MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Deferribacter desulfuricans SSM1

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013939	TTTGTT	2	12	154989	155000	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013939	TTTATT	2	12	213377	213388	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013939	ATTATA	2	12	270070	270081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013939	TGATTT	2	12	286669	286680	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013939	CTTTAT	2	12	287922	287933	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_013939	ATAAAA	2	12	295629	295640	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013939	TTGTTT	2	12	308604	308615	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013939	CATATT	2	12	312594	312605	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_013939	TTTATA	2	12	353088	353099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013939	AGTAGA	2	12	355470	355481	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013939	TTAAAA	2	12	355957	355968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013939	AGAGTG	2	12	379260	379271	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013939	ATAAAA	2	12	513200	513211	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013939	CCTTAT	2	12	513541	513552	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_013939	TTAGAT	2	12	514101	514112	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013939	AAAAAC	2	12	526354	526365	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_013939	TGAGGT	2	12	591421	591432	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013939	TTATGA	2	12	591532	591543	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013939	TTATAA	2	12	613149	613160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013939	TTAATT	2	12	626495	626506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013939	AAAAAT	2	12	626826	626837	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013939	TTGATT	2	12	647836	647847	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013939	TATAAA	2	12	668149	668160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013939	AATTTT	2	12	686071	686082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013939	CCCTTT	2	12	690486	690497	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_013939	TGATTA	2	12	756884	756895	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013939	ATTTAC	2	12	770814	770825	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_013939	TTAAAA	2	12	771820	771831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013939	TTTTAT	2	12	784651	784662	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013939	TTTTTA	2	12	814031	814042	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013939	ATCATA	2	12	848348	848359	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_013939	CATTTG	2	12	872907	872918	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_013939	TTTTAC	2	12	906913	906924	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_013939	TCAAAA	2	12	913116	913127	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_013939	TATGAT	2	12	918718	918729	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013939	AATATA	2	12	966514	966525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013939	AACTAA	2	12	1061159	1061170	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_013939	TAATTT	2	12	1083369	1083380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013939	ATTTTT	2	12	1240645	1240656	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013939	AAAAGA	2	12	1240707	1240718	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013939	AATTCA	2	12	1242956	1242967	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_013939	AAATTA	2	12	1254188	1254199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013939	ATCATA	2	12	1311480	1311491	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_013939	GTTAGC	2	12	1311542	1311553	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_013939	TTTAAA	2	12	1329402	1329413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013939	ATAAAT	2	12	1335247	1335258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013939	ATTTAT	2	12	1343933	1343944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013939	TCAAAT	2	12	1351045	1351056	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_013939	TTAAAA	2	12	1355129	1355140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013939	AATATA	2	12	1487780	1487791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013939	TTATAA	2	12	1492998	1493009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013939	TTATAT	2	12	1543006	1543017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013939	CCTTTT	2	12	1552575	1552586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_013939	ATTTTC	2	12	1632506	1632517	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_013939	AGTCTA	2	12	1663796	1663807	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_013939	CAATAA	2	12	1734112	1734123	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_013939	ATCATA	2	12	1763476	1763487	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_013939	TTTTTA	2	12	1812015	1812026	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013939	AATTTA	2	12	1870193	1870204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013939	CTTATA	2	12	1906154	1906165	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_013939	ATAAAA	2	12	1935259	1935270	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013939	AAAAAG	2	12	1944049	1944060	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013939	GATAAT	2	12	1948839	1948850	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013939	TTATAA	2	12	2044149	2044160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013939	TGGCTA	2	12	2074671	2074682	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_013939	TAAGAT	2	12	2094993	2095004	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013939	TTAGGC	2	12	2103213	2103224	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_013939	TAATAT	2	12	2156497	2156508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.