MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Aciduliprofundum boonei T469 chromosome

Total Repeats: 36

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013926	AAAAAT	2	12	2136	2147	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013926	AGGAGA	2	12	14632	14643	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013926	GAGAAG	2	12	47422	47433	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013926	AAATAT	2	12	95386	95397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013926	TTCTAT	2	12	111741	111752	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_013926	AAATTT	2	12	141494	141505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013926	ATTTAA	2	12	171135	171146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013926	TATTTT	2	12	228894	228905	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013926	ATTTTT	2	12	331307	331318	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013926	TAAAAT	2	12	478865	478876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013926	GTATTG	2	12	505531	505542	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013926	CTTTCT	2	12	548716	548727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_013926	GCATTT	2	12	603206	603217	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_013926	GCCGGG	2	12	604832	604843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_013926	GTGGAT	2	12	692873	692884	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013926	TTTTAT	2	12	712028	712039	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013926	ATAAAA	2	12	755845	755856	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013926	ATTAAG	2	12	796453	796464	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013926	TAAAAA	2	12	896796	896807	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013926	ATAAAA	2	12	911372	911383	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013926	TAAAAT	2	12	958751	958762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013926	AGAGAA	2	12	962500	962511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013926	TAGACA	2	12	973600	973611	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_013926	TAAAAT	2	12	991314	991325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013926	TCATAT	2	12	1010537	1010548	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_013926	ATTTTT	2	12	1028190	1028201	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013926	TTAAAT	2	12	1058469	1058480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013926	TTTTAT	2	12	1145918	1145929	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013926	TTCTGC	2	12	1150971	1150982	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_013926	CCGGGA	2	12	1181195	1181206	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_013926	ACATTT	2	12	1217559	1217570	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_013926	TAAAAA	2	12	1276448	1276459	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013926	AGGAAT	2	12	1359073	1359084	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013926	AAATTT	2	12	1381430	1381441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013926	GGGGTA	2	12	1422967	1422978	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013926	TGATAA	2	12	1468549	1468560	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.