MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 chromosome

Total Repeats: 8606

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013941	TG	3	6	37	42	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013941	CT	3	6	444	449	0 %	50 %	0 %	50 %	291280825
3	NC_013941	GC	3	6	753	758	0 %	0 %	50 %	50 %	291280825
4	NC_013941	TA	3	6	1030	1035	50 %	50 %	0 %	0 %	291280825
5	NC_013941	GC	3	6	1332	1337	0 %	0 %	50 %	50 %	291280825
6	NC_013941	TG	3	6	1434	1439	0 %	50 %	50 %	0 %	291280825
7	NC_013941	CG	4	8	2525	2532	0 %	0 %	50 %	50 %	291280825
8	NC_013941	TG	3	6	3605	3610	0 %	50 %	50 %	0 %	291280826
9	NC_013941	GC	3	6	3960	3965	0 %	0 %	50 %	50 %	291280827
10	NC_013941	GC	3	6	4441	4446	0 %	0 %	50 %	50 %	291280827
11	NC_013941	AG	3	6	4881	4886	50 %	0 %	50 %	0 %	291280827
12	NC_013941	GA	3	6	5090	5095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013941	AT	3	6	5612	5617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013941	CG	3	6	7553	7558	0 %	0 %	50 %	50 %	291280830
15	NC_013941	CG	3	6	7745	7750	0 %	0 %	50 %	50 %	291280830
16	NC_013941	TA	3	6	8024	8029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013941	TC	3	6	8345	8350	0 %	50 %	0 %	50 %	291280831
18	NC_013941	CG	3	6	8432	8437	0 %	0 %	50 %	50 %	291280831
19	NC_013941	TG	3	6	9477	9482	0 %	50 %	50 %	0 %	291280832
20	NC_013941	AG	3	6	11612	11617	50 %	0 %	50 %	0 %	291280835
21	NC_013941	AT	3	6	12141	12146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013941	CG	3	6	13558	13563	0 %	0 %	50 %	50 %	291280836
23	NC_013941	CG	3	6	14501	14506	0 %	0 %	50 %	50 %	291280837
24	NC_013941	CT	3	6	15556	15561	0 %	50 %	0 %	50 %	291280838
25	NC_013941	CT	3	6	15719	15724	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_013941	CT	3	6	16684	16689	0 %	50 %	0 %	50 %	291280839
27	NC_013941	TG	3	6	16734	16739	0 %	50 %	50 %	0 %	291280839
28	NC_013941	GA	3	6	17358	17363	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013941	TA	3	6	19166	19171	50 %	50 %	0 %	0 %	291280841
30	NC_013941	AT	4	8	19288	19295	50 %	50 %	0 %	0 %	291280842
31	NC_013941	TA	3	6	19502	19507	50 %	50 %	0 %	0 %	291280842
32	NC_013941	GC	3	6	19714	19719	0 %	0 %	50 %	50 %	291280842
33	NC_013941	AT	3	6	19937	19942	50 %	50 %	0 %	0 %	291280842
34	NC_013941	GT	3	6	20489	20494	0 %	50 %	50 %	0 %	291280842
35	NC_013941	AT	4	8	20642	20649	50 %	50 %	0 %	0 %	291280842
36	NC_013941	AT	3	6	20687	20692	50 %	50 %	0 %	0 %	291280842
37	NC_013941	AG	3	6	21018	21023	50 %	0 %	50 %	0 %	291280842
38	NC_013941	AT	3	6	23733	23738	50 %	50 %	0 %	0 %	291280845
39	NC_013941	AT	3	6	24376	24381	50 %	50 %	0 %	0 %	291280845
40	NC_013941	TC	3	6	24515	24520	0 %	50 %	0 %	50 %	291280845
41	NC_013941	TA	3	6	24908	24913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013941	GT	3	6	25115	25120	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013941	TC	3	6	25121	25126	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_013941	GC	3	6	25434	25439	0 %	0 %	50 %	50 %	291280846
45	NC_013941	GT	3	6	25850	25855	0 %	50 %	50 %	0 %	291280848
46	NC_013941	CG	3	6	25896	25901	0 %	0 %	50 %	50 %	291280848
47	NC_013941	CG	3	6	27282	27287	0 %	0 %	50 %	50 %	291280849
48	NC_013941	GC	3	6	27955	27960	0 %	0 %	50 %	50 %	291280849
49	NC_013941	GC	4	8	28073	28080	0 %	0 %	50 %	50 %	291280849
50	NC_013941	CG	3	6	28757	28762	0 %	0 %	50 %	50 %	291280849
51	NC_013941	GC	3	6	29919	29924	0 %	0 %	50 %	50 %	291280850
52	NC_013941	AT	3	6	30729	30734	50 %	50 %	0 %	0 %	291280852
53	NC_013941	TG	3	6	31079	31084	0 %	50 %	50 %	0 %	291280852
54	NC_013941	CG	3	6	31353	31358	0 %	0 %	50 %	50 %	291280852
55	NC_013941	TC	3	6	32248	32253	0 %	50 %	0 %	50 %	291280853
56	NC_013941	CT	3	6	34298	34303	0 %	50 %	0 %	50 %	291280855
57	NC_013941	CG	3	6	34448	34453	0 %	0 %	50 %	50 %	291280855
58	NC_013941	GC	3	6	35261	35266	0 %	0 %	50 %	50 %	291280856
59	NC_013941	GC	3	6	35465	35470	0 %	0 %	50 %	50 %	291280856
60	NC_013941	CG	3	6	35601	35606	0 %	0 %	50 %	50 %	291280856
61	NC_013941	TC	4	8	35763	35770	0 %	50 %	0 %	50 %	291280856
62	NC_013941	CG	3	6	36502	36507	0 %	0 %	50 %	50 %	291280856
63	NC_013941	GC	3	6	36670	36675	0 %	0 %	50 %	50 %	291280856
64	NC_013941	AT	3	6	38569	38574	50 %	50 %	0 %	0 %	291280857
65	NC_013941	TG	3	6	38656	38661	0 %	50 %	50 %	0 %	291280858
66	NC_013941	AG	3	6	38736	38741	50 %	0 %	50 %	0 %	291280858
67	NC_013941	CG	3	6	38915	38920	0 %	0 %	50 %	50 %	291280858
68	NC_013941	CT	3	6	39422	39427	0 %	50 %	0 %	50 %	291280859
69	NC_013941	CA	3	6	39490	39495	50 %	0 %	0 %	50 %	291280859
70	NC_013941	TC	3	6	40379	40384	0 %	50 %	0 %	50 %	291280860
71	NC_013941	GC	3	6	43992	43997	0 %	0 %	50 %	50 %	291280863
72	NC_013941	CG	3	6	44264	44269	0 %	0 %	50 %	50 %	291280863
73	NC_013941	TG	3	6	44467	44472	0 %	50 %	50 %	0 %	291280863
74	NC_013941	GC	4	8	45142	45149	0 %	0 %	50 %	50 %	291280864
75	NC_013941	CG	3	6	47025	47030	0 %	0 %	50 %	50 %	291280865
76	NC_013941	GC	3	6	48127	48132	0 %	0 %	50 %	50 %	291280866
77	NC_013941	GC	3	6	48934	48939	0 %	0 %	50 %	50 %	291280867
78	NC_013941	CG	3	6	50103	50108	0 %	0 %	50 %	50 %	291280868
79	NC_013941	TA	3	6	50291	50296	50 %	50 %	0 %	0 %	291280869
80	NC_013941	AT	3	6	51585	51590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013941	CT	3	6	51735	51740	0 %	50 %	0 %	50 %	291280870
82	NC_013941	CT	3	6	52704	52709	0 %	50 %	0 %	50 %	291280871
83	NC_013941	CG	3	6	53861	53866	0 %	0 %	50 %	50 %	291280871
84	NC_013941	GA	3	6	54095	54100	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013941	CA	3	6	54796	54801	50 %	0 %	0 %	50 %	291280873
86	NC_013941	GC	3	6	55274	55279	0 %	0 %	50 %	50 %	291280874
87	NC_013941	CG	4	8	55763	55770	0 %	0 %	50 %	50 %	291280875
88	NC_013941	CG	4	8	56051	56058	0 %	0 %	50 %	50 %	291280875
89	NC_013941	AC	3	6	56535	56540	50 %	0 %	0 %	50 %	291280876
90	NC_013941	AC	3	6	56755	56760	50 %	0 %	0 %	50 %	291280877
91	NC_013941	GA	3	6	58667	58672	50 %	0 %	50 %	0 %	291280879
92	NC_013941	GC	4	8	59053	59060	0 %	0 %	50 %	50 %	291280879
93	NC_013941	AT	3	6	60071	60076	50 %	50 %	0 %	0 %	291280880
94	NC_013941	GC	4	8	60525	60532	0 %	0 %	50 %	50 %	291280880
95	NC_013941	GT	3	6	62289	62294	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013941	AT	3	6	62306	62311	50 %	50 %	0 %	0 %	291280881
97	NC_013941	GC	3	6	63379	63384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_013941	AG	3	6	63885	63890	50 %	0 %	50 %	0 %	291280882
99	NC_013941	CG	3	6	66682	66687	0 %	0 %	50 %	50 %	291280884
100	NC_013941	AG	3	6	67562	67567	50 %	0 %	50 %	0 %	291280884
101	NC_013941	CG	3	6	67636	67641	0 %	0 %	50 %	50 %	291280884
102	NC_013941	CG	4	8	67755	67762	0 %	0 %	50 %	50 %	291280884
103	NC_013941	GC	3	6	71795	71800	0 %	0 %	50 %	50 %	291280887
104	NC_013941	TG	3	6	72409	72414	0 %	50 %	50 %	0 %	291280887
105	NC_013941	CG	3	6	72724	72729	0 %	0 %	50 %	50 %	291280887
106	NC_013941	GT	3	6	72895	72900	0 %	50 %	50 %	0 %	291280887
107	NC_013941	CG	3	6	73463	73468	0 %	0 %	50 %	50 %	291280888
108	NC_013941	GC	3	6	74618	74623	0 %	0 %	50 %	50 %	291280888
109	NC_013941	AG	3	6	74891	74896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013941	GA	3	6	75418	75423	50 %	0 %	50 %	0 %	291280889
111	NC_013941	CG	3	6	75487	75492	0 %	0 %	50 %	50 %	291280889
112	NC_013941	TG	3	6	76928	76933	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013941	GC	3	6	77927	77932	0 %	0 %	50 %	50 %	291280892
114	NC_013941	AC	3	6	78538	78543	50 %	0 %	0 %	50 %	291280892
115	NC_013941	GC	3	6	79056	79061	0 %	0 %	50 %	50 %	291280892
116	NC_013941	AG	3	6	79087	79092	50 %	0 %	50 %	0 %	291280892
117	NC_013941	GA	3	6	79100	79105	50 %	0 %	50 %	0 %	291280892
118	NC_013941	TC	3	6	81742	81747	0 %	50 %	0 %	50 %	291280895
119	NC_013941	CG	3	6	82324	82329	0 %	0 %	50 %	50 %	291280895
120	NC_013941	GC	3	6	83893	83898	0 %	0 %	50 %	50 %	291280896
121	NC_013941	TG	3	6	83990	83995	0 %	50 %	50 %	0 %	291280896
122	NC_013941	CG	3	6	84357	84362	0 %	0 %	50 %	50 %	291280897
123	NC_013941	CG	3	6	84477	84482	0 %	0 %	50 %	50 %	291280897
124	NC_013941	GC	3	6	85188	85193	0 %	0 %	50 %	50 %	291280897
125	NC_013941	GC	3	6	85291	85296	0 %	0 %	50 %	50 %	291280897
126	NC_013941	AT	3	6	85348	85353	50 %	50 %	0 %	0 %	291280897
127	NC_013941	GC	3	6	86239	86244	0 %	0 %	50 %	50 %	291280898
128	NC_013941	TC	3	6	89792	89797	0 %	50 %	0 %	50 %	291280901
129	NC_013941	TG	3	6	89950	89955	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013941	CT	3	6	89958	89963	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_013941	GC	4	8	90374	90381	0 %	0 %	50 %	50 %	291280902
132	NC_013941	GC	3	6	90781	90786	0 %	0 %	50 %	50 %	291280902
133	NC_013941	GC	3	6	91261	91266	0 %	0 %	50 %	50 %	291280902
134	NC_013941	TC	3	6	91743	91748	0 %	50 %	0 %	50 %	291280902
135	NC_013941	GA	3	6	91904	91909	50 %	0 %	50 %	0 %	291280902
136	NC_013941	GC	3	6	92153	92158	0 %	0 %	50 %	50 %	291280903
137	NC_013941	CG	3	6	92384	92389	0 %	0 %	50 %	50 %	291280903
138	NC_013941	GC	3	6	93145	93150	0 %	0 %	50 %	50 %	291280905
139	NC_013941	CG	3	6	93214	93219	0 %	0 %	50 %	50 %	291280905
140	NC_013941	AG	3	6	95578	95583	50 %	0 %	50 %	0 %	291280907
141	NC_013941	AG	3	6	97203	97208	50 %	0 %	50 %	0 %	291280909
142	NC_013941	GA	3	6	97794	97799	50 %	0 %	50 %	0 %	291280910
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