MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Deferribacter desulfuricans SSM1 megaplasmid pDF308

Total Repeats: 139

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013940	TATAA	2	10	373	382	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013940	TTGTT	2	10	497	506	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013940	TATAA	2	10	985	994	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013940	AAATA	2	10	24952	24961	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013940	TATAA	2	10	35626	35635	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013940	TAATA	2	10	36355	36364	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013940	TTATA	2	10	37161	37170	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013940	ATAAA	2	10	39455	39464	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013940	TATAA	2	10	40038	40047	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013940	ATAAA	2	10	41757	41766	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013940	TATAT	2	10	42112	42121	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013940	AATAA	2	10	42646	42655	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013940	TTTAT	2	10	43281	43290	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013940	AATTT	2	10	43454	43463	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013940	ATTAT	2	10	43464	43473	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013940	TCAAT	2	10	43895	43904	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_013940	TAAAT	2	10	44121	44130	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013940	TATAA	2	10	45280	45289	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013940	TAAAT	2	10	50784	50793	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013940	TATAA	2	10	51451	51460	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013940	TATAA	2	10	62858	62867	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013940	TAAAA	2	10	67695	67704	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013940	ATAAA	2	10	72079	72088	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013940	ATTAA	2	10	77875	77884	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013940	TACAA	2	10	77896	77905	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_013940	ATACA	2	10	85575	85584	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_013940	TATAA	2	10	86835	86844	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013940	TTAAA	2	10	88173	88182	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013940	AAATT	2	10	89545	89554	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013940	AATAA	2	10	90276	90285	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013940	TTAAT	2	10	90303	90312	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013940	TATAA	2	10	95526	95535	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013940	TAAAT	2	10	97366	97375	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013940	AAATT	2	10	98093	98102	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013940	TATAA	2	10	98204	98213	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013940	ATTTT	2	10	98570	98579	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013940	GATTT	2	10	98877	98886	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013940	AAATA	2	10	99124	99133	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013940	AAAGA	2	10	101089	101098	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013940	TTTTA	2	10	101605	101614	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013940	CAAAA	2	10	101688	101697	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_013940	AAAAT	2	10	102273	102282	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013940	TATAA	2	10	102863	102872	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013940	TAATT	2	10	104273	104282	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013940	ATAAA	2	10	104386	104395	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013940	TACAA	2	10	104418	104427	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_013940	TACAA	2	10	105725	105734	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_013940	TGAAA	2	10	106371	106380	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013940	AATTA	2	10	106401	106410	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013940	TATAA	2	10	109706	109715	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013940	TTATT	2	10	111069	111078	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013940	TATTT	2	10	112674	112683	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013940	TATAA	2	10	112790	112799	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013940	AGGGT	2	10	113607	113616	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013940	ATATA	2	10	114319	114328	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013940	TATAA	2	10	115217	115226	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013940	GTTAT	2	10	118446	118455	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013940	TAATA	2	10	118458	118467	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013940	TATAA	2	10	118994	119003	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013940	ATAAA	2	10	121054	121063	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013940	TATAA	2	10	126446	126455	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013940	TATAA	2	10	130569	130578	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013940	TTTTA	2	10	135779	135788	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013940	TTATA	2	10	139296	139305	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013940	AAGTA	2	10	139369	139378	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013940	ATTAA	2	10	141074	141083	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013940	AAATA	2	10	143294	143303	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013940	TATAA	2	10	146103	146112	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013940	ATAGT	2	10	149687	149696	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013940	GGTAT	2	10	150437	150446	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013940	AATAA	2	10	153887	153896	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013940	ACCCT	2	10	157960	157969	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
73	NC_013940	TAAAT	2	10	157992	158001	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013940	AAAAT	2	10	159743	159752	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013940	CAGCT	2	10	159816	159825	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
76	NC_013940	ATTTA	2	10	161644	161653	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013940	TCGTT	2	10	161832	161841	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_013940	TATAA	2	10	162467	162476	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013940	ATATA	2	10	166442	166451	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013940	ATATT	2	10	167443	167452	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013940	AAATA	2	10	167542	167551	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013940	ATATA	2	10	167709	167718	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013940	TTTTA	2	10	168365	168374	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013940	TATAA	2	10	169112	169121	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013940	ATATT	2	10	172186	172195	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013940	TCATA	2	10	173353	173362	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_013940	AAAAT	2	10	176629	176638	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013940	TAAAA	2	10	177516	177525	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013940	ATTTT	2	10	178687	178696	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013940	AAATA	2	10	178792	178801	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013940	ATATT	2	10	178883	178892	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013940	AAATC	2	10	179466	179475	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_013940	TATAA	2	10	180510	180519	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013940	AAGTA	2	10	182193	182202	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013940	ATGAT	2	10	182810	182819	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013940	TAATA	2	10	183287	183296	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013940	TATTG	2	10	187113	187122	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013940	AATAA	2	10	187222	187231	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013940	TAAAA	2	10	188799	188808	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013940	TATAA	2	10	195939	195948	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013940	ATTAT	3	15	197832	197846	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013940	ATCAA	2	10	198822	198831	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_013940	TTTTA	2	10	205629	205638	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013940	ATAAA	2	10	206499	206508	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013940	TATAT	2	10	206824	206833	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013940	TATAA	2	10	209171	209180	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013940	ATATA	2	10	212041	212050	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013940	TATAT	2	10	218249	218258	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013940	ATATT	2	10	218394	218403	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013940	TAAAA	2	10	224208	224217	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013940	CCCTA	2	10	226246	226255	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
112	NC_013940	TATAA	2	10	227557	227566	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013940	TTAAT	2	10	229143	229152	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013940	AAATA	2	10	229230	229239	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013940	TAAAA	2	10	230201	230210	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013940	TAATT	2	10	232485	232494	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013940	AATAT	2	10	233948	233957	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013940	ACAAA	2	10	234173	234182	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_013940	AATTA	2	10	238254	238263	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013940	TATAT	2	10	238359	238368	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013940	TTTAT	2	10	251568	251577	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013940	AAAAT	2	10	252133	252142	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013940	TAATT	2	10	252173	252182	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013940	AACTA	2	10	252185	252194	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_013940	ATTAA	2	10	258102	258111	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013940	TTATT	3	15	259494	259508	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013940	TAATT	2	10	260126	260135	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013940	TAATT	2	10	260159	260168	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013940	TAAAA	3	15	260312	260326	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013940	TTATA	2	10	261373	261382	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013940	ATTTA	2	10	261399	261408	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013940	TTATA	2	10	262362	262371	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013940	TAATA	2	10	269965	269974	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013940	TATTT	2	10	270839	270848	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013940	ATATA	2	10	270867	270876	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013940	ATTTT	2	10	282932	282941	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013940	AACAC	2	10	291328	291337	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
138	NC_013940	TATAT	2	10	303553	303562	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013940	ATAAA	2	10	308460	308469	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.