MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 chromosome

Total Repeats: 68339

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013941	CGG	2	6	353	358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291280825
2	NC_013941	TGG	2	6	475	480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291280825
3	NC_013941	GAT	2	6	482	487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291280825
4	NC_013941	CGC	3	9	569	577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291280825
5	NC_013941	TCG	2	6	613	618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291280825
6	NC_013941	CTG	2	6	795	800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291280825
7	NC_013941	CCG	2	6	848	853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291280825
8	NC_013941	CCG	2	6	907	912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291280825
9	NC_013941	TGG	2	6	931	936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291280825
10	NC_013941	ACT	2	6	958	963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291280825
11	NC_013941	CGG	2	6	967	972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291280825
12	NC_013941	TTG	2	6	998	1003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291280825
13	NC_013941	GTT	2	6	1067	1072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291280825
14	NC_013941	TTC	2	6	1126	1131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291280825
15	NC_013941	TGA	2	6	1232	1237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291280825
16	NC_013941	AAT	2	6	1272	1277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291280825
17	NC_013941	GGC	2	6	1328	1333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291280825
18	NC_013941	TGC	2	6	1343	1348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291280825
19	NC_013941	GTG	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291280825
20	NC_013941	ATC	2	6	1388	1393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291280825
21	NC_013941	AAG	2	6	1483	1488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291280825
22	NC_013941	GGT	2	6	1535	1540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291280825
23	NC_013941	TCT	2	6	1635	1640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291280825
24	NC_013941	GAT	2	6	1671	1676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291280825
25	NC_013941	TCA	2	6	1700	1705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291280825
26	NC_013941	CTG	2	6	1773	1778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291280825
27	NC_013941	GAA	2	6	1808	1813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291280825
28	NC_013941	GAA	2	6	1902	1907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291280825
29	NC_013941	ATC	2	6	1966	1971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291280825
30	NC_013941	TTG	2	6	1987	1992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291280825
31	NC_013941	TCG	2	6	2085	2090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291280825
32	NC_013941	TAC	2	6	2097	2102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291280825
33	NC_013941	TGA	2	6	2213	2218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291280825
34	NC_013941	TGA	2	6	2221	2226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291280825
35	NC_013941	GAT	2	6	2349	2354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291280825
36	NC_013941	TGC	2	6	2446	2451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291280825
37	NC_013941	CGA	2	6	2510	2515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291280825
38	NC_013941	TGA	2	6	2546	2551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291280825
39	NC_013941	TGA	2	6	2582	2587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291280825
40	NC_013941	TAT	2	6	2685	2690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291280825
41	NC_013941	TGC	2	6	2707	2712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291280825
42	NC_013941	GCG	2	6	2863	2868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291280826
43	NC_013941	CAA	2	6	2937	2942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291280826
44	NC_013941	GGT	2	6	3105	3110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291280826
45	NC_013941	GCA	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291280826
46	NC_013941	TGG	2	6	3243	3248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291280826
47	NC_013941	TGA	2	6	3257	3262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291280826
48	NC_013941	GAA	2	6	3265	3270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291280826
49	NC_013941	CAT	2	6	3276	3281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291280826
50	NC_013941	TGA	2	6	3303	3308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291280826
51	NC_013941	CGC	2	6	3385	3390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291280826
52	NC_013941	TGA	2	6	3473	3478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291280826
53	NC_013941	CGG	2	6	3704	3709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291280826
54	NC_013941	TGA	2	6	3861	3866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291280827
55	NC_013941	TGA	2	6	3924	3929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291280827
56	NC_013941	CGG	2	6	4059	4064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291280827
57	NC_013941	GGC	2	6	4252	4257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291280827
58	NC_013941	TGA	3	9	4323	4331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291280827
59	NC_013941	CTA	2	6	4404	4409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291280827
60	NC_013941	CGG	2	6	4493	4498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291280827
61	NC_013941	CTG	2	6	4501	4506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291280827
62	NC_013941	TGC	2	6	4542	4547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291280827
63	NC_013941	AAC	2	6	4651	4656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291280827
64	NC_013941	GTT	2	6	4674	4679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291280827
65	NC_013941	CCG	2	6	4680	4685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291280827
66	NC_013941	GCC	2	6	4717	4722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291280827
67	NC_013941	GAT	2	6	4726	4731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291280827
68	NC_013941	CCG	2	6	4973	4978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291280827
69	NC_013941	TGC	2	6	4983	4988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291280827
70	NC_013941	TGA	3	9	5000	5008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291280827
71	NC_013941	ATC	2	6	5009	5014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291280827
72	NC_013941	TTA	2	6	5361	5366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291280828
73	NC_013941	TGG	2	6	5398	5403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291280828
74	NC_013941	ACA	2	6	5406	5411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291280828
75	NC_013941	CCG	2	6	5449	5454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291280828
76	NC_013941	CCG	2	6	5458	5463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291280828
77	NC_013941	TCA	2	6	5481	5486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291280828
78	NC_013941	ATC	2	6	5489	5494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291280828
79	NC_013941	CGG	2	6	5496	5501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291280828
80	NC_013941	GCT	2	6	5687	5692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291280829
81	NC_013941	GGA	2	6	5724	5729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291280829
82	NC_013941	TCA	2	6	5734	5739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291280829
83	NC_013941	AAG	2	6	5740	5745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291280829
84	NC_013941	AAT	2	6	5799	5804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291280829
85	NC_013941	TCA	2	6	5813	5818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291280829
86	NC_013941	TTC	2	6	5866	5871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291280829
87	NC_013941	TTC	2	6	5911	5916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291280829
88	NC_013941	CAC	2	6	5958	5963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291280829
89	NC_013941	TGC	2	6	5976	5981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291280829
90	NC_013941	TTG	2	6	5998	6003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291280829
91	NC_013941	TGA	2	6	6005	6010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291280829
92	NC_013941	CTG	2	6	6360	6365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291280829
93	NC_013941	GTG	2	6	6400	6405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291280829
94	NC_013941	CAT	2	6	6542	6547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291280830
95	NC_013941	GCC	2	6	6759	6764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291280830
96	NC_013941	GTT	2	6	6813	6818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291280830
97	NC_013941	AGA	2	6	6830	6835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291280830
98	NC_013941	ATC	2	6	7057	7062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291280830
99	NC_013941	CGC	2	6	7101	7106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291280830
100	NC_013941	CGC	2	6	7203	7208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291280830
101	NC_013941	GCC	2	6	7209	7214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291280830
102	NC_013941	TTA	2	6	7283	7288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291280830
103	NC_013941	CAG	2	6	7386	7391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291280830
104	NC_013941	AAT	2	6	7407	7412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291280830
105	NC_013941	CGG	2	6	7700	7705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291280830
106	NC_013941	CAA	2	6	7879	7884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291280830
107	NC_013941	TAA	2	6	7934	7939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291280830
108	NC_013941	ACC	2	6	8270	8275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291280831
109	NC_013941	CAG	2	6	8417	8422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291280831
110	NC_013941	CAG	2	6	8438	8443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291280831
111	NC_013941	TGC	2	6	8659	8664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291280831
112	NC_013941	AAG	2	6	8679	8684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291280831
113	NC_013941	CTG	2	6	8705	8710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291280831
114	NC_013941	TTG	2	6	8769	8774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291280831
115	NC_013941	AGA	2	6	8830	8835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291280831
116	NC_013941	TAC	2	6	8870	8875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291280831
117	NC_013941	CTG	2	6	8978	8983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291280831
118	NC_013941	GCA	2	6	9085	9090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291280831
119	NC_013941	CTG	2	6	9182	9187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291280831
120	NC_013941	TGA	2	6	9303	9308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291280832
121	NC_013941	GCG	2	6	9354	9359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291280832
122	NC_013941	GAA	2	6	9389	9394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291280832
123	NC_013941	ATC	2	6	9461	9466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291280832
124	NC_013941	TGG	2	6	9486	9491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291280832
125	NC_013941	CAC	2	6	9517	9522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291280832
126	NC_013941	CGT	2	6	9542	9547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291280832
127	NC_013941	TGC	2	6	9847	9852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291280832
128	NC_013941	GAT	2	6	10044	10049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291280833
129	NC_013941	GCG	2	6	10051	10056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291280833
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133	NC_013941	CAG	2	6	10326	10331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291280833
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253	NC_013941	TCT	2	6	18933	18938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291280841
254	NC_013941	TAA	2	6	19000	19005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291280841
255	NC_013941	GAC	2	6	19012	19017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291280841
256	NC_013941	GTC	2	6	19074	19079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291280841
257	NC_013941	CGG	2	6	19129	19134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291280841
258	NC_013941	GTT	2	6	19180	19185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291280841
259	NC_013941	TAA	2	6	19250	19255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291280841
260	NC_013941	TCA	2	6	19350	19355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291280842
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273	NC_013941	ATT	2	6	20267	20272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291280842
274	NC_013941	TGA	2	6	20346	20351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291280842
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276	NC_013941	TAT	2	6	20458	20463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291280842
277	NC_013941	ATT	2	6	20501	20506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291280842
278	NC_013941	TAC	2	6	20512	20517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291280842
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281	NC_013941	GCA	2	6	20737	20742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291280842
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283	NC_013941	ATC	2	6	21131	21136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291280842
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285	NC_013941	AGG	2	6	21265	21270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291280842
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362	NC_013941	ATC	2	6	27297	27302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291280849
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375	NC_013941	TCT	2	6	28497	28502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291280849
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379	NC_013941	TGC	2	6	28724	28729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291280849
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498	NC_013941	GGC	2	6	38052	38057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291280856
499	NC_013941	CTG	2	6	38062	38067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291280856
500	NC_013941	CAT	2	6	38208	38213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291280856

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