MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptomyces scabiei 87.22 chromosome

Total Repeats: 10134

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013929	TCCGC	2	10	72	81	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
2	NC_013929	CGGCG	2	10	262	271	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3	NC_013929	CGGGC	2	10	433	442	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4	NC_013929	AGCGC	2	10	2483	2492	20 %	0 %	40 %	40 %	290954633
5	NC_013929	TGGTC	2	10	5847	5856	0 %	40 %	40 %	20 %	290954635
6	NC_013929	CGCAG	2	10	6585	6594	20 %	0 %	40 %	40 %	290954635
7	NC_013929	TCTGG	2	10	7138	7147	0 %	40 %	40 %	20 %	290954635
8	NC_013929	AGCGC	2	10	9069	9078	20 %	0 %	40 %	40 %	290954637
9	NC_013929	GCTTC	2	10	9842	9851	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_013929	GGCGG	2	10	10606	10615	0 %	0 %	80 %	20 %	290954638
11	NC_013929	CGGGC	2	10	12380	12389	0 %	0 %	60 %	40 %	290954639
12	NC_013929	GCCGG	2	10	13065	13074	0 %	0 %	60 %	40 %	290954639
13	NC_013929	CACTC	2	10	14028	14037	20 %	20 %	0 %	60 %	290954640
14	NC_013929	CCCGC	2	10	15850	15859	0 %	0 %	20 %	80 %	290954642
15	NC_013929	ACCGC	2	10	16286	16295	20 %	0 %	20 %	60 %	290954642
16	NC_013929	GCCCT	2	10	16375	16384	0 %	20 %	20 %	60 %	290954642
17	NC_013929	GCCCT	2	10	16900	16909	0 %	20 %	20 %	60 %	290954642
18	NC_013929	GCCAT	2	10	18608	18617	20 %	20 %	20 %	40 %	290954646
19	NC_013929	GACTC	2	10	18661	18670	20 %	20 %	20 %	40 %	290954646
20	NC_013929	GCCGG	2	10	18759	18768	0 %	0 %	60 %	40 %	290954646
21	NC_013929	CAGGG	2	10	19538	19547	20 %	0 %	60 %	20 %	290954648
22	NC_013929	GACGG	2	10	20548	20557	20 %	0 %	60 %	20 %	290954649
23	NC_013929	GGGCG	2	10	22974	22983	0 %	0 %	80 %	20 %	290954653
24	NC_013929	CGCGC	2	10	25777	25786	0 %	0 %	40 %	60 %	290954655
25	NC_013929	CCGGA	2	10	26848	26857	20 %	0 %	40 %	40 %	290954657
26	NC_013929	AGGGT	2	10	28468	28477	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013929	CCGCC	2	10	29344	29353	0 %	0 %	20 %	80 %	290954659
28	NC_013929	CCGGC	2	10	29599	29608	0 %	0 %	40 %	60 %	290954659
29	NC_013929	ACGCC	2	10	30027	30036	20 %	0 %	20 %	60 %	290954659
30	NC_013929	CCACC	2	10	31120	31129	20 %	0 %	0 %	80 %	290954660
31	NC_013929	GCAGC	2	10	32877	32886	20 %	0 %	40 %	40 %	290954661
32	NC_013929	CAGTC	2	10	33447	33456	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_013929	CGGGC	2	10	33896	33905	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
34	NC_013929	AGGCG	2	10	33986	33995	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
35	NC_013929	CCGCG	2	10	33996	34005	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
36	NC_013929	GGACC	2	10	35515	35524	20 %	0 %	40 %	40 %	290954663
37	NC_013929	GCGCG	2	10	35850	35859	0 %	0 %	60 %	40 %	290954663
38	NC_013929	CGGTT	2	10	36225	36234	0 %	40 %	40 %	20 %	290954664
39	NC_013929	CCGCG	2	10	36302	36311	0 %	0 %	40 %	60 %	290954664
40	NC_013929	GCGGG	2	10	36338	36347	0 %	0 %	80 %	20 %	290954664
41	NC_013929	TGGTG	2	10	37003	37012	0 %	40 %	60 %	0 %	290954664
42	NC_013929	GCGGG	2	10	39842	39851	0 %	0 %	80 %	20 %	290954667
43	NC_013929	GTCGG	2	10	41998	42007	0 %	20 %	60 %	20 %	290954668
44	NC_013929	CGGCT	2	10	42858	42867	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
45	NC_013929	CGCAG	2	10	43666	43675	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
46	NC_013929	TGGGG	2	10	44150	44159	0 %	20 %	80 %	0 %	290954669
47	NC_013929	CGTCG	2	10	44850	44859	0 %	20 %	40 %	40 %	290954669
48	NC_013929	CTTCG	2	10	45133	45142	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_013929	CTCGG	2	10	46363	46372	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
50	NC_013929	TGCCC	2	10	47077	47086	0 %	20 %	20 %	60 %	290954673
51	NC_013929	TCCGG	2	10	49102	49111	0 %	20 %	40 %	40 %	290954675
52	NC_013929	CGCGG	2	10	49360	49369	0 %	0 %	60 %	40 %	290954675
53	NC_013929	AGCGC	2	10	49667	49676	20 %	0 %	40 %	40 %	290954676
54	NC_013929	CGGGG	2	10	53153	53162	0 %	0 %	80 %	20 %	290954679
55	NC_013929	GGCGT	2	10	53883	53892	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
56	NC_013929	TCGGG	2	10	54341	54350	0 %	20 %	60 %	20 %	290954680
57	NC_013929	CACGC	2	10	56010	56019	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
58	NC_013929	GGGTC	2	10	57820	57829	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
59	NC_013929	ACGGC	2	10	61584	61593	20 %	0 %	40 %	40 %	290954684
60	NC_013929	CCGAT	2	10	61970	61979	20 %	20 %	20 %	40 %	290954684
61	NC_013929	GGAGG	2	10	62185	62194	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013929	GCCGG	2	10	62222	62231	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
63	NC_013929	CGACC	2	10	63876	63885	20 %	0 %	20 %	60 %	290954685
64	NC_013929	CGACC	2	10	64473	64482	20 %	0 %	20 %	60 %	290954685
65	NC_013929	GACGT	2	10	64930	64939	20 %	20 %	40 %	20 %	290954685
66	NC_013929	CTGGC	2	10	65750	65759	0 %	20 %	40 %	40 %	290954685
67	NC_013929	CCCGG	2	10	66993	67002	0 %	0 %	40 %	60 %	290954686
68	NC_013929	CGGTG	2	10	67078	67087	0 %	20 %	60 %	20 %	290954686
69	NC_013929	GCGGG	2	10	67174	67183	0 %	0 %	80 %	20 %	290954686
70	NC_013929	GCCAC	2	10	67977	67986	20 %	0 %	20 %	60 %	290954687
71	NC_013929	CAGCG	2	10	68591	68600	20 %	0 %	40 %	40 %	290954687
72	NC_013929	CGCCC	2	10	68767	68776	0 %	0 %	20 %	80 %	290954687
73	NC_013929	AGGTC	2	10	68778	68787	20 %	20 %	40 %	20 %	290954687
74	NC_013929	GCCGA	2	10	71213	71222	20 %	0 %	40 %	40 %	290954689
75	NC_013929	GGCCT	2	10	71420	71429	0 %	20 %	40 %	40 %	290954689
76	NC_013929	GATCA	2	10	71974	71983	40 %	20 %	20 %	20 %	290954689
77	NC_013929	CCCGG	2	10	72217	72226	0 %	0 %	40 %	60 %	290954689
78	NC_013929	GCGTC	2	10	72440	72449	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
79	NC_013929	GTCCA	2	10	73998	74007	20 %	20 %	20 %	40 %	290954691
80	NC_013929	GCCTC	2	10	76552	76561	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
81	NC_013929	CGGTT	2	10	78119	78128	0 %	40 %	40 %	20 %	290954695
82	NC_013929	CCGCG	2	10	78196	78205	0 %	0 %	40 %	60 %	290954695
83	NC_013929	GCGGG	2	10	78232	78241	0 %	0 %	80 %	20 %	290954695
84	NC_013929	TGGTG	2	10	78897	78906	0 %	40 %	60 %	0 %	290954695
85	NC_013929	GACTT	2	10	80960	80969	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_013929	CGGCC	2	10	81135	81144	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
87	NC_013929	GCCGG	2	10	81298	81307	0 %	0 %	60 %	40 %	290954698
88	NC_013929	GCCAC	2	10	82393	82402	20 %	0 %	20 %	60 %	290954699
89	NC_013929	CCCGG	2	10	82713	82722	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
90	NC_013929	CGGCG	2	10	83815	83824	0 %	0 %	60 %	40 %	290954701
91	NC_013929	ACCGG	2	10	85694	85703	20 %	0 %	40 %	40 %	290954702
92	NC_013929	CCCCG	2	10	85908	85917	0 %	0 %	20 %	80 %	290954702
93	NC_013929	CGGCC	2	10	86087	86096	0 %	0 %	40 %	60 %	290954702
94	NC_013929	GTGAC	2	10	86142	86151	20 %	20 %	40 %	20 %	290954702
95	NC_013929	CGGTC	2	10	86254	86263	0 %	20 %	40 %	40 %	290954703
96	NC_013929	CAGGA	2	10	86686	86695	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_013929	GCGCC	2	10	87683	87692	0 %	0 %	40 %	60 %	290954704
98	NC_013929	CCCGG	2	10	88139	88148	0 %	0 %	40 %	60 %	290954705
99	NC_013929	AGCCG	2	10	89558	89567	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
100	NC_013929	TGGCG	2	10	91221	91230	0 %	20 %	60 %	20 %	290954707
101	NC_013929	CGACC	2	10	91901	91910	20 %	0 %	20 %	60 %	290954708
102	NC_013929	CACCG	2	10	92278	92287	20 %	0 %	20 %	60 %	290954709
103	NC_013929	CGGCT	2	10	92729	92738	0 %	20 %	40 %	40 %	290954709
104	NC_013929	TCACC	2	10	93260	93269	20 %	20 %	0 %	60 %	290954711
105	NC_013929	TGCCA	2	10	93427	93436	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_013929	CGCCC	2	10	94220	94229	0 %	0 %	20 %	80 %	290954712
107	NC_013929	GCGCG	2	10	95656	95665	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
108	NC_013929	CGTGA	2	10	97713	97722	20 %	20 %	40 %	20 %	290954714
109	NC_013929	GCTGG	2	10	99345	99354	0 %	20 %	60 %	20 %	290954715
110	NC_013929	GCCCG	2	10	100093	100102	0 %	0 %	40 %	60 %	290954715
111	NC_013929	ACCCG	2	10	100291	100300	20 %	0 %	20 %	60 %	290954715
112	NC_013929	GACGG	2	10	100440	100449	20 %	0 %	60 %	20 %	290954715
113	NC_013929	AGCTG	2	10	101039	101048	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_013929	GCGGA	2	10	101070	101079	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
115	NC_013929	GGAGC	2	10	103473	103482	20 %	0 %	60 %	20 %	290954717
116	NC_013929	GCAAG	2	10	103505	103514	40 %	0 %	40 %	20 %	290954717
117	NC_013929	GTCTG	2	10	104633	104642	0 %	40 %	40 %	20 %	290954718
118	NC_013929	TCCCG	2	10	104960	104969	0 %	20 %	20 %	60 %	290954718
119	NC_013929	TCCCC	2	10	107095	107104	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
120	NC_013929	CGACG	2	10	107725	107734	20 %	0 %	40 %	40 %	290954720
121	NC_013929	CGCGG	2	10	109882	109891	0 %	0 %	60 %	40 %	290954723
122	NC_013929	GAACC	2	10	109958	109967	40 %	0 %	20 %	40 %	290954723
123	NC_013929	GTCCC	2	10	112673	112682	0 %	20 %	20 %	60 %	290954725
124	NC_013929	CGGCC	2	10	113425	113434	0 %	0 %	40 %	60 %	290954726
125	NC_013929	CCGGC	2	10	113925	113934	0 %	0 %	40 %	60 %	290954726
126	NC_013929	CGATG	2	10	114583	114592	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
127	NC_013929	CTGCG	2	10	117472	117481	0 %	20 %	40 %	40 %	290954730
128	NC_013929	CGGGC	2	10	118732	118741	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
129	NC_013929	CCGGG	2	10	118782	118791	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
130	NC_013929	CGGGC	2	10	119345	119354	0 %	0 %	60 %	40 %	290954732
131	NC_013929	CCCGG	2	10	119461	119470	0 %	0 %	40 %	60 %	290954732
132	NC_013929	CCCGG	2	10	124981	124990	0 %	0 %	40 %	60 %	290954737
133	NC_013929	GGCGG	2	10	126702	126711	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
134	NC_013929	AGGAG	2	10	131424	131433	40 %	0 %	60 %	0 %	290954742
135	NC_013929	TTCCC	2	10	132335	132344	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
136	NC_013929	GCCAG	2	10	133795	133804	20 %	0 %	40 %	40 %	290954743
137	NC_013929	GGTCG	2	10	133887	133896	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
138	NC_013929	GCCGG	2	10	134518	134527	0 %	0 %	60 %	40 %	290954744
139	NC_013929	CAGGG	2	10	134632	134641	20 %	0 %	60 %	20 %	290954744
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269	NC_013929	CGGGC	2	10	262775	262784	0 %	0 %	60 %	40 %	290954846
270	NC_013929	GTGCC	2	10	264470	264479	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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