MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Deferribacter desulfuricans SSM1 megaplasmid pDF308

Total Repeats: 245

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013940	TTTAAA	2	12	1015	1026	50 %	50 %	0 %	0 %	291280553
2	NC_013940	TGAGTA	2	12	2864	2875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291280554
3	NC_013940	ATCTAA	2	12	3727	3738	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	291280555
4	NC_013940	TAAAAA	2	12	4254	4265	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	291280556
5	NC_013940	ATTGAA	2	12	12399	12410	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	291280562
6	NC_013940	AAAAAG	2	12	13074	13085	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	291280562
7	NC_013940	TAAAAA	2	12	14435	14446	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	291280563
8	NC_013940	GCTTTA	2	12	18114	18125	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	291280567
9	NC_013940	AAAGGA	2	12	18285	18296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291280567
10	NC_013940	AAAAAT	2	12	18839	18850	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013940	ATCAAA	2	12	19740	19751	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	291280568
12	NC_013940	TTAATA	2	12	20194	20205	50 %	50 %	0 %	0 %	291280569
13	NC_013940	TTGATA	2	12	20408	20419	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	291280569
14	NC_013940	TAAAAA	2	12	20594	20605	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	291280569
15	NC_013940	TATAAT	2	12	20664	20675	50 %	50 %	0 %	0 %	291280569
16	NC_013940	CTTATA	2	12	22196	22207	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	291280571
17	NC_013940	TAGATG	2	12	23603	23614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291280571
18	NC_013940	GAAATT	2	12	23864	23875	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	291280572
19	NC_013940	TTTTAT	2	12	24256	24267	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	291280572
20	NC_013940	GTTCTG	2	12	25523	25534	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	291280574
21	NC_013940	ACGATG	2	12	29064	29075	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	291280578
22	NC_013940	TGAATT	2	12	29546	29557	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	291280579
23	NC_013940	ATACAA	2	12	31790	31801	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	291280580
24	NC_013940	TAAAAG	2	12	32481	32492	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	291280582
25	NC_013940	ATATTA	2	12	32760	32771	50 %	50 %	0 %	0 %	291280582
26	NC_013940	TAAATT	2	12	33048	33059	50 %	50 %	0 %	0 %	291280582
27	NC_013940	GAAAAT	2	12	34466	34477	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	291280582
28	NC_013940	CAGATG	2	12	35280	35291	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	291280582
29	NC_013940	ACAAAA	2	12	39043	39054	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	291280584
30	NC_013940	TTTAAA	2	12	40068	40079	50 %	50 %	0 %	0 %	291280586
31	NC_013940	TGTTAA	2	12	41842	41853	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013940	TAGATT	2	12	42540	42551	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013940	TTTAAA	2	12	45310	45321	50 %	50 %	0 %	0 %	291280588
34	NC_013940	GAATTT	2	12	47311	47322	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	291280589
35	NC_013940	AAATAT	2	12	47574	47585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291280589
36	NC_013940	TGGTAG	2	12	50166	50177	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	291280589
37	NC_013940	TTTAAA	2	12	51481	51492	50 %	50 %	0 %	0 %	291280591
38	NC_013940	TAAAGA	2	12	53369	53380	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013940	TATTAA	2	12	53798	53809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013940	ATATTT	2	12	56102	56113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291280595
41	NC_013940	ATTAAA	2	12	59370	59381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291280596
42	NC_013940	TTAATT	2	12	60055	60066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291280596
43	NC_013940	TTTTGC	2	12	62170	62181	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	291280598
44	NC_013940	TTTAAA	2	12	62888	62899	50 %	50 %	0 %	0 %	291280600
45	NC_013940	TATAAT	2	12	64819	64830	50 %	50 %	0 %	0 %	291280602
46	NC_013940	CATTTG	2	12	64863	64874	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	291280602
47	NC_013940	ATTAAA	3	18	67720	67737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013940	CTAAAA	2	12	67961	67972	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	291280603
49	NC_013940	TGATAT	2	12	68148	68159	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	291280603
50	NC_013940	TAATAT	2	12	68695	68706	50 %	50 %	0 %	0 %	291280604
51	NC_013940	ATTGAT	2	12	71348	71359	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	291280607
52	NC_013940	ACTAAA	2	12	72395	72406	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	291280608
53	NC_013940	ATTTAC	2	12	72567	72578	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	291280608
54	NC_013940	AAAATT	2	12	73674	73685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291280609
55	NC_013940	TATTTA	2	12	76816	76827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291280612
56	NC_013940	ATAAAT	2	12	77729	77740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291280613
57	NC_013940	TAATAC	2	12	78249	78260	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_013940	ATATGT	2	12	79889	79900	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	291280614
59	NC_013940	TATATC	2	12	80147	80158	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	291280614
60	NC_013940	TTTGTT	2	12	82739	82750	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	291280617
61	NC_013940	AAAATC	2	12	84813	84824	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	291280618
62	NC_013940	TATATG	2	12	86206	86217	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013940	CAAAAT	2	12	86860	86871	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_013940	GATAAT	2	12	87720	87731	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	291280619
65	NC_013940	TAAAAC	2	12	89040	89051	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	291280623
66	NC_013940	TTGAAA	2	12	89252	89263	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	291280623
67	NC_013940	TCATAT	2	12	89660	89671	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	291280624
68	NC_013940	TAAAAA	2	12	90323	90334	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013940	TTTAAA	2	12	95556	95567	50 %	50 %	0 %	0 %	291280630
70	NC_013940	ATCATT	2	12	99186	99197	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_013940	ATTTAG	2	12	99492	99503	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013940	CAAATA	2	12	100083	100094	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_013940	TGATAT	2	12	100159	100170	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013940	TTTAAT	2	12	101150	101161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013940	TAAAAC	2	12	101947	101958	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_013940	ACATTA	2	12	102224	102235	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_013940	TTTAAA	2	12	102893	102904	50 %	50 %	0 %	0 %	291280632
78	NC_013940	AACACA	2	12	106289	106300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_013940	AGATAA	2	12	106417	106428	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013940	TTTATT	2	12	106626	106637	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013940	ATTTTT	2	12	107450	107461	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	291280633
82	NC_013940	CATCTA	2	12	108099	108110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291280634
83	NC_013940	TTTATT	2	12	108133	108144	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	291280634
84	NC_013940	ATTTTC	2	12	108157	108168	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	291280634
85	NC_013940	TTTTAT	2	12	108771	108782	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	291280634
86	NC_013940	TTTAAA	2	12	110071	110082	50 %	50 %	0 %	0 %	291280635
87	NC_013940	TTTTTC	2	12	110541	110552	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	291280636
88	NC_013940	AAATAT	2	12	112566	112577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013940	ATAAAC	2	12	114448	114459	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_013940	AAAGAA	2	12	114493	114504	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013940	TTTAAA	2	12	115247	115258	50 %	50 %	0 %	0 %	291280642
92	NC_013940	AAAAGA	2	12	118222	118233	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	291280645
93	NC_013940	TTTAAA	2	12	119024	119035	50 %	50 %	0 %	0 %	291280647
94	NC_013940	TAATAT	2	12	121100	121111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013940	AAAGAG	2	12	123557	123568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291280649
96	NC_013940	TTTAAA	2	12	126476	126487	50 %	50 %	0 %	0 %	291280653
97	NC_013940	CAAAAT	2	12	129607	129618	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_013940	ATTCAT	2	12	130441	130452	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	291280654
99	NC_013940	ACCAAT	2	12	132055	132066	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	291280656
100	NC_013940	CTTTGT	2	12	132951	132962	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	291280657
101	NC_013940	AGATAA	2	12	134410	134421	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	291280658
102	NC_013940	TTTGCT	2	12	135496	135507	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	291280659
103	NC_013940	ACTTTT	2	12	136766	136777	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	291280661
104	NC_013940	ATTTAA	2	12	137037	137048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013940	TAATAT	2	12	138879	138890	50 %	50 %	0 %	0 %	291280663
106	NC_013940	TTAAAT	2	12	139811	139822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013940	TTTTAT	2	12	140451	140462	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013940	ATTTTT	2	12	140560	140571	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013940	TATAGA	2	12	143945	143956	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	291280667
110	NC_013940	CCAGAA	2	12	145207	145218	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	291280669
111	NC_013940	TTTAAA	2	12	146133	146144	50 %	50 %	0 %	0 %	291280672
112	NC_013940	TAGAAG	2	12	148181	148192	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	291280673
113	NC_013940	TAAAGA	2	12	148905	148916	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	291280673
114	NC_013940	TAAAAA	2	12	149245	149256	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013940	AATAAA	2	12	153839	153850	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013940	AAAAAT	2	12	154012	154023	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013940	AGGTAT	2	12	155128	155139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291280680
118	NC_013940	TTTATC	2	12	155734	155745	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	291280680
119	NC_013940	CTTTTA	2	12	158791	158802	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	291280684
120	NC_013940	ATTAGG	2	12	160116	160127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291280686
121	NC_013940	TTTAAA	2	12	162497	162508	50 %	50 %	0 %	0 %	291280688
122	NC_013940	TAGATT	2	12	163867	163878	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013940	AATATA	2	12	165976	165987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291280689
124	NC_013940	TATTTT	2	12	166430	166441	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013940	ATTTAT	2	12	166519	166530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013940	TTTAAA	2	12	169142	169153	50 %	50 %	0 %	0 %	291280693
127	NC_013940	AATCAT	2	12	171426	171437	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	291280695
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129	NC_013940	TATATC	2	12	175415	175426	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_013940	TATCAT	2	12	175800	175811	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	291280701
131	NC_013940	TTTATT	2	12	176558	176569	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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135	NC_013940	TTTAAA	2	12	180540	180551	50 %	50 %	0 %	0 %	291280706
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243	NC_013940	AAATAG	2	12	307020	307031	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	291280808
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245	NC_013940	TAATTT	2	12	308242	308253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.