MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Deferribacter desulfuricans SSM1

Total Repeats: 211

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013939	ACAAT	2	10	13115	13124	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_013939	GAATT	2	10	13168	13177	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013939	ATAAA	2	10	28699	28708	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013939	TTAAT	2	10	33531	33540	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013939	ATATT	2	10	67382	67391	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013939	AGCAA	2	10	80198	80207	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_013939	CTTTT	2	10	91632	91641	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_013939	TTAGT	2	10	97677	97686	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013939	TTTAC	2	10	109105	109114	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_013939	GTTTT	2	10	157984	157993	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013939	TTACT	2	10	181643	181652	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_013939	AATTT	2	10	184978	184987	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013939	AAATC	2	10	190104	190113	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_013939	TAAAA	2	10	196631	196640	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013939	CTATA	2	10	212108	212117	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_013939	ATTTT	2	10	213424	213433	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013939	TATAA	2	10	219728	219737	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013939	TCCAT	2	10	250516	250525	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_013939	ATCAT	2	10	251212	251221	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_013939	ATTTC	2	10	251231	251240	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_013939	TCCAA	2	10	252850	252859	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
22	NC_013939	TGAAA	2	10	285155	285164	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013939	AAATT	2	10	285201	285210	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013939	ATGTT	2	10	285223	285232	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013939	AGAAA	2	10	285595	285604	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013939	AAAAC	2	10	286413	286422	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_013939	AAATA	2	10	287937	287946	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013939	TTAAT	2	10	308559	308568	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013939	TAAAA	2	10	313019	313028	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013939	AATAT	2	10	325048	325057	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013939	ATTTC	2	10	340783	340792	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_013939	ATTAA	2	10	342821	342830	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013939	TTTAA	2	10	348009	348018	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013939	ATCAA	2	10	351318	351327	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_013939	TTATA	2	10	352013	352022	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013939	ATTTT	2	10	352836	352845	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013939	CTTAA	2	10	354419	354428	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_013939	GGGAT	2	10	356123	356132	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013939	ATATC	2	10	356165	356174	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_013939	GTATT	2	10	375144	375153	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013939	TTATT	2	10	380904	380913	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013939	TATTT	2	10	391716	391725	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013939	ATATA	2	10	459742	459751	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013939	GATTT	2	10	478790	478799	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013939	GTGAG	2	10	489851	489860	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013939	TAAAA	2	10	495489	495498	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013939	TGTTA	2	10	496037	496046	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013939	TTTAA	2	10	507909	507918	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013939	AACTA	2	10	513687	513696	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_013939	AATTC	2	10	514731	514740	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_013939	AATCA	2	10	514896	514905	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_013939	AACCC	2	10	516094	516103	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
53	NC_013939	TATAT	2	10	516630	516639	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013939	AAAAC	2	10	527494	527503	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_013939	AAAAG	2	10	543214	543223	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013939	CTAAA	2	10	550549	550558	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_013939	ATCAT	2	10	576639	576648	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_013939	GCGGT	2	10	581361	581370	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
59	NC_013939	TGTAG	2	10	582397	582406	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013939	AATAG	2	10	582683	582692	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013939	AGGCG	2	10	584390	584399	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
62	NC_013939	AGAGG	2	10	584522	584531	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013939	AGGGG	2	10	584621	584630	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013939	ATTGT	2	10	591554	591563	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013939	ATATT	2	10	601163	601172	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013939	GCTTC	2	10	610834	610843	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NC_013939	TTGTT	2	10	613457	613466	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013939	TATTG	2	10	619475	619484	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013939	TAATT	2	10	626517	626526	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013939	TATTT	2	10	651998	652007	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013939	TAAAC	2	10	657849	657858	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_013939	AAAGT	2	10	659628	659637	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013939	TAAAA	2	10	659763	659772	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013939	ATTTT	2	10	659870	659879	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013939	TGTAA	2	10	670661	670670	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013939	TTTTA	2	10	691226	691235	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013939	ATATT	2	10	709537	709546	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013939	AAATA	2	10	709709	709718	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013939	TTAAT	2	10	713830	713839	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013939	TTTAT	2	10	716330	716339	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013939	ATTTG	2	10	735067	735076	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013939	TAAAT	2	10	778870	778879	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013939	AAATT	2	10	788607	788616	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013939	CTTGA	2	10	788650	788659	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_013939	TTTAC	2	10	788782	788791	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_013939	ATTTT	2	10	812664	812673	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013939	TTTTA	2	10	815550	815559	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013939	CAGGG	2	10	816532	816541	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
89	NC_013939	TTATA	2	10	818709	818718	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013939	AAAAT	2	10	832625	832634	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013939	AGCAA	2	10	848419	848428	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_013939	TAATT	2	10	869979	869988	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013939	ATAGA	2	10	870542	870551	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013939	TAAGT	2	10	870565	870574	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013939	AACTA	2	10	878050	878059	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_013939	CAATC	2	10	878237	878246	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
97	NC_013939	TCCTT	2	10	878451	878460	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
98	NC_013939	ATAAA	2	10	878571	878580	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013939	TCATT	2	10	880273	880282	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_013939	TCATT	2	10	880414	880423	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_013939	AATAG	2	10	883008	883017	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013939	TCTAA	2	10	890981	890990	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_013939	AAGGA	2	10	893628	893637	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013939	CTTTT	2	10	900090	900099	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_013939	TTTTA	2	10	901744	901753	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013939	TTACT	2	10	914158	914167	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_013939	AAAAT	2	10	921287	921296	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013939	ATAGG	2	10	927201	927210	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013939	ATAAA	2	10	968094	968103	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013939	AAAAT	2	10	973517	973526	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013939	TAAAA	2	10	974709	974718	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013939	TAAAA	2	10	1023408	1023417	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013939	ATAAA	2	10	1056597	1056606	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013939	TAATT	2	10	1072679	1072688	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013939	ATTTT	2	10	1072698	1072707	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013939	CAAAA	2	10	1146978	1146987	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_013939	TTTAT	2	10	1151334	1151343	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013939	TAAAT	2	10	1171099	1171108	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013939	ATTAT	2	10	1171181	1171190	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013939	TAAAG	2	10	1172366	1172375	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013939	TTTAT	2	10	1181380	1181389	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013939	TTAAA	2	10	1185533	1185542	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013939	TAAAA	2	10	1185545	1185554	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013939	TATAG	2	10	1210635	1210644	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013939	ATATA	2	10	1215725	1215734	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013939	GTTAA	2	10	1231418	1231427	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013939	TTTAT	2	10	1240620	1240629	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013939	TCAAA	2	10	1284575	1284584	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_013939	AATGA	2	10	1296658	1296667	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013939	CTTCA	2	10	1311424	1311433	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
131	NC_013939	TTATA	2	10	1336642	1336651	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013939	CTAAA	2	10	1337049	1337058	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_013939	TCAAA	2	10	1354661	1354670	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_013939	TGTTT	2	10	1354708	1354717	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013939	AATGG	2	10	1374127	1374136	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013939	TAAAA	2	10	1385949	1385958	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013939	GGAAA	2	10	1396061	1396070	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013939	TATAA	2	10	1439630	1439639	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013939	AGCAA	2	10	1479310	1479319	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_013939	ATTAT	2	10	1479344	1479353	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013939	AAATA	2	10	1488052	1488061	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013939	AATAA	2	10	1492683	1492692	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013939	TTGCT	2	10	1492767	1492776	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_013939	AAAAG	2	10	1528635	1528644	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013939	AAAAG	2	10	1540579	1540588	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013939	AAAAT	2	10	1552196	1552205	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013939	TTGCT	2	10	1562923	1562932	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.