MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Deferribacter desulfuricans SSM1 megaplasmid pDF308

Total Repeats: 189

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013940	TTTAAA	2	12	1015	1026	50 %	50 %	0 %	0 %	291280553
2	NC_013940	TGAGTA	2	12	2864	2875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291280554
3	NC_013940	ATCTAA	2	12	3727	3738	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	291280555
4	NC_013940	TAAAAA	2	12	4254	4265	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	291280556
5	NC_013940	ATTGAA	2	12	12399	12410	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	291280562
6	NC_013940	AAAAAG	2	12	13074	13085	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	291280562
7	NC_013940	TAAAAA	2	12	14435	14446	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	291280563
8	NC_013940	GCTTTA	2	12	18114	18125	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	291280567
9	NC_013940	AAAGGA	2	12	18285	18296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291280567
10	NC_013940	ATCAAA	2	12	19740	19751	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	291280568
11	NC_013940	TTAATA	2	12	20194	20205	50 %	50 %	0 %	0 %	291280569
12	NC_013940	TTGATA	2	12	20408	20419	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	291280569
13	NC_013940	TAAAAA	2	12	20594	20605	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	291280569
14	NC_013940	TATAAT	2	12	20664	20675	50 %	50 %	0 %	0 %	291280569
15	NC_013940	CTTATA	2	12	22196	22207	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	291280571
16	NC_013940	TAGATG	2	12	23603	23614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291280571
17	NC_013940	GAAATT	2	12	23864	23875	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	291280572
18	NC_013940	TTTTAT	2	12	24256	24267	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	291280572
19	NC_013940	GTTCTG	2	12	25523	25534	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	291280574
20	NC_013940	ACGATG	2	12	29064	29075	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	291280578
21	NC_013940	TGAATT	2	12	29546	29557	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	291280579
22	NC_013940	ATACAA	2	12	31790	31801	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	291280580
23	NC_013940	TAAAAG	2	12	32481	32492	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	291280582
24	NC_013940	ATATTA	2	12	32760	32771	50 %	50 %	0 %	0 %	291280582
25	NC_013940	TAAATT	2	12	33048	33059	50 %	50 %	0 %	0 %	291280582
26	NC_013940	GAAAAT	2	12	34466	34477	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	291280582
27	NC_013940	CAGATG	2	12	35280	35291	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	291280582
28	NC_013940	ACAAAA	2	12	39043	39054	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	291280584
29	NC_013940	TTTAAA	2	12	40068	40079	50 %	50 %	0 %	0 %	291280586
30	NC_013940	TTTAAA	2	12	45310	45321	50 %	50 %	0 %	0 %	291280588
31	NC_013940	GAATTT	2	12	47311	47322	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	291280589
32	NC_013940	AAATAT	2	12	47574	47585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291280589
33	NC_013940	TGGTAG	2	12	50166	50177	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	291280589
34	NC_013940	TTTAAA	2	12	51481	51492	50 %	50 %	0 %	0 %	291280591
35	NC_013940	ATATTT	2	12	56102	56113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291280595
36	NC_013940	ATTAAA	2	12	59370	59381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291280596
37	NC_013940	TTAATT	2	12	60055	60066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291280596
38	NC_013940	TTTTGC	2	12	62170	62181	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	291280598
39	NC_013940	TTTAAA	2	12	62888	62899	50 %	50 %	0 %	0 %	291280600
40	NC_013940	TATAAT	2	12	64819	64830	50 %	50 %	0 %	0 %	291280602
41	NC_013940	CATTTG	2	12	64863	64874	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	291280602
42	NC_013940	CTAAAA	2	12	67961	67972	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	291280603
43	NC_013940	TGATAT	2	12	68148	68159	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	291280603
44	NC_013940	TAATAT	2	12	68695	68706	50 %	50 %	0 %	0 %	291280604
45	NC_013940	ATTGAT	2	12	71348	71359	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	291280607
46	NC_013940	ACTAAA	2	12	72395	72406	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	291280608
47	NC_013940	ATTTAC	2	12	72567	72578	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	291280608
48	NC_013940	AAAATT	2	12	73674	73685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291280609
49	NC_013940	TATTTA	2	12	76816	76827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291280612
50	NC_013940	ATAAAT	2	12	77729	77740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291280613
51	NC_013940	ATATGT	2	12	79889	79900	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	291280614
52	NC_013940	TATATC	2	12	80147	80158	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	291280614
53	NC_013940	TTTGTT	2	12	82739	82750	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	291280617
54	NC_013940	AAAATC	2	12	84813	84824	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	291280618
55	NC_013940	GATAAT	2	12	87720	87731	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	291280619
56	NC_013940	TAAAAC	2	12	89040	89051	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	291280623
57	NC_013940	TTGAAA	2	12	89252	89263	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	291280623
58	NC_013940	TCATAT	2	12	89660	89671	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	291280624
59	NC_013940	TTTAAA	2	12	95556	95567	50 %	50 %	0 %	0 %	291280630
60	NC_013940	TTTAAA	2	12	102893	102904	50 %	50 %	0 %	0 %	291280632
61	NC_013940	ATTTTT	2	12	107450	107461	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	291280633
62	NC_013940	CATCTA	2	12	108099	108110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291280634
63	NC_013940	TTTATT	2	12	108133	108144	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	291280634
64	NC_013940	ATTTTC	2	12	108157	108168	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	291280634
65	NC_013940	TTTTAT	2	12	108771	108782	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	291280634
66	NC_013940	TTTAAA	2	12	110071	110082	50 %	50 %	0 %	0 %	291280635
67	NC_013940	TTTTTC	2	12	110541	110552	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	291280636
68	NC_013940	TTTAAA	2	12	115247	115258	50 %	50 %	0 %	0 %	291280642
69	NC_013940	AAAAGA	2	12	118222	118233	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	291280645
70	NC_013940	TTTAAA	2	12	119024	119035	50 %	50 %	0 %	0 %	291280647
71	NC_013940	AAAGAG	2	12	123557	123568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291280649
72	NC_013940	TTTAAA	2	12	126476	126487	50 %	50 %	0 %	0 %	291280653
73	NC_013940	ATTCAT	2	12	130441	130452	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	291280654
74	NC_013940	ACCAAT	2	12	132055	132066	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	291280656
75	NC_013940	CTTTGT	2	12	132951	132962	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	291280657
76	NC_013940	AGATAA	2	12	134410	134421	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	291280658
77	NC_013940	TTTGCT	2	12	135496	135507	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	291280659
78	NC_013940	ACTTTT	2	12	136766	136777	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	291280661
79	NC_013940	TAATAT	2	12	138879	138890	50 %	50 %	0 %	0 %	291280663
80	NC_013940	TATAGA	2	12	143945	143956	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	291280667
81	NC_013940	CCAGAA	2	12	145207	145218	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	291280669
82	NC_013940	TTTAAA	2	12	146133	146144	50 %	50 %	0 %	0 %	291280672
83	NC_013940	TAGAAG	2	12	148181	148192	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	291280673
84	NC_013940	TAAAGA	2	12	148905	148916	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	291280673
85	NC_013940	AGGTAT	2	12	155128	155139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291280680
86	NC_013940	TTTATC	2	12	155734	155745	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	291280680
87	NC_013940	CTTTTA	2	12	158791	158802	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	291280684
88	NC_013940	ATTAGG	2	12	160116	160127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291280686
89	NC_013940	TTTAAA	2	12	162497	162508	50 %	50 %	0 %	0 %	291280688
90	NC_013940	AATATA	2	12	165976	165987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291280689
91	NC_013940	TTTAAA	2	12	169142	169153	50 %	50 %	0 %	0 %	291280693
92	NC_013940	AATCAT	2	12	171426	171437	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	291280695
93	NC_013940	ATTAAA	2	12	171595	171606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291280695
94	NC_013940	TATCAT	2	12	175800	175811	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	291280701
95	NC_013940	TTTCTT	2	12	176772	176783	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	291280702
96	NC_013940	AAAAAT	2	12	176792	176803	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	291280702
97	NC_013940	TTTAAA	2	12	180540	180551	50 %	50 %	0 %	0 %	291280706
98	NC_013940	TTTTCA	2	12	184714	184725	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	291280708
99	NC_013940	AGTATC	2	12	185571	185582	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	291280708
100	NC_013940	AATTAT	2	12	185651	185662	50 %	50 %	0 %	0 %	291280708
101	NC_013940	AATTAC	2	12	185735	185746	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	291280708
102	NC_013940	TTTAAA	2	12	195969	195980	50 %	50 %	0 %	0 %	291280717
103	NC_013940	TAAATA	2	12	199374	199385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291280721
104	NC_013940	TATTCA	2	12	199935	199946	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	291280722
105	NC_013940	TTTTTC	2	12	200341	200352	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	291280724
106	NC_013940	TTTAAA	2	12	209201	209212	50 %	50 %	0 %	0 %	291280734
107	NC_013940	ATTAAA	2	12	213184	213195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291280736
108	NC_013940	CAGATG	2	12	213774	213785	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	291280736
109	NC_013940	TACAAA	2	12	213990	214001	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	291280736
110	NC_013940	TTTAAT	2	12	216974	216985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291280739
111	NC_013940	TTAAAT	2	12	217471	217482	50 %	50 %	0 %	0 %	291280739
112	NC_013940	TTTAAT	2	12	218996	219007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291280740
113	NC_013940	ATTTAA	2	12	219613	219624	50 %	50 %	0 %	0 %	291280740
114	NC_013940	ATTAAA	2	12	222535	222546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291280741
115	NC_013940	AAGAAA	2	12	223077	223088	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	291280741
116	NC_013940	TATTAA	2	12	225820	225831	50 %	50 %	0 %	0 %	291280744
117	NC_013940	TTTGAA	2	12	226343	226354	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	291280745
118	NC_013940	GTTACA	2	12	226483	226494	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	291280745
119	NC_013940	TATTAA	2	12	226697	226708	50 %	50 %	0 %	0 %	291280745
120	NC_013940	TTTAAA	2	12	227587	227598	50 %	50 %	0 %	0 %	291280747
121	NC_013940	TATAGT	2	12	230642	230653	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	291280750
122	NC_013940	ATCAAA	2	12	231783	231794	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	291280751
123	NC_013940	TAAAAT	2	12	232298	232309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291280751
124	NC_013940	ATTATA	2	12	232989	233000	50 %	50 %	0 %	0 %	291280752
125	NC_013940	AAATAA	2	12	234759	234770	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	291280753
126	NC_013940	AAACAG	2	12	236098	236109	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	291280753
127	NC_013940	TATCCA	2	12	236733	236744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291280754
128	NC_013940	AGTGGA	2	12	237677	237688	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	291280755
129	NC_013940	TATAAA	2	12	237813	237824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291280755
130	NC_013940	AGAATT	2	12	237951	237962	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	291280755
131	NC_013940	ATTCAT	2	12	238873	238884	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	291280756
132	NC_013940	GTATTT	2	12	239394	239405	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	291280756
133	NC_013940	TCTATA	2	12	239529	239540	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	291280756
134	NC_013940	TTTTAA	2	12	240676	240687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291280756
135	NC_013940	TATTTC	2	12	241590	241601	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	291280757
136	NC_013940	ATCATT	2	12	242059	242070	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	291280758
137	NC_013940	ATAATT	2	12	242573	242584	50 %	50 %	0 %	0 %	291280758
138	NC_013940	ATTAAT	2	12	243265	243276	50 %	50 %	0 %	0 %	291280758
139	NC_013940	TTTAAA	2	12	248718	248729	50 %	50 %	0 %	0 %	291280764
140	NC_013940	TTTATA	2	12	248985	248996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291280764
141	NC_013940	TCACTA	2	12	250579	250590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291280765
142	NC_013940	ATTTAA	2	12	250794	250805	50 %	50 %	0 %	0 %	291280765
143	NC_013940	TTAATT	2	12	252034	252045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291280767
144	NC_013940	TAAAAA	2	12	252490	252501	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	291280768
145	NC_013940	ATTTAA	2	12	253167	253178	50 %	50 %	0 %	0 %	291280768
146	NC_013940	GAATCT	2	12	253604	253615	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	291280770
147	NC_013940	ATAAAT	2	12	255842	255853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291280772
148	NC_013940	TAAATC	2	12	255970	255981	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	291280773
149	NC_013940	TAAATC	2	12	256694	256705	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	291280774
150	NC_013940	ATCATA	2	12	260900	260911	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	291280777
151	NC_013940	TAGATT	2	12	262911	262922	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	291280779
152	NC_013940	TAAAAT	2	12	266227	266238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291280781
153	NC_013940	AGTTTT	2	12	266348	266359	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	291280781
154	NC_013940	ATTAAT	2	12	266460	266471	50 %	50 %	0 %	0 %	291280781
155	NC_013940	ATATAA	2	12	268123	268134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291280782
156	NC_013940	AAAATC	2	12	269508	269519	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	291280783
157	NC_013940	CTACAA	2	12	271017	271028	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	291280785
158	NC_013940	ATTTTT	2	12	272545	272556	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	291280785
159	NC_013940	TTTTTC	2	12	272848	272859	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	291280786
160	NC_013940	ATTAAT	2	12	274348	274359	50 %	50 %	0 %	0 %	291280786
161	NC_013940	ATAGAA	2	12	275860	275871	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	291280787
162	NC_013940	AAACTA	2	12	277180	277191	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	291280789
163	NC_013940	TTTTAA	2	12	278993	279004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291280791
164	NC_013940	GTTACC	2	12	283767	283778	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	291280796
165	NC_013940	TTTGTT	2	12	285910	285921	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	291280798
166	NC_013940	AAATTC	2	12	286109	286120	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	291280798
167	NC_013940	TCTATA	2	12	286656	286667	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	291280798
168	NC_013940	TTAAAT	2	12	287731	287742	50 %	50 %	0 %	0 %	291280798
169	NC_013940	TTTAGC	2	12	288017	288028	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	291280798
170	NC_013940	ATTATA	2	12	288964	288975	50 %	50 %	0 %	0 %	291280799
171	NC_013940	TTTCGA	2	12	289956	289967	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	291280799
172	NC_013940	TTAGAT	2	12	290262	290273	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	291280799
173	NC_013940	AATTTA	2	12	290919	290930	50 %	50 %	0 %	0 %	291280799
174	NC_013940	TAAAAT	2	12	292579	292590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291280800
175	NC_013940	TTTAAA	2	12	293151	293162	50 %	50 %	0 %	0 %	291280800
176	NC_013940	TTTGTT	2	12	293600	293611	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	291280801
177	NC_013940	TAAAAA	2	12	295708	295719	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	291280803
178	NC_013940	ATGATA	2	12	295953	295964	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	291280803
179	NC_013940	ACATAG	2	12	296094	296105	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	291280803
180	NC_013940	ATATAA	2	12	296232	296243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291280803
181	NC_013940	TTAACT	2	12	296612	296623	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	291280803
182	NC_013940	TTATAT	2	12	297202	297213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291280804
183	NC_013940	ATACCT	2	12	297811	297822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291280805
184	NC_013940	TATTTA	2	12	301535	301546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291280806
185	NC_013940	TATTCA	2	12	303518	303529	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	291280806
186	NC_013940	TTAACA	2	12	304809	304820	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	291280807
187	NC_013940	TATAAA	2	12	306727	306738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291280808
188	NC_013940	AAATAG	2	12	307020	307031	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	291280808
189	NC_013940	TTATAT	2	12	307671	307682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291280808

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.