MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Deferribacter desulfuricans SSM1 megaplasmid pDF308

Total Repeats: 435

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013940	TATAA	2	10	373	382	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013940	TTGTT	2	10	497	506	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013940	TATAA	2	10	985	994	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013940	GAATT	2	10	3503	3512	40 %	40 %	20 %	0 %	291280554
5	NC_013940	AAATA	2	10	5065	5074	80 %	20 %	0 %	0 %	291280558
6	NC_013940	AGATA	2	10	6499	6508	60 %	20 %	20 %	0 %	291280558
7	NC_013940	ATATT	2	10	7096	7105	40 %	60 %	0 %	0 %	291280559
8	NC_013940	TAAAA	2	10	7739	7748	80 %	20 %	0 %	0 %	291280559
9	NC_013940	AGAAA	2	10	7868	7877	80 %	0 %	20 %	0 %	291280559
10	NC_013940	ATGGT	2	10	8596	8605	20 %	40 %	40 %	0 %	291280559
11	NC_013940	AATAA	2	10	11872	11881	80 %	20 %	0 %	0 %	291280561
12	NC_013940	TAAGT	2	10	12584	12593	40 %	40 %	20 %	0 %	291280562
13	NC_013940	TGTAT	2	10	12836	12845	20 %	60 %	20 %	0 %	291280562
14	NC_013940	GATCA	2	10	12867	12876	40 %	20 %	20 %	20 %	291280562
15	NC_013940	ATAAA	2	10	13150	13159	80 %	20 %	0 %	0 %	291280562
16	NC_013940	GTGAA	2	10	13309	13318	40 %	20 %	40 %	0 %	291280562
17	NC_013940	AAAAG	2	10	13870	13879	80 %	0 %	20 %	0 %	291280563
18	NC_013940	AGGAG	2	10	15792	15801	40 %	0 %	60 %	0 %	291280564
19	NC_013940	ATAAA	2	10	15983	15992	80 %	20 %	0 %	0 %	291280564
20	NC_013940	ATGTT	2	10	16383	16392	20 %	60 %	20 %	0 %	291280565
21	NC_013940	TCAAA	2	10	16995	17004	60 %	20 %	0 %	20 %	291280566
22	NC_013940	TAATA	2	10	17176	17185	60 %	40 %	0 %	0 %	291280566
23	NC_013940	TTTAG	2	10	17247	17256	20 %	60 %	20 %	0 %	291280567
24	NC_013940	TTACT	2	10	19407	19416	20 %	60 %	0 %	20 %	291280568
25	NC_013940	AGTTT	2	10	20866	20875	20 %	60 %	20 %	0 %	291280570
26	NC_013940	ACAAA	2	10	21126	21135	80 %	0 %	0 %	20 %	291280570
27	NC_013940	TAAAA	2	10	22461	22470	80 %	20 %	0 %	0 %	291280571
28	NC_013940	TATGG	2	10	23928	23937	20 %	40 %	40 %	0 %	291280572
29	NC_013940	AAATA	2	10	24952	24961	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013940	TTTCT	2	10	26075	26084	0 %	80 %	0 %	20 %	291280574
31	NC_013940	ATTTA	2	10	26988	26997	40 %	60 %	0 %	0 %	291280575
32	NC_013940	AGTTT	2	10	27163	27172	20 %	60 %	20 %	0 %	291280576
33	NC_013940	ATTAT	2	10	27485	27494	40 %	60 %	0 %	0 %	291280576
34	NC_013940	GTTAT	2	10	27655	27664	20 %	60 %	20 %	0 %	291280576
35	NC_013940	TATAA	2	10	27717	27726	60 %	40 %	0 %	0 %	291280576
36	NC_013940	TTTTA	2	10	27799	27808	20 %	80 %	0 %	0 %	291280577
37	NC_013940	TGTTA	2	10	28501	28510	20 %	60 %	20 %	0 %	291280577
38	NC_013940	TTAGA	2	10	30727	30736	40 %	40 %	20 %	0 %	291280579
39	NC_013940	ATGCA	2	10	31404	31413	40 %	20 %	20 %	20 %	291280580
40	NC_013940	AATTT	2	10	33012	33021	40 %	60 %	0 %	0 %	291280582
41	NC_013940	AGAAA	2	10	33512	33521	80 %	0 %	20 %	0 %	291280582
42	NC_013940	TATAA	2	10	35626	35635	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013940	AAAAG	2	10	35819	35828	80 %	0 %	20 %	0 %	291280583
44	NC_013940	TTTAT	2	10	35959	35968	20 %	80 %	0 %	0 %	291280583
45	NC_013940	AAATA	2	10	36107	36116	80 %	20 %	0 %	0 %	291280583
46	NC_013940	TAATA	2	10	36355	36364	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013940	TTATA	2	10	37161	37170	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013940	TAAAA	2	10	38862	38871	80 %	20 %	0 %	0 %	291280584
49	NC_013940	ATAAA	2	10	39455	39464	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013940	TATAA	2	10	40038	40047	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013940	ATAAA	2	10	41757	41766	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013940	TATAT	2	10	42112	42121	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013940	AATAA	2	10	42646	42655	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013940	TTTAT	2	10	43281	43290	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013940	AATTT	2	10	43454	43463	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013940	ATTAT	2	10	43464	43473	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013940	TCAAT	2	10	43895	43904	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_013940	TAAAT	2	10	44121	44130	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013940	TATAA	2	10	45280	45289	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013940	TAAAT	2	10	50784	50793	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013940	TATAA	2	10	51451	51460	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013940	ATTAT	2	10	54411	54420	40 %	60 %	0 %	0 %	291280592
63	NC_013940	TAAAT	2	10	55822	55831	60 %	40 %	0 %	0 %	291280594
64	NC_013940	AGAAA	2	10	57279	57288	80 %	0 %	20 %	0 %	291280595
65	NC_013940	GTTAA	2	10	57529	57538	40 %	40 %	20 %	0 %	291280595
66	NC_013940	TTTAG	2	10	58542	58551	20 %	60 %	20 %	0 %	291280596
67	NC_013940	ATGGA	2	10	59221	59230	40 %	20 %	40 %	0 %	291280596
68	NC_013940	AAAGA	2	10	59319	59328	80 %	0 %	20 %	0 %	291280596
69	NC_013940	TAATT	2	10	59885	59894	40 %	60 %	0 %	0 %	291280596
70	NC_013940	TTTAT	2	10	60406	60415	20 %	80 %	0 %	0 %	291280596
71	NC_013940	TTCTT	2	10	61784	61793	0 %	80 %	0 %	20 %	291280597
72	NC_013940	AAGTA	2	10	62347	62356	60 %	20 %	20 %	0 %	291280598
73	NC_013940	TATAA	2	10	62858	62867	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013940	TTACA	2	10	64895	64904	40 %	40 %	0 %	20 %	291280602
75	NC_013940	ATATT	2	10	65260	65269	40 %	60 %	0 %	0 %	291280602
76	NC_013940	AAATT	2	10	65360	65369	60 %	40 %	0 %	0 %	291280602
77	NC_013940	TATAG	2	10	65948	65957	40 %	40 %	20 %	0 %	291280602
78	NC_013940	AATTT	2	10	66339	66348	40 %	60 %	0 %	0 %	291280602
79	NC_013940	TAAAC	2	10	66571	66580	60 %	20 %	0 %	20 %	291280602
80	NC_013940	TAAAA	2	10	67695	67704	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013940	GTTAA	2	10	67825	67834	40 %	40 %	20 %	0 %	291280603
82	NC_013940	ATATA	2	10	69585	69594	60 %	40 %	0 %	0 %	291280605
83	NC_013940	AGTTT	2	10	70415	70424	20 %	60 %	20 %	0 %	291280606
84	NC_013940	ATAAA	2	10	72079	72088	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013940	AATAA	2	10	73109	73118	80 %	20 %	0 %	0 %	291280608
86	NC_013940	ATTTT	2	10	73224	73233	20 %	80 %	0 %	0 %	291280608
87	NC_013940	TAAAT	2	10	74210	74219	60 %	40 %	0 %	0 %	291280609
88	NC_013940	ATTTA	2	10	75158	75167	40 %	60 %	0 %	0 %	291280609
89	NC_013940	TAATT	2	10	77235	77244	40 %	60 %	0 %	0 %	291280613
90	NC_013940	AATTA	2	10	77487	77496	60 %	40 %	0 %	0 %	291280613
91	NC_013940	AAAAT	2	10	77528	77537	80 %	20 %	0 %	0 %	291280613
92	NC_013940	ATTAA	2	10	77875	77884	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013940	TACAA	2	10	77896	77905	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_013940	AAATT	2	10	79647	79656	60 %	40 %	0 %	0 %	291280614
95	NC_013940	ATTTT	2	10	79770	79779	20 %	80 %	0 %	0 %	291280614
96	NC_013940	ATTAT	2	10	80481	80490	40 %	60 %	0 %	0 %	291280614
97	NC_013940	GTTGT	2	10	80596	80605	0 %	60 %	40 %	0 %	291280614
98	NC_013940	TATAA	2	10	81334	81343	60 %	40 %	0 %	0 %	291280615
99	NC_013940	TTTTA	2	10	82676	82685	20 %	80 %	0 %	0 %	291280617
100	NC_013940	TATAA	2	10	84360	84369	60 %	40 %	0 %	0 %	291280617
101	NC_013940	TGTAA	2	10	84516	84525	40 %	40 %	20 %	0 %	291280617
102	NC_013940	ATACA	2	10	85575	85584	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_013940	TATAA	2	10	86835	86844	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013940	ATGCA	2	10	87034	87043	40 %	20 %	20 %	20 %	291280619
105	NC_013940	TTAAA	2	10	88173	88182	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013940	AAACA	2	10	88882	88891	80 %	0 %	0 %	20 %	291280622
107	NC_013940	TATAT	2	10	89068	89077	40 %	60 %	0 %	0 %	291280623
108	NC_013940	AAATT	2	10	89545	89554	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013940	AATAT	2	10	90078	90087	60 %	40 %	0 %	0 %	291280624
110	NC_013940	AATAA	2	10	90276	90285	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013940	TTAAT	2	10	90303	90312	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013940	AATAA	2	10	91130	91139	80 %	20 %	0 %	0 %	291280625
113	NC_013940	TTAAT	2	10	94795	94804	40 %	60 %	0 %	0 %	291280628
114	NC_013940	ATATT	2	10	94970	94979	40 %	60 %	0 %	0 %	291280628
115	NC_013940	TATAA	2	10	95526	95535	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013940	TAAAT	2	10	97366	97375	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013940	AAATT	2	10	98093	98102	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013940	TATAA	2	10	98204	98213	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013940	ATTTT	2	10	98570	98579	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013940	GATTT	2	10	98877	98886	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013940	AAATA	2	10	99124	99133	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013940	AAAGA	2	10	101089	101098	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013940	TTTTA	2	10	101605	101614	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013940	CAAAA	2	10	101688	101697	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_013940	AAAAT	2	10	102273	102282	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013940	TATAA	2	10	102863	102872	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013940	TAATT	2	10	104273	104282	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013940	ATAAA	2	10	104386	104395	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013940	TACAA	2	10	104418	104427	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_013940	TACAA	2	10	105725	105734	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_013940	TGAAA	2	10	106371	106380	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013940	AATTA	2	10	106401	106410	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013940	AAGTT	2	10	107830	107839	40 %	40 %	20 %	0 %	291280633
134	NC_013940	AATTA	2	10	108337	108346	60 %	40 %	0 %	0 %	291280634
135	NC_013940	TTTAA	2	10	109118	109127	40 %	60 %	0 %	0 %	291280634
136	NC_013940	TATAA	2	10	109270	109279	60 %	40 %	0 %	0 %	291280634
137	NC_013940	TATAA	2	10	109706	109715	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013940	ATTAT	2	10	109803	109812	40 %	60 %	0 %	0 %	291280635
139	NC_013940	AATAA	2	10	110162	110171	80 %	20 %	0 %	0 %	291280635
140	NC_013940	TTATT	2	10	111069	111078	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013940	CATTT	2	10	111884	111893	20 %	60 %	0 %	20 %	291280637
142	NC_013940	TATTT	2	10	112674	112683	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013940	TATAA	2	10	112790	112799	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013940	AGGGT	2	10	113607	113616	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013940	AAATA	2	10	113751	113760	80 %	20 %	0 %	0 %	291280639
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152	NC_013940	ATAAA	2	10	118373	118382	80 %	20 %	0 %	0 %	291280645
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162	NC_013940	TATAA	2	10	130569	130578	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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269	NC_013940	ATTAT	3	15	197832	197846	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_013940	TCTAT	2	10	197872	197881	20 %	60 %	0 %	20 %	291280719
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274	NC_013940	TATTT	2	10	199221	199230	20 %	80 %	0 %	0 %	291280721
275	NC_013940	TAATA	2	10	199305	199314	60 %	40 %	0 %	0 %	291280721
276	NC_013940	TATTT	2	10	199605	199614	20 %	80 %	0 %	0 %	291280722
277	NC_013940	TAAAT	2	10	200889	200898	60 %	40 %	0 %	0 %	291280724
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415	NC_013940	AATTA	2	10	286511	286520	60 %	40 %	0 %	0 %	291280798
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.