	AGTT	2	8	201192	201199	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013941	AAGG	2	8	212945	212952	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013941	AAAC	2	8	219288	219295	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_013941	ATCA	2	8	226037	226044	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_013941	GCTT	2	8	227143	227150	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_013941	CCGG	2	8	228197	228204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_013941	GTAG	2	8	228496	228503	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013941	TAAA	2	8	228880	228887	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013941	GAAA	2	8	229026	229033	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013941	CTGA	2	8	229485	229492	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_013941	GTAC	2	8	229569	229576	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_013941	CGTC	2	8	230010	230017	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_013941	AAAG	2	8	230133	230140	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013941	GCTG	2	8	230811	230818	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_013941	CCTG	2	8	232244	232251	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_013941	CCGT	2	8	232279	232286	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_013941	ATTT	2	8	234207	234214	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013941	CCTG	2	8	240468	240475	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_013941	CCGT	2	8	240503	240510	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_013941	TCAT	2	8	240650	240657	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_013941	AATG	2	8	240727	240734	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013941	TGTT	2	8	240753	240760	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013941	ACAG	2	8	257666	257673	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_013941	CTTT	2	8	261326	261333	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_013941	GTGC	2	8	261999	262006	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_013941	AGGC	2	8	262296	262303	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_013941	CATC	2	8	262317	262324	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_013941	ATAA	2	8	263518	263525	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013941	ATCG	2	8	263540	263547	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_013941	GATT	2	8	263723	263730	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013941	TGTA	2	8	263957	263964	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013941	CTGT	2	8	264772	264779	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_013941	GGGA	2	8	267140	267147	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013941	CTGG	2	8	267437	267444	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_013941	GGCG	2	8	267710	267717	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
87	NC_013941	GACG	2	8	267731	267738	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_013941	GCGG	2	8	267782	267789	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
89	NC_013941	GCGG	2	8	268013	268020	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
90	NC_013941	CCGG	2	8	268138	268145	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_013941	CAGC	2	8	268454	268461	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_013941	GTCA	2	8	268791	268798	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_013941	CTGA	2	8	269037	269044	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_013941	CACC	2	8	269942	269949	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
95	NC_013941	CAGC	2	8	269963	269970	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_013941	GTGA	2	8	270369	270376	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013941	ATGC	2	8	271239	271246	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_013941	ATTG	2	8	271304	271311	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013941	GTAA	2	8	271496	271503	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013941	TTAA	2	8	271505	271512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013941	CAGC	2	8	272528	272535	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_013941	AGTG	2	8	272933	272940	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013941	TAGC	2	8	273505	273512	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_013941	TGGA	2	8	274714	274721	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013941	ATAA	2	8	275106	275113	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013941	TAAT	2	8	278175	278182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013941	TAAT	2	8	278400	278407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013941	ATAC	2	8	278519	278526	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_013941	TATT	2	8	286963	286970	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013941	AGTG	2	8	288459	288466	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013941	ATTG	2	8	288517	288524	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013941	CGCC	2	8	293632	293639	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
113	NC_013941	TAAG	2	8	293850	293857	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013941	GAAC	2	8	293868	293875	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_013941	AGTA	2	8	296951	296958	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013941	CGTT	2	8	300016	300023	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_013941	GAAT	2	8	309052	309059	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013941	AAGA	2	8	310619	310626	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013941	GTTT	2	8	310701	310708	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013941	TTAT	2	8	311781	311788	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013941	ACAA	2	8	311819	311826	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_013941	ATTT	2	8	312158	312165	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013941	TCAA	2	8	312174	312181	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_013941	CAGC	2	8	320501	320508	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_013941	GACA	2	8	320589	320596	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_013941	ATTT	2	8	322348	322355	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013941	AAGG	2	8	322374	322381	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013941	CTGA	2	8	329537	329544	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_013941	TGAA	2	8	329549	329556	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013941	GCGG	2	8	338820	338827	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
131	NC_013941	ACGG	2	8	344378	344385	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_013941	TGTT	2	8	344643	344650	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013941	ATTT	2	8	345554	345561	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013941	TGTT	2	8	345924	345931	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013941	GCAT	2	8	346740	346747	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_013941	GGTT	2	8	347829	347836	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013941	TTGA	2	8	347842	347849	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013941	TCTT	2	8	348013	348020	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_013941	TAAT	2	8	348311	348318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013941	GCTG	2	8	349965	349972	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_013941	TGAG	2	8	350015	350022	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013941	CTGT	2	8	350719	350726	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_013941	GGTT	2	8	350948	350955	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013941	TGCT	2	8	351095	351102	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_013941	TTAT	2	8	351223	351230	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013941	CAGC	2	8	351288	351295	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_013941	TGCT	2	8	351550	351557	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_013941	TTCT	2	8	353656	353663	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_013941	ACAT	2	8	354557	354564	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_013941	TTCT	2	8	354949	354956	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_013941	AAAG	2	8	354979	354986	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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445	NC_013941	CATG	2	8	1160453	1160460	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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451	NC_013941	ATCG	2	8	1181371	1181378	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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475	NC_013941	AACG	2	8	1267013	1267020	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
476	NC_013941	CAAT	2	8	1267055	1267062	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
477	NC_013941	TTAA	2	8	1275838	1275845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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482	NC_013941	TGAT	2	8	1291313	1291320	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
483	NC_013941	CGGG	2	8	1299773	1299780	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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485	NC_013941	TTCA	2	8	1308744	1308751	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
486	NC_013941	CTAT	2	8	1308763	1308770	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
487	NC_013941	AGTC	2	8	1312605	1312612	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
488	NC_013941	GGTT	2	8	1315534	1315541	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
489	NC_013941	TGCT	2	8	1316034	1316041	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
490	NC_013941	CGTG	2	8	1316850	1316857	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
491	NC_013941	TCGA	2	8	1317011	1317018	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
492	NC_013941	ATTT	2	8	1317472	1317479	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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498	NC_013941	ATTT	2	8	1320939	1320946	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
499	NC_013941	GTTT	2	8	1320972	1320979	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
500	NC_013941	TTAT	2	8	1321225	1321232	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

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