MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptomyces scabiei 87.22 chromosome

Total Repeats: 2057

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013929	TCCGC	2	10	72	81	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
2	NC_013929	CGGCG	2	10	262	271	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3	NC_013929	CGGGC	2	10	433	442	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4	NC_013929	GCTTC	2	10	9842	9851	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_013929	AGGGT	2	10	28468	28477	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013929	CAGTC	2	10	33447	33456	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_013929	CGGGC	2	10	33896	33905	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8	NC_013929	AGGCG	2	10	33986	33995	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
9	NC_013929	CCGCG	2	10	33996	34005	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
10	NC_013929	CGGCT	2	10	42858	42867	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_013929	CGCAG	2	10	43666	43675	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_013929	CTTCG	2	10	45133	45142	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_013929	CTCGG	2	10	46363	46372	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_013929	GGCGT	2	10	53883	53892	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
15	NC_013929	CACGC	2	10	56010	56019	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
16	NC_013929	GGGTC	2	10	57820	57829	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_013929	GGAGG	2	10	62185	62194	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013929	GCCGG	2	10	62222	62231	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
19	NC_013929	GCGTC	2	10	72440	72449	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_013929	GCCTC	2	10	76552	76561	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
21	NC_013929	GACTT	2	10	80960	80969	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_013929	CGGCC	2	10	81135	81144	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
23	NC_013929	CCCGG	2	10	82713	82722	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
24	NC_013929	CAGGA	2	10	86686	86695	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_013929	AGCCG	2	10	89558	89567	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_013929	TGCCA	2	10	93427	93436	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_013929	GCGCG	2	10	95656	95665	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
28	NC_013929	AGCTG	2	10	101039	101048	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_013929	GCGGA	2	10	101070	101079	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
30	NC_013929	TCCCC	2	10	107095	107104	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
31	NC_013929	CGATG	2	10	114583	114592	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_013929	CGGGC	2	10	118732	118741	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
33	NC_013929	CCGGG	2	10	118782	118791	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
34	NC_013929	GGCGG	2	10	126702	126711	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
35	NC_013929	TTCCC	2	10	132335	132344	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
36	NC_013929	GGTCG	2	10	133887	133896	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
37	NC_013929	CGGGG	2	10	137760	137769	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
38	NC_013929	TGGTG	2	10	138202	138211	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013929	GGCCG	2	10	151045	151054	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
40	NC_013929	CGGTG	2	10	151875	151884	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
41	NC_013929	TTCAC	2	10	184745	184754	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_013929	CGGCG	2	10	197480	197489	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
43	NC_013929	GTGAG	2	10	200426	200435	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013929	CGGCG	2	10	200719	200728	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
45	NC_013929	CCGCG	2	10	201191	201200	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
46	NC_013929	CCCGT	2	10	204559	204568	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
47	NC_013929	CCGGG	2	10	205694	205703	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
48	NC_013929	TGCCC	2	10	205712	205721	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
49	NC_013929	GGCCG	2	10	207386	207395	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
50	NC_013929	GGCCG	2	10	209593	209602	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
51	NC_013929	CGGCG	2	10	209618	209627	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
52	NC_013929	TCGGT	2	10	209690	209699	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_013929	CCGGG	2	10	223118	223127	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
54	NC_013929	CCCGG	2	10	223909	223918	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
55	NC_013929	GGGGC	2	10	223969	223978	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
56	NC_013929	GGGGT	2	10	225834	225843	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013929	GCCGC	2	10	233372	233381	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
58	NC_013929	CGCGG	2	10	233402	233411	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
59	NC_013929	CGCGC	2	10	241366	241375	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
60	NC_013929	GAGCG	2	10	241402	241411	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
61	NC_013929	GGGCC	2	10	243214	243223	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
62	NC_013929	GGCCG	2	10	243487	243496	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
63	NC_013929	GCCGC	2	10	247556	247565	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
64	NC_013929	CGGCA	2	10	254909	254918	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
65	NC_013929	CGGGC	2	10	260881	260890	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
66	NC_013929	GGGGC	2	10	260894	260903	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
67	NC_013929	GTGCC	2	10	264470	264479	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
68	NC_013929	TCCGA	2	10	270360	270369	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_013929	CGAGC	2	10	271212	271221	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
70	NC_013929	GCCAG	2	10	271981	271990	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
71	NC_013929	TCGAG	2	10	273452	273461	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_013929	GCCGA	2	10	276232	276241	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
73	NC_013929	GCCCG	2	10	296083	296092	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
74	NC_013929	ACAGC	2	10	303466	303475	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
75	NC_013929	CCGGC	2	10	307078	307087	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
76	NC_013929	ATCCC	2	10	318151	318160	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
77	NC_013929	GCGGT	2	10	319550	319559	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
78	NC_013929	CGGGG	2	10	319758	319767	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
79	NC_013929	GCGAT	2	10	321193	321202	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_013929	CGGCC	2	10	323733	323742	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
81	NC_013929	TCTCC	2	10	324112	324121	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
82	NC_013929	CGCGG	2	10	324534	324543	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
83	NC_013929	CGCGC	2	10	330356	330365	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
84	NC_013929	CGCAC	2	10	335054	335063	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
85	NC_013929	ACGGG	2	10	337836	337845	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
86	NC_013929	TCGGT	2	10	342285	342294	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_013929	GCCGG	2	10	348196	348205	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
88	NC_013929	GGGCG	2	10	348264	348273	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
89	NC_013929	GCGCT	2	10	348453	348462	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
90	NC_013929	CGGTG	2	10	348644	348653	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
91	NC_013929	CGGCC	2	10	350428	350437	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
92	NC_013929	CGTGG	2	10	356788	356797	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
93	NC_013929	GTCGG	2	10	356816	356825	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
94	NC_013929	CCGGT	2	10	356872	356881	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
95	NC_013929	CCTGT	2	10	397178	397187	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
96	NC_013929	CACCG	2	10	400627	400636	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
97	NC_013929	CCCGG	2	10	403291	403300	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
98	NC_013929	CTGCC	2	10	404134	404143	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
99	NC_013929	CCGGA	2	10	409725	409734	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
100	NC_013929	TACCT	2	10	411408	411417	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
101	NC_013929	CCGCC	2	10	414195	414204	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
102	NC_013929	CCAAC	2	10	414329	414338	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
103	NC_013929	TGACC	2	10	414517	414526	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
104	NC_013929	GGCCC	2	10	414755	414764	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
105	NC_013929	GGGCA	2	10	418775	418784	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
106	NC_013929	TCCCG	2	10	422912	422921	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
107	NC_013929	ACTCC	2	10	422974	422983	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
108	NC_013929	GGGCC	2	10	424846	424855	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
109	NC_013929	AGGGC	2	10	426675	426684	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
110	NC_013929	GCGCC	2	10	434649	434658	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
111	NC_013929	GGCGC	2	10	439350	439359	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
112	NC_013929	CGGCC	2	10	455315	455324	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
113	NC_013929	CCCGC	2	10	456705	456714	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
114	NC_013929	TGCGG	2	10	461019	461028	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
115	NC_013929	GCCCT	2	10	466251	466260	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
116	NC_013929	GTCCC	2	10	470138	470147	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
117	NC_013929	CCGGC	2	10	470235	470244	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
118	NC_013929	CCGAC	2	10	471052	471061	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
119	NC_013929	CCGGA	2	10	480249	480258	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
120	NC_013929	CGGGC	2	10	480266	480275	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
121	NC_013929	TCCCG	2	10	488340	488349	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
122	NC_013929	GTGCA	2	10	489373	489382	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
123	NC_013929	TGCGG	2	10	515947	515956	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
124	NC_013929	CCGCG	2	10	516019	516028	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
125	NC_013929	GTGAG	2	10	519780	519789	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013929	GCACG	2	10	525982	525991	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
127	NC_013929	CTCCC	2	10	526650	526659	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
128	NC_013929	TCACG	2	10	532817	532826	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
129	NC_013929	GAAGG	2	10	537067	537076	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013929	GGCCG	2	10	538917	538926	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
131	NC_013929	CGGTC	2	10	549098	549107	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
132	NC_013929	CGCGC	2	10	555378	555387	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
133	NC_013929	CGGCG	2	10	557062	557071	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
134	NC_013929	CCGTC	2	10	560402	560411	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
135	NC_013929	CGGTC	2	10	568601	568610	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
136	NC_013929	CCGTG	2	10	574024	574033	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
137	NC_013929	GGGCC	2	10	588968	588977	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
138	NC_013929	GTGCC	2	10	589025	589034	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
139	NC_013929	CGCGG	2	10	589732	589741	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
140	NC_013929	CGGCG	2	10	593072	593081	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
141	NC_013929	TGCCG	2	10	612862	612871	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
142	NC_013929	CGCAC	2	10	616128	616137	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
143	NC_013929	TCCGG	2	10	616834	616843	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
144	NC_013929	CCCGT	2	10	618296	618305	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
145	NC_013929	CCCGT	2	10	618325	618334	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
146	NC_013929	GTCGG	2	10	621376	621385	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
147	NC_013929	CCGGC	2	10	625714	625723	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
148	NC_013929	GGACG	2	10	626367	626376	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
149	NC_013929	TGCCC	2	10	629101	629110	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
150	NC_013929	CGTTC	2	10	638509	638518	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
151	NC_013929	CGGCC	2	10	641218	641227	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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159	NC_013929	GCCGG	2	10	669973	669982	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
160	NC_013929	GGGCC	2	10	670133	670142	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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165	NC_013929	TCGGA	2	10	699115	699124	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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172	NC_013929	GCGGG	2	10	734900	734909	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
173	NC_013929	CCGGC	2	10	736578	736587	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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177	NC_013929	CCCGC	2	10	750379	750388	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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182	NC_013929	CGGGC	2	10	796884	796893	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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185	NC_013929	ACCGA	2	10	844487	844496	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
186	NC_013929	TGGGA	2	10	849441	849450	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
187	NC_013929	GGCCC	2	10	850281	850290	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
188	NC_013929	CCGGG	2	10	853915	853924	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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191	NC_013929	GGGGC	2	10	862938	862947	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
192	NC_013929	GCCCC	2	10	862957	862966	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
193	NC_013929	TCGTG	2	10	863976	863985	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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225	NC_013929	CGGTC	2	10	1081831	1081840	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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232	NC_013929	TGGCC	2	10	1126476	1126485	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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243	NC_013929	CCGGG	2	10	1151115	1151124	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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256	NC_013929	CTCGC	2	10	1194842	1194851	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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261	NC_013929	TCCTC	2	10	1209153	1209162	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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263	NC_013929	CCGGG	2	10	1209264	1209273	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
264	NC_013929	CGGTC	2	10	1209581	1209590	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
265	NC_013929	CCGCC	2	10	1209830	1209839	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
266	NC_013929	CTCCC	2	10	1237583	1237592	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
267	NC_013929	AAGCC	2	10	1238212	1238221	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
268	NC_013929	GCTGC	2	10	1240971	1240980	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
269	NC_013929	GTCCG	2	10	1249551	1249560	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
270	NC_013929	CGCGA	2	10	1251058	1251067	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
271	NC_013929	GCGCC	2	10	1251112	1251121	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
272	NC_013929	CGCGG	2	10	1255391	1255400	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
273	NC_013929	GCCCC	2	10	1258535	1258544	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
274	NC_013929	CGGCC	2	10	1263559	1263568	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
275	NC_013929	GGTGG	2	10	1273104	1273113	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
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277	NC_013929	ACTCT	2	10	1274802	1274811	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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282	NC_013929	TGGTG	2	10	1298713	1298722	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
283	NC_013929	GTCCC	2	10	1302850	1302859	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
284	NC_013929	GGGAT	2	10	1303158	1303167	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
285	NC_013929	CGCGC	2	10	1306500	1306509	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
286	NC_013929	CCGGT	2	10	1307886	1307895	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
287	NC_013929	CCGGG	2	10	1308744	1308753	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
288	NC_013929	GAGTG	2	10	1311969	1311978	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
289	NC_013929	GCCGC	2	10	1313481	1313490	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
290	NC_013929	GGAGG	2	10	1320867	1320876	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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293	NC_013929	CGGAC	2	10	1347329	1347338	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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423	NC_013929	GCACG	2	10	2091179	2091188	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
424	NC_013929	GGACC	2	10	2091353	2091362	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
425	NC_013929	CGGTC	2	10	2091371	2091380	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
426	NC_013929	GACAC	2	10	2099277	2099286	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
427	NC_013929	CCCGT	2	10	2102219	2102228	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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490	NC_013929	GCCCG	2	10	2397483	2397492	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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